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Sequence, Chains, Units

Title STRUCTURE OF THE U65C MUTANT A-RIBOSWITCH APTAMER FROM THE B SUBTILIS PBUE OPERON
Keywords APTAMER, RNA, A-RIBOSWITCH
Experiment X-ray diffraction
Number of Models  1

   Database       ID code    StatusCoordinate files
        Header     Asymmetric unit     Biological unit  
PDB   3IVN     released     available     available     Quaternary Structure Server  
Asymmetric unit from PDB
 Unit     Type     Name   Chain ID   Residues   Atoms   Hetatoms 
1  RNA    A 69 1466 0
2  RNA    B 69 1466 0
3  Ligand   A-RIBOSWITCH  A 7 0 7
4  Ligand   A-RIBOSWITCH  B 4 0 4
5 Water     88 0 88
total       237 2932 99
Nucleic acids
Unit 1   G5 G6 C7 C8 A9 G10 U11 A12 U13 A14 A15 C16 C17 U18 C19 A20 A21 U22 G23 A24 U25 A26 U27 G28 G29 U30 U31 U32 G33 A34 G35 G36 G37 U38 G39 U40 C41 U42 A43 C44 C45 A46 G47 G48 A49 A50 C51 C52 G53 U54 A55 A56 A57 A58 U59 C60 C61 U62 G63 A64 C65 U66 A67 C68 U69 G70 G71 U72 C73
Unit 2   G5 G6 C7 C8 A9 G10 U11 A12 U13 A14 A15 C16 C17 U18 C19 A20 A21 U22 G23 A24 U25 A26 U27 G28 G29 U30 U31 U32 G33 A34 G35 G36 G37 U38 G39 U40 C41 U42 A43 C44 C45 A46 G47 G48 A49 A50 C51 C52 G53 U54 A55 A56 A57 A58 U59 C60 C61 U62 G63 A64 C65 U66 A67 C68 U69 G70 G71 U72 C73
Ligands
Unit 3   MG101 MG102 MG103 MG104 MG105 BR106 BR107
Unit 4   MG101 MG102 MG103 MG104
Chirality of ribose and phosphate atoms

Check the naming of phosphate and ribose substituents. Recommended for phosphate oxygens and for ribose hydrogens in NMR structures.

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Perl script:    PDBscan.pl  (15 Sep 2016)
Author:    Peter Slickers  (slickers@leibniz-fli.de),  IMB Jena,  Germany