5J34 - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: ISOPROPYLMALATE DEHYDROGENASE K232M MUTANT
• Keywords: DEHYDROGENASE, LEUCINE BIOSYNTHESIS, GLUCOSINOLATE BIOSYNTHE OXIDOREDUCTASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	5J34	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	3-ISOPROPYLMALATE DEHYDROGENASE 2, CHLOROPLASTIC	A	359	2708	0
2	Protein	3-ISOPROPYLMALATE DEHYDROGENASE 2, CHLOROPLASTIC	B	359	2708	0
3	Protein	3-ISOPROPYLMALATE DEHYDROGENASE 2, CHLOROPLASTIC	C	359	2708	0
4	Protein	3-ISOPROPYLMALATE DEHYDROGENASE 2, CHLOROPLASTIC	D	359	2708	0
5	Ligand	3-ISOPROPYLMALATE DEHYDROGENASE 2, CHLOROPLASTIC	A	4	0	16
6	Ligand	3-ISOPROPYLMALATE DEHYDROGENASE 2, CHLOROPLASTIC	B	2	0	6
7	Ligand	3-ISOPROPYLMALATE DEHYDROGENASE 2, CHLOROPLASTIC	C	2	0	6
8	Ligand	3-ISOPROPYLMALATE DEHYDROGENASE 2, CHLOROPLASTIC	D	2	0	6
9	Water			1456	0	1456
total				2902	10832	1490

Proteins

Unit 1	LYS 41 ARG 42 TYR 43 THR 44 ILE 45 THR 46 LEU 47 LEU 48 PRO 49 GLY 50 ASP 51 GLY 52 ILE 53 GLY 54 PRO 55 GLU 56 VAL 57 VAL 58 SER 59 ILE 60 ALA 61 LYS 62 ASN 63 VAL 64 LEU 65 GLN 66 GLN 67 ALA 68 GLY 69 SER 70 LEU 71 GLU 72 GLY 73 VAL 74 GLU 75 PHE 76 ASN 77 PHE 78 ARG 79 GLU 80 MET 81 PRO 82 ILE 83 GLY 84 GLY 85 ALA 86 ALA 87 LEU 88 ASP 89 LEU 90 VAL 91 GLY 92 VAL 93 PRO 94 LEU 95 PRO 96 GLU 97 GLU 98 THR 99 ILE 100 SER 101 ALA 102 ALA 103 LYS 104 GLU 105 SER 106 ASP 107 ALA 108 VAL 109 LEU 110 LEU 111 GLY 112 ALA 113 ILE 114 GLY 115 GLY 116 TYR 117 LYS 118 TRP 119 ASP 120 ASN 121 ASN 122 GLU 123 LYS 124 HIS 125 LEU 126 ARG 127 PRO 128 GLU 129 LYS 130 GLY 131 LEU 132 LEU 133 GLN 134 ILE 135 ARG 136 ALA 137 ALA 138 LEU 139 LYS 140 VAL 141 PHE 142 ALA 143 ASN 144 LEU 145 ARG 146 PRO 147 ALA 148 THR 149 VAL 150 LEU 151 PRO 152 GLN 153 LEU 154 VAL 155 ASP 156 ALA 157 SER 158 THR 159 LEU 160 LYS 161 ARG 162 GLU 163 VAL 164 ALA 165 GLU 166 GLY 167 VAL 168 ASP 169 LEU 170 MET 171 VAL 172 VAL 173 ARG 174 GLU 175 LEU 176 THR 177 GLY 178 GLY 179 ILE 180 TYR 181 PHE 182 GLY 183 GLU 184 PRO 185 ARG 186 GLY 187 ILE 188 LYS 189 THR 190 ASN 191 GLU 192 ASN 193 GLY 194 GLU 195 GLU 196 VAL 197 GLY 198 PHE 199 ASN 200 THR 201 GLU 202 VAL 203 TYR 204 ALA 205 ALA 206 HIS 207 GLU 208 ILE 209 ASP 210 ARG 211 ILE 212 ALA 213 ARG 214 VAL 215 ALA 216 PHE 217 GLU 218 THR 219 ALA 220 ARG 221 LYS 222 ARG 223 ARG 224 GLY 225 LYS 226 LEU 227 CYS 228 SER 229 VAL 230 ASP 231 MET 232 ALA 233 ASN 234 VAL 235 LEU 236 GLU 237 ALA 238 SER 239 ILE 240 LEU 241 TRP 242 ARG 243 LYS 244 ARG 245 VAL 246 THR 247 ALA 248 LEU 249 ALA 250 SER 251 GLU 252 TYR 253 PRO 254 ASP 255 VAL 256 GLU 257 LEU 258 SER 259 HIS 260 MET 261 TYR 262 VAL 263 ASP 264 ASN 265 ALA 266 ALA 267 MET 268 GLN 269 LEU 270 VAL 271 ARG 272 ASP 273 PRO 274 LYS 275 GLN 276 PHE 277 ASP 278 THR 279 ILE 280 VAL 281 THR 282 ASN 283 ASN 284 ILE 285 PHE 286 GLY 287 ASP 288 ILE 289 LEU 290 SER 291 ASP 292 GLU 293 ALA 294 SER 295 MET 296 ILE 297 THR 298 GLY 299 SER 300 ILE 301 GLY 302 MET 303 LEU 304 PRO 305 SER 306 ALA 307 SER 308 LEU 309 SER 310 ASP 311 SER 312 GLY 313 PRO 314 GLY 315 LEU 316 PHE 317 GLU 318 PRO 319 ILE 320 HIS 321 GLY 322 SER 323 ALA 324 PRO 325 ASP 326 ILE 327 ALA 328 GLY 329 GLN 330 ASP 331 LYS 332 ALA 333 ASN 334 PRO 335 LEU 336 ALA 337 THR 338 ILE 339 LEU 340 SER 341 ALA 342 ALA 343 MET 344 LEU 345 LEU 346 LYS 347 TYR 348 GLY 349 LEU 350 GLY 351 GLU 352 GLU 353 LYS 354 ALA 355 ALA 356 LYS 357 ARG 358 ILE 359 GLU 360 ASP 361 ALA 362 VAL 363 LEU 364 VAL 365 ALA 366 LEU 367 ASN 368 ASN 369 GLY 370 PHE 371 ARG 372 THR 373 GLY 374 ASP 375 ILE 376 TYR 377 SER 378 ALA 379 GLY 380 THR 381 LYS 382 LEU 383 VAL 384 GLY 385 CYS 386 LYS 387 GLU 388 MET 389 GLY 390 GLU 391 GLU 392 VAL 393 LEU 394 LYS 395 SER 396 VAL 397 ASP 398 SER 399
Unit 2	LYS 41 ARG 42 TYR 43 THR 44 ILE 45 THR 46 LEU 47 LEU 48 PRO 49 GLY 50 ASP 51 GLY 52 ILE 53 GLY 54 PRO 55 GLU 56 VAL 57 VAL 58 SER 59 ILE 60 ALA 61 LYS 62 ASN 63 VAL 64 LEU 65 GLN 66 GLN 67 ALA 68 GLY 69 SER 70 LEU 71 GLU 72 GLY 73 VAL 74 GLU 75 PHE 76 ASN 77 PHE 78 ARG 79 GLU 80 MET 81 PRO 82 ILE 83 GLY 84 GLY 85 ALA 86 ALA 87 LEU 88 ASP 89 LEU 90 VAL 91 GLY 92 VAL 93 PRO 94 LEU 95 PRO 96 GLU 97 GLU 98 THR 99 ILE 100 SER 101 ALA 102 ALA 103 LYS 104 GLU 105 SER 106 ASP 107 ALA 108 VAL 109 LEU 110 LEU 111 GLY 112 ALA 113 ILE 114 GLY 115 GLY 116 TYR 117 LYS 118 TRP 119 ASP 120 ASN 121 ASN 122 GLU 123 LYS 124 HIS 125 LEU 126 ARG 127 PRO 128 GLU 129 LYS 130 GLY 131 LEU 132 LEU 133 GLN 134 ILE 135 ARG 136 ALA 137 ALA 138 LEU 139 LYS 140 VAL 141 PHE 142 ALA 143 ASN 144 LEU 145 ARG 146 PRO 147 ALA 148 THR 149 VAL 150 LEU 151 PRO 152 GLN 153 LEU 154 VAL 155 ASP 156 ALA 157 SER 158 THR 159 LEU 160 LYS 161 ARG 162 GLU 163 VAL 164 ALA 165 GLU 166 GLY 167 VAL 168 ASP 169 LEU 170 MET 171 VAL 172 VAL 173 ARG 174 GLU 175 LEU 176 THR 177 GLY 178 GLY 179 ILE 180 TYR 181 PHE 182 GLY 183 GLU 184 PRO 185 ARG 186 GLY 187 ILE 188 LYS 189 THR 190 ASN 191 GLU 192 ASN 193 GLY 194 GLU 195 GLU 196 VAL 197 GLY 198 PHE 199 ASN 200 THR 201 GLU 202 VAL 203 TYR 204 ALA 205 ALA 206 HIS 207 GLU 208 ILE 209 ASP 210 ARG 211 ILE 212 ALA 213 ARG 214 VAL 215 ALA 216 PHE 217 GLU 218 THR 219 ALA 220 ARG 221 LYS 222 ARG 223 ARG 224 GLY 225 LYS 226 LEU 227 CYS 228 SER 229 VAL 230 ASP 231 MET 232 ALA 233 ASN 234 VAL 235 LEU 236 GLU 237 ALA 238 SER 239 ILE 240 LEU 241 TRP 242 ARG 243 LYS 244 ARG 245 VAL 246 THR 247 ALA 248 LEU 249 ALA 250 SER 251 GLU 252 TYR 253 PRO 254 ASP 255 VAL 256 GLU 257 LEU 258 SER 259 HIS 260 MET 261 TYR 262 VAL 263 ASP 264 ASN 265 ALA 266 ALA 267 MET 268 GLN 269 LEU 270 VAL 271 ARG 272 ASP 273 PRO 274 LYS 275 GLN 276 PHE 277 ASP 278 THR 279 ILE 280 VAL 281 THR 282 ASN 283 ASN 284 ILE 285 PHE 286 GLY 287 ASP 288 ILE 289 LEU 290 SER 291 ASP 292 GLU 293 ALA 294 SER 295 MET 296 ILE 297 THR 298 GLY 299 SER 300 ILE 301 GLY 302 MET 303 LEU 304 PRO 305 SER 306 ALA 307 SER 308 LEU 309 SER 310 ASP 311 SER 312 GLY 313 PRO 314 GLY 315 LEU 316 PHE 317 GLU 318 PRO 319 ILE 320 HIS 321 GLY 322 SER 323 ALA 324 PRO 325 ASP 326 ILE 327 ALA 328 GLY 329 GLN 330 ASP 331 LYS 332 ALA 333 ASN 334 PRO 335 LEU 336 ALA 337 THR 338 ILE 339 LEU 340 SER 341 ALA 342 ALA 343 MET 344 LEU 345 LEU 346 LYS 347 TYR 348 GLY 349 LEU 350 GLY 351 GLU 352 GLU 353 LYS 354 ALA 355 ALA 356 LYS 357 ARG 358 ILE 359 GLU 360 ASP 361 ALA 362 VAL 363 LEU 364 VAL 365 ALA 366 LEU 367 ASN 368 ASN 369 GLY 370 PHE 371 ARG 372 THR 373 GLY 374 ASP 375 ILE 376 TYR 377 SER 378 ALA 379 GLY 380 THR 381 LYS 382 LEU 383 VAL 384 GLY 385 CYS 386 LYS 387 GLU 388 MET 389 GLY 390 GLU 391 GLU 392 VAL 393 LEU 394 LYS 395 SER 396 VAL 397 ASP 398 SER 399
Unit 3	LYS 41 ARG 42 TYR 43 THR 44 ILE 45 THR 46 LEU 47 LEU 48 PRO 49 GLY 50 ASP 51 GLY 52 ILE 53 GLY 54 PRO 55 GLU 56 VAL 57 VAL 58 SER 59 ILE 60 ALA 61 LYS 62 ASN 63 VAL 64 LEU 65 GLN 66 GLN 67 ALA 68 GLY 69 SER 70 LEU 71 GLU 72 GLY 73 VAL 74 GLU 75 PHE 76 ASN 77 PHE 78 ARG 79 GLU 80 MET 81 PRO 82 ILE 83 GLY 84 GLY 85 ALA 86 ALA 87 LEU 88 ASP 89 LEU 90 VAL 91 GLY 92 VAL 93 PRO 94 LEU 95 PRO 96 GLU 97 GLU 98 THR 99 ILE 100 SER 101 ALA 102 ALA 103 LYS 104 GLU 105 SER 106 ASP 107 ALA 108 VAL 109 LEU 110 LEU 111 GLY 112 ALA 113 ILE 114 GLY 115 GLY 116 TYR 117 LYS 118 TRP 119 ASP 120 ASN 121 ASN 122 GLU 123 LYS 124 HIS 125 LEU 126 ARG 127 PRO 128 GLU 129 LYS 130 GLY 131 LEU 132 LEU 133 GLN 134 ILE 135 ARG 136 ALA 137 ALA 138 LEU 139 LYS 140 VAL 141 PHE 142 ALA 143 ASN 144 LEU 145 ARG 146 PRO 147 ALA 148 THR 149 VAL 150 LEU 151 PRO 152 GLN 153 LEU 154 VAL 155 ASP 156 ALA 157 SER 158 THR 159 LEU 160 LYS 161 ARG 162 GLU 163 VAL 164 ALA 165 GLU 166 GLY 167 VAL 168 ASP 169 LEU 170 MET 171 VAL 172 VAL 173 ARG 174 GLU 175 LEU 176 THR 177 GLY 178 GLY 179 ILE 180 TYR 181 PHE 182 GLY 183 GLU 184 PRO 185 ARG 186 GLY 187 ILE 188 LYS 189 THR 190 ASN 191 GLU 192 ASN 193 GLY 194 GLU 195 GLU 196 VAL 197 GLY 198 PHE 199 ASN 200 THR 201 GLU 202 VAL 203 TYR 204 ALA 205 ALA 206 HIS 207 GLU 208 ILE 209 ASP 210 ARG 211 ILE 212 ALA 213 ARG 214 VAL 215 ALA 216 PHE 217 GLU 218 THR 219 ALA 220 ARG 221 LYS 222 ARG 223 ARG 224 GLY 225 LYS 226 LEU 227 CYS 228 SER 229 VAL 230 ASP 231 MET 232 ALA 233 ASN 234 VAL 235 LEU 236 GLU 237 ALA 238 SER 239 ILE 240 LEU 241 TRP 242 ARG 243 LYS 244 ARG 245 VAL 246 THR 247 ALA 248 LEU 249 ALA 250 SER 251 GLU 252 TYR 253 PRO 254 ASP 255 VAL 256 GLU 257 LEU 258 SER 259 HIS 260 MET 261 TYR 262 VAL 263 ASP 264 ASN 265 ALA 266 ALA 267 MET 268 GLN 269 LEU 270 VAL 271 ARG 272 ASP 273 PRO 274 LYS 275 GLN 276 PHE 277 ASP 278 THR 279 ILE 280 VAL 281 THR 282 ASN 283 ASN 284 ILE 285 PHE 286 GLY 287 ASP 288 ILE 289 LEU 290 SER 291 ASP 292 GLU 293 ALA 294 SER 295 MET 296 ILE 297 THR 298 GLY 299 SER 300 ILE 301 GLY 302 MET 303 LEU 304 PRO 305 SER 306 ALA 307 SER 308 LEU 309 SER 310 ASP 311 SER 312 GLY 313 PRO 314 GLY 315 LEU 316 PHE 317 GLU 318 PRO 319 ILE 320 HIS 321 GLY 322 SER 323 ALA 324 PRO 325 ASP 326 ILE 327 ALA 328 GLY 329 GLN 330 ASP 331 LYS 332 ALA 333 ASN 334 PRO 335 LEU 336 ALA 337 THR 338 ILE 339 LEU 340 SER 341 ALA 342 ALA 343 MET 344 LEU 345 LEU 346 LYS 347 TYR 348 GLY 349 LEU 350 GLY 351 GLU 352 GLU 353 LYS 354 ALA 355 ALA 356 LYS 357 ARG 358 ILE 359 GLU 360 ASP 361 ALA 362 VAL 363 LEU 364 VAL 365 ALA 366 LEU 367 ASN 368 ASN 369 GLY 370 PHE 371 ARG 372 THR 373 GLY 374 ASP 375 ILE 376 TYR 377 SER 378 ALA 379 GLY 380 THR 381 LYS 382 LEU 383 VAL 384 GLY 385 CYS 386 LYS 387 GLU 388 MET 389 GLY 390 GLU 391 GLU 392 VAL 393 LEU 394 LYS 395 SER 396 VAL 397 ASP 398 SER 399
Unit 4	LYS 41 ARG 42 TYR 43 THR 44 ILE 45 THR 46 LEU 47 LEU 48 PRO 49 GLY 50 ASP 51 GLY 52 ILE 53 GLY 54 PRO 55 GLU 56 VAL 57 VAL 58 SER 59 ILE 60 ALA 61 LYS 62 ASN 63 VAL 64 LEU 65 GLN 66 GLN 67 ALA 68 GLY 69 SER 70 LEU 71 GLU 72 GLY 73 VAL 74 GLU 75 PHE 76 ASN 77 PHE 78 ARG 79 GLU 80 MET 81 PRO 82 ILE 83 GLY 84 GLY 85 ALA 86 ALA 87 LEU 88 ASP 89 LEU 90 VAL 91 GLY 92 VAL 93 PRO 94 LEU 95 PRO 96 GLU 97 GLU 98 THR 99 ILE 100 SER 101 ALA 102 ALA 103 LYS 104 GLU 105 SER 106 ASP 107 ALA 108 VAL 109 LEU 110 LEU 111 GLY 112 ALA 113 ILE 114 GLY 115 GLY 116 TYR 117 LYS 118 TRP 119 ASP 120 ASN 121 ASN 122 GLU 123 LYS 124 HIS 125 LEU 126 ARG 127 PRO 128 GLU 129 LYS 130 GLY 131 LEU 132 LEU 133 GLN 134 ILE 135 ARG 136 ALA 137 ALA 138 LEU 139 LYS 140 VAL 141 PHE 142 ALA 143 ASN 144 LEU 145 ARG 146 PRO 147 ALA 148 THR 149 VAL 150 LEU 151 PRO 152 GLN 153 LEU 154 VAL 155 ASP 156 ALA 157 SER 158 THR 159 LEU 160 LYS 161 ARG 162 GLU 163 VAL 164 ALA 165 GLU 166 GLY 167 VAL 168 ASP 169 LEU 170 MET 171 VAL 172 VAL 173 ARG 174 GLU 175 LEU 176 THR 177 GLY 178 GLY 179 ILE 180 TYR 181 PHE 182 GLY 183 GLU 184 PRO 185 ARG 186 GLY 187 ILE 188 LYS 189 THR 190 ASN 191 GLU 192 ASN 193 GLY 194 GLU 195 GLU 196 VAL 197 GLY 198 PHE 199 ASN 200 THR 201 GLU 202 VAL 203 TYR 204 ALA 205 ALA 206 HIS 207 GLU 208 ILE 209 ASP 210 ARG 211 ILE 212 ALA 213 ARG 214 VAL 215 ALA 216 PHE 217 GLU 218 THR 219 ALA 220 ARG 221 LYS 222 ARG 223 ARG 224 GLY 225 LYS 226 LEU 227 CYS 228 SER 229 VAL 230 ASP 231 MET 232 ALA 233 ASN 234 VAL 235 LEU 236 GLU 237 ALA 238 SER 239 ILE 240 LEU 241 TRP 242 ARG 243 LYS 244 ARG 245 VAL 246 THR 247 ALA 248 LEU 249 ALA 250 SER 251 GLU 252 TYR 253 PRO 254 ASP 255 VAL 256 GLU 257 LEU 258 SER 259 HIS 260 MET 261 TYR 262 VAL 263 ASP 264 ASN 265 ALA 266 ALA 267 MET 268 GLN 269 LEU 270 VAL 271 ARG 272 ASP 273 PRO 274 LYS 275 GLN 276 PHE 277 ASP 278 THR 279 ILE 280 VAL 281 THR 282 ASN 283 ASN 284 ILE 285 PHE 286 GLY 287 ASP 288 ILE 289 LEU 290 SER 291 ASP 292 GLU 293 ALA 294 SER 295 MET 296 ILE 297 THR 298 GLY 299 SER 300 ILE 301 GLY 302 MET 303 LEU 304 PRO 305 SER 306 ALA 307 SER 308 LEU 309 SER 310 ASP 311 SER 312 GLY 313 PRO 314 GLY 315 LEU 316 PHE 317 GLU 318 PRO 319 ILE 320 HIS 321 GLY 322 SER 323 ALA 324 PRO 325 ASP 326 ILE 327 ALA 328 GLY 329 GLN 330 ASP 331 LYS 332 ALA 333 ASN 334 PRO 335 LEU 336 ALA 337 THR 338 ILE 339 LEU 340 SER 341 ALA 342 ALA 343 MET 344 LEU 345 LEU 346 LYS 347 TYR 348 GLY 349 LEU 350 GLY 351 GLU 352 GLU 353 LYS 354 ALA 355 ALA 356 LYS 357 ARG 358 ILE 359 GLU 360 ASP 361 ALA 362 VAL 363 LEU 364 VAL 365 ALA 366 LEU 367 ASN 368 ASN 369 GLY 370 PHE 371 ARG 372 THR 373 GLY 374 ASP 375 ILE 376 TYR 377 SER 378 ALA 379 GLY 380 THR 381 LYS 382 LEU 383 VAL 384 GLY 385 CYS 386 LYS 387 GLU 388 MET 389 GLY 390 GLU 391 GLU 392 VAL 393 LEU 394 LYS 395 SER 396 VAL 397 ASP 398 SER 399

Ligands

Unit 5	MG 501 SO4 502 SO4 503 SO4 504
Unit 6	MG 501 SO4 502
Unit 7	MG 501 SO4 502
Unit 8	MG 501 SO4 502