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Sequence, Chains, Units

Title HIV-1 DIS(MAL) DUPLEX PB-SOAKED
Keywords RNA, HIV-1, METAL IONS, BULGE
Experiment X-ray diffraction
Number of Models  1

   Database       ID code    StatusCoordinate files
        Header     Asymmetric unit     Biological unit  
PDB   1Y95     released     available     available     Quaternary Structure Server  
Asymmetric unit from PDB
 Unit     Type     Name   Chain ID   Residues   Atoms   Hetatoms 
1  RNA    A 23 490 0
2  RNA    B 23 490 0
3  Ligand   5'- R(*CP*UP*UP*GP*CP*UP*GP*AP*GP*GP*UP*GP*CP*AP*CP*AP*CP*AP*GP *CP*AP*AP*G)-3'  A 7 0 7
4  Ligand   5'- R(*CP*UP*UP*GP*CP*UP*GP*AP*GP*GP*UP*GP*CP*AP*CP*AP*CP*AP*GP *CP*AP*AP*G)-3'  B 6 0 6
5 Water     44 0 44
total       103 980 57
Nucleic acids
Unit 1   C1 U2 U3 G4 C5 U6 G7 A8 G9 G10 U11 G12 C13 A14 C15 A16 C17 A18 G19 C20 A21 A22 G23
Unit 2   C1 U2 U3 G4 C5 U6 G7 A8 G9 G10 U11 G12 C13 A14 C15 A16 C17 A18 G19 C20 A21 A22 G23
Ligands
Unit 3   MG30 MG32 PB36 MG37 MG38 MG40 MG43
Unit 4   PB31 MG33 MG34 PB35 MG41 MG42
Chirality of ribose and phosphate atoms

Check the naming of phosphate and ribose substituents. Recommended for phosphate oxygens and for ribose hydrogens in NMR structures.

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Perl script:    PDBscan.pl  (15 Sep 2016)
Author:    Peter Slickers  (slickers@leibniz-fli.de),  IMB Jena,  Germany