5UK4 - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: VESICULAR STOMATITS VIRUS N PROTEIN IN COMPLEX WITH INHIBITO NANOBODY 1307
• Keywords: VESICULAR STOMATITIS VIRUS, NUCLEOPROTEIN, INHIBITORY VHH, A VIRAL PROTEIN-RNA-IMMUNE SYSTEM COMPLEX
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	5UK4	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	NUCLEOPROTEIN	P	414	3281	0
2	Protein	ANTI-VESICULAR STOMATITIS VIRUS N VHH	p	125	968	0
3	Protein	NUCLEOPROTEIN	B	412	3270	0
4	Protein	ANTI-VESICULAR STOMATITIS VIRUS N VHH	b	125	968	0
5	Protein	NUCLEOPROTEIN	Q	419	3316	0
6	Protein	ANTI-VESICULAR STOMATITIS VIRUS N VHH	q	125	968	0
7	Protein	NUCLEOPROTEIN	C	417	3299	0
8	Protein	ANTI-VESICULAR STOMATITIS VIRUS N VHH	c	125	968	0
9	Protein	NUCLEOPROTEIN	R	419	3315	0
10	Protein	ANTI-VESICULAR STOMATITIS VIRUS N VHH	r	125	968	0
11	Protein	NUCLEOPROTEIN	D	418	3305	0
12	Protein	ANTI-VESICULAR STOMATITIS VIRUS N VHH	d	125	968	0
13	Protein	NUCLEOPROTEIN	S	421	3327	0
14	Protein	ANTI-VESICULAR STOMATITIS VIRUS N VHH	s	125	968	0
15	Protein	NUCLEOPROTEIN	E	413	3273	0
16	Protein	ANTI-VESICULAR STOMATITIS VIRUS N VHH	e	125	968	0
17	Protein	NUCLEOPROTEIN	T	421	3327	0
18	Protein	ANTI-VESICULAR STOMATITIS VIRUS N VHH	t	125	968	0
19	Protein	NUCLEOPROTEIN	K	421	3327	0
20	Protein	ANTI-VESICULAR STOMATITIS VIRUS N VHH	k	125	968	0
21	Protein	NUCLEOPROTEIN	L	421	3327	0
22	Protein	ANTI-VESICULAR STOMATITIS VIRUS N VHH	l	125	968	0
23	Protein	NUCLEOPROTEIN	N	418	3305	0
24	Protein	ANTI-VESICULAR STOMATITIS VIRUS N VHH	n	125	968	0
25	Protein	NUCLEOPROTEIN	M	416	3291	0
26	Protein	ANTI-VESICULAR STOMATITIS VIRUS N VHH	m	125	968	0
27	Protein	NUCLEOPROTEIN	F	421	3327	0
28	Protein	ANTI-VESICULAR STOMATITIS VIRUS N VHH	f	125	968	0
29	Protein	NUCLEOPROTEIN	G	416	3295	0
30	Protein	ANTI-VESICULAR STOMATITIS VIRUS N VHH	g	125	968	0
31	Protein	NUCLEOPROTEIN	H	420	3316	0
32	Protein	ANTI-VESICULAR STOMATITIS VIRUS N VHH	h	125	968	0
33	Protein	NUCLEOPROTEIN	I	415	3289	0
34	Protein	ANTI-VESICULAR STOMATITIS VIRUS N VHH	i	125	968	0
35	Protein		O	420	3323	0
36	Protein		o	125	968	0
37	Protein		J	420	3323	0
38	Protein		j	125	968	0
39	Protein		A	416	3290	0
40	Protein		a	125	968	0
41	RNA		u	45	900	0
42	RNA		v	45	900	0
43	RNA		w	45	900	0
44	RNA		x	45	900	0
total				11038	89086	0

Proteins

Unit 1	SER 2 VAL 3 THR 4 VAL 5 LYS 6 ARG 7 ILE 8 ILE 9 ASP 10 ASN 11 THR 12 VAL 13 ILE 14 VAL 15 PRO 16 LYS 17 LEU 18 PRO 19 ALA 20 ASN 21 GLU 22 ASP 23 PRO 24 VAL 25 GLU 26 TYR 27 PRO 28 ALA 29 ASP 30 TYR 31 PHE 32 ARG 33 LYS 34 SER 35 LYS 36 GLU 37 ILE 38 PRO 39 LEU 40 TYR 41 ILE 42 ASN 43 THR 44 THR 45 LYS 46 SER 47 LEU 48 SER 49 ASP 50 LEU 51 ARG 52 GLY 53 TYR 54 VAL 55 TYR 56 GLN 57 GLY 58 LEU 59 LYS 60 SER 61 GLY 62 ASN 63 VAL 64 SER 65 ILE 66 ILE 67 HIS 68 VAL 69 ASN 70 SER 71 TYR 72 LEU 73 TYR 74 GLY 75 ALA 76 LEU 77 LYS 78 ASP 79 ILE 80 ARG 81 GLY 82 LYS 83 LEU 84 ASP 85 LYS 86 ASP 87 TRP 88 SER 89 SER 90 PHE 91 GLY 92 ILE 93 ASN 94 ILE 95 GLY 96 LYS 97 ALA 98 GLY 99 ASP 100 THR 101 ILE 102 GLY 103 ILE 104 PHE 105 ASP 106 LEU 107 VAL 108 SER 109 LEU 110 LYS 111 ALA 112 LEU 113 VAL 121 SER 122 ASP 123 ALA 124 SER 125 ARG 126 THR 127 SER 128 ALA 129 ASP 130 ASP 131 LYS 132 TRP 133 LEU 134 PRO 135 LEU 136 TYR 137 LEU 138 LEU 139 GLY 140 LEU 141 TYR 142 ARG 143 VAL 144 GLY 145 ARG 146 THR 147 GLN 148 MET 149 PRO 150 GLU 151 TYR 152 ARG 153 LYS 154 LYS 155 LEU 156 MET 157 ASP 158 GLY 159 LEU 160 THR 161 ASN 162 GLN 163 CYS 164 LYS 165 MET 166 ILE 167 ASN 168 GLU 169 GLN 170 PHE 171 GLU 172 PRO 173 LEU 174 VAL 175 PRO 176 GLU 177 GLY 178 ARG 179 ASP 180 ILE 181 PHE 182 ASP 183 VAL 184 TRP 185 GLY 186 ASN 187 ASP 188 SER 189 ASN 190 TYR 191 THR 192 LYS 193 ILE 194 VAL 195 ALA 196 ALA 197 VAL 198 ASP 199 MET 200 PHE 201 PHE 202 HIS 203 MET 204 PHE 205 LYS 206 LYS 207 HIS 208 GLU 209 CYS 210 ALA 211 SER 212 PHE 213 ARG 214 TYR 215 GLY 216 THR 217 ILE 218 VAL 219 SER 220 ARG 221 PHE 222 LYS 223 ASP 224 CYS 225 ALA 226 ALA 227 LEU 228 ALA 229 THR 230 PHE 231 GLY 232 HIS 233 LEU 234 CYS 235 LYS 236 ILE 237 THR 238 GLY 239 MET 240 SER 241 THR 242 GLU 243 ASP 244 VAL 245 THR 246 THR 247 TRP 248 ILE 249 LEU 250 ASN 251 ARG 252 GLU 253 VAL 254 ALA 255 ASP 256 GLU 257 MET 258 VAL 259 GLN 260 MET 261 MET 262 LEU 263 PRO 264 GLY 265 GLN 266 GLU 267 ILE 268 ASP 269 LYS 270 ALA 271 ASP 272 SER 273 TYR 274 MET 275 PRO 276 TYR 277 LEU 278 ILE 279 ASP 280 PHE 281 GLY 282 LEU 283 SER 284 SER 285 LYS 286 SER 287 PRO 288 TYR 289 SER 290 SER 291 VAL 292 LYS 293 ASN 294 PRO 295 ALA 296 PHE 297 HIS 298 PHE 299 TRP 300 GLY 301 GLN 302 LEU 303 THR 304 ALA 305 LEU 306 LEU 307 LEU 308 ARG 309 SER 310 THR 311 ARG 312 ALA 313 ARG 314 ASN 315 ALA 316 ARG 317 GLN 318 PRO 319 ASP 320 ASP 321 ILE 322 GLU 323 TYR 324 THR 325 SER 326 LEU 327 THR 328 THR 329 ALA 330 GLY 331 LEU 332 LEU 333 TYR 334 ALA 335 TYR 336 ALA 337 VAL 338 GLY 339 SER 340 SER 341 ALA 342 ASP 343 LEU 344 ALA 345 GLN 346 GLN 347 PHE 348 CYS 349 VAL 350 GLY 351 ASP 352 ASN 353 LYS 354 TYR 355 THR 356 PRO 357 ASP 358 ASP 359 SER 360 THR 361 GLY 362 GLY 363 LEU 364 THR 365 THR 366 ASN 367 ALA 368 PRO 369 PRO 370 GLN 371 GLY 372 ARG 373 ASP 374 VAL 375 VAL 376 GLU 377 TRP 378 LEU 379 GLY 380 TRP 381 PHE 382 GLU 383 ASP 384 GLN 385 ASN 386 ARG 387 LYS 388 PRO 389 THR 390 PRO 391 ASP 392 MET 393 MET 394 GLN 395 TYR 396 ALA 397 LYS 398 ARG 399 ALA 400 VAL 401 MET 402 SER 403 LEU 404 GLN 405 GLY 406 LEU 407 ARG 408 GLU 409 LYS 410 THR 411 ILE 412 GLY 413 LYS 414 TYR 415 ALA 416 LYS 417 SER 418 GLU 419 PHE 420 ASP 421 LYS 422
Unit 2	GLN 1 VAL 2 GLN 3 LEU 4 VAL 5 GLU 6 THR 7 GLY 8 GLY 9 GLY 10 LEU 11 VAL 12 GLN 13 THR 14 GLY 15 GLY 16 SER 17 LEU 18 ARG 19 LEU 20 SER 21 CYS 22 LYS 23 ALA 24 SER 25 GLY 26 ARG 27 THR 28 PHE 29 SER 30 ASN 31 SER 32 ILE 33 MET 34 GLY 35 TRP 36 PHE 37 ARG 38 GLN 39 ALA 40 PRO 41 GLY 42 LYS 43 GLU 44 ARG 45 ASP 46 PHE 47 VAL 48 ALA 49 LYS 50 ILE 51 SER 52 TRP 53 ARG 54 ASN 55 ASP 56 TYR 57 THR 58 THR 59 TYR 60 ALA 61 ASP 62 SER 63 VAL 64 LYS 65 GLY 66 ARG 67 PHE 68 THR 69 ILE 70 SER 71 ARG 72 ASP 73 ASN 74 ALA 75 SER 76 ASN 77 MET 78 VAL 79 TYR 80 LEU 81 LEU 82 MET 83 ASN 84 ASN 85 LEU 86 LYS 87 PRO 88 GLU 89 ASP 90 THR 91 ALA 92 VAL 93 TYR 94 TYR 95 CYS 96 ALA 97 ALA 98 THR 99 LYS 100 ALA 101 TYR 102 ASN 103 GLY 104 GLY 105 GLU 106 THR 107 SER 108 GLY 109 ARG 110 GLY 111 PHE 112 TYR 113 TYR 114 TRP 115 GLY 116 GLN 117 GLY 118 THR 119 GLN 120 VAL 121 THR 122 VAL 123 SER 124 SER 125
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Unit 20	GLN 1 VAL 2 GLN 3 LEU 4 VAL 5 GLU 6 THR 7 GLY 8 GLY 9 GLY 10 LEU 11 VAL 12 GLN 13 THR 14 GLY 15 GLY 16 SER 17 LEU 18 ARG 19 LEU 20 SER 21 CYS 22 LYS 23 ALA 24 SER 25 GLY 26 ARG 27 THR 28 PHE 29 SER 30 ASN 31 SER 32 ILE 33 MET 34 GLY 35 TRP 36 PHE 37 ARG 38 GLN 39 ALA 40 PRO 41 GLY 42 LYS 43 GLU 44 ARG 45 ASP 46 PHE 47 VAL 48 ALA 49 LYS 50 ILE 51 SER 52 TRP 53 ARG 54 ASN 55 ASP 56 TYR 57 THR 58 THR 59 TYR 60 ALA 61 ASP 62 SER 63 VAL 64 LYS 65 GLY 66 ARG 67 PHE 68 THR 69 ILE 70 SER 71 ARG 72 ASP 73 ASN 74 ALA 75 SER 76 ASN 77 MET 78 VAL 79 TYR 80 LEU 81 LEU 82 MET 83 ASN 84 ASN 85 LEU 86 LYS 87 PRO 88 GLU 89 ASP 90 THR 91 ALA 92 VAL 93 TYR 94 TYR 95 CYS 96 ALA 97 ALA 98 THR 99 LYS 100 ALA 101 TYR 102 ASN 103 GLY 104 GLY 105 GLU 106 THR 107 SER 108 GLY 109 ARG 110 GLY 111 PHE 112 TYR 113 TYR 114 TRP 115 GLY 116 GLN 117 GLY 118 THR 119 GLN 120 VAL 121 THR 122 VAL 123 SER 124 SER 125
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Unit 38	GLN 1 VAL 2 GLN 3 LEU 4 VAL 5 GLU 6 THR 7 GLY 8 GLY 9 GLY 10 LEU 11 VAL 12 GLN 13 THR 14 GLY 15 GLY 16 SER 17 LEU 18 ARG 19 LEU 20 SER 21 CYS 22 LYS 23 ALA 24 SER 25 GLY 26 ARG 27 THR 28 PHE 29 SER 30 ASN 31 SER 32 ILE 33 MET 34 GLY 35 TRP 36 PHE 37 ARG 38 GLN 39 ALA 40 PRO 41 GLY 42 LYS 43 GLU 44 ARG 45 ASP 46 PHE 47 VAL 48 ALA 49 LYS 50 ILE 51 SER 52 TRP 53 ARG 54 ASN 55 ASP 56 TYR 57 THR 58 THR 59 TYR 60 ALA 61 ASP 62 SER 63 VAL 64 LYS 65 GLY 66 ARG 67 PHE 68 THR 69 ILE 70 SER 71 ARG 72 ASP 73 ASN 74 ALA 75 SER 76 ASN 77 MET 78 VAL 79 TYR 80 LEU 81 LEU 82 MET 83 ASN 84 ASN 85 LEU 86 LYS 87 PRO 88 GLU 89 ASP 90 THR 91 ALA 92 VAL 93 TYR 94 TYR 95 CYS 96 ALA 97 ALA 98 THR 99 LYS 100 ALA 101 TYR 102 ASN 103 GLY 104 GLY 105 GLU 106 THR 107 SER 108 GLY 109 ARG 110 GLY 111 PHE 112 TYR 113 TYR 114 TRP 115 GLY 116 GLN 117 GLY 118 THR 119 GLN 120 VAL 121 THR 122 VAL 123 SER 124 SER 125
Unit 39	SER 2 VAL 3 THR 4 VAL 5 LYS 6 ARG 7 ILE 8 ILE 9 ASP 10 ASN 11 THR 12 VAL 13 ILE 14 VAL 15 PRO 16 LYS 17 LEU 18 PRO 19 ALA 20 ASN 21 GLU 22 ASP 23 PRO 24 VAL 25 GLU 26 TYR 27 PRO 28 ALA 29 ASP 30 TYR 31 PHE 32 ARG 33 LYS 34 SER 35 LYS 36 GLU 37 ILE 38 PRO 39 LEU 40 TYR 41 ILE 42 ASN 43 THR 44 THR 45 LYS 46 SER 47 LEU 48 SER 49 ASP 50 LEU 51 ARG 52 GLY 53 TYR 54 VAL 55 TYR 56 GLN 57 GLY 58 LEU 59 LYS 60 SER 61 GLY 62 ASN 63 VAL 64 SER 65 ILE 66 ILE 67 HIS 68 VAL 69 ASN 70 SER 71 TYR 72 LEU 73 TYR 74 GLY 75 ALA 76 LEU 77 LYS 78 ASP 79 ILE 80 ARG 81 GLY 82 LYS 83 LEU 84 ASP 85 LYS 86 ASP 87 TRP 88 SER 89 SER 90 PHE 91 GLY 92 ILE 93 ASN 94 ILE 95 GLY 96 LYS 97 ALA 98 GLY 99 ASP 100 THR 101 ILE 102 GLY 103 ILE 104 PHE 105 ASP 106 LEU 107 VAL 108 SER 109 LEU 110 LYS 111 ALA 112 LEU 113 ASP 114 GLY 115 VAL 116 LEU 117 PRO 118 SER 122 ASP 123 ALA 124 SER 125 SER 128 ALA 129 ASP 130 ASP 131 LYS 132 TRP 133 LEU 134 PRO 135 LEU 136 TYR 137 LEU 138 LEU 139 GLY 140 LEU 141 TYR 142 ARG 143 VAL 144 GLY 145 ARG 146 THR 147 GLN 148 MET 149 PRO 150 GLU 151 TYR 152 ARG 153 LYS 154 LYS 155 LEU 156 MET 157 ASP 158 GLY 159 LEU 160 THR 161 ASN 162 GLN 163 CYS 164 LYS 165 MET 166 ILE 167 ASN 168 GLU 169 GLN 170 PHE 171 GLU 172 PRO 173 LEU 174 VAL 175 PRO 176 GLU 177 GLY 178 ARG 179 ASP 180 ILE 181 PHE 182 ASP 183 VAL 184 TRP 185 GLY 186 ASN 187 ASP 188 SER 189 ASN 190 TYR 191 THR 192 LYS 193 ILE 194 VAL 195 ALA 196 ALA 197 VAL 198 ASP 199 MET 200 PHE 201 PHE 202 HIS 203 MET 204 PHE 205 LYS 206 LYS 207 HIS 208 GLU 209 CYS 210 ALA 211 SER 212 PHE 213 ARG 214 TYR 215 GLY 216 THR 217 ILE 218 VAL 219 SER 220 ARG 221 PHE 222 LYS 223 ASP 224 CYS 225 ALA 226 ALA 227 LEU 228 ALA 229 THR 230 PHE 231 GLY 232 HIS 233 LEU 234 CYS 235 LYS 236 ILE 237 THR 238 GLY 239 MET 240 SER 241 THR 242 GLU 243 ASP 244 VAL 245 THR 246 THR 247 TRP 248 ILE 249 LEU 250 ASN 251 ARG 252 GLU 253 VAL 254 ALA 255 ASP 256 GLU 257 MET 258 VAL 259 GLN 260 MET 261 MET 262 LEU 263 PRO 264 GLY 265 GLN 266 GLU 267 ILE 268 ASP 269 LYS 270 ALA 271 ASP 272 SER 273 TYR 274 MET 275 PRO 276 TYR 277 LEU 278 ILE 279 ASP 280 PHE 281 GLY 282 LEU 283 SER 284 SER 285 LYS 286 SER 287 PRO 288 TYR 289 SER 290 SER 291 VAL 292 LYS 293 ASN 294 PRO 295 ALA 296 PHE 297 HIS 298 PHE 299 TRP 300 GLY 301 GLN 302 LEU 303 THR 304 ALA 305 LEU 306 LEU 307 LEU 308 ARG 309 SER 310 THR 311 ARG 312 ALA 313 ARG 314 ASN 315 ALA 316 ARG 317 GLN 318 PRO 319 ASP 320 ASP 321 ILE 322 GLU 323 TYR 324 THR 325 SER 326 LEU 327 THR 328 THR 329 ALA 330 GLY 331 LEU 332 LEU 333 TYR 334 ALA 335 TYR 336 ALA 337 VAL 338 GLY 339 SER 340 SER 341 ALA 342 ASP 343 LEU 344 ALA 345 GLN 346 GLN 347 PHE 348 CYS 349 VAL 350 GLY 351 ASP 352 ASN 353 LYS 354 TYR 355 THR 356 PRO 357 ASP 358 ASP 359 SER 360 THR 361 GLY 362 GLY 363 LEU 364 THR 365 THR 366 ASN 367 ALA 368 PRO 369 PRO 370 GLN 371 GLY 372 ARG 373 ASP 374 VAL 375 VAL 376 GLU 377 TRP 378 LEU 379 GLY 380 TRP 381 PHE 382 GLU 383 ASP 384 GLN 385 ASN 386 ARG 387 LYS 388 PRO 389 THR 390 PRO 391 ASP 392 MET 393 MET 394 GLN 395 TYR 396 ALA 397 LYS 398 ARG 399 ALA 400 VAL 401 MET 402 SER 403 LEU 404 GLN 405 GLY 406 LEU 407 ARG 408 GLU 409 LYS 410 THR 411 ILE 412 GLY 413 LYS 414 TYR 415 ALA 416 LYS 417 SER 418 GLU 419 PHE 420 ASP 421 LYS 422
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Nucleic acids

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Unit 44	U 1 U 2 U 3 U 4 U 5 U 6 U 7 U 8 U 9 U 10 U 11 U 12 U 13 U 14 U 15 U 16 U 17 U 18 U 19 U 20 U 21 U 22 U 23 U 24 U 25 U 26 U 27 U 28 U 29 U 30 U 31 U 32 U 33 U 34 U 35 U 36 U 37 U 38 U 39 U 40 U 41 U 42 U 43 U 44 U 45