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Sequence, Chains, Units

Title STRUCTURE OF AN RNA-2'-DEOXYGUANOSINE COMPLEX
Keywords RNA, RNA-LIGAND COMPLEX, RIBOSWITCH
Experiment X-ray diffraction
Number of Models  1

   Database       ID code    StatusCoordinate files
        Header     Asymmetric unit     Biological unit  
PDB   3DS7     released     available     available     Quaternary Structure Server  
Asymmetric unit from PDB
 Unit     Type     Name   Chain ID   Residues   Atoms   Hetatoms 
1  RNA    A 67 1425 0
2  RNA    B 67 1428 0
3  Ligand   67-MER  A 7 0 58
4  Ligand   67-MER  B 8 0 65
5 Water     622 0 622
total       771 2853 745
Nucleic acids
Unit 1   G15 G16 A17 C18 A19 U20 A21 C22 A23 A24 U25 C26 G27 C28 G29 U30 G31 G32 A33 U34 A35 U36 G37 G38 C39 A40 C41 G42 C43 A44 A45 G46 A47 U48 C49 C50 C51 G52 C53 C54 G55 G56 G57 C58 A59 C60 C61 G62 U63 A64 A65 A66 U67 G68 U69 C70 C71 G72 A73 C74 U75 A76 U77 G78 U79 C80 C81
Unit 2   G215 G216 A217 C218 A219 U220 A221 C222 A223 A224 U225 C226 G227 C228 G229 U230 G231 G232 A233 U234 A235 U236 G237 G238 C239 A240 C241 G242 C243 A244 A245 G246 A247 U248 C249 C250 C251 G252 C253 C254 G255 G256 G257 C258 A259 C260 C261 G262 U263 A264 A265 A266 U267 G268 U269 C270 C271 G272 A273 C274 U275 A276 U277 G278 U279 C280 C281
Ligands
Unit 3   ACT96 NCO101 NCO102 NCO103 NCO104 NCO105 GNG120
Unit 4   ACT296 NCO301 NCO302 NCO303 NCO304 NCO305 NCO306 GNG320
Chirality of ribose and phosphate atoms

Check the naming of phosphate and ribose substituents. Recommended for phosphate oxygens and for ribose hydrogens in NMR structures.

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Perl script:    PDBscan.pl  (15 Sep 2016)
Author:    Peter Slickers  (slickers@leibniz-fli.de),  IMB Jena,  Germany