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Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

Title CRYSTAL STRUCTURE SOLUTION OF RICE GST1 (OSGSTU1) IN COMPLEX GLUTATHIONE.
Keywords HERBICIDE DETOXIFICATION, PLANT GLUTATHIONE S-TRANSFERASE, TRANSFERASE
Experiment X-ray diffraction
Number of Models  1


   Database       ID code    StatusCoordinate files
        Header     Asymmetric unit     Biological unit  

PDB   1OYJ     released     available     available     Quaternary Structure Server  


Asymmetric unit from PDB
 Unit     Type     Name   Chain ID   Residues   Atoms   Hetatoms 
1  Protein   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  A 228 1794 0
2  Protein   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  B 224 1760 0
3  Protein   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  C 227 1784 0
4  Protein   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  D 223 1745 0
5  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  A 1 0 1
6  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  C 1 0 1
7  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  A 1 0 1
8  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  D 1 0 1
9  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  B 1 0 1
10  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  D 1 0 1
11  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  C 1 0 1
12  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  A 1 0 1
13  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  C 1 0 1
14  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  A 3 0 3
15  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  C 3 0 3
16  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  B 1 0 1
17  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  D 1 0 1
18  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  C 1 0 1
19  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  D 1 0 1
20  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  B 1 0 1
21  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  A 5 0 43
22  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  B 1 0 20
23  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  C 3 0 60
24  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  D 1 0 20
25  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  B 1 0 6
26  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  D 1 0 6
27  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  C 1 0 6
28  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  D 1 0 6
29  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  C 1 0 6
30  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  A 1 0 6
31  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  C 2 0 12
32  Ligand   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE  A 1 0 6
33 Water     611 0 611
total       1552 7083 828

Proteins
Unit 1 ALA2 GLU3 GLU4 LYS5 GLU6 LEU7 VAL8 LEU9 LEU10 ASP11 PHE12 TRP13 VAL14 SER15 PRO16 PHE17 GLY18 GLN19 ARG20 CYS21 ARG22 ILE23 ALA24 MET25 ALA26 GLU27 LYS28 GLY29 LEU30 GLU31 PHE32 GLU33 TYR34 ARG35 GLU36 GLU37 ASP38 LEU39 GLY40 ASN41 LYS42 SER43 ASP44 LEU45 LEU46 LEU47 ARG48 SER49 ASN50 PRO51 VAL52 HIS53 ARG54 LYS55 ILE56 PRO57 VAL58 LEU59 LEU60 HIS61 ALA62 GLY63 ARG64 PRO65 VAL66 SER67 GLU68 SER69 LEU70 VAL71 ILE72 LEU73 GLN74 TYR75 LEU76 ASP77 ASP78 ALA79 PHE80 PRO81 GLY82 THR83 PRO84 HIS85 LEU86 LEU87 PRO88 PRO89 ALA90 ASN91 SER92 GLY93 ALA95 ASP96 ALA97 ALA98 TYR99 ALA100 ARG101 ALA102 THR103 ALA104 ARG105 PHE106 TRP107 ALA108 ASP109 TYR110 VAL111 ASP112 ARG113 LYS114 LEU115 TYR116 ASP117 CYS118 GLY119 SER120 ARG121 LEU122 TRP123 ARG124 LEU125 LYS126 GLY127 GLU128 PRO129 GLN130 ALA131 ALA132 ALA133 GLY134 ARG135 GLU136 MET137 ALA138 GLU139 ILE140 LEU141 ARG142 THR143 LEU144 GLU145 ALA146 GLU147 LEU148 GLY149 ASP150 ARG151 GLU152 PHE153 PHE154 GLY155 GLY156 GLY157 GLY158 GLY159 GLY160 ARG161 LEU162 GLY163 PHE164 VAL165 ASP166 VAL167 ALA168 LEU169 VAL170 PRO171 PHE172 THR173 ALA174 TRP175 PHE176 TYR177 SER178 TYR179 GLU180 ARG181 CYS182 GLY183 GLY184 PHE185 SER186 VAL187 GLU188 GLU189 VAL190 ALA191 PRO192 ARG193 LEU194 ALA195 ALA196 TRP197 ALA198 ARG199 ARG200 CYS201 GLY202 ARG203 ILE204 ASP205 SER206 VAL207 VAL208 LYS209 HIS210 LEU211 PRO212 SER213 PRO214 GLU215 LYS216 VAL217 TYR218 ASP219 PHE220 VAL221 GLY222 VAL223 LEU224 LYS225 LYS226 LYS227 TYR228 GLY229 VAL230
Unit 2 GLU3 GLU4 LYS5 GLU6 LEU7 VAL8 LEU9 LEU10 ASP11 PHE12 TRP13 VAL14 SER15 PRO16 PHE17 GLY18 GLN19 ARG20 CYS21 ARG22 ILE23 ALA24 MET25 ALA26 GLU27 LYS28 GLY29 LEU30 GLU31 PHE32 GLU33 TYR34 ARG35 GLU36 GLU37 ASP38 LEU39 GLY40 ASN41 LYS42 SER43 ASP44 LEU45 LEU46 LEU47 ARG48 SER49 ASN50 PRO51 VAL52 HIS53 ARG54 LYS55 ILE56 PRO57 VAL58 LEU59 LEU60 HIS61 ALA62 GLY63 ARG64 PRO65 VAL66 SER67 GLU68 SER69 LEU70 VAL71 ILE72 LEU73 GLN74 TYR75 LEU76 ASP77 ASP78 ALA79 PHE80 PRO81 GLY82 THR83 PRO84 HIS85 LEU86 LEU87 PRO88 PRO89 ALA90 ASN91 SER92 ASP94 ALA95 ASP96 ALA97 ALA98 TYR99 ALA100 ARG101 ALA102 THR103 ALA104 ARG105 PHE106 TRP107 ALA108 ASP109 TYR110 VAL111 ASP112 ARG113 LYS114 LEU115 TYR116 ASP117 CYS118 GLY119 SER120 ARG121 LEU122 TRP123 ARG124 LEU125 LYS126 GLY127 GLU128 PRO129 GLN130 ALA131 ALA132 ALA133 GLY134 ARG135 GLU136 MET137 ALA138 GLU139 ILE140 LEU141 ARG142 THR143 LEU144 GLU145 ALA146 GLU147 LEU148 GLY149 ASP150 ARG151 GLU152 PHE153 PHE154 GLY155 GLY156 GLY157 GLY158 GLY159 GLY160 ARG161 LEU162 GLY163 PHE164 VAL165 ASP166 VAL167 ALA168 LEU169 VAL170 PRO171 PHE172 THR173 ALA174 TRP175 PHE176 TYR177 SER178 TYR179 GLU180 ARG181 CYS182 GLY183 GLY184 PHE185 SER186 VAL187 GLU188 GLU189 VAL190 ALA191 PRO192 ARG193 LEU194 ALA195 ALA196 TRP197 ALA198 ARG199 ARG200 CYS201 GLY202 ARG203 ILE204 ASP205 SER206 VAL207 VAL208 LYS209 HIS210 LEU211 PRO212 SER213 PRO214 GLU215 LYS216 VAL217 TYR218 ASP219 PHE220 VAL221 GLY222 VAL223 LEU224 LYS225 LYS226 LYS227
Unit 3 GLU3 GLU4 LYS5 GLU6 LEU7 VAL8 LEU9 LEU10 ASP11 PHE12 TRP13 VAL14 SER15 PRO16 PHE17 GLY18 GLN19 ARG20 CYS21 ARG22 ILE23 ALA24 MET25 ALA26 GLU27 LYS28 GLY29 LEU30 GLU31 PHE32 GLU33 TYR34 ARG35 GLU36 GLU37 ASP38 LEU39 GLY40 ASN41 LYS42 SER43 ASP44 LEU45 LEU46 LEU47 ARG48 SER49 ASN50 PRO51 VAL52 HIS53 ARG54 LYS55 ILE56 PRO57 VAL58 LEU59 LEU60 HIS61 ALA62 GLY63 ARG64 PRO65 VAL66 SER67 GLU68 SER69 LEU70 VAL71 ILE72 LEU73 GLN74 TYR75 LEU76 ASP77 ASP78 ALA79 PHE80 PRO81 GLY82 THR83 PRO84 HIS85 LEU86 LEU87 PRO88 PRO89 ALA90 ASN91 SER92 GLY93 ASP94 ALA95 ASP96 ALA97 ALA98 TYR99 ALA100 ARG101 ALA102 THR103 ALA104 ARG105 PHE106 TRP107 ALA108 ASP109 TYR110 VAL111 ASP112 ARG113 LYS114 LEU115 TYR116 ASP117 CYS118 GLY119 SER120 ARG121 LEU122 TRP123 ARG124 LEU125 LYS126 GLY127 GLU128 PRO129 GLN130 ALA131 ALA132 ALA133 GLY134 ARG135 GLU136 MET137 ALA138 GLU139 ILE140 LEU141 ARG142 THR143 LEU144 GLU145 ALA146 GLU147 LEU148 GLY149 ASP150 ARG151 GLU152 PHE153 PHE154 GLY155 GLY156 GLY157 GLY158 GLY159 GLY160 ARG161 LEU162 GLY163 PHE164 VAL165 ASP166 VAL167 ALA168 LEU169 VAL170 PRO171 PHE172 THR173 ALA174 TRP175 PHE176 TYR177 SER178 TYR179 GLU180 ARG181 CYS182 GLY183 GLY184 PHE185 SER186 VAL187 GLU188 GLU189 VAL190 ALA191 PRO192 ARG193 LEU194 ALA195 ALA196 TRP197 ALA198 ARG199 ARG200 CYS201 GLY202 ARG203 ILE204 ASP205 SER206 VAL207 VAL208 LYS209 HIS210 LEU211 PRO212 SER213 PRO214 GLU215 LYS216 VAL217 TYR218 ASP219 PHE220 VAL221 GLY222 VAL223 LEU224 LYS225 LYS226 LYS227 TYR228 GLY229
Unit 4 GLU3 GLU4 LYS5 GLU6 LEU7 VAL8 LEU9 LEU10 ASP11 PHE12 TRP13 VAL14 SER15 PRO16 PHE17 GLY18 GLN19 ARG20 CYS21 ARG22 ILE23 ALA24 MET25 ALA26 GLU27 LYS28 GLY29 LEU30 GLU31 PHE32 GLU33 TYR34 ARG35 GLU36 GLU37 ASP38 LEU39 GLY40 ASN41 LYS42 SER43 ASP44 LEU45 LEU46 LEU47 ARG48 SER49 ASN50 PRO51 VAL52 HIS53 ARG54 LYS55 ILE56 PRO57 VAL58 LEU59 LEU60 HIS61 ALA62 GLY63 ARG64 PRO65 VAL66 SER67 GLU68 SER69 LEU70 VAL71 ILE72 LEU73 GLN74 TYR75 LEU76 ASP77 ASP78 ALA79 PHE80 PRO81 GLY82 THR83 PRO84 HIS85 LEU86 LEU87 PRO88 PRO89 ALA90 ASN91 SER92 ALA95 ASP96 ALA97 ALA98 TYR99 ALA100 ARG101 ALA102 THR103 ALA104 ARG105 PHE106 TRP107 ALA108 ASP109 TYR110 VAL111 ASP112 ARG113 LYS114 LEU115 TYR116 ASP117 CYS118 GLY119 SER120 ARG121 LEU122 TRP123 ARG124 LEU125 LYS126 GLY127 GLU128 PRO129 GLN130 ALA131 ALA132 ALA133 GLY134 ARG135 GLU136 MET137 ALA138 GLU139 ILE140 LEU141 ARG142 THR143 LEU144 GLU145 ALA146 GLU147 LEU148 GLY149 ASP150 ARG151 GLU152 PHE153 PHE154 GLY155 GLY156 GLY157 GLY158 GLY159 GLY160 ARG161 LEU162 GLY163 PHE164 VAL165 ASP166 VAL167 ALA168 LEU169 VAL170 PRO171 PHE172 THR173 ALA174 TRP175 PHE176 TYR177 SER178 TYR179 GLU180 ARG181 CYS182 GLY183 GLY184 PHE185 SER186 VAL187 GLU188 GLU189 VAL190 ALA191 PRO192 ARG193 LEU194 ALA195 ALA196 TRP197 ALA198 ARG199 ARG200 CYS201 GLY202 ARG203 ILE204 ASP205 SER206 VAL207 VAL208 LYS209 HIS210 LEU211 PRO212 SER213 PRO214 GLU215 LYS216 VAL217 TYR218 ASP219 PHE220 VAL221 GLY222 VAL223 LEU224 LYS225 LYS226 LYS227

Ligands
Unit 5 MG815
Unit 6 MG816
Unit 7 MG817
Unit 8 CL819
Unit 9 CL820
Unit 10 CL821
Unit 11 CL822
Unit 12 CL823
Unit 13 CL824
Unit 14 CL825 CL826 CL827
Unit 15 CL828 CL829 CL830
Unit 16 CL831
Unit 17 CL832
Unit 18 CL833
Unit 19 CL834
Unit 20 CL835
Unit 21 GSH799 GSH800 CL836 CL837 CL838
Unit 22 GSH801
Unit 23 GSH802 GSH803 GSH804
Unit 24 GSH805
Unit 25 GOL806
Unit 26 GOL807
Unit 27 GOL808
Unit 28 GOL809
Unit 29 GOL810
Unit 30 GOL811
Unit 31 GOL812 GOL813
Unit 32 GOL814

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Perl script:    PDBscan.pl  (15 Sep 2016)
Author:    Peter Slickers  (slickers@leibniz-fli.de),  IMB Jena,  Germany