1HI9 - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: ZN-DEPENDENT D-AMINOPEPTIDASE DPPA FROM BACILLUS SUBTILIS, A COMPARTMENTALIZING PROTEASE.
• Keywords: HYDROLASE (PROTEASE), PROTEASE, D-AMINOPEPTIDASE, DECAMER, S COMPARTMENTALIZING
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	1HI9	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	DIPEPTIDE TRANSPORT PROTEIN DPPA	A	274	2114	0
2	Protein	DIPEPTIDE TRANSPORT PROTEIN DPPA	B	274	2114	0
3	Protein	DIPEPTIDE TRANSPORT PROTEIN DPPA	C	274	2114	0
4	Protein	DIPEPTIDE TRANSPORT PROTEIN DPPA	D	274	2114	0
5	Protein	DIPEPTIDE TRANSPORT PROTEIN DPPA	E	274	2114	0
6	Ligand	DIPEPTIDE TRANSPORT PROTEIN DPPA	A	2	0	2
7	Ligand	DIPEPTIDE TRANSPORT PROTEIN DPPA	B	2	0	2
8	Ligand	DIPEPTIDE TRANSPORT PROTEIN DPPA	C	2	0	2
9	Ligand	DIPEPTIDE TRANSPORT PROTEIN DPPA	D	2	0	2
10	Ligand	DIPEPTIDE TRANSPORT PROTEIN DPPA	E	2	0	2
11	Water			247	0	247
total				1627	10570	257

Proteins

Unit 1	MET 1 LYS 2 LEU 3 TYR 4 MET 5 SER 6 VAL 7 ASP 8 MET 9 GLU 10 GLY 11 ILE 12 SER 13 GLY 14 LEU 15 PRO 16 ASP 17 ASP 18 THR 19 PHE 20 VAL 21 ASP 22 SER 23 GLY 24 LYS 25 ARG 26 ASN 27 TYR 28 GLU 29 ARG 30 GLY 31 ARG 32 LEU 33 ILE 34 MET 35 THR 36 GLU 37 GLU 38 ALA 39 ASN 40 TYR 41 CYS 42 ILE 43 ALA 44 GLU 45 ALA 46 PHE 47 ASN 48 SER 49 GLY 50 CYS 51 THR 52 GLU 53 VAL 54 LEU 55 VAL 56 ASN 57 ASP 58 SER 59 HIS 60 SER 61 LYS 62 MET 63 ASN 64 ASN 65 LEU 66 MET 67 VAL 68 GLU 69 LYS 70 LEU 71 HIS 72 PRO 73 GLU 74 ALA 75 ASP 76 LEU 77 ILE 78 SER 79 GLY 80 ASP 81 VAL 82 LYS 83 PRO 84 PHE 85 SER 86 MET 87 VAL 88 GLU 89 GLY 90 LEU 91 ASP 92 ASP 93 THR 94 PHE 95 ARG 96 GLY 97 ALA 98 LEU 99 PHE 100 LEU 101 GLY 102 TYR 103 HIS 104 ALA 105 ARG 106 ALA 107 SER 108 THR 109 PRO 110 GLY 111 VAL 112 MET 113 SER 114 HIS 115 SER 116 MET 117 ILE 118 PHE 119 GLY 120 VAL 121 ARG 122 HIS 123 PHE 124 TYR 125 ILE 126 ASN 127 ASP 128 ARG 129 PRO 130 VAL 131 GLY 132 GLU 133 LEU 134 GLY 135 LEU 136 ASN 137 ALA 138 TYR 139 VAL 140 ALA 141 GLY 142 TYR 143 TYR 144 ASP 145 VAL 146 PRO 147 VAL 148 LEU 149 MET 150 VAL 151 ALA 152 GLY 153 ASP 154 ASP 155 ARG 156 ALA 157 ALA 158 LYS 159 GLU 160 ALA 161 GLU 162 GLU 163 LEU 164 ILE 165 PRO 166 ASN 167 VAL 168 THR 169 THR 170 ALA 171 ALA 172 VAL 173 LYS 174 GLN 175 THR 176 ILE 177 SER 178 ARG 179 SER 180 ALA 181 VAL 182 LYS 183 CYS 184 LEU 185 SER 186 PRO 187 ALA 188 LYS 189 ARG 190 GLY 191 ARG 192 LEU 193 LEU 194 THR 195 GLU 196 LYS 197 THR 198 ALA 199 PHE 200 ALA 201 LEU 202 GLN 203 ASN 204 LYS 205 ASP 206 LYS 207 VAL 208 LYS 209 PRO 210 LEU 211 THR 212 PRO 213 PRO 214 ASP 215 ARG 216 PRO 217 VAL 218 LEU 219 SER 220 ILE 221 GLU 222 PHE 223 ALA 224 ASN 225 TYR 226 GLY 227 GLN 228 ALA 229 GLU 230 TRP 231 ALA 232 ASN 233 LEU 234 MET 235 PRO 236 GLY 237 THR 238 GLU 239 ILE 240 LYS 241 THR 242 GLY 243 THR 244 THR 245 THR 246 VAL 247 GLN 248 PHE 249 GLN 250 ALA 251 LYS 252 ASP 253 MET 254 LEU 255 GLU 256 ALA 257 TYR 258 GLN 259 ALA 260 MET 261 LEU 262 VAL 263 MET 264 THR 265 GLU 266 LEU 267 ALA 268 MET 269 ARG 270 THR 271 SER 272 PHE 273 CYS 274
Unit 2	MET 1 LYS 2 LEU 3 TYR 4 MET 5 SER 6 VAL 7 ASP 8 MET 9 GLU 10 GLY 11 ILE 12 SER 13 GLY 14 LEU 15 PRO 16 ASP 17 ASP 18 THR 19 PHE 20 VAL 21 ASP 22 SER 23 GLY 24 LYS 25 ARG 26 ASN 27 TYR 28 GLU 29 ARG 30 GLY 31 ARG 32 LEU 33 ILE 34 MET 35 THR 36 GLU 37 GLU 38 ALA 39 ASN 40 TYR 41 CYS 42 ILE 43 ALA 44 GLU 45 ALA 46 PHE 47 ASN 48 SER 49 GLY 50 CYS 51 THR 52 GLU 53 VAL 54 LEU 55 VAL 56 ASN 57 ASP 58 SER 59 HIS 60 SER 61 LYS 62 MET 63 ASN 64 ASN 65 LEU 66 MET 67 VAL 68 GLU 69 LYS 70 LEU 71 HIS 72 PRO 73 GLU 74 ALA 75 ASP 76 LEU 77 ILE 78 SER 79 GLY 80 ASP 81 VAL 82 LYS 83 PRO 84 PHE 85 SER 86 MET 87 VAL 88 GLU 89 GLY 90 LEU 91 ASP 92 ASP 93 THR 94 PHE 95 ARG 96 GLY 97 ALA 98 LEU 99 PHE 100 LEU 101 GLY 102 TYR 103 HIS 104 ALA 105 ARG 106 ALA 107 SER 108 THR 109 PRO 110 GLY 111 VAL 112 MET 113 SER 114 HIS 115 SER 116 MET 117 ILE 118 PHE 119 GLY 120 VAL 121 ARG 122 HIS 123 PHE 124 TYR 125 ILE 126 ASN 127 ASP 128 ARG 129 PRO 130 VAL 131 GLY 132 GLU 133 LEU 134 GLY 135 LEU 136 ASN 137 ALA 138 TYR 139 VAL 140 ALA 141 GLY 142 TYR 143 TYR 144 ASP 145 VAL 146 PRO 147 VAL 148 LEU 149 MET 150 VAL 151 ALA 152 GLY 153 ASP 154 ASP 155 ARG 156 ALA 157 ALA 158 LYS 159 GLU 160 ALA 161 GLU 162 GLU 163 LEU 164 ILE 165 PRO 166 ASN 167 VAL 168 THR 169 THR 170 ALA 171 ALA 172 VAL 173 LYS 174 GLN 175 THR 176 ILE 177 SER 178 ARG 179 SER 180 ALA 181 VAL 182 LYS 183 CYS 184 LEU 185 SER 186 PRO 187 ALA 188 LYS 189 ARG 190 GLY 191 ARG 192 LEU 193 LEU 194 THR 195 GLU 196 LYS 197 THR 198 ALA 199 PHE 200 ALA 201 LEU 202 GLN 203 ASN 204 LYS 205 ASP 206 LYS 207 VAL 208 LYS 209 PRO 210 LEU 211 THR 212 PRO 213 PRO 214 ASP 215 ARG 216 PRO 217 VAL 218 LEU 219 SER 220 ILE 221 GLU 222 PHE 223 ALA 224 ASN 225 TYR 226 GLY 227 GLN 228 ALA 229 GLU 230 TRP 231 ALA 232 ASN 233 LEU 234 MET 235 PRO 236 GLY 237 THR 238 GLU 239 ILE 240 LYS 241 THR 242 GLY 243 THR 244 THR 245 THR 246 VAL 247 GLN 248 PHE 249 GLN 250 ALA 251 LYS 252 ASP 253 MET 254 LEU 255 GLU 256 ALA 257 TYR 258 GLN 259 ALA 260 MET 261 LEU 262 VAL 263 MET 264 THR 265 GLU 266 LEU 267 ALA 268 MET 269 ARG 270 THR 271 SER 272 PHE 273 CYS 274
Unit 3	MET 1 LYS 2 LEU 3 TYR 4 MET 5 SER 6 VAL 7 ASP 8 MET 9 GLU 10 GLY 11 ILE 12 SER 13 GLY 14 LEU 15 PRO 16 ASP 17 ASP 18 THR 19 PHE 20 VAL 21 ASP 22 SER 23 GLY 24 LYS 25 ARG 26 ASN 27 TYR 28 GLU 29 ARG 30 GLY 31 ARG 32 LEU 33 ILE 34 MET 35 THR 36 GLU 37 GLU 38 ALA 39 ASN 40 TYR 41 CYS 42 ILE 43 ALA 44 GLU 45 ALA 46 PHE 47 ASN 48 SER 49 GLY 50 CYS 51 THR 52 GLU 53 VAL 54 LEU 55 VAL 56 ASN 57 ASP 58 SER 59 HIS 60 SER 61 LYS 62 MET 63 ASN 64 ASN 65 LEU 66 MET 67 VAL 68 GLU 69 LYS 70 LEU 71 HIS 72 PRO 73 GLU 74 ALA 75 ASP 76 LEU 77 ILE 78 SER 79 GLY 80 ASP 81 VAL 82 LYS 83 PRO 84 PHE 85 SER 86 MET 87 VAL 88 GLU 89 GLY 90 LEU 91 ASP 92 ASP 93 THR 94 PHE 95 ARG 96 GLY 97 ALA 98 LEU 99 PHE 100 LEU 101 GLY 102 TYR 103 HIS 104 ALA 105 ARG 106 ALA 107 SER 108 THR 109 PRO 110 GLY 111 VAL 112 MET 113 SER 114 HIS 115 SER 116 MET 117 ILE 118 PHE 119 GLY 120 VAL 121 ARG 122 HIS 123 PHE 124 TYR 125 ILE 126 ASN 127 ASP 128 ARG 129 PRO 130 VAL 131 GLY 132 GLU 133 LEU 134 GLY 135 LEU 136 ASN 137 ALA 138 TYR 139 VAL 140 ALA 141 GLY 142 TYR 143 TYR 144 ASP 145 VAL 146 PRO 147 VAL 148 LEU 149 MET 150 VAL 151 ALA 152 GLY 153 ASP 154 ASP 155 ARG 156 ALA 157 ALA 158 LYS 159 GLU 160 ALA 161 GLU 162 GLU 163 LEU 164 ILE 165 PRO 166 ASN 167 VAL 168 THR 169 THR 170 ALA 171 ALA 172 VAL 173 LYS 174 GLN 175 THR 176 ILE 177 SER 178 ARG 179 SER 180 ALA 181 VAL 182 LYS 183 CYS 184 LEU 185 SER 186 PRO 187 ALA 188 LYS 189 ARG 190 GLY 191 ARG 192 LEU 193 LEU 194 THR 195 GLU 196 LYS 197 THR 198 ALA 199 PHE 200 ALA 201 LEU 202 GLN 203 ASN 204 LYS 205 ASP 206 LYS 207 VAL 208 LYS 209 PRO 210 LEU 211 THR 212 PRO 213 PRO 214 ASP 215 ARG 216 PRO 217 VAL 218 LEU 219 SER 220 ILE 221 GLU 222 PHE 223 ALA 224 ASN 225 TYR 226 GLY 227 GLN 228 ALA 229 GLU 230 TRP 231 ALA 232 ASN 233 LEU 234 MET 235 PRO 236 GLY 237 THR 238 GLU 239 ILE 240 LYS 241 THR 242 GLY 243 THR 244 THR 245 THR 246 VAL 247 GLN 248 PHE 249 GLN 250 ALA 251 LYS 252 ASP 253 MET 254 LEU 255 GLU 256 ALA 257 TYR 258 GLN 259 ALA 260 MET 261 LEU 262 VAL 263 MET 264 THR 265 GLU 266 LEU 267 ALA 268 MET 269 ARG 270 THR 271 SER 272 PHE 273 CYS 274
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Ligands

Unit 6	ZN 300 ZN 301
Unit 7	ZN 300 ZN 301
Unit 8	ZN 300 ZN 301
Unit 9	ZN 300 ZN 301
Unit 10	ZN 300 ZN 301