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Sequence, Chains, Units

Title SAM-II RIBOSWITCH BOUND TO S-ADENOSYLMETHIONINE
Keywords MRNA, RIBOSWITCH, SAM, S-ADENOSYLMETHIONINE, ADOMET, RNA- LIGAND COMPLEX, DOUBLE HELIX, PSEUDOKNOT, BASE TRIPLE
Experiment X-ray diffraction
Number of Models  1

   Database       ID code    StatusCoordinate files
        Header     Asymmetric unit     Biological unit  
PDB   2QWY     released     available     available     Quaternary Structure Server  
Asymmetric unit from PDB
 Unit     Type     Name   Chain ID   Residues   Atoms   Hetatoms 
1  RNA    A 52 1118 0
2  RNA    B 52 1118 0
3  RNA    C 52 1118 0
4  Ligand   SAM-II RIBOSWITCH  A 5 0 36
5  Ligand   SAM-II RIBOSWITCH  B 3 0 34
6  Ligand   SAM-II RIBOSWITCH  C 4 0 35
7 Water     154 0 154
total       322 3354 259
Nucleic acids
Unit 1   G1 C2 G3 C4 G5 G6 C7 G8 A9 U10 U11 U12 A13 A14 C15 C16 G17 U18 A19 U20 U21 G22 C23 A24 G25 U26 C27 G28 C29 G30 U31 G32 A33 U34 A35 A36 A37 U38 G39 U40 A41 G42 C43 U44 A45 A46 A47 A48 A49 G50 G51 A52
Unit 2   G1 C2 G3 C4 G5 G6 C7 G8 A9 U10 U11 U12 A13 A14 C15 C16 G17 U18 A19 U20 U21 G22 C23 A24 G25 U26 C27 G28 C29 G30 U31 G32 A33 U34 A35 A36 A37 U38 G39 U40 A41 G42 C43 U44 A45 A46 A47 A48 A49 G50 G51 A52
Unit 3   G1 C2 G3 C4 G5 G6 C7 G8 A9 U10 U11 U12 A13 A14 C15 C16 G17 U18 A19 U20 U21 G22 C23 A24 G25 U26 C27 G28 C29 G30 U31 G32 A33 U34 A35 A36 A37 U38 G39 U40 A41 G42 C43 U44 A45 A46 A47 A48 A49 G50 G51 A52
Ligands
Unit 4   PO40 PO453 SAM100 CS101 MG102
Unit 5   PO40 PO453 SAM300
Unit 6   PO40 PO453 SAM500 CS501
Chirality of ribose and phosphate atoms

Check the naming of phosphate and ribose substituents. Recommended for phosphate oxygens and for ribose hydrogens in NMR structures.

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Perl script:    PDBscan.pl  (15 Sep 2016)
Author:    Peter Slickers  (slickers@leibniz-fli.de),  IMB Jena,  Germany