JenaLib Home    
[Image Library Home]     [Helix Analysis Home]     [Image Library Entry]     [Helix Analysis Entry]   

Sequence, Chains, Units

Title OCTAMERIC RNA DUPLEX SOAKED IN MANGANESE(II)CHLORIDE
Keywords RNA, DUPLEX, DI- AND TRIVALENT METAL IONS
Experiment X-ray diffraction
Number of Models  1


   Database       ID code    StatusCoordinate files
        Header     Asymmetric unit     Biological unit  

PDB   4U3O     released     available     available     Quaternary Structure Server  


Asymmetric unit from PDB
 Unit     Type     Name   Chain ID   Residues   Atoms   Hetatoms 
1  RNA    A 8 167 0
2  RNA    B 8 167 0
3  Ligand   RNA (5'-R(*UP*CP*GP*UP*AP*CP*GP*A)-3')  A 2 0 2
4  Ligand   RNA (5'-R(*UP*CP*GP*UP*AP*CP*GP*A)-3')  B 2 0 2
5 Water     65 0 65
total       85 334 69

Nucleic acids
Unit 1   U1 C2 G3 U4 A5 C6 G7 A8
Unit 2   U1 C2 G3 U4 A5 C6 G7 A8

Ligands
Unit 3   MN101 MN102
Unit 4   MN101 MN102

Chirality of ribose and phosphate atoms

Check the naming of phosphate and ribose substituents. Recommended for phosphate oxygens and for ribose hydrogens in NMR structures.


Go to    [Image Library Home]    [Helix Analysis Home]    [Image Library Entry]    [Helix Analysis Entry]   

Perl script:    PDBscan.pl  (15 Sep 2016)
Author:    Peter Slickers  (slickers@leibniz-fli.de),  IMB Jena,  Germany