Jena Library of Biological Macromolecules - Home Page [Image Library Home] [Image Library Entry]

Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

Title THE BLUETONGUE VIRUS (BTV) CORE BINDS DSRNA
Keywords VIRUS/VIRAL PROTEIN/RNA, VIRUS, VIRAL PROTEIN, RNA
Experiment X-ray diffraction
Number of Models  1


   Database       ID code    StatusCoordinate files
        Header     Asymmetric unit     Biological unit  

PDB   1H1K     released     available     available     Quaternary Structure Server  


Asymmetric unit from PDB
 Unit     Type     Name   Chain ID   Residues   Atoms   Hetatoms 
1  RNA    I 412 9061 0
2  RNA    J 276 6069 0
3  RNA    K 265 5827 0
4  RNA    L 412 8237 0
5  RNA    M 276 5517 0
6  RNA    N 265 5297 0
total       1906 40008 0

Nucleic acids
Unit 1 A1 A2 A3 A4 A5 A6 A7 A8 A9 A10 A11 A12 A13 A14 A15 A16 A17 A18 A19 A20 A21 A22 A23 A24 A25 A26 A27 A28 A29 A30 A31 A32 A33 A34 A35 A36 A37 A38 A39 A40 A41 A42 A43 A44 A45 A46 A47 A48 A49 A50 A51 A52 A53 A54 A55 A56 A57 A58 A59 A60 A61 A62 A63 A64 A65 A66 A67 A68 A69 A70 A71 A72 A73 A74 A75 A76 A77 A78 A79 A80 A81 A82 A83 A84 A85 A86 A87 A88 A89 A90 A91 A92 A93 A94 A95 A96 A97 A98 A99 A100 A101 A102 A103 A104 A105 A106 A107 A108 A109 A110 A111 A112 A113 A114 A115 A116 A117 A118 A119 A120 A121 A122 A123 A124 A125 A126 A127 A128 A129 A130 A131 A132 A133 A134 A135 A136 A137 A138 A139 A140 A141 A142 A143 A144 A145 A146 A147 A148 A149 A150 A151 A152 A153 A154 A155 A156 A157 A158 A159 A160 A161 A162 A163 A164 A165 A166 A167 A168 A169 A170 A171 A172 A173 A174 A175 A176 A177 A178 A179 A180 A181 A182 A183 A184 A185 A186 A187 A188 A189 A190 A191 A192 A193 A194 A195 A196 A197 A198 A199 A200 A201 A202 A203 A204 A205 A206 A207 A208 A209 A210 A211 A212 A213 A214 A215 A216 A217 A218 A219 A220 A221 A222 A223 A224 A225 A226 A227 A228 A229 A230 A231 A232 A233 A234 A235 A236 A237 A238 A239 A240 A241 A242 A243 A244 A245 A246 A247 A248 A249 A250 A251 A252 A253 A254 A255 A256 A257 A258 A259 A260 A261 A262 A263 A264 A265 A266 A267 A268 A269 A270 A271 A272 A273 A274 A275 A276 A277 A278 A279 A280 A281 A282 A283 A284 A285 A286 A287 A288 A289 A290 A291 A292 A293 A294 A295 A296 A297 A298 A299 A300 A301 A302 A303 A304 A305 A306 A307 A308 A309 A310 A311 A312 A313 A314 A315 A316 A317 A318 A319 A320 A321 A322 A323 A324 A325 A326 A327 A328 A329 A330 A331 A332 A333 A334 A335 A336 A337 A338 A339 A340 A341 A342 A343 A344 A345 A346 A347 A348 A349 A350 A351 A352 A353 A354 A355 A356 A357 A358 A359 A360 A361 A362 A363 A364 A365 A366 A367 A368 A369 A370 A371 A372 A373 A374 A375 A376 A377 A378 A379 A380 A381 A382 A383 A384 A385 A386 A387 A388 A389 A390 A391 A392 A393 A394 A395 A396 A397 A398 A399 A400 A401 A402 A403 A404 A405 A406 A407 A408 A409 A410 A411 A412
Unit 2 A1 A2 A3 A4 A5 A6 A7 A8 A9 A10 A11 A12 A13 A14 A15 A16 A17 A18 A19 A20 A21 A22 A23 A24 A25 A26 A27 A28 A29 A30 A31 A32 A33 A34 A35 A36 A37 A38 A39 A40 A41 A42 A43 A44 A45 A46 A47 A48 A49 A50 A51 A52 A53 A54 A55 A56 A57 A58 A59 A60 A61 A62 A63 A64 A65 A66 A67 A68 A69 A70 A71 A72 A73 A74 A75 A76 A77 A78 A79 A80 A81 A82 A83 A84 A85 A86 A87 A88 A89 A90 A91 A92 A93 A94 A95 A96 A97 A98 A99 A100 A101 A102 A103 A104 A105 A106 A107 A108 A109 A110 A111 A112 A113 A114 A115 A116 A117 A118 A119 A120 A121 A122 A123 A124 A125 A126 A127 A128 A129 A130 A131 A132 A133 A134 A135 A136 A137 A138 A139 A140 A141 A142 A143 A144 A145 A146 A147 A148 A149 A150 A151 A152 A153 A154 A155 A156 A157 A158 A159 A160 A161 A162 A163 A164 A165 A166 A167 A168 A169 A170 A171 A172 A173 A174 A175 A176 A177 A178 A179 A180 A181 A182 A183 A184 A185 A186 A187 A188 A189 A190 A191 A192 A193 A194 A195 A196 A197 A198 A199 A200 A201 A202 A203 A204 A205 A206 A207 A208 A209 A210 A211 A212 A213 A214 A215 A216 A217 A218 A219 A220 A221 A222 A223 A224 A225 A226 A227 A228 A229 A230 A231 A232 A233 A234 A235 A236 A237 A238 A239 A240 A241 A242 A243 A244 A245 A246 A247 A248 A249 A250 A251 A252 A253 A254 A255 A256 A257 A258 A259 A260 A261 A262 A263 A264 A265 A266 A267 A268 A269 A270 A271 A272 A273 A274 A275 A276
Unit 3 A1 A2 A3 A4 A5 A6 A7 A8 A9 A10 A11 A12 A13 A14 A15 A16 A17 A18 A19 A20 A21 A22 A23 A24 A25 A26 A27 A28 A29 A30 A31 A32 A33 A34 A35 A36 A37 A38 A39 A40 A41 A42 A43 A44 A45 A46 A47 A48 A49 A50 A51 A52 A53 A54 A55 A56 A57 A58 A59 A60 A61 A62 A63 A64 A65 A66 A67 A68 A69 A70 A71 A72 A73 A74 A75 A76 A77 A78 A79 A80 A81 A82 A83 A84 A85 A86 A87 A88 A89 A90 A91 A92 A93 A94 A95 A96 A97 A98 A99 A100 A101 A102 A103 A104 A105 A106 A107 A108 A109 A110 A111 A112 A113 A114 A115 A116 A117 A118 A119 A120 A121 A122 A123 A124 A125 A126 A127 A128 A129 A130 A131 A132 A133 A134 A135 A136 A137 A138 A139 A140 A141 A142 A143 A144 A145 A146 A147 A148 A149 A150 A151 A152 A153 A154 A155 A156 A157 A158 A159 A160 A161 A162 A163 A164 A165 A166 A167 A168 A169 A170 A171 A172 A173 A174 A175 A176 A177 A178 A179 A180 A181 A182 A183 A184 A185 A186 A187 A188 A189 A190 A191 A192 A193 A194 A195 A196 A197 A198 A199 A200 A201 A202 A203 A204 A205 A206 A207 A208 A209 A210 A211 A212 A213 A214 A215 A216 A217 A218 A219 A220 A221 A222 A223 A224 A225 A226 A227 A228 A229 A230 A231 A232 A233 A234 A235 A236 A237 A238 A239 A240 A241 A242 A243 A244 A245 A246 A247 A248 A249 A250 A251 A252 A253 A254 A255 A256 A257 A258 A259 A260 A261 A262 A263 A264 A265
Unit 4 U413 U414 U415 U416 U417 U418 U419 U420 U421 U422 U423 U424 U425 U426 U427 U428 U429 U430 U431 U432 U433 U434 U435 U436 U437 U438 U439 U440 U441 U442 U443 U444 U445 U446 U447 U448 U449 U450 U451 U452 U453 U454 U455 U456 U457 U458 U459 U460 U461 U462 U463 U464 U465 U466 U467 U468 U469 U470 U471 U472 U473 U474 U475 U476 U477 U478 U479 U480 U481 U482 U483 U484 U485 U486 U487 U488 U489 U490 U491 U492 U493 U494 U495 U496 U497 U498 U499 U500 U501 U502 U503 U504 U505 U506 U507 U508 U509 U510 U511 U512 U513 U514 U515 U516 U517 U518 U519 U520 U521 U522 U523 U524 U525 U526 U527 U528 U529 U530 U531 U532 U533 U534 U535 U536 U537 U538 U539 U540 U541 U542 U543 U544 U545 U546 U547 U548 U549 U550 U551 U552 U553 U554 U555 U556 U557 U558 U559 U560 U561 U562 U563 U564 U565 U566 U567 U568 U569 U570 U571 U572 U573 U574 U575 U576 U577 U578 U579 U580 U581 U582 U583 U584 U585 U586 U587 U588 U589 U590 U591 U592 U593 U594 U595 U596 U597 U598 U599 U600 U601 U602 U603 U604 U605 U606 U607 U608 U609 U610 U611 U612 U613 U614 U615 U616 U617 U618 U619 U620 U621 U622 U623 U624 U625 U626 U627 U628 U629 U630 U631 U632 U633 U634 U635 U636 U637 U638 U639 U640 U641 U642 U643 U644 U645 U646 U647 U648 U649 U650 U651 U652 U653 U654 U655 U656 U657 U658 U659 U660 U661 U662 U663 U664 U665 U666 U667 U668 U669 U670 U671 U672 U673 U674 U675 U676 U677 U678 U679 U680 U681 U682 U683 U684 U685 U686 U687 U688 U689 U690 U691 U692 U693 U694 U695 U696 U697 U698 U699 U700 U701 U702 U703 U704 U705 U706 U707 U708 U709 U710 U711 U712 U713 U714 U715 U716 U717 U718 U719 U720 U721 U722 U723 U724 U725 U726 U727 U728 U729 U730 U731 U732 U733 U734 U735 U736 U737 U738 U739 U740 U741 U742 U743 U744 U745 U746 U747 U748 U749 U750 U751 U752 U753 U754 U755 U756 U757 U758 U759 U760 U761 U762 U763 U764 U765 U766 U767 U768 U769 U770 U771 U772 U773 U774 U775 U776 U777 U778 U779 U780 U781 U782 U783 U784 U785 U786 U787 U788 U789 U790 U791 U792 U793 U794 U795 U796 U797 U798 U799 U800 U801 U802 U803 U804 U805 U806 U807 U808 U809 U810 U811 U812 U813 U814 U815 U816 U817 U818 U819 U820 U821 U822 U823 U824
Unit 5 U277 U278 U279 U280 U281 U282 U283 U284 U285 U286 U287 U288 U289 U290 U291 U292 U293 U294 U295 U296 U297 U298 U299 U300 U301 U302 U303 U304 U305 U306 U307 U308 U309 U310 U311 U312 U313 U314 U315 U316 U317 U318 U319 U320 U321 U322 U323 U324 U325 U326 U327 U328 U329 U330 U331 U332 U333 U334 U335 U336 U337 U338 U339 U340 U341 U342 U343 U344 U345 U346 U347 U348 U349 U350 U351 U352 U353 U354 U355 U356 U357 U358 U359 U360 U361 U362 U363 U364 U365 U366 U367 U368 U369 U370 U371 U372 U373 U374 U375 U376 U377 U378 U379 U380 U381 U382 U383 U384 U385 U386 U387 U388 U389 U390 U391 U392 U393 U394 U395 U396 U397 U398 U399 U400 U401 U402 U403 U404 U405 U406 U407 U408 U409 U410 U411 U412 U413 U414 U415 U416 U417 U418 U419 U420 U421 U422 U423 U424 U425 U426 U427 U428 U429 U430 U431 U432 U433 U434 U435 U436 U437 U438 U439 U440 U441 U442 U443 U444 U445 U446 U447 U448 U449 U450 U451 U452 U453 U454 U455 U456 U457 U458 U459 U460 U461 U462 U463 U464 U465 U466 U467 U468 U469 U470 U471 U472 U473 U474 U475 U476 U477 U478 U479 U480 U481 U482 U483 U484 U485 U486 U487 U488 U489 U490 U491 U492 U493 U494 U495 U496 U497 U498 U499 U500 U501 U502 U503 U504 U505 U506 U507 U508 U509 U510 U511 U512 U513 U514 U515 U516 U517 U518 U519 U520 U521 U522 U523 U524 U525 U526 U527 U528 U529 U530 U531 U532 U533 U534 U535 U536 U537 U538 U539 U540 U541 U542 U543 U544 U545 U546 U547 U548 U549 U550 U551 U552
Unit 6 U266 U267 U268 U269 U270 U271 U272 U273 U274 U275 U276 U277 U278 U279 U280 U281 U282 U283 U284 U285 U286 U287 U288 U289 U290 U291 U292 U293 U294 U295 U296 U297 U298 U299 U300 U301 U302 U303 U304 U305 U306 U307 U308 U309 U310 U311 U312 U313 U314 U315 U316 U317 U318 U319 U320 U321 U322 U323 U324 U325 U326 U327 U328 U329 U330 U331 U332 U333 U334 U335 U336 U337 U338 U339 U340 U341 U342 U343 U344 U345 U346 U347 U348 U349 U350 U351 U352 U353 U354 U355 U356 U357 U358 U359 U360 U361 U362 U363 U364 U365 U366 U367 U368 U369 U370 U371 U372 U373 U374 U375 U376 U377 U378 U379 U380 U381 U382 U383 U384 U385 U386 U387 U388 U389 U390 U391 U392 U393 U394 U395 U396 U397 U398 U399 U400 U401 U402 U403 U404 U405 U406 U407 U408 U409 U410 U411 U412 U413 U414 U415 U416 U417 U418 U419 U420 U421 U422 U423 U424 U425 U426 U427 U428 U429 U430 U431 U432 U433 U434 U435 U436 U437 U438 U439 U440 U441 U442 U443 U444 U445 U446 U447 U448 U449 U450 U451 U452 U453 U454 U455 U456 U457 U458 U459 U460 U461 U462 U463 U464 U465 U466 U467 U468 U469 U470 U471 U472 U473 U474 U475 U476 U477 U478 U479 U480 U481 U482 U483 U484 U485 U486 U487 U488 U489 U490 U491 U492 U493 U494 U495 U496 U497 U498 U499 U500 U501 U502 U503 U504 U505 U506 U507 U508 U509 U510 U511 U512 U513 U514 U515 U516 U517 U518 U519 U520 U521 U522 U523 U524 U525 U526 U527 U528 U529 U530

Chirality of ribose and phosphate atoms

Check the naming of phosphate and ribose substituents. Recommended for phosphate oxygens and for ribose hydrogens in NMR structures.


Go to    [Image Library Home]    [Image Library Entry]
Perl script:    PDBscan.pl  (15 Sep 2016)
Author:    Peter Slickers  (slickers@leibniz-fli.de),  IMB Jena,  Germany