5MHK - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: ICP4 DNA-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH 19MER DNA DUPLEX FRO PROMOTER
• Keywords: TRANSCRIPTION FACTOR, HERPES VIRUS, INTERCALATION, TRANSCRIP
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	5MHK	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Other macromolecule		G	19	390	0
2	Other macromolecule		H	18	364	0
3	Other macromolecule		E	15	313	0
4	Other macromolecule		F	16	321	0
5	Protein	RS1ICP4 DNA BINDING DOMAIN	A	186	1398	0
6	Protein	RS1ICP4 DNA BINDING DOMAIN	C	195	1461	0
7	Protein	RS1ICP4 DNA BINDING DOMAIN	D	197	1483	0
8	Protein	RS1ICP4 DNA BINDING DOMAIN	B	197	1487	0
9	Protein	RS1ICP4 DNA BINDING DOMAIN	J	2	18	0
10	Ligand		H	1	0	1
11	Ligand	RS1ICP4 DNA BINDING DOMAIN	A	2	0	10
12	Ligand	RS1ICP4 DNA BINDING DOMAIN	C	3	0	11
13	Ligand	RS1ICP4 DNA BINDING DOMAIN	D	1	0	5
14	Ligand	RS1ICP4 DNA BINDING DOMAIN	B	2	0	10
15	Water			235	0	236
total				1089	7235	273

Proteins

Unit 5	GLY 300 ALA 301 PHE 302 TYR 303 ALA 304 ARG 305 TYR 306 ARG 307 ASP 308 GLY 309 TYR 310 VAL 311 SER 312 GLY 313 GLU 314 PRO 315 TRP 316 PRO 317 GLY 318 ALA 319 GLY 320 PRO 321 PRO 322 PRO 323 PRO 324 GLY 325 ARG 326 VAL 327 LEU 328 TYR 329 GLY 330 GLY 331 LEU 332 GLY 333 ASP 334 SER 335 ARG 336 PRO 337 GLY 338 LEU 339 TRP 340 GLY 341 ALA 342 PRO 343 GLU 344 ALA 345 GLU 346 GLU 347 ALA 348 ARG 349 ARG 350 ARG 351 PHE 352 GLU 353 ALA 354 SER 355 GLY 356 ALA 357 PRO 358 ALA 359 ALA 360 VAL 361 TRP 362 ALA 363 PRO 364 GLU 365 LEU 366 GLY 367 ASP 368 ALA 369 ALA 370 GLN 371 GLN 372 TYR 373 ALA 374 LEU 375 ILE 376 THR 377 ARG 378 LEU 379 LEU 380 TYR 381 THR 382 PRO 383 ASP 384 ALA 385 GLU 386 ALA 387 MET 388 GLY 389 TRP 390 LEU 391 GLN 392 ASN 393 PRO 394 ARG 395 VAL 396 VAL 397 PRO 398 GLY 399 ASP 400 VAL 401 ALA 402 LEU 403 ASP 404 GLN 405 ALA 406 CYS 407 PHE 408 ARG 409 ILE 410 SER 411 GLY 412 ALA 413 ALA 414 ARG 415 ASN 416 SER 417 SER 418 SER 419 PHE 420 ILE 421 THR 422 GLY 423 SER 424 VAL 425 ALA 426 ARG 427 ALA 428 VAL 429 PRO 430 HIS 431 LEU 432 GLY 433 TYR 434 ALA 435 MET 436 ALA 437 ALA 438 GLY 439 ARG 440 PHE 441 GLY 442 TRP 443 GLY 444 LEU 445 ALA 446 HIS 447 ALA 448 ALA 449 ALA 450 ALA 451 VAL 452 ALA 453 MET 454 SER 455 ARG 456 ARG 457 TYR 458 ASP 459 ARG 460 ALA 461 GLN 462 LYS 463 GLY 464 PHE 465 LEU 466 LEU 467 THR 468 SER 469 LEU 470 ARG 471 ARG 472 ALA 473 TYR 474 ALA 475 PRO 476 LEU 477 LEU 478 ALA 479 ARG 480 GLU 481 ASN 482 ALA 483 ALA 484 LEU 485
Unit 6	GLU 292 LEU 293 ASP 294 ALA 295 ASP 296 ALA 297 THR 298 SER 299 GLY 300 ALA 301 PHE 302 TYR 303 ALA 304 ARG 305 TYR 306 ARG 307 ASP 308 GLY 309 TYR 310 VAL 311 SER 312 GLY 313 GLU 314 PRO 315 TRP 316 PRO 317 GLY 318 ALA 319 GLY 320 PRO 321 PRO 322 PRO 323 PRO 324 GLY 325 ARG 326 VAL 327 LEU 328 TYR 329 GLY 330 GLY 331 LEU 332 GLY 333 ASP 334 SER 335 ARG 336 PRO 337 GLY 338 LEU 339 TRP 340 GLY 341 ALA 342 PRO 343 GLU 344 ALA 345 GLU 346 GLU 347 ALA 348 ARG 349 ARG 350 ARG 351 PHE 352 GLU 353 ALA 354 SER 355 GLY 356 ALA 357 PRO 358 ALA 359 ALA 360 VAL 361 TRP 362 ALA 363 PRO 364 GLU 365 LEU 366 GLY 367 ASP 368 ALA 369 ALA 370 GLN 371 GLN 372 TYR 373 ALA 374 LEU 375 ILE 376 THR 377 ARG 378 LEU 379 LEU 380 TYR 381 THR 382 PRO 383 ASP 384 ALA 385 GLU 386 ALA 387 MET 388 GLY 389 TRP 390 LEU 391 GLN 392 ASN 393 PRO 394 ARG 395 VAL 396 VAL 397 PRO 398 GLY 399 ASP 400 VAL 401 ALA 402 LEU 403 ASP 404 GLN 405 ALA 406 CYS 407 PHE 408 ARG 409 ILE 410 SER 411 GLY 412 ALA 413 ALA 414 ARG 415 ASN 416 SER 417 SER 418 SER 419 PHE 420 ILE 421 THR 422 GLY 423 SER 424 VAL 425 ALA 426 ARG 427 ALA 428 VAL 429 PRO 430 HIS 431 LEU 432 GLY 433 TYR 434 ALA 435 MET 436 ALA 437 ALA 438 GLY 439 ARG 440 PHE 441 GLY 442 TRP 443 GLY 444 LEU 445 ALA 446 HIS 447 ALA 448 ALA 449 ALA 450 ALA 451 VAL 452 ALA 453 MET 454 SER 455 ARG 456 ARG 457 TYR 458 ASP 459 ARG 460 ALA 461 GLN 462 LYS 463 GLY 464 PHE 465 LEU 466 LEU 467 THR 468 SER 469 LEU 470 ARG 471 ARG 472 ALA 473 TYR 474 ALA 475 PRO 476 LEU 477 LEU 478 ALA 479 ARG 480 GLU 481 ASN 482 ALA 483 ALA 484 LEU 485 THR 486
Unit 7	ARG 289 ARG 290 VAL 291 GLU 292 LEU 293 ASP 294 ALA 295 ASP 296 ALA 297 THR 298 SER 299 GLY 300 ALA 301 PHE 302 TYR 303 ALA 304 ARG 305 TYR 306 ARG 307 ASP 308 GLY 309 TYR 310 VAL 311 SER 312 GLY 313 GLU 314 PRO 315 TRP 316 PRO 317 GLY 318 ALA 319 GLY 320 PRO 321 PRO 322 PRO 323 PRO 324 GLY 325 ARG 326 VAL 327 LEU 328 TYR 329 GLY 330 GLY 331 LEU 332 GLY 333 ASP 334 SER 335 ARG 336 PRO 337 GLY 338 LEU 339 TRP 340 GLY 341 ALA 342 PRO 343 GLU 344 ALA 345 GLU 346 GLU 347 ALA 348 ARG 349 ARG 350 ARG 351 PHE 352 GLU 353 ALA 354 SER 355 GLY 356 ALA 357 PRO 358 ALA 359 ALA 360 VAL 361 TRP 362 ALA 363 PRO 364 GLU 365 LEU 366 GLY 367 ASP 368 ALA 369 ALA 370 GLN 371 GLN 372 TYR 373 ALA 374 LEU 375 ILE 376 THR 377 ARG 378 LEU 379 LEU 380 TYR 381 THR 382 PRO 383 ASP 384 ALA 385 GLU 386 ALA 387 MET 388 GLY 389 TRP 390 LEU 391 GLN 392 ASN 393 PRO 394 ARG 395 VAL 396 VAL 397 PRO 398 GLY 399 ASP 400 VAL 401 ALA 402 LEU 403 ASP 404 GLN 405 ALA 406 CYS 407 PHE 408 ARG 409 ILE 410 SER 411 GLY 412 ALA 413 ALA 414 ARG 415 ASN 416 SER 417 SER 418 SER 419 PHE 420 ILE 421 THR 422 GLY 423 SER 424 VAL 425 ALA 426 ARG 427 ALA 428 VAL 429 PRO 430 HIS 431 LEU 432 GLY 433 TYR 434 ALA 435 MET 436 ALA 437 ALA 438 GLY 439 ARG 440 PHE 441 GLY 442 TRP 443 GLY 444 LEU 445 ALA 446 HIS 447 ALA 448 ALA 449 ALA 450 ALA 451 VAL 452 ALA 453 MET 454 SER 455 ARG 456 ARG 457 TYR 458 ASP 459 ARG 460 ALA 461 GLN 462 LYS 463 GLY 464 PHE 465 LEU 466 LEU 467 THR 468 SER 469 LEU 470 ARG 471 ARG 472 ALA 473 TYR 474 ALA 475 PRO 476 LEU 477 LEU 478 ALA 479 ARG 480 GLU 481 ASN 482 ALA 483 ALA 484 LEU 485
Unit 8	GLN 287 PRO 288 ARG 289 ARG 290 VAL 291 GLU 292 LEU 293 ASP 294 ALA 295 ASP 296 ALA 297 THR 298 SER 299 GLY 300 ALA 301 PHE 302 TYR 303 ALA 304 ARG 305 TYR 306 ARG 307 ASP 308 GLY 309 TYR 310 VAL 311 SER 312 GLY 313 GLU 314 PRO 315 TRP 316 PRO 317 GLY 318 ALA 319 GLY 320 PRO 321 PRO 322 PRO 323 PRO 324 GLY 325 ARG 326 VAL 327 LEU 328 TYR 329 GLY 330 GLY 331 LEU 332 GLY 333 ASP 334 SER 335 ARG 336 PRO 337 GLY 338 LEU 339 TRP 340 GLY 341 ALA 342 PRO 343 GLU 344 ALA 345 GLU 346 GLU 347 ALA 348 ARG 349 ARG 350 ARG 351 PHE 352 GLU 353 ALA 354 SER 355 GLY 356 ALA 357 PRO 358 ALA 359 ALA 360 VAL 361 TRP 362 ALA 363 PRO 364 GLU 365 LEU 366 GLY 367 ASP 368 ALA 369 ALA 370 GLN 371 GLN 372 TYR 373 ALA 374 LEU 375 ILE 376 THR 377 ARG 378 LEU 379 LEU 380 TYR 381 THR 382 PRO 383 ASP 384 ALA 385 GLU 386 ALA 387 MET 388 GLY 389 TRP 390 LEU 391 GLN 392 ASN 393 PRO 394 ARG 395 VAL 396 VAL 397 PRO 398 GLY 399 ASP 400 VAL 401 ALA 402 LEU 403 ASP 404 GLN 405 ALA 406 CYS 407 PHE 408 ARG 409 ILE 410 SER 411 GLY 412 ALA 413 ALA 414 ARG 415 ASN 416 SER 419 PHE 420 ILE 421 THR 422 GLY 423 SER 424 VAL 425 ALA 426 ARG 427 ALA 428 VAL 429 PRO 430 HIS 431 LEU 432 GLY 433 TYR 434 ALA 435 MET 436 ALA 437 ALA 438 GLY 439 ARG 440 PHE 441 GLY 442 TRP 443 GLY 444 LEU 445 ALA 446 HIS 447 ALA 448 ALA 449 ALA 450 ALA 451 VAL 452 ALA 453 MET 454 SER 455 ARG 456 ARG 457 TYR 458 ASP 459 ARG 460 ALA 461 GLN 462 LYS 463 GLY 464 PHE 465 LEU 466 LEU 467 THR 468 SER 469 LEU 470 ARG 471 ARG 472 ALA 473 TYR 474 ALA 475 PRO 476 LEU 477 LEU 478 ALA 479 ARG 480 GLU 481 ASN 482 ALA 483 ALA 484 LEU 485
Unit 9	PHE 283 THR 284

Other macromolecules

Unit 1	DG 21 DC 22 DT 23 DC 24 DC 25 DG 26 DT 27 DG 28 DT 29 DG 30 DG 31 DA 32 DC 33 DG 34 DA 35 DT 36 DC 37 DG 38 DG 39
Unit 2	DC 1 DC 2 DG 3 DA 4 DT 5 DC 6 DG 7 DT 8 DC 9 DC 10 DA 11 DC 12 DA 13 DC 14 DG 15 DG 16 DA 17 DG 18
Unit 3	DC 25 DG 26 DT 27 DG 28 DT 29 DG 30 DG 31 DA 32 DC 33 DG 34 DA 35 DT 36 DC 37 DG 38 DG 39
Unit 4	DC 1 DC 2 DG 3 DA 4 DT 5 DC 6 DG 7 DT 8 DC 9 DC 10 DA 11 DC 12 DA 13 DC 14 DG 15 DG 16

Ligands

Unit 10	MG 101
Unit 11	SO4 501 SO4 502
Unit 12	CL 501 SO4 502 SO4 503
Unit 13	SO4 501
Unit 14	SO4 501 SO4 502