2YVJ - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF THE FERREDOXIN-FERREDOXIN REDUCTASE (BPHA3-BPHA4)COMPLEX
• Keywords: ELECTRON TRANSFER, FERREDOXIN, FERREDOXIN REDUCTASE, OXIDOREDUCTASE/ELECTRON TRANSPORT COMPLEX
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	2YVJ	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	FERREDOXIN REDUCTASE	A	402	2992	0
2	Protein	BIPHENYL DIOXYGENASE FERREDOXIN SUBUNIT	B	106	804	0
3	Protein	FERREDOXIN REDUCTASE	P	401	2991	0
4	Ligand	FERREDOXIN REDUCTASE	A	2	0	88
5	Ligand	BIPHENYL DIOXYGENASE FERREDOXIN SUBUNIT	B	1	0	4
6	Ligand	FERREDOXIN REDUCTASE	P	2	0	88
7	Water			78	0	78
total				992	6787	258

Proteins

Unit 1	ALA 5 LEU 6 LYS 7 ALA 8 PRO 9 VAL 10 VAL 11 VAL 12 LEU 13 GLY 14 ALA 15 GLY 16 LEU 17 ALA 18 SER 19 VAL 20 SER 21 PHE 22 VAL 23 ALA 24 GLU 25 LEU 26 ARG 27 GLN 28 ALA 29 GLY 30 TYR 31 GLN 32 GLY 33 LEU 34 ILE 35 THR 36 VAL 37 VAL 38 GLY 39 ASP 40 GLU 41 ALA 42 GLU 43 ARG 44 PRO 45 TYR 46 ASP 47 ARG 48 PRO 49 PRO 50 LEU 51 SER 52 LYS 53 ASP 54 PHE 55 MET 56 ALA 57 HIS 58 GLY 59 ASP 60 ALA 61 GLU 62 LYS 63 ILE 64 ARG 65 LEU 66 ASP 67 CYS 68 LYS 69 ARG 70 ALA 71 PRO 72 GLU 73 VAL 74 GLU 75 TRP 76 LEU 77 LEU 78 GLY 79 VAL 80 THR 81 ALA 82 GLN 83 SER 84 PHE 85 ASP 86 PRO 87 GLN 88 ALA 89 HIS 90 THR 91 VAL 92 ALA 93 LEU 94 SER 95 ASP 96 GLY 97 ARG 98 THR 99 LEU 100 PRO 101 TYR 102 GLY 103 THR 104 LEU 105 VAL 106 LEU 107 ALA 108 THR 109 GLY 110 ALA 111 ALA 112 PRO 113 ARG 114 ALA 115 LEU 116 PRO 117 THR 118 LEU 119 GLN 120 GLY 121 ALA 122 THR 123 MET 124 PRO 125 VAL 126 HIS 127 THR 128 LEU 129 ARG 130 THR 131 LEU 132 GLU 133 ASP 134 ALA 135 ARG 136 ARG 137 ILE 138 GLN 139 ALA 140 GLY 141 LEU 142 ARG 143 PRO 144 GLN 145 SER 146 ARG 147 LEU 148 LEU 149 ILE 150 VAL 151 GLY 152 GLY 153 GLY 154 VAL 155 ILE 156 GLY 157 LEU 158 GLU 159 LEU 160 ALA 161 ALA 162 THR 163 ALA 164 ARG 165 THR 166 ALA 167 GLY 168 VAL 169 HIS 170 VAL 171 SER 172 LEU 173 VAL 174 GLU 175 THR 176 GLN 177 PRO 178 ARG 179 LEU 180 MET 181 SER 182 ARG 183 ALA 184 ALA 185 PRO 186 ALA 187 THR 188 LEU 189 ALA 190 ASP 191 PHE 192 VAL 193 ALA 194 ARG 195 TYR 196 HIS 197 ALA 198 ALA 199 GLN 200 GLY 201 VAL 202 ASP 203 LEU 204 ARG 205 PHE 206 GLU 207 ARG 208 SER 209 VAL 210 THR 211 GLY 212 SER 213 VAL 214 ASP 215 GLY 216 VAL 217 VAL 218 LEU 219 LEU 220 ASP 221 ASP 222 GLY 223 THR 224 ARG 225 ILE 226 ALA 227 ALA 228 ASP 229 MET 230 VAL 231 VAL 232 VAL 233 GLY 234 ILE 235 GLY 236 VAL 237 LEU 238 ALA 239 ASN 240 ASP 241 ALA 242 LEU 243 ALA 244 ARG 245 ALA 246 ALA 247 GLY 248 LEU 249 ALA 250 CYS 251 ASP 252 ASP 253 GLY 254 ILE 255 PHE 256 VAL 257 ASP 258 ALA 259 TYR 260 GLY 261 ARG 262 THR 263 THR 264 CYS 265 PRO 266 ASP 267 VAL 268 TYR 269 ALA 270 LEU 271 GLY 272 ASP 273 VAL 274 THR 275 ARG 276 GLN 277 ARG 278 ASN 279 PRO 280 LEU 281 SER 282 GLY 283 ARG 284 PHE 285 GLU 286 ARG 287 ILE 288 GLU 289 THR 290 TRP 291 SER 292 ASN 293 ALA 294 GLN 295 ASN 296 GLN 297 GLY 298 ILE 299 ALA 300 VAL 301 ALA 302 ARG 303 HIS 304 LEU 305 VAL 306 ASP 307 PRO 308 THR 309 ALA 310 PRO 311 GLY 312 TYR 313 ALA 314 GLU 315 LEU 316 PRO 317 TRP 318 TYR 319 TRP 320 SER 321 ASP 322 GLN 323 GLY 324 ALA 325 LEU 326 ARG 327 ILE 328 GLN 329 VAL 330 ALA 331 GLY 332 LEU 333 ALA 334 SER 335 GLY 336 ASP 337 GLU 338 GLU 339 ILE 340 VAL 341 ARG 342 GLY 343 GLU 344 VAL 345 SER 346 LEU 347 ASP 348 ALA 349 PRO 350 LYS 351 PHE 352 THR 353 LEU 354 ILE 355 GLU 356 LEU 357 GLN 358 LYS 359 GLY 360 ARG 361 ILE 362 VAL 363 GLY 364 ALA 365 THR 366 CYS 367 VAL 368 ASN 369 ASN 370 ALA 371 ARG 372 ASP 373 PHE 374 ALA 375 PRO 376 LEU 377 ARG 378 ARG 379 LEU 380 LEU 381 ALA 382 VAL 383 GLY 384 ALA 385 LYS 386 PRO 387 ASP 388 ARG 389 ALA 390 ALA 391 LEU 392 ALA 393 ASP 394 PRO 395 ALA 396 THR 397 ASP 398 LEU 399 ARG 400 LYS 401 LEU 402 ALA 403 ALA 404 ALA 405 VAL 406
Unit 2	THR 2 PHE 3 THR 4 LYS 5 ALA 6 CYS 7 SER 8 VAL 9 ASP 10 GLU 11 VAL 12 PRO 13 PRO 14 GLY 15 GLU 16 ALA 17 LEU 18 GLN 19 VAL 20 SER 21 HIS 22 ASP 23 ALA 24 GLN 25 LYS 26 VAL 27 ALA 28 ILE 29 PHE 30 ASN 31 VAL 32 ASP 33 GLY 34 GLU 35 PHE 36 PHE 37 ALA 38 THR 39 GLN 40 ASP 41 GLN 42 CYS 43 THR 44 HIS 45 GLY 46 GLU 47 TRP 48 SER 49 LEU 50 SER 51 GLU 52 GLY 53 GLY 54 TYR 55 LEU 56 ASP 57 GLY 58 ASP 59 VAL 60 VAL 61 GLU 62 CYS 63 SER 64 LEU 65 HIS 66 MET 67 GLY 68 LYS 69 PHE 70 CYS 71 VAL 72 ARG 73 THR 74 GLY 75 LYS 76 VAL 77 LYS 78 SER 79 PRO 80 PRO 81 PRO 82 CYS 83 GLU 84 PRO 85 LEU 86 LYS 87 VAL 88 TYR 89 PRO 90 ILE 91 ARG 92 ILE 93 GLU 94 GLY 95 ARG 96 ASP 97 VAL 98 LEU 99 VAL 100 ASP 101 PHE 102 SER 103 ARG 104 ALA 105 ALA 106 LEU 107
Unit 3	LEU 6 LYS 7 ALA 8 PRO 9 VAL 10 VAL 11 VAL 12 LEU 13 GLY 14 ALA 15 GLY 16 LEU 17 ALA 18 SER 19 VAL 20 SER 21 PHE 22 VAL 23 ALA 24 GLU 25 LEU 26 ARG 27 GLN 28 ALA 29 GLY 30 TYR 31 GLN 32 GLY 33 LEU 34 ILE 35 THR 36 VAL 37 VAL 38 GLY 39 ASP 40 GLU 41 ALA 42 GLU 43 ARG 44 PRO 45 TYR 46 ASP 47 ARG 48 PRO 49 PRO 50 LEU 51 SER 52 LYS 53 ASP 54 PHE 55 MET 56 ALA 57 HIS 58 GLY 59 ASP 60 ALA 61 GLU 62 LYS 63 ILE 64 ARG 65 LEU 66 ASP 67 CYS 68 LYS 69 ARG 70 ALA 71 PRO 72 GLU 73 VAL 74 GLU 75 TRP 76 LEU 77 LEU 78 GLY 79 VAL 80 THR 81 ALA 82 GLN 83 SER 84 PHE 85 ASP 86 PRO 87 GLN 88 ALA 89 HIS 90 THR 91 VAL 92 ALA 93 LEU 94 SER 95 ASP 96 GLY 97 ARG 98 THR 99 LEU 100 PRO 101 TYR 102 GLY 103 THR 104 LEU 105 VAL 106 LEU 107 ALA 108 THR 109 GLY 110 ALA 111 ALA 112 PRO 113 ARG 114 ALA 115 LEU 116 PRO 117 THR 118 LEU 119 GLN 120 GLY 121 ALA 122 THR 123 MET 124 PRO 125 VAL 126 HIS 127 THR 128 LEU 129 ARG 130 THR 131 LEU 132 GLU 133 ASP 134 ALA 135 ARG 136 ARG 137 ILE 138 GLN 139 ALA 140 GLY 141 LEU 142 ARG 143 PRO 144 GLN 145 SER 146 ARG 147 LEU 148 LEU 149 ILE 150 VAL 151 GLY 152 GLY 153 GLY 154 VAL 155 ILE 156 GLY 157 LEU 158 GLU 159 LEU 160 ALA 161 ALA 162 THR 163 ALA 164 ARG 165 THR 166 ALA 167 GLY 168 VAL 169 HIS 170 VAL 171 SER 172 LEU 173 VAL 174 GLU 175 THR 176 GLN 177 PRO 178 ARG 179 LEU 180 MET 181 SER 182 ARG 183 ALA 184 ALA 185 PRO 186 ALA 187 THR 188 LEU 189 ALA 190 ASP 191 PHE 192 VAL 193 ALA 194 ARG 195 TYR 196 HIS 197 ALA 198 ALA 199 GLN 200 GLY 201 VAL 202 ASP 203 LEU 204 ARG 205 PHE 206 GLU 207 ARG 208 SER 209 VAL 210 THR 211 GLY 212 SER 213 VAL 214 ASP 215 GLY 216 VAL 217 VAL 218 LEU 219 LEU 220 ASP 221 ASP 222 GLY 223 THR 224 ARG 225 ILE 226 ALA 227 ALA 228 ASP 229 MET 230 VAL 231 VAL 232 VAL 233 GLY 234 ILE 235 GLY 236 VAL 237 LEU 238 ALA 239 ASN 240 ASP 241 ALA 242 LEU 243 ALA 244 ARG 245 ALA 246 ALA 247 GLY 248 LEU 249 ALA 250 CYS 251 ASP 252 ASP 253 GLY 254 ILE 255 PHE 256 VAL 257 ASP 258 ALA 259 TYR 260 GLY 261 ARG 262 THR 263 THR 264 CYS 265 PRO 266 ASP 267 VAL 268 TYR 269 ALA 270 LEU 271 GLY 272 ASP 273 VAL 274 THR 275 ARG 276 GLN 277 ARG 278 ASN 279 PRO 280 LEU 281 SER 282 GLY 283 ARG 284 PHE 285 GLU 286 ARG 287 ILE 288 GLU 289 THR 290 TRP 291 SER 292 ASN 293 ALA 294 GLN 295 ASN 296 GLN 297 GLY 298 ILE 299 ALA 300 VAL 301 ALA 302 ARG 303 HIS 304 LEU 305 VAL 306 ASP 307 PRO 308 THR 309 ALA 310 PRO 311 GLY 312 TYR 313 ALA 314 GLU 315 LEU 316 PRO 317 TRP 318 TYR 319 TRP 320 SER 321 ASP 322 GLN 323 GLY 324 ALA 325 LEU 326 ARG 327 ILE 328 GLN 329 VAL 330 ALA 331 GLY 332 LEU 333 ALA 334 SER 335 GLY 336 ASP 337 GLU 338 GLU 339 ILE 340 VAL 341 ARG 342 GLY 343 GLU 344 VAL 345 SER 346 LEU 347 ASP 348 ALA 349 PRO 350 LYS 351 PHE 352 THR 353 LEU 354 ILE 355 GLU 356 LEU 357 GLN 358 LYS 359 GLY 360 ARG 361 ILE 362 VAL 363 GLY 364 ALA 365 THR 366 CYS 367 VAL 368 ASN 369 ASN 370 ALA 371 ARG 372 ASP 373 PHE 374 ALA 375 PRO 376 LEU 377 ARG 378 ARG 379 LEU 380 LEU 381 ALA 382 VAL 383 GLY 384 ALA 385 LYS 386 PRO 387 ASP 388 ARG 389 ALA 390 ALA 391 LEU 392 ALA 393 ASP 394 PRO 395 ALA 396 THR 397 ASP 398 LEU 399 ARG 400 LYS 401 LEU 402 ALA 403 ALA 404 ALA 405 VAL 406

Ligands

Unit 4	FAD 501 NAI 503
Unit 5	FES 500
Unit 6	FAD 502 NAI 504