7MDH - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: STRUCTURAL BASIS FOR LIGHT ACITVATION OF A CHLOROPLAST ENZYM STRUCTURE OF SORGHUM NADP-MALATE DEHYDROGENASE IN ITS OXIDI
• Keywords: CHLOROPLASTIC MALATE DEHYDROGENASE (NADP+), ACTIVATED BY LIG CHLOROPLASTIC MALATE DEHYDROGENASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	7MDH	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	PROTEIN (MALATE DEHYDROGENASE)	A	351	2688	0
2	Protein	PROTEIN (MALATE DEHYDROGENASE)	B	360	2765	0
3	Protein	PROTEIN (MALATE DEHYDROGENASE)	C	352	2693	0
4	Protein	PROTEIN (MALATE DEHYDROGENASE)	D	352	2704	0
5	Ligand	PROTEIN (MALATE DEHYDROGENASE)	A	4	0	4
6	Ligand	PROTEIN (MALATE DEHYDROGENASE)	B	5	0	5
7	Ligand	PROTEIN (MALATE DEHYDROGENASE)	C	5	0	5
8	Ligand	PROTEIN (MALATE DEHYDROGENASE)	D	3	0	3
9	Water			265	0	265
total				1697	10850	282

Proteins

Unit 1	ASP 23 CYS 24 PHE 25 GLY 26 VAL 27 PHE 28 CYS 29 THR 30 TRP 43 LYS 44 LYS 45 LEU 46 VAL 47 ASN 48 ILE 49 ALA 50 VAL 51 SER 52 GLY 53 ALA 54 ALA 55 GLY 56 MET 57 ILE 58 SER 59 ASN 60 HIS 61 LEU 62 LEU 63 PHE 64 LYS 65 LEU 66 ALA 67 SER 68 GLY 69 GLU 70 VAL 71 PHE 72 GLY 73 GLN 74 ASP 75 GLN 76 PRO 77 ILE 78 ALA 79 LEU 80 LYS 81 LEU 82 LEU 83 GLY 84 SER 85 GLU 86 ARG 87 SER 88 PHE 89 GLN 90 ALA 91 LEU 92 GLU 93 GLY 94 VAL 95 ALA 96 MET 97 GLU 98 LEU 99 GLU 100 ASP 101 SER 102 LEU 103 TYR 104 PRO 105 LEU 106 LEU 107 ARG 108 GLU 109 VAL 110 SER 111 ILE 112 GLY 113 ILE 114 ASP 115 PRO 116 TYR 117 GLU 118 VAL 119 PHE 120 GLU 121 ASP 122 VAL 123 ASP 124 TRP 125 ALA 126 LEU 127 LEU 128 ILE 129 GLY 130 ALA 131 LYS 132 PRO 133 ARG 134 GLY 135 PRO 136 GLY 137 MET 138 GLU 139 ARG 140 ALA 141 ALA 142 LEU 143 LEU 144 ASP 145 ILE 146 ASN 147 GLY 148 GLN 149 ILE 150 PHE 151 ALA 152 ASP 153 GLN 154 GLY 155 LYS 156 ALA 157 LEU 158 ASN 159 ALA 160 VAL 161 ALA 162 SER 163 LYS 164 ASN 165 VAL 166 LYS 167 VAL 168 LEU 169 VAL 170 VAL 171 GLY 172 ASN 173 PRO 174 CYS 175 ASN 176 THR 177 ASN 178 ALA 179 LEU 180 ILE 181 CYS 182 LEU 183 LYS 184 ASN 185 ALA 186 PRO 187 ASP 188 ILE 189 PRO 190 ALA 191 LYS 192 ASN 193 PHE 194 HIS 195 ALA 196 LEU 197 THR 198 ARG 199 LEU 200 ASP 201 GLU 202 ASN 203 ARG 204 ALA 205 LYS 206 CYS 207 GLN 208 LEU 209 ALA 210 LEU 211 LYS 212 ALA 213 GLY 214 VAL 215 PHE 216 TYR 217 ASP 218 LYS 219 VAL 220 SER 221 ASN 222 VAL 223 THR 224 ILE 225 TRP 226 GLY 227 ASN 228 HIS 229 SER 230 THR 231 THR 232 GLN 233 VAL 234 PRO 235 ASP 236 PHE 237 LEU 238 ASN 239 ALA 240 LYS 241 ILE 242 ASP 243 GLY 244 ARG 245 PRO 246 VAL 247 LYS 248 GLU 249 VAL 250 ILE 251 LYS 252 ARG 253 THR 254 LYS 255 TRP 256 LEU 257 GLU 258 GLU 259 GLU 260 PHE 261 THR 262 ILE 263 THR 264 VAL 265 GLN 266 LYS 267 ARG 268 GLY 269 GLY 270 ALA 271 LEU 272 ILE 273 GLN 274 LYS 275 TRP 276 GLY 277 ARG 278 SER 279 SER 280 ALA 281 ALA 282 SER 283 THR 284 ALA 285 VAL 286 SER 287 ILE 288 ALA 289 ASP 290 ALA 291 ILE 292 LYS 293 SER 294 LEU 295 VAL 296 THR 297 PRO 298 THR 299 PRO 300 GLU 301 GLY 302 ASP 303 TRP 304 PHE 305 SER 306 THR 307 GLY 308 VAL 309 TYR 310 THR 311 THR 312 GLY 313 ASN 314 PRO 315 TYR 316 GLY 317 ILE 318 ALA 319 GLU 320 ASP 321 ILE 322 VAL 323 PHE 324 SER 325 MET 326 PRO 327 CYS 328 ARG 329 SER 330 LYS 331 GLY 332 ASP 333 GLY 334 ASP 335 TYR 336 GLU 337 LEU 338 ALA 339 THR 340 ASP 341 VAL 342 SER 343 ASN 344 ASP 345 ASP 346 PHE 347 LEU 348 TRP 349 GLU 350 ARG 351 ILE 352 LYS 353 LYS 354 SER 355 GLU 356 ALA 357 GLU 358 LEU 359 LEU 360 ALA 361 GLU 362 LYS 363 LYS 364 CYS 365 VAL 366 ALA 367 HIS 368 LEU 369 THR 370 GLY 371 GLU 372 GLY 373 ASN 374 ALA 375 TYR 376 CYS 377 ASP 378 VAL 379 PRO 380 GLU 381 ASP 382 THR 383 MET 384 LEU 385
Unit 2	ARG 21 LYS 22 ASP 23 CYS 24 PHE 25 GLY 26 VAL 27 PHE 28 CYS 29 THR 30 THR 31 TYR 32 ASP 33 LEU 34 LYS 35 SER 42 TRP 43 LYS 44 LYS 45 LEU 46 VAL 47 ASN 48 ILE 49 ALA 50 VAL 51 SER 52 GLY 53 ALA 54 ALA 55 GLY 56 MET 57 ILE 58 SER 59 ASN 60 HIS 61 LEU 62 LEU 63 PHE 64 LYS 65 LEU 66 ALA 67 SER 68 GLY 69 GLU 70 VAL 71 PHE 72 GLY 73 GLN 74 ASP 75 GLN 76 PRO 77 ILE 78 ALA 79 LEU 80 LYS 81 LEU 82 LEU 83 GLY 84 SER 85 GLU 86 ARG 87 SER 88 PHE 89 GLN 90 ALA 91 LEU 92 GLU 93 GLY 94 VAL 95 ALA 96 MET 97 GLU 98 LEU 99 GLU 100 ASP 101 SER 102 LEU 103 TYR 104 PRO 105 LEU 106 LEU 107 ARG 108 GLU 109 VAL 110 SER 111 ILE 112 GLY 113 ILE 114 ASP 115 PRO 116 TYR 117 GLU 118 VAL 119 PHE 120 GLU 121 ASP 122 VAL 123 ASP 124 TRP 125 ALA 126 LEU 127 LEU 128 ILE 129 GLY 130 ALA 131 LYS 132 PRO 133 ARG 134 GLY 135 PRO 136 GLY 137 MET 138 GLU 139 ARG 140 ALA 141 ALA 142 LEU 143 LEU 144 ASP 145 ILE 146 ASN 147 GLY 148 GLN 149 ILE 150 PHE 151 ALA 152 ASP 153 GLN 154 GLY 155 LYS 156 ALA 157 LEU 158 ASN 159 ALA 160 VAL 161 ALA 162 SER 163 LYS 164 ASN 165 VAL 166 LYS 167 VAL 168 LEU 169 VAL 170 VAL 171 GLY 172 ASN 173 PRO 174 CYS 175 ASN 176 THR 177 ASN 178 ALA 179 LEU 180 ILE 181 CYS 182 LEU 183 LYS 184 ASN 185 ALA 186 PRO 187 ASP 188 ILE 189 PRO 190 ALA 191 LYS 192 ASN 193 PHE 194 HIS 195 ALA 196 LEU 197 THR 198 ARG 199 LEU 200 ASP 201 GLU 202 ASN 203 ARG 204 ALA 205 LYS 206 CYS 207 GLN 208 LEU 209 ALA 210 LEU 211 LYS 212 ALA 213 GLY 214 VAL 215 PHE 216 TYR 217 ASP 218 LYS 219 VAL 220 SER 221 ASN 222 VAL 223 THR 224 ILE 225 TRP 226 GLY 227 ASN 228 HIS 229 SER 230 THR 231 THR 232 GLN 233 VAL 234 PRO 235 ASP 236 PHE 237 LEU 238 ASN 239 ALA 240 LYS 241 ILE 242 ASP 243 GLY 244 ARG 245 PRO 246 VAL 247 LYS 248 GLU 249 VAL 250 ILE 251 LYS 252 ARG 253 THR 254 LYS 255 TRP 256 LEU 257 GLU 258 GLU 259 GLU 260 PHE 261 THR 262 ILE 263 THR 264 VAL 265 GLN 266 LYS 267 ARG 268 GLY 269 GLY 270 ALA 271 LEU 272 ILE 273 GLN 274 LYS 275 TRP 276 GLY 277 ARG 278 SER 279 SER 280 ALA 281 ALA 282 SER 283 THR 284 ALA 285 VAL 286 SER 287 ILE 288 ALA 289 ASP 290 ALA 291 ILE 292 LYS 293 SER 294 LEU 295 VAL 296 THR 297 PRO 298 THR 299 PRO 300 GLU 301 GLY 302 ASP 303 TRP 304 PHE 305 SER 306 THR 307 GLY 308 VAL 309 TYR 310 THR 311 THR 312 GLY 313 ASN 314 PRO 315 TYR 316 GLY 317 ILE 318 ALA 319 GLU 320 ASP 321 ILE 322 VAL 323 PHE 324 SER 325 MET 326 PRO 327 CYS 328 ARG 329 SER 330 LYS 331 GLY 332 ASP 333 GLY 334 ASP 335 TYR 336 GLU 337 LEU 338 ALA 339 THR 340 ASP 341 VAL 342 SER 343 ASN 344 ASP 345 ASP 346 PHE 347 LEU 348 TRP 349 GLU 350 ARG 351 ILE 352 LYS 353 LYS 354 SER 355 GLU 356 ALA 357 GLU 358 LEU 359 LEU 360 ALA 361 GLU 362 LYS 363 LYS 364 CYS 365 VAL 366 ALA 367 HIS 368 LEU 369 THR 370 GLY 371 GLU 372 GLY 373 ASN 374 ALA 375 TYR 376 CYS 377 ASP 378 VAL 379 PRO 380 GLU 381 ASP 382 THR 383 MET 384 LEU 385 PRO 386
Unit 3	ASP 23 CYS 24 PHE 25 GLY 26 VAL 27 PHE 28 CYS 29 THR 30 THR 31 SER 42 TRP 43 LYS 44 LYS 45 LEU 46 VAL 47 ASN 48 ILE 49 ALA 50 VAL 51 SER 52 GLY 53 ALA 54 ALA 55 GLY 56 MET 57 ILE 58 SER 59 ASN 60 HIS 61 LEU 62 LEU 63 PHE 64 LYS 65 LEU 66 ALA 67 SER 68 GLY 69 GLU 70 VAL 71 PHE 72 GLY 73 GLN 74 ASP 75 GLN 76 PRO 77 ILE 78 ALA 79 LEU 80 LYS 81 LEU 82 LEU 83 GLY 84 SER 85 GLU 86 ARG 87 SER 88 PHE 89 GLN 90 ALA 91 LEU 92 GLU 93 GLY 94 VAL 95 ALA 96 MET 97 GLU 98 LEU 99 GLU 100 ASP 101 SER 102 LEU 103 TYR 104 PRO 105 LEU 106 LEU 107 ARG 108 GLU 109 VAL 110 SER 111 ILE 112 GLY 113 ILE 114 ASP 115 PRO 116 TYR 117 GLU 118 VAL 119 PHE 120 GLU 121 ASP 122 VAL 123 ASP 124 TRP 125 ALA 126 LEU 127 LEU 128 ILE 129 GLY 130 ALA 131 LYS 132 PRO 133 ARG 134 GLY 135 PRO 136 GLY 137 MET 138 GLU 139 ARG 140 ALA 141 ALA 142 LEU 143 LEU 144 ASP 145 ILE 146 ASN 147 GLY 148 GLN 149 ILE 150 PHE 151 ALA 152 ASP 153 GLN 154 GLY 155 LYS 156 ALA 157 LEU 158 ASN 159 ALA 160 VAL 161 ALA 162 SER 163 LYS 164 ASN 165 VAL 166 LYS 167 VAL 168 LEU 169 VAL 170 VAL 171 GLY 172 ASN 173 PRO 174 CYS 175 ASN 176 THR 177 ASN 178 ALA 179 LEU 180 ILE 181 CYS 182 LEU 183 LYS 184 ASN 185 ALA 186 PRO 187 ASP 188 ILE 189 PRO 190 ALA 191 LYS 192 ASN 193 PHE 194 HIS 195 ALA 196 LEU 197 THR 198 ARG 199 LEU 200 ASP 201 GLU 202 ASN 203 ARG 204 ALA 205 LYS 206 CYS 207 GLN 208 LEU 209 ALA 210 LEU 211 LYS 212 ALA 213 GLY 214 VAL 215 PHE 216 TYR 217 ASP 218 LYS 219 VAL 220 SER 221 ASN 222 VAL 223 THR 224 ILE 225 TRP 226 GLY 227 ASN 228 HIS 229 SER 230 THR 231 THR 232 GLN 233 VAL 234 PRO 235 ASP 236 PHE 237 LEU 238 ASN 239 ALA 240 LYS 241 ILE 242 ASP 243 GLY 244 ARG 245 PRO 246 VAL 247 LYS 248 GLU 249 VAL 250 ILE 251 LYS 252 ARG 253 THR 254 LYS 255 TRP 256 LEU 257 GLU 258 GLU 259 GLU 260 PHE 261 THR 262 ILE 263 THR 264 VAL 265 GLN 266 LYS 267 ARG 268 GLY 269 GLY 270 ALA 271 LEU 272 ILE 273 GLN 274 LYS 275 TRP 276 GLY 277 ARG 278 SER 279 SER 280 ALA 281 ALA 282 SER 283 THR 284 ALA 285 VAL 286 SER 287 ILE 288 ALA 289 ASP 290 ALA 291 ILE 292 LYS 293 SER 294 LEU 295 VAL 296 THR 297 PRO 298 THR 299 PRO 300 GLU 301 GLY 302 ASP 303 TRP 304 PHE 305 SER 306 THR 307 GLY 308 VAL 309 TYR 310 THR 311 THR 312 GLY 313 ASN 314 PRO 315 TYR 316 GLY 317 ILE 318 ALA 319 GLU 320 ASP 321 ILE 322 VAL 323 PHE 324 SER 325 MET 326 PRO 327 CYS 328 ARG 329 SER 330 LYS 331 GLY 332 ASP 333 GLY 334 ASP 335 TYR 336 GLU 337 LEU 338 ALA 339 THR 340 ASP 341 VAL 342 SER 343 ASN 344 ASP 345 ASP 346 PHE 347 LEU 348 TRP 349 GLU 350 ARG 351 ILE 352 LYS 353 LYS 354 SER 355 GLU 356 ALA 357 GLU 358 LEU 359 LEU 360 ALA 361 GLU 362 LYS 363 LYS 364 CYS 365 VAL 366 ALA 367 HIS 368 LEU 369 THR 370 GLY 371 GLU 372 GLY 373 ASN 374 ALA 375 TYR 376 CYS 377 ASP 378 VAL 379 PRO 380 GLU 381 ASP 382 THR 383 MET 384
Unit 4	ARG 21 LYS 22 ASP 23 CYS 24 PHE 25 GLY 26 VAL 27 PHE 28 CYS 29 THR 30 THR 31 TYR 32 ASP 33 TRP 43 LYS 44 LYS 45 LEU 46 VAL 47 ASN 48 ILE 49 ALA 50 VAL 51 SER 52 GLY 53 ALA 54 ALA 55 GLY 56 MET 57 ILE 58 SER 59 ASN 60 HIS 61 LEU 62 LEU 63 PHE 64 LYS 65 LEU 66 ALA 67 SER 68 GLY 69 GLU 70 VAL 71 PHE 72 GLY 73 GLN 74 ASP 75 GLN 76 PRO 77 ILE 78 ALA 79 LEU 80 LYS 81 LEU 82 LEU 83 GLY 84 SER 85 GLU 86 ARG 87 SER 88 PHE 89 GLN 90 ALA 91 LEU 92 GLU 93 GLY 94 VAL 95 ALA 96 MET 97 GLU 98 LEU 99 GLU 100 ASP 101 SER 102 LEU 103 TYR 104 PRO 105 LEU 106 LEU 107 ARG 108 GLU 109 VAL 110 SER 111 ILE 112 GLY 113 ILE 114 ASP 115 PRO 116 TYR 117 GLU 118 VAL 119 PHE 120 GLU 121 ASP 122 VAL 123 ASP 124 TRP 125 ALA 126 LEU 127 LEU 128 ILE 129 GLY 130 ALA 131 LYS 132 PRO 133 ARG 134 GLY 135 PRO 136 GLY 137 MET 138 GLU 139 ARG 140 ALA 141 ALA 142 LEU 143 LEU 144 ASP 145 ILE 146 ASN 147 GLY 148 GLN 149 ILE 150 PHE 151 ALA 152 ASP 153 GLN 154 GLY 155 LYS 156 ALA 157 LEU 158 ASN 159 ALA 160 VAL 161 ALA 162 SER 163 LYS 164 ASN 165 VAL 166 LYS 167 VAL 168 LEU 169 VAL 170 VAL 171 GLY 172 ASN 173 PRO 174 CYS 175 ASN 176 THR 177 ASN 178 ALA 179 LEU 180 ILE 181 CYS 182 LEU 183 LYS 184 ASN 185 ALA 186 PRO 187 ASP 188 ILE 189 PRO 190 ALA 191 LYS 192 ASN 193 PHE 194 HIS 195 ALA 196 LEU 197 THR 198 ARG 199 LEU 200 ASP 201 GLU 202 ASN 203 ARG 204 ALA 205 LYS 206 CYS 207 GLN 208 LEU 209 ALA 210 LEU 211 LYS 212 ALA 213 GLY 214 VAL 215 PHE 216 TYR 217 ASP 218 LYS 219 VAL 220 SER 221 ASN 222 VAL 223 THR 224 ILE 225 TRP 226 GLY 227 ASN 228 HIS 229 SER 230 THR 231 THR 232 GLN 233 VAL 234 PRO 235 ASP 236 PHE 237 LEU 238 ASN 239 ALA 240 LYS 241 ILE 242 ASP 243 GLY 244 ARG 245 PRO 246 VAL 247 LYS 248 GLU 249 VAL 250 ILE 251 LYS 252 ARG 253 THR 254 LYS 255 TRP 256 LEU 257 GLU 258 GLU 259 GLU 260 PHE 261 THR 262 ILE 263 THR 264 VAL 265 GLN 266 LYS 267 ARG 268 GLY 269 GLY 270 ALA 271 LEU 272 ILE 273 GLN 274 LYS 275 TRP 276 GLY 277 ARG 278 SER 279 SER 280 ALA 281 ALA 282 SER 283 THR 284 ALA 285 VAL 286 SER 287 ILE 288 ALA 289 ASP 290 ALA 291 ILE 292 LYS 293 SER 294 LEU 295 VAL 296 THR 297 PRO 298 THR 299 PRO 300 GLU 301 GLY 302 ASP 303 TRP 304 PHE 305 SER 306 THR 307 GLY 308 VAL 309 TYR 310 THR 311 THR 312 GLY 313 ASN 314 PRO 315 TYR 316 GLY 317 ILE 318 ALA 319 GLU 320 ASP 321 ILE 322 VAL 323 PHE 324 SER 325 MET 326 PRO 327 CYS 328 ARG 329 SER 330 LYS 331 GLY 332 ASP 333 GLY 334 ASP 335 TYR 336 GLU 337 LEU 338 ALA 339 THR 340 ASP 341 VAL 342 SER 343 ASN 344 ASP 345 ASP 346 PHE 347 LEU 348 TRP 349 GLU 350 ARG 351 ILE 352 LYS 353 LYS 354 SER 355 GLU 356 ALA 357 GLU 358 LEU 359 LEU 360 ALA 361 GLU 362 LYS 363 LYS 364 CYS 365 VAL 366 ALA 367 HIS 368 LEU 369 THR 370 GLY 371 GLU 372 GLY 373 ASN 374 ALA 375 TYR 376 CYS 377 ASP 378 VAL 379 PRO 380 GLU 381

Ligands

Unit 5	ZN 501 ZN 502 ZN 503 ZN 504
Unit 6	ZN 501 ZN 502 ZN 503 ZN 504 ZN 505
Unit 7	ZN 501 ZN 502 ZN 503 ZN 504 ZN 505
Unit 8	ZN 501 ZN 502 ZN 503