5ITY - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NEIL1(P2G) BOUND TO DUPLEX DNA CO THYMINE GLYCOL
• Keywords: DNA GLYCOSYLASE NEIL1 FPG NEI BASE EXCISION REPAIR, DNA BIND PROTEIN-DNA COMPLEX
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	5ITY	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	ENDONUCLEASE 8-LIKE 1	A	292	4681	28
2	Protein	ENDONUCLEASE 8-LIKE 1	B	262	2078	0
3	Protein	ENDONUCLEASE 8-LIKE 1	C	292	4681	28
4	Other macromolecule	DNA (26-MER)	D	26	505	22
5	Protein	DNA (26-MER)	E	292	4681	28
6	Other macromolecule	DNA (26-MER)	F	26	505	22
7	Protein	ENDONUCLEASE 8-LIKE 1	B	292	4681	28
8	Water			360	0	360
total				1842	21812	516

Proteins

Unit 1	GLY 2 GLU 3 GLY 4 PRO 5 GLU 6 LEU 7 HIS 8 LEU 9 ALA 10 SER 11 GLN 12 PHE 13 VAL 14 ASN 15 GLU 16 ALA 17 CYS 18 ARG 19 ALA 20 LEU 21 VAL 22 PHE 23 GLY 24 GLY 25 CYS 26 VAL 27 GLU 28 LYS 29 SER 30 SER 31 VAL 32 SER 33 ARG 34 ASN 35 PRO 36 GLU 37 VAL 38 PRO 39 PHE 40 GLU 41 SER 42 SER 43 ALA 44 TYR 45 ARG 46 ILE 47 SER 48 ALA 49 SER 50 ALA 51 ARG 52 GLY 53 LYS 54 GLU 55 LEU 56 ARG 57 LEU 58 ILE 59 LEU 60 SER 61 PRO 62 LEU 63 PRO 64 GLY 65 ALA 66 GLN 67 PRO 68 GLN 69 GLN 70 GLU 71 PRO 72 LEU 73 ALA 74 LEU 75 VAL 76 PHE 77 ARG 78 PHE 79 GLY 80 MET 81 SER 82 GLY 83 SER 84 PHE 85 GLN 86 LEU 87 VAL 88 PRO 89 ARG 90 GLU 91 GLU 92 LEU 93 PRO 94 ARG 95 HIS 96 ALA 97 HIS 98 LEU 99 ARG 100 PHE 101 TYR 102 THR 103 ALA 104 PRO 105 PRO 106 GLY 107 PRO 108 ARG 109 LEU 110 ALA 111 LEU 112 CYS 113 PHE 114 VAL 115 ASP 116 ILE 117 ARG 118 ARG 119 PHE 120 GLY 121 ARG 122 TRP 123 ASP 124 LEU 125 GLY 126 GLY 127 LYS 128 TRP 129 GLN 130 PRO 131 GLY 132 ARG 133 GLY 134 PRO 135 CYS 136 VAL 137 LEU 138 GLN 139 GLU 140 TYR 141 GLN 142 GLN 143 PHE 144 ARG 145 GLU 146 ASN 147 VAL 148 LEU 149 ARG 150 ASN 151 LEU 152 ALA 153 ASP 154 LYS 155 ALA 156 PHE 157 ASP 158 ARG 159 PRO 160 ILE 161 CYS 162 GLU 163 ALA 164 LEU 165 LEU 166 ASP 167 GLN 168 ARG 169 PHE 170 PHE 171 ASN 172 GLY 173 ILE 174 GLY 175 ASN 176 TYR 177 LEU 178 ARG 179 ALA 180 GLU 181 ILE 182 LEU 183 TYR 184 ARG 185 LEU 186 LYS 187 ILE 188 PRO 189 PRO 190 PHE 191 GLU 192 LYS 193 ALA 194 ARG 195 SER 196 VAL 197 LEU 198 GLU 199 ALA 200 LEU 201 GLN 202 ASN 222 PRO 223 ASP 224 LEU 225 LEU 226 GLU 227 LEU 228 CYS 229 HIS 230 SER 231 VAL 232 PRO 233 LYS 234 GLU 235 VAL 236 VAL 237 GLN 238 LEU 239 GLY 240 GLY 241 ARG 242 GLY 243 TYR 244 GLU 250 GLU 251 ASP 252 PHE 253 ALA 254 ALA 255 PHE 256 ARG 257 ALA 258 TRP 259 LEU 260 ARG 261 CYS 262 TYR 263 GLY 264 MET 265 PRO 266 GLY 267 MET 268 SER 269 SER 270 LEU 271 GLN 272 ASP 273 ARG 274 HIS 275 GLY 276 ARG 277 THR 278 ILE 279 TRP 280 PHE 281 GLN 282 GLY 283 ASP 284 PRO 285 GLY 286 PRO 287 LEU 288 ALA 289 PRO 290 DC 291 DG 292 DT 293 DC 294 DC 295 DA 296 CTG 297 DG 298 DT 299 DC 300 DT 301 DA 302 DC 303 DT 306 DA 307 DG 308 DA 309 DC 310 DC 311 DT 312 DG 313 DG 314 DA 315 DC 316 DG 317 DG 318 GOL 501
Unit 2	GLY 2 GLU 3 GLY 4 PRO 5 GLU 6 LEU 7 HIS 8 LEU 9 ALA 10 SER 11 GLN 12 PHE 13 VAL 14 ASN 15 GLU 16 ALA 17 CYS 18 ARG 19 ALA 20 LEU 21 VAL 22 PHE 23 GLY 24 GLY 25 CYS 26 VAL 27 GLU 28 LYS 29 SER 30 SER 31 VAL 32 SER 33 ARG 34 ASN 35 PRO 36 GLU 37 VAL 38 PRO 39 PHE 40 GLU 41 SER 42 SER 43 ALA 44 TYR 45 ARG 46 ILE 47 SER 48 ALA 49 SER 50 ALA 51 ARG 52 GLY 53 LYS 54 GLU 55 LEU 56 ARG 57 LEU 58 ILE 59 LEU 60 SER 61 PRO 62 LEU 63 PRO 64 GLY 65 ALA 66 GLN 67 PRO 68 GLN 69 GLN 70 GLU 71 PRO 72 LEU 73 ALA 74 LEU 75 VAL 76 PHE 77 ARG 78 PHE 79 GLY 80 MET 81 SER 82 GLY 83 SER 84 PHE 85 GLN 86 LEU 87 VAL 88 PRO 89 ARG 90 GLU 91 GLU 92 LEU 93 PRO 94 ARG 95 HIS 96 ALA 97 HIS 98 LEU 99 ARG 100 PHE 101 TYR 102 THR 103 ALA 104 PRO 105 PRO 106 GLY 107 PRO 108 ARG 109 LEU 110 ALA 111 LEU 112 CYS 113 PHE 114 VAL 115 ASP 116 ILE 117 ARG 118 ARG 119 PHE 120 GLY 121 ARG 122 TRP 123 ASP 124 LEU 125 GLY 126 GLY 127 LYS 128 TRP 129 GLN 130 PRO 131 GLY 132 ARG 133 GLY 134 PRO 135 CYS 136 VAL 137 LEU 138 GLN 139 GLU 140 TYR 141 GLN 142 GLN 143 PHE 144 ARG 145 GLU 146 ASN 147 VAL 148 LEU 149 ARG 150 ASN 151 LEU 152 ALA 153 ASP 154 LYS 155 ALA 156 PHE 157 ASP 158 ARG 159 PRO 160 ILE 161 CYS 162 GLU 163 ALA 164 LEU 165 LEU 166 ASP 167 GLN 168 ARG 169 PHE 170 PHE 171 ASN 172 GLY 173 ILE 174 GLY 175 ASN 176 TYR 177 LEU 178 ARG 179 ALA 180 GLU 181 ILE 182 LEU 183 TYR 184 ARG 185 LEU 186 LYS 187 ILE 188 PRO 189 PRO 190 PHE 191 GLU 192 LYS 193 ALA 194 ARG 195 SER 196 VAL 197 LEU 198 GLU 199 ALA 200 LEU 201 ASN 222 PRO 223 ASP 224 LEU 225 LEU 226 GLU 227 LEU 228 CYS 229 HIS 230 SER 231 VAL 232 PRO 233 LYS 234 GLU 235 VAL 236 VAL 237 GLN 238 LEU 239 GLY 240 GLY 241 ARG 242 GLY 243 TYR 244 ASP 252 PHE 253 ALA 254 ALA 255 PHE 256 ARG 257 ALA 258 TRP 259 LEU 260 ARG 261 CYS 262 TYR 263 GLY 264 MET 265 PRO 266 GLY 267 MET 268 SER 269 SER 270 LEU 271 GLN 272 ASP 273 ARG 274 HIS 275 GLY 276 ARG 277 THR 278 ILE 279 TRP 280 PHE 281 GLN 282 GLY 283 ASP 284 PRO 285 GLY 286 PRO 287 LEU 288 ALA 289 PRO 290
Unit 3	GLY 2 GLU 3 GLY 4 PRO 5 GLU 6 LEU 7 HIS 8 LEU 9 ALA 10 SER 11 GLN 12 PHE 13 VAL 14 ASN 15 GLU 16 ALA 17 CYS 18 ARG 19 ALA 20 LEU 21 VAL 22 PHE 23 GLY 24 GLY 25 CYS 26 VAL 27 GLU 28 LYS 29 SER 30 SER 31 VAL 32 SER 33 ARG 34 ASN 35 PRO 36 GLU 37 VAL 38 PRO 39 PHE 40 GLU 41 SER 42 SER 43 ALA 44 TYR 45 ARG 46 ILE 47 SER 48 ALA 49 SER 50 ALA 51 ARG 52 GLY 53 LYS 54 GLU 55 LEU 56 ARG 57 LEU 58 ILE 59 LEU 60 SER 61 PRO 62 LEU 63 PRO 64 GLY 65 ALA 66 GLN 67 PRO 68 GLN 69 GLN 70 GLU 71 PRO 72 LEU 73 ALA 74 LEU 75 VAL 76 PHE 77 ARG 78 PHE 79 GLY 80 MET 81 SER 82 GLY 83 SER 84 PHE 85 GLN 86 LEU 87 VAL 88 PRO 89 ARG 90 GLU 91 GLU 92 LEU 93 PRO 94 ARG 95 HIS 96 ALA 97 HIS 98 LEU 99 ARG 100 PHE 101 TYR 102 THR 103 ALA 104 PRO 105 PRO 106 GLY 107 PRO 108 ARG 109 LEU 110 ALA 111 LEU 112 CYS 113 PHE 114 VAL 115 ASP 116 ILE 117 ARG 118 ARG 119 PHE 120 GLY 121 ARG 122 TRP 123 ASP 124 LEU 125 GLY 126 GLY 127 LYS 128 TRP 129 GLN 130 PRO 131 GLY 132 ARG 133 GLY 134 PRO 135 CYS 136 VAL 137 LEU 138 GLN 139 GLU 140 TYR 141 GLN 142 GLN 143 PHE 144 ARG 145 GLU 146 ASN 147 VAL 148 LEU 149 ARG 150 ASN 151 LEU 152 ALA 153 ASP 154 LYS 155 ALA 156 PHE 157 ASP 158 ARG 159 PRO 160 ILE 161 CYS 162 GLU 163 ALA 164 LEU 165 LEU 166 ASP 167 GLN 168 ARG 169 PHE 170 PHE 171 ASN 172 GLY 173 ILE 174 GLY 175 ASN 176 TYR 177 LEU 178 ARG 179 ALA 180 GLU 181 ILE 182 LEU 183 TYR 184 ARG 185 LEU 186 LYS 187 ILE 188 PRO 189 PRO 190 PHE 191 GLU 192 LYS 193 ALA 194 ARG 195 SER 196 VAL 197 LEU 198 GLU 199 ALA 200 LEU 201 GLN 202 ASN 222 PRO 223 ASP 224 LEU 225 LEU 226 GLU 227 LEU 228 CYS 229 HIS 230 SER 231 VAL 232 PRO 233 LYS 234 GLU 235 VAL 236 VAL 237 GLN 238 LEU 239 GLY 240 GLY 241 ARG 242 GLY 243 TYR 244 GLU 250 GLU 251 ASP 252 PHE 253 ALA 254 ALA 255 PHE 256 ARG 257 ALA 258 TRP 259 LEU 260 ARG 261 CYS 262 TYR 263 GLY 264 MET 265 PRO 266 GLY 267 MET 268 SER 269 SER 270 LEU 271 GLN 272 ASP 273 ARG 274 HIS 275 GLY 276 ARG 277 THR 278 ILE 279 TRP 280 PHE 281 GLN 282 GLY 283 ASP 284 PRO 285 GLY 286 PRO 287 LEU 288 ALA 289 PRO 290 DC 291 DG 292 DT 293 DC 294 DC 295 DA 296 CTG 297 DG 298 DT 299 DC 300 DT 301 DA 302 DC 303 DT 306 DA 307 DG 308 DA 309 DC 310 DC 311 DT 312 DG 313 DG 314 DA 315 DC 316 DG 317 DG 318 GOL 501
Unit 5	GLY 2 GLU 3 GLY 4 PRO 5 GLU 6 LEU 7 HIS 8 LEU 9 ALA 10 SER 11 GLN 12 PHE 13 VAL 14 ASN 15 GLU 16 ALA 17 CYS 18 ARG 19 ALA 20 LEU 21 VAL 22 PHE 23 GLY 24 GLY 25 CYS 26 VAL 27 GLU 28 LYS 29 SER 30 SER 31 VAL 32 SER 33 ARG 34 ASN 35 PRO 36 GLU 37 VAL 38 PRO 39 PHE 40 GLU 41 SER 42 SER 43 ALA 44 TYR 45 ARG 46 ILE 47 SER 48 ALA 49 SER 50 ALA 51 ARG 52 GLY 53 LYS 54 GLU 55 LEU 56 ARG 57 LEU 58 ILE 59 LEU 60 SER 61 PRO 62 LEU 63 PRO 64 GLY 65 ALA 66 GLN 67 PRO 68 GLN 69 GLN 70 GLU 71 PRO 72 LEU 73 ALA 74 LEU 75 VAL 76 PHE 77 ARG 78 PHE 79 GLY 80 MET 81 SER 82 GLY 83 SER 84 PHE 85 GLN 86 LEU 87 VAL 88 PRO 89 ARG 90 GLU 91 GLU 92 LEU 93 PRO 94 ARG 95 HIS 96 ALA 97 HIS 98 LEU 99 ARG 100 PHE 101 TYR 102 THR 103 ALA 104 PRO 105 PRO 106 GLY 107 PRO 108 ARG 109 LEU 110 ALA 111 LEU 112 CYS 113 PHE 114 VAL 115 ASP 116 ILE 117 ARG 118 ARG 119 PHE 120 GLY 121 ARG 122 TRP 123 ASP 124 LEU 125 GLY 126 GLY 127 LYS 128 TRP 129 GLN 130 PRO 131 GLY 132 ARG 133 GLY 134 PRO 135 CYS 136 VAL 137 LEU 138 GLN 139 GLU 140 TYR 141 GLN 142 GLN 143 PHE 144 ARG 145 GLU 146 ASN 147 VAL 148 LEU 149 ARG 150 ASN 151 LEU 152 ALA 153 ASP 154 LYS 155 ALA 156 PHE 157 ASP 158 ARG 159 PRO 160 ILE 161 CYS 162 GLU 163 ALA 164 LEU 165 LEU 166 ASP 167 GLN 168 ARG 169 PHE 170 PHE 171 ASN 172 GLY 173 ILE 174 GLY 175 ASN 176 TYR 177 LEU 178 ARG 179 ALA 180 GLU 181 ILE 182 LEU 183 TYR 184 ARG 185 LEU 186 LYS 187 ILE 188 PRO 189 PRO 190 PHE 191 GLU 192 LYS 193 ALA 194 ARG 195 SER 196 VAL 197 LEU 198 GLU 199 ALA 200 LEU 201 GLN 202 ASN 222 PRO 223 ASP 224 LEU 225 LEU 226 GLU 227 LEU 228 CYS 229 HIS 230 SER 231 VAL 232 PRO 233 LYS 234 GLU 235 VAL 236 VAL 237 GLN 238 LEU 239 GLY 240 GLY 241 ARG 242 GLY 243 TYR 244 GLU 250 GLU 251 ASP 252 PHE 253 ALA 254 ALA 255 PHE 256 ARG 257 ALA 258 TRP 259 LEU 260 ARG 261 CYS 262 TYR 263 GLY 264 MET 265 PRO 266 GLY 267 MET 268 SER 269 SER 270 LEU 271 GLN 272 ASP 273 ARG 274 HIS 275 GLY 276 ARG 277 THR 278 ILE 279 TRP 280 PHE 281 GLN 282 GLY 283 ASP 284 PRO 285 GLY 286 PRO 287 LEU 288 ALA 289 PRO 290 DC 291 DG 292 DT 293 DC 294 DC 295 DA 296 CTG 297 DG 298 DT 299 DC 300 DT 301 DA 302 DC 303 DT 306 DA 307 DG 308 DA 309 DC 310 DC 311 DT 312 DG 313 DG 314 DA 315 DC 316 DG 317 DG 318 GOL 501
Unit 7	GLY 2 GLU 3 GLY 4 PRO 5 GLU 6 LEU 7 HIS 8 LEU 9 ALA 10 SER 11 GLN 12 PHE 13 VAL 14 ASN 15 GLU 16 ALA 17 CYS 18 ARG 19 ALA 20 LEU 21 VAL 22 PHE 23 GLY 24 GLY 25 CYS 26 VAL 27 GLU 28 LYS 29 SER 30 SER 31 VAL 32 SER 33 ARG 34 ASN 35 PRO 36 GLU 37 VAL 38 PRO 39 PHE 40 GLU 41 SER 42 SER 43 ALA 44 TYR 45 ARG 46 ILE 47 SER 48 ALA 49 SER 50 ALA 51 ARG 52 GLY 53 LYS 54 GLU 55 LEU 56 ARG 57 LEU 58 ILE 59 LEU 60 SER 61 PRO 62 LEU 63 PRO 64 GLY 65 ALA 66 GLN 67 PRO 68 GLN 69 GLN 70 GLU 71 PRO 72 LEU 73 ALA 74 LEU 75 VAL 76 PHE 77 ARG 78 PHE 79 GLY 80 MET 81 SER 82 GLY 83 SER 84 PHE 85 GLN 86 LEU 87 VAL 88 PRO 89 ARG 90 GLU 91 GLU 92 LEU 93 PRO 94 ARG 95 HIS 96 ALA 97 HIS 98 LEU 99 ARG 100 PHE 101 TYR 102 THR 103 ALA 104 PRO 105 PRO 106 GLY 107 PRO 108 ARG 109 LEU 110 ALA 111 LEU 112 CYS 113 PHE 114 VAL 115 ASP 116 ILE 117 ARG 118 ARG 119 PHE 120 GLY 121 ARG 122 TRP 123 ASP 124 LEU 125 GLY 126 GLY 127 LYS 128 TRP 129 GLN 130 PRO 131 GLY 132 ARG 133 GLY 134 PRO 135 CYS 136 VAL 137 LEU 138 GLN 139 GLU 140 TYR 141 GLN 142 GLN 143 PHE 144 ARG 145 GLU 146 ASN 147 VAL 148 LEU 149 ARG 150 ASN 151 LEU 152 ALA 153 ASP 154 LYS 155 ALA 156 PHE 157 ASP 158 ARG 159 PRO 160 ILE 161 CYS 162 GLU 163 ALA 164 LEU 165 LEU 166 ASP 167 GLN 168 ARG 169 PHE 170 PHE 171 ASN 172 GLY 173 ILE 174 GLY 175 ASN 176 TYR 177 LEU 178 ARG 179 ALA 180 GLU 181 ILE 182 LEU 183 TYR 184 ARG 185 LEU 186 LYS 187 ILE 188 PRO 189 PRO 190 PHE 191 GLU 192 LYS 193 ALA 194 ARG 195 SER 196 VAL 197 LEU 198 GLU 199 ALA 200 LEU 201 GLN 202 ASN 222 PRO 223 ASP 224 LEU 225 LEU 226 GLU 227 LEU 228 CYS 229 HIS 230 SER 231 VAL 232 PRO 233 LYS 234 GLU 235 VAL 236 VAL 237 GLN 238 LEU 239 GLY 240 GLY 241 ARG 242 GLY 243 TYR 244 GLU 250 GLU 251 ASP 252 PHE 253 ALA 254 ALA 255 PHE 256 ARG 257 ALA 258 TRP 259 LEU 260 ARG 261 CYS 262 TYR 263 GLY 264 MET 265 PRO 266 GLY 267 MET 268 SER 269 SER 270 LEU 271 GLN 272 ASP 273 ARG 274 HIS 275 GLY 276 ARG 277 THR 278 ILE 279 TRP 280 PHE 281 GLN 282 GLY 283 ASP 284 PRO 285 GLY 286 PRO 287 LEU 288 ALA 289 PRO 290 DC 291 DG 292 DT 293 DC 294 DC 295 DA 296 CTG 297 DG 298 DT 299 DC 300 DT 301 DA 302 DC 303 DT 306 DA 307 DG 308 DA 309 DC 310 DC 311 DT 312 DG 313 DG 314 DA 315 DC 316 DG 317 DG 318 GOL 501

Other macromolecules

Unit 4	DC 291 DG 292 DT 293 DC 294 DC 295 DA 296 CTG 297 DG 298 DT 299 DC 300 DT 301 DA 302 DC 303 DT 306 DA 307 DG 308 DA 309 DC 310 DC 311 DT 312 DG 313 DG 314 DA 315 DC 316 DG 317 DG 318
Unit 6	DC 291 DG 292 DT 293 DC 294 DC 295 DA 296 CTG 297 DG 298 DT 299 DC 300 DT 301 DA 302 DC 303 DT 306 DA 307 DG 308 DA 309 DC 310 DC 311 DT 312 DG 313 DG 314 DA 315 DC 316 DG 317 DG 318