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Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

Title COMPLEX OF DC-SIGN AND GLCNAC2MAN3
Keywords C-TYPE LECTIN, PROTEIN CARBOHYDRATE COMPLEX, SUGAR BINDING P
Experiment X-ray diffraction
Number of Models  1

   Database       ID code    StatusCoordinate files
        Header     Asymmetric unit     Biological unit  
PDB   1K9I     released     available     available     Quaternary Structure Server  
Asymmetric unit from PDB
 Unit     Type     Name   Chain ID   Residues   Atoms   Hetatoms 
1  Protein   MDC-SIGN1B TYPE I ISOFORM  A 128 1042 0
2  Protein   MDC-SIGN1B TYPE I ISOFORM  B 128 1042 0
3  Protein   MDC-SIGN1B TYPE I ISOFORM  C 128 1042 0
4  Protein   MDC-SIGN1B TYPE I ISOFORM  D 132 1070 0
5  Protein   MDC-SIGN1B TYPE I ISOFORM  E 128 1042 0
6  Protein   MDC-SIGN1B TYPE I ISOFORM  F 128 1042 0
7  Protein   MDC-SIGN1B TYPE I ISOFORM  G 128 1042 0
8  Protein   MDC-SIGN1B TYPE I ISOFORM  H 127 1037 0
9  Protein   MDC-SIGN1B TYPE I ISOFORM  I 128 1042 0
10  Protein   MDC-SIGN1B TYPE I ISOFORM  J 128 1042 0
11  Ligand    K 5 0 62
12  Ligand    L 5 0 62
13  Ligand    M 5 0 62
14  Ligand    N 5 0 62
15  Ligand    O 5 0 62
16  Ligand   MDC-SIGN1B TYPE I ISOFORM  A 3 0 3
17  Ligand   MDC-SIGN1B TYPE I ISOFORM  B 3 0 3
18  Ligand   MDC-SIGN1B TYPE I ISOFORM  C 3 0 3
19  Ligand   MDC-SIGN1B TYPE I ISOFORM  D 3 0 3
20  Ligand   MDC-SIGN1B TYPE I ISOFORM  E 3 0 3
21  Ligand   MDC-SIGN1B TYPE I ISOFORM  F 3 0 3
22  Ligand   MDC-SIGN1B TYPE I ISOFORM  G 3 0 3
23  Ligand   MDC-SIGN1B TYPE I ISOFORM  H 3 0 3
24  Ligand   MDC-SIGN1B TYPE I ISOFORM  I 3 0 3
25  Ligand   MDC-SIGN1B TYPE I ISOFORM  J 3 0 3
26 Water     252 0 252
total       1590 10443 592
Proteins
Unit 1 PRO255 CYS256 PRO257 TRP258 GLU259 TRP260 THR261 PHE262 PHE263 GLN264 GLY265 ASN266 CYS267 TYR268 PHE269 MET270 SER271 ASN272 SER273 GLN274 ARG275 ASN276 TRP277 HIS278 ASP279 SER280 ILE281 THR282 ALA283 CYS284 LYS285 GLU286 VAL287 GLY288 ALA289 GLN290 LEU291 VAL292 VAL293 ILE294 LYS295 SER296 ALA297 GLU298 GLU299 GLN300 ASN301 PHE302 LEU303 GLN304 LEU305 GLN306 SER307 SER308 ARG309 SER310 ASN311 ARG312 PHE313 THR314 TRP315 MET316 GLY317 LEU318 SER319 ASP320 LEU321 ASN322 GLN323 GLU324 GLY325 THR326 TRP327 GLN328 TRP329 VAL330 ASP331 GLY332 SER333 PRO334 LEU335 LEU336 PRO337 SER338 PHE339 LYS340 GLN341 TYR342 TRP343 ASN344 ARG345 GLY346 GLU347 PRO348 ASN349 ASN350 VAL351 GLY352 GLU353 GLU354 ASP355 CYS356 ALA357 GLU358 PHE359 SER360 GLY361 ASN362 GLY363 TRP364 ASN365 ASP366 ASP367 LYS368 CYS369 ASN370 LEU371 ALA372 LYS373 PHE374 TRP375 ILE376 CYS377 LYS378 LYS379 SER380 ALA381 ALA382
Unit 2 PRO255 CYS256 PRO257 TRP258 GLU259 TRP260 THR261 PHE262 PHE263 GLN264 GLY265 ASN266 CYS267 TYR268 PHE269 MET270 SER271 ASN272 SER273 GLN274 ARG275 ASN276 TRP277 HIS278 ASP279 SER280 ILE281 THR282 ALA283 CYS284 LYS285 GLU286 VAL287 GLY288 ALA289 GLN290 LEU291 VAL292 VAL293 ILE294 LYS295 SER296 ALA297 GLU298 GLU299 GLN300 ASN301 PHE302 LEU303 GLN304 LEU305 GLN306 SER307 SER308 ARG309 SER310 ASN311 ARG312 PHE313 THR314 TRP315 MET316 GLY317 LEU318 SER319 ASP320 LEU321 ASN322 GLN323 GLU324 GLY325 THR326 TRP327 GLN328 TRP329 VAL330 ASP331 GLY332 SER333 PRO334 LEU335 LEU336 PRO337 SER338 PHE339 LYS340 GLN341 TYR342 TRP343 ASN344 ARG345 GLY346 GLU347 PRO348 ASN349 ASN350 VAL351 GLY352 GLU353 GLU354 ASP355 CYS356 ALA357 GLU358 PHE359 SER360 GLY361 ASN362 GLY363 TRP364 ASN365 ASP366 ASP367 LYS368 CYS369 ASN370 LEU371 ALA372 LYS373 PHE374 TRP375 ILE376 CYS377 LYS378 LYS379 SER380 ALA381 ALA382
Unit 3 PRO255 CYS256 PRO257 TRP258 GLU259 TRP260 THR261 PHE262 PHE263 GLN264 GLY265 ASN266 CYS267 TYR268 PHE269 MET270 SER271 ASN272 SER273 GLN274 ARG275 ASN276 TRP277 HIS278 ASP279 SER280 ILE281 THR282 ALA283 CYS284 LYS285 GLU286 VAL287 GLY288 ALA289 GLN290 LEU291 VAL292 VAL293 ILE294 LYS295 SER296 ALA297 GLU298 GLU299 GLN300 ASN301 PHE302 LEU303 GLN304 LEU305 GLN306 SER307 SER308 ARG309 SER310 ASN311 ARG312 PHE313 THR314 TRP315 MET316 GLY317 LEU318 SER319 ASP320 LEU321 ASN322 GLN323 GLU324 GLY325 THR326 TRP327 GLN328 TRP329 VAL330 ASP331 GLY332 SER333 PRO334 LEU335 LEU336 PRO337 SER338 PHE339 LYS340 GLN341 TYR342 TRP343 ASN344 ARG345 GLY346 GLU347 PRO348 ASN349 ASN350 VAL351 GLY352 GLU353 GLU354 ASP355 CYS356 ALA357 GLU358 PHE359 SER360 GLY361 ASN362 GLY363 TRP364 ASN365 ASP366 ASP367 LYS368 CYS369 ASN370 LEU371 ALA372 LYS373 PHE374 TRP375 ILE376 CYS377 LYS378 LYS379 SER380 ALA381 ALA382
Unit 4 CYS253 HIS254 PRO255 CYS256 PRO257 TRP258 GLU259 TRP260 THR261 PHE262 PHE263 GLN264 GLY265 ASN266 CYS267 TYR268 PHE269 MET270 SER271 ASN272 SER273 GLN274 ARG275 ASN276 TRP277 HIS278 ASP279 SER280 ILE281 THR282 ALA283 CYS284 LYS285 GLU286 VAL287 GLY288 ALA289 GLN290 LEU291 VAL292 VAL293 ILE294 LYS295 SER296 ALA297 GLU298 GLU299 GLN300 ASN301 PHE302 LEU303 GLN304 LEU305 GLN306 SER307 SER308 ARG309 SER310 ASN311 ARG312 PHE313 THR314 TRP315 MET316 GLY317 LEU318 SER319 ASP320 LEU321 ASN322 GLN323 GLU324 GLY325 THR326 TRP327 GLN328 TRP329 VAL330 ASP331 GLY332 SER333 PRO334 LEU335 LEU336 PRO337 SER338 PHE339 LYS340 GLN341 TYR342 TRP343 ASN344 ARG345 GLY346 GLU347 PRO348 ASN349 ASN350 VAL351 GLY352 GLU353 GLU354 ASP355 CYS356 ALA357 GLU358 PHE359 SER360 GLY361 ASN362 GLY363 TRP364 ASN365 ASP366 ASP367 LYS368 CYS369 ASN370 LEU371 ALA372 LYS373 PHE374 TRP375 ILE376 CYS377 LYS378 LYS379 SER380 ALA381 ALA382 SER383 CYS384
Unit 5 PRO255 CYS256 PRO257 TRP258 GLU259 TRP260 THR261 PHE262 PHE263 GLN264 GLY265 ASN266 CYS267 TYR268 PHE269 MET270 SER271 ASN272 SER273 GLN274 ARG275 ASN276 TRP277 HIS278 ASP279 SER280 ILE281 THR282 ALA283 CYS284 LYS285 GLU286 VAL287 GLY288 ALA289 GLN290 LEU291 VAL292 VAL293 ILE294 LYS295 SER296 ALA297 GLU298 GLU299 GLN300 ASN301 PHE302 LEU303 GLN304 LEU305 GLN306 SER307 SER308 ARG309 SER310 ASN311 ARG312 PHE313 THR314 TRP315 MET316 GLY317 LEU318 SER319 ASP320 LEU321 ASN322 GLN323 GLU324 GLY325 THR326 TRP327 GLN328 TRP329 VAL330 ASP331 GLY332 SER333 PRO334 LEU335 LEU336 PRO337 SER338 PHE339 LYS340 GLN341 TYR342 TRP343 ASN344 ARG345 GLY346 GLU347 PRO348 ASN349 ASN350 VAL351 GLY352 GLU353 GLU354 ASP355 CYS356 ALA357 GLU358 PHE359 SER360 GLY361 ASN362 GLY363 TRP364 ASN365 ASP366 ASP367 LYS368 CYS369 ASN370 LEU371 ALA372 LYS373 PHE374 TRP375 ILE376 CYS377 LYS378 LYS379 SER380 ALA381 ALA382
Unit 6 PRO255 CYS256 PRO257 TRP258 GLU259 TRP260 THR261 PHE262 PHE263 GLN264 GLY265 ASN266 CYS267 TYR268 PHE269 MET270 SER271 ASN272 SER273 GLN274 ARG275 ASN276 TRP277 HIS278 ASP279 SER280 ILE281 THR282 ALA283 CYS284 LYS285 GLU286 VAL287 GLY288 ALA289 GLN290 LEU291 VAL292 VAL293 ILE294 LYS295 SER296 ALA297 GLU298 GLU299 GLN300 ASN301 PHE302 LEU303 GLN304 LEU305 GLN306 SER307 SER308 ARG309 SER310 ASN311 ARG312 PHE313 THR314 TRP315 MET316 GLY317 LEU318 SER319 ASP320 LEU321 ASN322 GLN323 GLU324 GLY325 THR326 TRP327 GLN328 TRP329 VAL330 ASP331 GLY332 SER333 PRO334 LEU335 LEU336 PRO337 SER338 PHE339 LYS340 GLN341 TYR342 TRP343 ASN344 ARG345 GLY346 GLU347 PRO348 ASN349 ASN350 VAL351 GLY352 GLU353 GLU354 ASP355 CYS356 ALA357 GLU358 PHE359 SER360 GLY361 ASN362 GLY363 TRP364 ASN365 ASP366 ASP367 LYS368 CYS369 ASN370 LEU371 ALA372 LYS373 PHE374 TRP375 ILE376 CYS377 LYS378 LYS379 SER380 ALA381 ALA382
Unit 7 PRO255 CYS256 PRO257 TRP258 GLU259 TRP260 THR261 PHE262 PHE263 GLN264 GLY265 ASN266 CYS267 TYR268 PHE269 MET270 SER271 ASN272 SER273 GLN274 ARG275 ASN276 TRP277 HIS278 ASP279 SER280 ILE281 THR282 ALA283 CYS284 LYS285 GLU286 VAL287 GLY288 ALA289 GLN290 LEU291 VAL292 VAL293 ILE294 LYS295 SER296 ALA297 GLU298 GLU299 GLN300 ASN301 PHE302 LEU303 GLN304 LEU305 GLN306 SER307 SER308 ARG309 SER310 ASN311 ARG312 PHE313 THR314 TRP315 MET316 GLY317 LEU318 SER319 ASP320 LEU321 ASN322 GLN323 GLU324 GLY325 THR326 TRP327 GLN328 TRP329 VAL330 ASP331 GLY332 SER333 PRO334 LEU335 LEU336 PRO337 SER338 PHE339 LYS340 GLN341 TYR342 TRP343 ASN344 ARG345 GLY346 GLU347 PRO348 ASN349 ASN350 VAL351 GLY352 GLU353 GLU354 ASP355 CYS356 ALA357 GLU358 PHE359 SER360 GLY361 ASN362 GLY363 TRP364 ASN365 ASP366 ASP367 LYS368 CYS369 ASN370 LEU371 ALA372 LYS373 PHE374 TRP375 ILE376 CYS377 LYS378 LYS379 SER380 ALA381 ALA382
Unit 8 PRO255 CYS256 PRO257 TRP258 GLU259 TRP260 THR261 PHE262 PHE263 GLN264 GLY265 ASN266 CYS267 TYR268 PHE269 MET270 SER271 ASN272 SER273 GLN274 ARG275 ASN276 TRP277 HIS278 ASP279 SER280 ILE281 THR282 ALA283 CYS284 LYS285 GLU286 VAL287 GLY288 ALA289 GLN290 LEU291 VAL292 VAL293 ILE294 LYS295 SER296 ALA297 GLU298 GLU299 GLN300 ASN301 PHE302 LEU303 GLN304 LEU305 GLN306 SER307 SER308 ARG309 SER310 ASN311 ARG312 PHE313 THR314 TRP315 MET316 GLY317 LEU318 SER319 ASP320 LEU321 ASN322 GLN323 GLU324 GLY325 THR326 TRP327 GLN328 TRP329 VAL330 ASP331 GLY332 SER333 PRO334 LEU335 LEU336 PRO337 SER338 PHE339 LYS340 GLN341 TYR342 TRP343 ASN344 ARG345 GLY346 GLU347 PRO348 ASN349 ASN350 VAL351 GLY352 GLU353 GLU354 ASP355 CYS356 ALA357 GLU358 PHE359 SER360 GLY361 ASN362 GLY363 TRP364 ASN365 ASP366 ASP367 LYS368 CYS369 ASN370 LEU371 ALA372 LYS373 PHE374 TRP375 ILE376 CYS377 LYS378 LYS379 SER380 ALA381
Unit 9 PRO255 CYS256 PRO257 TRP258 GLU259 TRP260 THR261 PHE262 PHE263 GLN264 GLY265 ASN266 CYS267 TYR268 PHE269 MET270 SER271 ASN272 SER273 GLN274 ARG275 ASN276 TRP277 HIS278 ASP279 SER280 ILE281 THR282 ALA283 CYS284 LYS285 GLU286 VAL287 GLY288 ALA289 GLN290 LEU291 VAL292 VAL293 ILE294 LYS295 SER296 ALA297 GLU298 GLU299 GLN300 ASN301 PHE302 LEU303 GLN304 LEU305 GLN306 SER307 SER308 ARG309 SER310 ASN311 ARG312 PHE313 THR314 TRP315 MET316 GLY317 LEU318 SER319 ASP320 LEU321 ASN322 GLN323 GLU324 GLY325 THR326 TRP327 GLN328 TRP329 VAL330 ASP331 GLY332 SER333 PRO334 LEU335 LEU336 PRO337 SER338 PHE339 LYS340 GLN341 TYR342 TRP343 ASN344 ARG345 GLY346 GLU347 PRO348 ASN349 ASN350 VAL351 GLY352 GLU353 GLU354 ASP355 CYS356 ALA357 GLU358 PHE359 SER360 GLY361 ASN362 GLY363 TRP364 ASN365 ASP366 ASP367 LYS368 CYS369 ASN370 LEU371 ALA372 LYS373 PHE374 TRP375 ILE376 CYS377 LYS378 LYS379 SER380 ALA381 ALA382
Unit 10 PRO255 CYS256 PRO257 TRP258 GLU259 TRP260 THR261 PHE262 PHE263 GLN264 GLY265 ASN266 CYS267 TYR268 PHE269 MET270 SER271 ASN272 SER273 GLN274 ARG275 ASN276 TRP277 HIS278 ASP279 SER280 ILE281 THR282 ALA283 CYS284 LYS285 GLU286 VAL287 GLY288 ALA289 GLN290 LEU291 VAL292 VAL293 ILE294 LYS295 SER296 ALA297 GLU298 GLU299 GLN300 ASN301 PHE302 LEU303 GLN304 LEU305 GLN306 SER307 SER308 ARG309 SER310 ASN311 ARG312 PHE313 THR314 TRP315 MET316 GLY317 LEU318 SER319 ASP320 LEU321 ASN322 GLN323 GLU324 GLY325 THR326 TRP327 GLN328 TRP329 VAL330 ASP331 GLY332 SER333 PRO334 LEU335 LEU336 PRO337 SER338 PHE339 LYS340 GLN341 TYR342 TRP343 ASN344 ARG345 GLY346 GLU347 PRO348 ASN349 ASN350 VAL351 GLY352 GLU353 GLU354 ASP355 CYS356 ALA357 GLU358 PHE359 SER360 GLY361 ASN362 GLY363 TRP364 ASN365 ASP366 ASP367 LYS368 CYS369 ASN370 LEU371 ALA372 LYS373 PHE374 TRP375 ILE376 CYS377 LYS378 LYS379 SER380 ALA381 ALA382
Ligands
Unit 11 MAN1 MAN2 NAG3 MAN4 NAG5
Unit 12 MAN1 MAN2 NAG3 MAN4 NAG5
Unit 13 MAN1 MAN2 NAG3 MAN4 NAG5
Unit 14 MAN1 MAN2 NAG3 MAN4 NAG5
Unit 15 MAN1 MAN2 NAG3 MAN4 NAG5
Unit 16 CA405 CA406 CA407
Unit 17 CA501 CA502 CA503
Unit 18 CA601 CA602 CA603
Unit 19 CA701 CA702 CA703
Unit 20 CA801 CA802 CA803
Unit 21 CA901 CA902 CA903
Unit 22 CA1001 CA1002 CA1003
Unit 23 CA1101 CA1102 CA1103
Unit 24 CA1201 CA1202 CA1203
Unit 25 CA1301 CA1302 CA1303
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Perl script:    PDBscan.pl  (15 Sep 2016)
Author:    Peter Slickers  (slickers@leibniz-fli.de),  IMB Jena,  Germany