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Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

Title CRYSTAL STRUCTURE OF THE SELF-ASSEMBLED PROPEPTIDES FROM APE
Keywords TRIMERIC COILED-COIL, HYDROLASE
Experiment X-ray diffraction
Number of Models  1


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PDB   5JHC     released     available     available     Quaternary Structure Server  


Asymmetric unit from PDB
 Unit     Type     Name   Chain ID   Residues   Atoms   Hetatoms 
1  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  A 24 173 0
2  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  C 24 158 0
3  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  E 24 172 0
4  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  G 24 179 0
5  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  I 24 173 0
6  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  K 24 189 0
7  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  M 24 186 0
8  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  O 24 170 0
9  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  Q 24 185 0
10  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  S 24 162 0
11  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  U 24 186 0
12  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  W 24 180 0
13  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  Y 20 116 0
14  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  B 24 167 0
15  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  a 23 156 0
16  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  b 23 151 0
17  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  D 22 152 0
18  Protein    F 24 172 0
19  Protein    c 24 166 0
20  Protein    H 23 181 0
21  Protein    d 24 172 0
22  Protein    J 24 176 0
23  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  e 24 179 0
24  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  L 24 191 0
25  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  f 24 173 0
26  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  N 24 180 0
27  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  g 24 164 0
28  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  P 23 177 0
29  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  h 24 177 0
30  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  R 24 182 0
31  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  i 24 173 0
32  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  T 24 182 0
33  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  j 24 186 0
34  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  V 24 177 0
35  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  k 24 176 0
36  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  X 24 173 0
37  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  l 24 184 0
38  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  Z 14 89 0
39  Protein   VACUOLAR AMINOPEPTIDASE 1  m 22 122 0
total       914 6607 0

Proteins
Unit 1 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 2 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 3 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 4 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 5 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 6 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 7 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 8 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 9 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 10 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 11 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 12 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 13 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18
Unit 14 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 15 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 16 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 17 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 18 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 19 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 20 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 21 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 22 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 23 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 24 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 25 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 26 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 27 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 28 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 29 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 30 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 31 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 32 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 33 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 34 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 35 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 36 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 37 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22
Unit 38 GLY-1 PRO0 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12
Unit 39 MET1 GLU2 GLU3 GLN4 ARG5 GLU6 ILE7 LEU8 GLU9 GLN10 LEU11 LYS12 LYS13 THR14 LEU15 GLN16 MET17 LEU18 THR19 VAL20 GLU21 LEU22

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Perl script:    PDBscan.pl  (15 Sep 2016)
Author:    Peter Slickers  (slickers@leibniz-fli.de),  IMB Jena,  Germany