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Sequence, Chains, Units

Title HIV-1 SUBTYPE F DIS RNA EXTENDED DUPLEX FORM
Keywords HIV RNA BULGED-ADENINE
Experiment X-ray diffraction
Number of Models  1

   Database       ID code    StatusCoordinate files
        Header     Asymmetric unit     Biological unit  
PDB   2QEK     released     available     available     Quaternary Structure Server  
Asymmetric unit from PDB
 Unit     Type     Name   Chain ID   Residues   Atoms   Hetatoms 
1  RNA    A 23 489 0
2  RNA    B 23 489 0
3  Ligand   HIV-1 SUBTYPE F DIS GENOMIC RNA  A 3 0 3
4  Ligand   HIV-1 SUBTYPE F DIS GENOMIC RNA  B 1 0 1
5 Water     73 0 73
total       123 978 77
Nucleic acids
Unit 1   C1 U2 U3 G4 C5 U6 G7 A8 A9 G10 U11 G12 C13 A14 C15 A16 C17 A18 G19 C20 A21 A22 G23
Unit 2   C1 U2 U3 G4 C5 U6 G7 A8 A9 G10 U11 G12 C13 A14 C15 A16 C17 A18 G19 C20 A21 A22 G23
Ligands
Unit 3   K9002 K9003 MG9004
Unit 4   K9001
Chirality of ribose and phosphate atoms

Check the naming of phosphate and ribose substituents. Recommended for phosphate oxygens and for ribose hydrogens in NMR structures.

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Perl script:    PDBscan.pl  (15 Sep 2016)
Author:    Peter Slickers  (slickers@leibniz-fli.de),  IMB Jena,  Germany