1YHM - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: STRUCTURE OF THE COMPLEX OF TRYPANOSOMA CRUZI FARNESYL DISPH SYNTHASE WITH ALENDRONATE, ISOPENTENYL DIPHOSPHATE AND MG+2
• Keywords: FARNESYL DIPHOSPHATE SYNTHASE, ALENDRONATE, ISOPENTENYL DIPH MEVALONATE PATWAY, GERANYL TRANSFERASE, DIMETHYLALLYL TRANS FPPS, TRANSFERASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	1YHM	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	FARNESYL PYROPHOSPHATE SYNTHASE	A	362	2771	120
2	Protein	FARNESYL PYROPHOSPHATE SYNTHASE	B	362	2771	120
3	Protein	FARNESYL PYROPHOSPHATE SYNTHASE	C	362	2771	120
4	Ligand	FARNESYL PYROPHOSPHATE SYNTHASE	A	6	0	36
5	Ligand	FARNESYL PYROPHOSPHATE SYNTHASE	B	6	0	36
6	Ligand	FARNESYL PYROPHOSPHATE SYNTHASE	C	6	0	36
7	Water			110	0	110
total				1214	8313	578

Proteins

Unit 1	MSE 1 ALA 2 SER 3 MSE 4 GLU 5 ARG 6 PHE 7 LEU 8 SER 9 VAL 10 TYR 11 ASP 12 GLU 13 VAL 14 GLN 15 ALA 16 PHE 17 LEU 18 LEU 19 ASP 20 GLN 21 LEU 22 GLN 23 SER 24 LYS 25 TYR 26 GLU 27 ILE 28 ASP 29 PRO 30 ASN 31 ARG 32 ALA 33 ARG 34 TYR 35 LEU 36 ARG 37 ILE 38 MSE 39 MSE 40 ASP 41 THR 42 THR 43 CYS 44 LEU 45 GLY 46 GLY 47 LYS 48 TYR 49 PHE 50 ARG 51 GLY 52 MSE 53 THR 54 VAL 55 VAL 56 ASN 57 VAL 58 ALA 59 GLU 60 GLY 61 PHE 62 LEU 63 ALA 64 VAL 65 THR 66 GLN 67 HIS 68 ASP 69 GLU 70 ALA 71 THR 72 LYS 73 GLU 74 ARG 75 ILE 76 LEU 77 HIS 78 ASP 79 ALA 80 CYS 81 VAL 82 GLY 83 GLY 84 TRP 85 MSE 86 ILE 87 GLU 88 PHE 89 LEU 90 GLN 91 ALA 92 HIS 93 TYR 94 LEU 95 VAL 96 GLU 97 ASP 98 ASP 99 ILE 100 MSE 101 ASP 102 GLY 103 SER 104 VAL 105 MSE 106 ARG 107 ARG 108 GLY 109 LYS 110 PRO 111 CYS 112 TRP 113 TYR 114 ARG 115 PHE 116 PRO 117 GLY 118 VAL 119 THR 120 THR 121 GLN 122 CYS 123 ALA 124 ILE 125 ASN 126 ASP 127 GLY 128 ILE 129 ILE 130 LEU 131 LYS 132 SER 133 TRP 134 THR 135 GLN 136 ILE 137 MSE 138 ALA 139 TRP 140 HIS 141 TYR 142 PHE 143 ALA 144 ASP 145 ARG 146 PRO 147 PHE 148 LEU 149 LYS 150 ASP 151 LEU 152 LEU 153 CYS 154 LEU 155 PHE 156 GLN 157 LYS 158 VAL 159 ASP 160 TYR 161 ALA 162 THR 163 ALA 164 VAL 165 GLY 166 GLN 167 MSE 168 TYR 169 ASP 170 VAL 171 THR 172 SER 173 MSE 174 CYS 175 ASP 176 SER 177 ASN 178 LYS 179 LEU 180 ASP 181 PRO 182 GLU 183 VAL 184 ALA 185 GLN 186 PRO 187 MSE 188 THR 189 THR 190 ASP 191 PHE 192 ALA 193 GLU 194 PHE 195 THR 196 PRO 197 ALA 198 ILE 199 TYR 200 LYS 201 ARG 202 ILE 203 VAL 204 LYS 205 TYR 206 LYS 207 THR 208 THR 209 PHE 210 TYR 211 THR 212 TYR 213 LEU 214 LEU 215 PRO 216 LEU 217 VAL 218 MSE 219 GLY 220 LEU 221 PHE 222 VAL 223 SER 224 GLU 225 ALA 226 ALA 227 ALA 228 SER 229 VAL 230 GLU 231 MSE 232 ASN 233 LEU 234 VAL 235 GLU 236 ARG 237 VAL 238 ALA 239 HIS 240 LEU 241 ILE 242 GLY 243 GLU 244 TYR 245 PHE 246 GLN 247 VAL 248 GLN 249 ASP 250 ASP 251 VAL 252 MSE 253 ASP 254 CYS 255 PHE 256 THR 257 PRO 258 PRO 259 GLU 260 GLN 261 LEU 262 GLY 263 LYS 264 VAL 265 GLY 266 THR 267 ASP 268 ILE 269 GLU 270 ASP 271 ALA 272 LYS 273 CYS 274 SER 275 TRP 276 LEU 277 ALA 278 VAL 279 THR 280 PHE 281 LEU 282 GLY 283 LYS 284 ALA 285 ASN 286 ALA 287 ALA 288 GLN 289 VAL 290 ALA 291 GLU 292 PHE 293 LYS 294 ALA 295 ASN 296 TYR 297 GLY 298 ASP 299 LYS 300 ASP 301 PRO 302 ALA 303 LYS 304 VAL 305 ALA 306 VAL 307 VAL 308 LYS 309 ARG 310 LEU 311 TYR 312 SER 313 GLU 314 ALA 315 ASN 316 LEU 317 GLN 318 ALA 319 ASP 320 PHE 321 ALA 322 ALA 323 TYR 324 GLU 325 ALA 326 GLU 327 VAL 328 VAL 329 ARG 330 GLU 331 VAL 332 GLU 333 SER 334 LEU 335 ILE 336 GLU 337 GLN 338 LEU 339 LYS 340 VAL 341 LYS 342 SER 343 PRO 344 THR 345 PHE 346 ALA 347 GLU 348 SER 349 VAL 350 ALA 351 VAL 352 VAL 353 TRP 354 GLU 355 LYS 356 THR 357 HIS 358 LYS 359 ARG 360 LYS 361 LYS 362
Unit 2	MSE 1 ALA 2 SER 3 MSE 4 GLU 5 ARG 6 PHE 7 LEU 8 SER 9 VAL 10 TYR 11 ASP 12 GLU 13 VAL 14 GLN 15 ALA 16 PHE 17 LEU 18 LEU 19 ASP 20 GLN 21 LEU 22 GLN 23 SER 24 LYS 25 TYR 26 GLU 27 ILE 28 ASP 29 PRO 30 ASN 31 ARG 32 ALA 33 ARG 34 TYR 35 LEU 36 ARG 37 ILE 38 MSE 39 MSE 40 ASP 41 THR 42 THR 43 CYS 44 LEU 45 GLY 46 GLY 47 LYS 48 TYR 49 PHE 50 ARG 51 GLY 52 MSE 53 THR 54 VAL 55 VAL 56 ASN 57 VAL 58 ALA 59 GLU 60 GLY 61 PHE 62 LEU 63 ALA 64 VAL 65 THR 66 GLN 67 HIS 68 ASP 69 GLU 70 ALA 71 THR 72 LYS 73 GLU 74 ARG 75 ILE 76 LEU 77 HIS 78 ASP 79 ALA 80 CYS 81 VAL 82 GLY 83 GLY 84 TRP 85 MSE 86 ILE 87 GLU 88 PHE 89 LEU 90 GLN 91 ALA 92 HIS 93 TYR 94 LEU 95 VAL 96 GLU 97 ASP 98 ASP 99 ILE 100 MSE 101 ASP 102 GLY 103 SER 104 VAL 105 MSE 106 ARG 107 ARG 108 GLY 109 LYS 110 PRO 111 CYS 112 TRP 113 TYR 114 ARG 115 PHE 116 PRO 117 GLY 118 VAL 119 THR 120 THR 121 GLN 122 CYS 123 ALA 124 ILE 125 ASN 126 ASP 127 GLY 128 ILE 129 ILE 130 LEU 131 LYS 132 SER 133 TRP 134 THR 135 GLN 136 ILE 137 MSE 138 ALA 139 TRP 140 HIS 141 TYR 142 PHE 143 ALA 144 ASP 145 ARG 146 PRO 147 PHE 148 LEU 149 LYS 150 ASP 151 LEU 152 LEU 153 CYS 154 LEU 155 PHE 156 GLN 157 LYS 158 VAL 159 ASP 160 TYR 161 ALA 162 THR 163 ALA 164 VAL 165 GLY 166 GLN 167 MSE 168 TYR 169 ASP 170 VAL 171 THR 172 SER 173 MSE 174 CYS 175 ASP 176 SER 177 ASN 178 LYS 179 LEU 180 ASP 181 PRO 182 GLU 183 VAL 184 ALA 185 GLN 186 PRO 187 MSE 188 THR 189 THR 190 ASP 191 PHE 192 ALA 193 GLU 194 PHE 195 THR 196 PRO 197 ALA 198 ILE 199 TYR 200 LYS 201 ARG 202 ILE 203 VAL 204 LYS 205 TYR 206 LYS 207 THR 208 THR 209 PHE 210 TYR 211 THR 212 TYR 213 LEU 214 LEU 215 PRO 216 LEU 217 VAL 218 MSE 219 GLY 220 LEU 221 PHE 222 VAL 223 SER 224 GLU 225 ALA 226 ALA 227 ALA 228 SER 229 VAL 230 GLU 231 MSE 232 ASN 233 LEU 234 VAL 235 GLU 236 ARG 237 VAL 238 ALA 239 HIS 240 LEU 241 ILE 242 GLY 243 GLU 244 TYR 245 PHE 246 GLN 247 VAL 248 GLN 249 ASP 250 ASP 251 VAL 252 MSE 253 ASP 254 CYS 255 PHE 256 THR 257 PRO 258 PRO 259 GLU 260 GLN 261 LEU 262 GLY 263 LYS 264 VAL 265 GLY 266 THR 267 ASP 268 ILE 269 GLU 270 ASP 271 ALA 272 LYS 273 CYS 274 SER 275 TRP 276 LEU 277 ALA 278 VAL 279 THR 280 PHE 281 LEU 282 GLY 283 LYS 284 ALA 285 ASN 286 ALA 287 ALA 288 GLN 289 VAL 290 ALA 291 GLU 292 PHE 293 LYS 294 ALA 295 ASN 296 TYR 297 GLY 298 ASP 299 LYS 300 ASP 301 PRO 302 ALA 303 LYS 304 VAL 305 ALA 306 VAL 307 VAL 308 LYS 309 ARG 310 LEU 311 TYR 312 SER 313 GLU 314 ALA 315 ASN 316 LEU 317 GLN 318 ALA 319 ASP 320 PHE 321 ALA 322 ALA 323 TYR 324 GLU 325 ALA 326 GLU 327 VAL 328 VAL 329 ARG 330 GLU 331 VAL 332 GLU 333 SER 334 LEU 335 ILE 336 GLU 337 GLN 338 LEU 339 LYS 340 VAL 341 LYS 342 SER 343 PRO 344 THR 345 PHE 346 ALA 347 GLU 348 SER 349 VAL 350 ALA 351 VAL 352 VAL 353 TRP 354 GLU 355 LYS 356 THR 357 HIS 358 LYS 359 ARG 360 LYS 361 LYS 362
Unit 3	MSE 1 ALA 2 SER 3 MSE 4 GLU 5 ARG 6 PHE 7 LEU 8 SER 9 VAL 10 TYR 11 ASP 12 GLU 13 VAL 14 GLN 15 ALA 16 PHE 17 LEU 18 LEU 19 ASP 20 GLN 21 LEU 22 GLN 23 SER 24 LYS 25 TYR 26 GLU 27 ILE 28 ASP 29 PRO 30 ASN 31 ARG 32 ALA 33 ARG 34 TYR 35 LEU 36 ARG 37 ILE 38 MSE 39 MSE 40 ASP 41 THR 42 THR 43 CYS 44 LEU 45 GLY 46 GLY 47 LYS 48 TYR 49 PHE 50 ARG 51 GLY 52 MSE 53 THR 54 VAL 55 VAL 56 ASN 57 VAL 58 ALA 59 GLU 60 GLY 61 PHE 62 LEU 63 ALA 64 VAL 65 THR 66 GLN 67 HIS 68 ASP 69 GLU 70 ALA 71 THR 72 LYS 73 GLU 74 ARG 75 ILE 76 LEU 77 HIS 78 ASP 79 ALA 80 CYS 81 VAL 82 GLY 83 GLY 84 TRP 85 MSE 86 ILE 87 GLU 88 PHE 89 LEU 90 GLN 91 ALA 92 HIS 93 TYR 94 LEU 95 VAL 96 GLU 97 ASP 98 ASP 99 ILE 100 MSE 101 ASP 102 GLY 103 SER 104 VAL 105 MSE 106 ARG 107 ARG 108 GLY 109 LYS 110 PRO 111 CYS 112 TRP 113 TYR 114 ARG 115 PHE 116 PRO 117 GLY 118 VAL 119 THR 120 THR 121 GLN 122 CYS 123 ALA 124 ILE 125 ASN 126 ASP 127 GLY 128 ILE 129 ILE 130 LEU 131 LYS 132 SER 133 TRP 134 THR 135 GLN 136 ILE 137 MSE 138 ALA 139 TRP 140 HIS 141 TYR 142 PHE 143 ALA 144 ASP 145 ARG 146 PRO 147 PHE 148 LEU 149 LYS 150 ASP 151 LEU 152 LEU 153 CYS 154 LEU 155 PHE 156 GLN 157 LYS 158 VAL 159 ASP 160 TYR 161 ALA 162 THR 163 ALA 164 VAL 165 GLY 166 GLN 167 MSE 168 TYR 169 ASP 170 VAL 171 THR 172 SER 173 MSE 174 CYS 175 ASP 176 SER 177 ASN 178 LYS 179 LEU 180 ASP 181 PRO 182 GLU 183 VAL 184 ALA 185 GLN 186 PRO 187 MSE 188 THR 189 THR 190 ASP 191 PHE 192 ALA 193 GLU 194 PHE 195 THR 196 PRO 197 ALA 198 ILE 199 TYR 200 LYS 201 ARG 202 ILE 203 VAL 204 LYS 205 TYR 206 LYS 207 THR 208 THR 209 PHE 210 TYR 211 THR 212 TYR 213 LEU 214 LEU 215 PRO 216 LEU 217 VAL 218 MSE 219 GLY 220 LEU 221 PHE 222 VAL 223 SER 224 GLU 225 ALA 226 ALA 227 ALA 228 SER 229 VAL 230 GLU 231 MSE 232 ASN 233 LEU 234 VAL 235 GLU 236 ARG 237 VAL 238 ALA 239 HIS 240 LEU 241 ILE 242 GLY 243 GLU 244 TYR 245 PHE 246 GLN 247 VAL 248 GLN 249 ASP 250 ASP 251 VAL 252 MSE 253 ASP 254 CYS 255 PHE 256 THR 257 PRO 258 PRO 259 GLU 260 GLN 261 LEU 262 GLY 263 LYS 264 VAL 265 GLY 266 THR 267 ASP 268 ILE 269 GLU 270 ASP 271 ALA 272 LYS 273 CYS 274 SER 275 TRP 276 LEU 277 ALA 278 VAL 279 THR 280 PHE 281 LEU 282 GLY 283 LYS 284 ALA 285 ASN 286 ALA 287 ALA 288 GLN 289 VAL 290 ALA 291 GLU 292 PHE 293 LYS 294 ALA 295 ASN 296 TYR 297 GLY 298 ASP 299 LYS 300 ASP 301 PRO 302 ALA 303 LYS 304 VAL 305 ALA 306 VAL 307 VAL 308 LYS 309 ARG 310 LEU 311 TYR 312 SER 313 GLU 314 ALA 315 ASN 316 LEU 317 GLN 318 ALA 319 ASP 320 PHE 321 ALA 322 ALA 323 TYR 324 GLU 325 ALA 326 GLU 327 VAL 328 VAL 329 ARG 330 GLU 331 VAL 332 GLU 333 SER 334 LEU 335 ILE 336 GLU 337 GLN 338 LEU 339 LYS 340 VAL 341 LYS 342 SER 343 PRO 344 THR 345 PHE 346 ALA 347 GLU 348 SER 349 VAL 350 ALA 351 VAL 352 VAL 353 TRP 354 GLU 355 LYS 356 THR 357 HIS 358 LYS 359 ARG 360 LYS 361 LYS 362

Ligands

Unit 4	SO4 370 MG 401 MG 402 MG 403 IPE 900 AHD 901
Unit 5	SO4 1370 MG 1401 MG 1402 MG 1403 IPE 1900 AHD 1901
Unit 6	SO4 2370 MG 2401 MG 2402 MG 2403 IPE 2900 AHD 2901