JenaLib Home    
[Image Library Home]     [Helix Analysis Home]     [Image Library Entry]     [Helix Analysis Entry]   

Sequence, Chains, Units

Title RNA 10MER DUPLEX WITH SIX 2'-5'-LINKAGES
Keywords 2'-5'-LINKAGE, RNA
Experiment X-ray diffraction
Number of Models  1


   Database       ID code    StatusCoordinate files
        Header     Asymmetric unit     Biological unit  

PDB   4MSR     released     available     available     Quaternary Structure Server  


Asymmetric unit from PDB
 Unit     Type     Name   Chain ID   Residues   Atoms   Hetatoms 
1  RNA    A 10 212 0
2  RNA    B 10 212 0
3  Ligand   RNA 10MER DUPLEX WITH SIX 2'-5'-LINKAGES  A 2 0 2
4  Ligand   RNA 10MER DUPLEX WITH SIX 2'-5'-LINKAGES  B 3 0 3
5 Water     120 0 120
total       145 424 125

Nucleic acids
Unit 1   C1 C2 G3 G4 C5 G6 C7 C8 G9 G10
Unit 2   C1 C2 G3 G4 C5 G6 C7 C8 G9 G10

Ligands
Unit 3   SR101 SR102
Unit 4   SR101 SR102 SR103

Chirality of ribose and phosphate atoms

Check the naming of phosphate and ribose substituents. Recommended for phosphate oxygens and for ribose hydrogens in NMR structures.


Go to    [Image Library Home]    [Helix Analysis Home]    [Image Library Entry]    [Helix Analysis Entry]   

Perl script:    PDBscan.pl  (15 Sep 2016)
Author:    Peter Slickers  (slickers@leibniz-fli.de),  IMB Jena,  Germany