3GH3 - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: STRUCTURAL INSIGHTS INTO THE CATALYTIC MECHANISM OF CD38: EV A CONFORMATIONALLY FLEXIBLE COVALENT ENZYME-SUBSTRATE COMPL
• Keywords: CD38, CYCLIC ADP RIBOSE, ECTO-ADP-RIBOSYL CYCLASE, 2 GLYCOSI HYDROLASE, GLYCOSIDASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	3GH3	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	ECTO-NAD+ GLYCOHYDROLASE (CD38 MOLECULE)	A	241	1911	0
2	Protein	ECTO-NAD+ GLYCOHYDROLASE (CD38 MOLECULE)	B	241	1920	0
3	Ligand		C	2	0	28
4	Ligand		D	2	0	28
5	Ligand	ECTO-NAD+ GLYCOHYDROLASE (CD38 MOLECULE)	A	1	0	5
6	Ligand	ECTO-NAD+ GLYCOHYDROLASE (CD38 MOLECULE)	B	2	0	10
7	Water			528	0	528
total				1017	3831	599

Proteins

Unit 1

TYR 36 SER 37 GLY 38 LEU 39 ASN 40 ARG 41 TRP 42 HIS 43 GLY 44 ALA 45 GLY 46 SER 47 THR 48 ALA 49 ASP 50 PHE 51 GLN 52 LYS 53 ILE 54 ILE 55 GLN 56 GLU 57 ARG 58 CYS 59 ASP 60 THR 61 TYR 62 THR 63 GLN 64 THR 65 ILE 66 ARG 67 PRO 68 GLY 69 SER 70 ARG 71 SER 72 ARG 73 ASN 74 CYS 75 GLN 76 ALA 77 ILE 78 ARG 79 GLN 80 ALA 81 PHE 82 MET 83 SER 84 ALA 85 PHE 86 ILE 87 SER 88 LYS 89 ASP 90 PRO 91 CYS 92 LYS 93 ALA 94 THR 95 LYS 96 GLU 97 ASP 98 TYR 99 ASN 100 SER 101 LEU 102 ILE 103 ASN 104 LEU 105 ALA 106 PRO 107 PRO 108 THR 109 VAL 110 PRO 111 CYS 112 GLY 113 GLN 114 GLN 115 VAL 116 PHE 117 TRP 118 SER 119 LYS 120 THR 121 LYS 122 GLU 123 LEU 124 ALA 125 HIS 126 GLU 127 TYR 128 ALA 129 LYS 130 ARG 131 ARG 132 ARG 133 LEU 134 MET 135 THR 136 LEU 137 GLU 138 ASP 139 THR 140 LEU 141 LEU 142 GLY 143 TYR 144 LEU 145 ALA 146 ASP 147 GLY 148 LEU 149 ARG 150 TRP 151 CYS 152 GLY 153 GLU 154 PRO 155 GLY 156 SER 157 SER 158 ASP 159 LEU 160 ASN 161 ILE 162 TRP 163 SER 164 CYS 165 PRO 166 ASP 167 TRP 168 ARG 169 LYS 170 ASP 171 CYS 172 ARG 173 THR 174 ASN 175 TYR 176 LEU 177 SER 178 VAL 179 PHE 180 TRP 181 GLU 182 VAL 183 LEU 184 SER 185 GLU 186 ARG 187 PHE 188 ALA 189 GLU 190 SER 191 ALA 192 CYS 193 ASN 194 THR 195 VAL 196 ARG 197 VAL 198 VAL 199 LEU 200 ASN 201 GLY 202 SER 203 LEU 204 GLU 205 ASN 206 ALA 207 PHE 208 ASP 209 SER 210 MET 211 SER 212 ILE 213 PHE 214 GLY 215 ARG 216 VAL 217 GLU 218 ALA 219 PRO 220 ASN 221 LEU 222 ARG 223 PRO 224 GLN 225 VAL 226 GLU 227 LEU 228 GLU 229 ALA 230 TRP 231 LEU 232 VAL 233 HIS 234 ASP 235 THR 236 GLY 237 LYS 238 PRO 239 PRO 240 SER 241 ASP 242 SER 243 CYS 244 SER 245 GLY 246 SER 247 SER 248 ILE 249 ARG 250 LYS 251 LEU 252 LYS 253 SER 254 ILE 255 LEU 256 ASP 257 GLY 258 ARG 259 ASN 260 VAL 261 LYS 262 PHE 263 ARG 264 CYS 265 MET 266 ASP 267 ASN 268 LEU 269 SER 270 ARG 271 ASP 272 GLN 273 PHE 274 LEU 275 GLN 276

Unit 2

GLY 38 LEU 39 ASN 40 ARG 41 TRP 42 HIS 43 GLY 44 ALA 45 GLY 46 SER 47 THR 48 ALA 49 ASP 50 PHE 51 GLN 52 LYS 53 ILE 54 ILE 55 GLN 56 GLU 57 ARG 58 CYS 59 ASP 60 THR 61 TYR 62 THR 63 GLN 64 THR 65 ILE 66 ARG 67 PRO 68 GLY 69 SER 70 ARG 71 SER 72 ARG 73 ASN 74 CYS 75 GLN 76 ALA 77 ILE 78 ARG 79 GLN 80 ALA 81 PHE 82 MET 83 SER 84 ALA 85 PHE 86 ILE 87 SER 88 LYS 89 ASP 90 PRO 91 CYS 92 LYS 93 ALA 94 THR 95 LYS 96 GLU 97 ASP 98 TYR 99 ASN 100 SER 101 LEU 102 ILE 103 ASN 104 LEU 105 ALA 106 PRO 107 PRO 108 THR 109 VAL 110 PRO 111 CYS 112 GLY 113 GLN 114 GLN 115 VAL 116 PHE 117 TRP 118 SER 119 LYS 120 THR 121 LYS 122 GLU 123 LEU 124 ALA 125 HIS 126 GLU 127 TYR 128 ALA 129 LYS 130 ARG 131 ARG 132 ARG 133 LEU 134 MET 135 THR 136 LEU 137 GLU 138 ASP 139 THR 140 LEU 141 LEU 142 GLY 143 TYR 144 LEU 145 ALA 146 ASP 147 GLY 148 LEU 149 ARG 150 TRP 151 CYS 152 GLY 153 GLU 154 PRO 155 GLY 156 SER 157 SER 158 ASP 159 LEU 160 ASN 161 ILE 162 TRP 163 SER 164 CYS 165 PRO 166 ASP 167 TRP 168 ARG 169 LYS 170 ASP 171 CYS 172 ARG 173 THR 174 ASN 175 TYR 176 LEU 177 SER 178 VAL 179 PHE 180 TRP 181 GLU 182 VAL 183 LEU 184 SER 185 GLU 186 ARG 187 PHE 188 ALA 189 GLU 190 SER 191 ALA 192 CYS 193 ASN 194 THR 195 VAL 196 ARG 197 VAL 198 VAL 199 LEU 200 ASN 201 GLY 202 SER 203 LEU 204 GLU 205 ASN 206 ALA 207 PHE 208 ASP 209 SER 210 MET 211 SER 212 ILE 213 PHE 214 GLY 215 ARG 216 VAL 217 GLU 218 ALA 219 PRO 220 ASN 221 LEU 222 ARG 223 PRO 224 GLN 225 VAL 226 GLU 227 LEU 228 GLU 229 ALA 230 TRP 231 LEU 232 VAL 233 HIS 234 ASP 235 THR 236 GLY 237 LYS 238 PRO 239 PRO 240 SER 241 ASP 242 SER 243 CYS 244 SER 245 GLY 246 SER 247 SER 248 ILE 249 ARG 250 LYS 251 LEU 252 LYS 253 SER 254 ILE 255 LEU 256 ASP 257 GLY 258 ARG 259 ASN 260 VAL 261 LYS 262 PHE 263 ARG 264 CYS 265 MET 266 ASP 267 ASN 268 LEU 269 SER 270 ARG 271 ASP 272 GLN 273 PHE 274 LEU 275 GLN 276 ARG 277 SER 278

Ligands

Unit 3	NAG 1 NAG 2
Unit 4	NAG 1 NAG 2
Unit 5	SO4 1
Unit 6	SO4 2 CAC 1001