load pdb inline background [255,255,255] color cpk select ligand cpk select not ligand wireframe 40 select selected and not bonded cpk 40 select ( protein and carbon and *.CA ) or ( nucleic and *.C5* ) label "%n %r" color label black select not ( HYDROGEN or CARBON or NITROGEN or OXYGEN or PHOSPHORUS or SULPHUR ) label "%e" select carbon color green select phosphorus color magenta select not bonded cpk select all show info exit LINK O3B UDP A 404 MN MN A 405 1555 1555 2.13 LINK O1A UDP A 404 MN MN A 405 1555 1555 2.34 LINK O1A UDP B 404 MN MN B 405 1555 1555 2.27 LINK O3B UDP B 404 MN MN B 405 1555 1555 2.30 LINK O3B UDP C 404 MN MN C 405 1555 1555 2.22 LINK O1A UDP C 404 MN MN C 405 1555 1555 2.28 HETATM 6790 N1 UDP A 404 15.898 46.314 113.031 1.00 33.81 N HETATM 6791 C2 UDP A 404 14.767 45.836 112.359 1.00 34.37 C HETATM 6792 N3 UDP A 404 13.730 46.728 112.101 1.00 33.14 N HETATM 6793 C4 UDP A 404 13.821 48.046 112.510 1.00 34.14 C HETATM 6794 C5 UDP A 404 14.951 48.550 113.187 1.00 31.95 C HETATM 6795 C6 UDP A 404 16.065 47.683 113.247 1.00 34.69 C HETATM 6796 O2 UDP A 404 14.661 44.628 112.018 1.00 33.77 O HETATM 6797 O4 UDP A 404 12.869 48.746 112.241 1.00 32.48 O HETATM 6798 C1' UDP A 404 16.974 45.356 113.383 1.00 34.94 C HETATM 6799 C2' UDP A 404 17.776 44.851 112.201 1.00 34.67 C HETATM 6800 O2' UDP A 404 18.162 43.540 112.561 1.00 30.23 O HETATM 6801 C3' UDP A 404 18.925 45.847 112.210 1.00 33.69 C HETATM 6802 C4' UDP A 404 19.205 46.038 113.689 1.00 35.18 C HETATM 6803 O4' UDP A 404 17.917 45.950 114.273 1.00 39.34 O HETATM 6804 O3' UDP A 404 20.024 45.363 111.463 1.00 40.45 O HETATM 6805 C5' UDP A 404 19.905 47.339 114.106 1.00 34.75 C HETATM 6806 O5' UDP A 404 19.313 48.502 113.579 1.00 43.15 O HETATM 6807 PA UDP A 404 19.962 49.460 112.409 1.00 55.07 P HETATM 6808 O1A UDP A 404 19.866 48.832 111.053 1.00 48.85 O HETATM 6809 O2A UDP A 404 19.311 50.800 112.356 1.00 55.52 O HETATM 6810 O3A UDP A 404 21.497 49.815 112.745 1.00 64.81 O HETATM 6811 PB UDP A 404 22.332 50.690 111.654 1.00 79.72 P HETATM 6812 O1B UDP A 404 23.182 51.633 112.437 1.00 75.18 O HETATM 6813 O2B UDP A 404 21.463 51.517 110.754 1.00 78.07 O HETATM 6814 O3B UDP A 404 23.102 49.708 110.822 1.00 77.42 O HETATM 6842 N1 UDP B 404 48.825 45.417 70.184 1.00 22.41 N HETATM 6843 C2 UDP B 404 47.570 45.677 69.616 1.00 20.49 C HETATM 6844 N3 UDP B 404 47.352 45.523 68.271 1.00 16.71 N HETATM 6845 C4 UDP B 404 48.397 45.087 67.462 1.00 28.26 C HETATM 6846 C5 UDP B 404 49.667 44.804 67.984 1.00 26.33 C HETATM 6847 C6 UDP B 404 49.859 45.011 69.368 1.00 27.97 C HETATM 6848 O2 UDP B 404 46.598 46.064 70.280 1.00 26.66 O HETATM 6849 O4 UDP B 404 48.170 44.989 66.266 1.00 31.34 O HETATM 6850 C1' UDP B 404 49.030 45.637 71.638 1.00 24.51 C HETATM 6851 C2' UDP B 404 48.229 44.646 72.444 1.00 27.79 C HETATM 6852 O2' UDP B 404 48.027 45.260 73.704 1.00 25.65 O HETATM 6853 C3' UDP B 404 49.243 43.504 72.589 1.00 25.92 C HETATM 6854 C4' UDP B 404 50.508 44.294 72.874 1.00 30.21 C HETATM 6855 O4' UDP B 404 50.376 45.491 72.104 1.00 28.95 O HETATM 6856 O3' UDP B 404 48.874 42.672 73.671 1.00 30.40 O HETATM 6857 C5' UDP B 404 51.797 43.553 72.523 1.00 33.33 C HETATM 6858 O5' UDP B 404 51.674 42.904 71.279 1.00 44.51 O HETATM 6859 PA UDP B 404 51.643 41.272 71.098 1.00 53.23 P HETATM 6860 O1A UDP B 404 50.344 40.631 71.505 1.00 44.48 O HETATM 6861 O2A UDP B 404 51.991 40.895 69.713 1.00 54.44 O HETATM 6862 O3A UDP B 404 52.855 40.674 71.960 1.00 63.21 O HETATM 6863 PB UDP B 404 53.107 39.077 71.794 1.00 79.20 P HETATM 6864 O1B UDP B 404 54.595 38.887 71.922 1.00 74.32 O HETATM 6865 O2B UDP B 404 52.609 38.542 70.484 1.00 75.24 O HETATM 6866 O3B UDP B 404 52.309 38.388 72.859 1.00 76.77 O HETATM 6905 N1 UDP C 404 31.757 -0.365 92.268 1.00 43.57 N HETATM 6906 C2 UDP C 404 30.890 -0.137 91.213 1.00 47.90 C HETATM 6907 N3 UDP C 404 29.730 -0.883 91.052 1.00 49.07 N HETATM 6908 C4 UDP C 404 29.458 -1.899 91.959 1.00 49.21 C HETATM 6909 C5 UDP C 404 30.328 -2.142 93.024 1.00 45.94 C HETATM 6910 C6 UDP C 404 31.316 -1.187 93.276 1.00 45.05 C HETATM 6911 O2 UDP C 404 31.126 0.753 90.403 1.00 49.54 O HETATM 6912 O4 UDP C 404 28.427 -2.563 91.809 1.00 50.43 O HETATM 6913 C1' UDP C 404 33.007 0.445 92.408 1.00 43.81 C HETATM 6914 C2' UDP C 404 32.837 1.958 92.612 1.00 41.35 C HETATM 6915 O2' UDP C 404 34.003 2.577 92.078 1.00 37.32 O HETATM 6916 C3' UDP C 404 32.843 2.021 94.125 1.00 43.46 C HETATM 6917 C4' UDP C 404 33.941 1.040 94.477 1.00 46.17 C HETATM 6918 O4' UDP C 404 33.826 0.025 93.485 1.00 43.72 O HETATM 6919 O3' UDP C 404 33.075 3.284 94.681 1.00 39.93 O HETATM 6920 C5' UDP C 404 33.862 0.516 95.912 1.00 52.34 C HETATM 6921 O5' UDP C 404 32.560 0.050 96.206 1.00 63.84 O HETATM 6922 PA UDP C 404 31.555 0.823 97.225 1.00 66.73 P HETATM 6923 O1A UDP C 404 31.400 2.218 96.773 1.00 71.90 O HETATM 6924 O2A UDP C 404 30.184 0.250 97.262 1.00 71.27 O HETATM 6925 O3A UDP C 404 32.304 0.730 98.652 1.00 75.85 O HETATM 6926 PB UDP C 404 31.519 1.152 100.013 1.00 85.22 P HETATM 6927 O1B UDP C 404 32.410 0.863 101.173 1.00 83.81 O HETATM 6928 O2B UDP C 404 30.294 0.302 100.112 1.00 84.72 O HETATM 6929 O3B UDP C 404 31.150 2.604 99.973 1.00 82.38 O