5H8W - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: XPD MECHANISM
• Keywords: HELICASE, HYDROLASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	5H8W	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	ATP-DEPENDENT DNA HELICASE TA0057	A	596	4792	0
2	Other macromolecule	DNA (5'-D(P*TP*AP*CP*GP*A)-3')	E	5	87	0
3	Ligand	ATP-DEPENDENT DNA HELICASE TA0057	A	3	0	10
4	Water			43	0	43
total				647	4879	53

Proteins

Unit 1

GLN 20 LYS 21 SER 22 TYR 23 GLY 24 VAL 25 ALA 26 LEU 27 GLU 28 SER 29 PRO 30 THR 31 GLY 32 SER 33 GLY 34 LYS 35 THR 36 ILE 37 MET 38 ALA 39 LEU 40 LYS 41 SER 42 ALA 43 LEU 44 GLN 45 TYR 46 SER 47 SER 48 GLU 49 ARG 50 LYS 51 LEU 52 LYS 53 VAL 54 LEU 55 TYR 56 LEU 57 VAL 58 ARG 59 THR 60 ASN 61 SER 62 GLN 63 GLU 64 GLU 65 GLN 66 VAL 67 ILE 68 LYS 69 GLU 70 LEU 71 ARG 72 SER 73 LEU 74 SER 75 SER 76 THR 77 MET 78 LYS 79 ILE 80 ARG 81 ALA 82 ILE 83 PRO 84 MET 85 GLN 86 GLY 87 ARG 88 VAL 89 ASN 90 MET 91 CYS 92 ILE 93 LEU 94 TYR 95 ARG 96 MET 97 VAL 98 ASP 99 ASP 100 LEU 101 HIS 102 GLU 103 ILE 104 ASN 105 ALA 106 GLU 107 SER 108 LEU 109 ALA 110 LYS 111 PHE 112 CYS 113 ASN 114 MET 115 LYS 116 LYS 117 ARG 118 GLU 119 VAL 120 MET 121 ALA 122 GLY 123 ASN 124 GLU 125 ALA 126 ALA 127 CYS 128 PRO 129 TYR 130 PHE 131 ASN 132 PHE 133 LYS 134 ILE 135 ARG 136 SER 137 ASP 138 GLU 139 THR 140 LYS 141 ARG 142 PHE 143 LEU 144 PHE 145 ASP 146 GLU 147 LEU 148 PRO 149 THR 150 ALA 151 GLU 152 GLU 153 PHE 154 TYR 155 ASP 156 TYR 157 GLY 158 GLU 159 ARG 160 ASN 161 ASN 162 VAL 163 CYS 164 PRO 165 TYR 166 GLU 167 SER 168 MET 169 LYS 170 ALA 171 ALA 172 LEU 173 PRO 174 ASP 175 ALA 176 ASP 177 ILE 178 VAL 179 ILE 180 ALA 181 PRO 182 TYR 183 ALA 184 TYR 185 PHE 186 LEU 187 ASN 188 ARG 189 SER 190 VAL 191 ALA 192 GLU 193 LYS 194 PHE 195 LEU 196 SER 197 HIS 198 TRP 199 GLY 200 VAL 201 SER 202 ARG 203 ASN 204 GLN 205 ILE 206 VAL 207 ILE 208 ILE 209 LEU 210 ASP 211 GLU 212 ALA 213 HIS 214 ASN 215 LEU 216 PRO 217 ASP 218 ILE 219 GLY 220 ARG 221 SER 222 ILE 223 GLY 224 SER 225 PHE 226 ARG 227 ILE 228 SER 229 VAL 230 GLU 231 SER 232 LEU 233 ASN 234 ARG 235 ALA 236 ASP 237 ARG 238 GLU 239 ALA 240 GLN 241 ALA 242 TYR 243 GLY 244 ASP 245 PRO 246 GLU 247 LEU 248 SER 249 GLN 250 LYS 251 ILE 252 HIS 253 VAL 254 SER 255 ASP 256 LEU 257 ILE 258 GLU 259 MET 260 ILE 261 ARG 262 SER 263 ALA 264 LEU 265 GLN 266 SER 267 MET 268 VAL 269 SER 270 GLU 271 ARG 272 CYS 273 GLY 274 LYS 275 GLY 276 ASP 277 VAL 278 ARG 279 ILE 280 ARG 281 PHE 282 GLN 283 GLU 284 PHE 285 MET 286 GLU 287 TYR 288 MET 289 ARG 290 ILE 291 MET 292 ASN 293 LYS 294 ARG 295 SER 296 GLU 297 ARG 298 GLU 299 ILE 300 ARG 301 SER 302 LEU 303 LEU 304 ASN 305 ALA 306 LEU 307 TYR 308 LEU 309 PHE 310 GLY 311 GLU 312 TYR 313 VAL 314 GLU 315 ASN 316 GLU 317 LYS 318 GLU 319 LYS 320 VAL 321 GLY 322 LYS 323 VAL 324 PRO 325 PHE 326 SER 327 TYR 328 ALA 329 SER 330 SER 331 VAL 332 ALA 333 SER 334 ARG 335 ILE 336 ILE 337 ALA 338 PHE 339 SER 340 ASP 341 GLN 342 ASP 343 GLU 344 GLU 345 LYS 346 TYR 347 ALA 348 ALA 349 ILE 350 LEU 351 SER 352 PRO 353 GLU 354 ASP 355 GLY 356 GLY 357 TYR 358 MET 359 GLN 360 ALA 361 ALA 362 ALA 363 LEU 364 ASP 365 PRO 366 SER 367 GLY 368 ILE 369 LEU 370 GLU 371 VAL 372 LEU 373 LYS 374 GLU 375 SER 376 LYS 377 THR 378 ILE 379 HIS 380 MET 381 SER 382 GLY 383 THR 384 LEU 385 ASP 386 PRO 387 PHE 388 ASP 389 PHE 390 TYR 391 SER 392 ASP 393 ILE 394 THR 395 GLY 396 PHE 397 GLU 398 ILE 399 PRO 400 PHE 401 LYS 402 LYS 403 ILE 404 GLY 405 GLU 406 ILE 407 PHE 408 PRO 409 PRO 410 GLU 411 ASN 412 ARG 413 TYR 414 ILE 415 ALA 416 TYR 417 TYR 418 ASP 419 GLY 420 VAL 421 SER 422 SER 423 LYS 424 TYR 425 ASP 426 THR 427 LEU 428 ASP 429 GLU 430 LYS 431 GLU 432 LEU 433 ASP 434 ARG 435 MET 436 ALA 437 THR 438 VAL 439 ILE 440 GLU 441 ASP 442 ILE 443 ILE 444 LEU 445 LYS 446 VAL 447 LYS 448 LYS 449 ASN 450 THR 451 ILE 452 VAL 453 TYR 454 PHE 455 PRO 456 SER 457 TYR 458 SER 459 LEU 460 MET 461 ASP 462 ARG 463 VAL 464 GLU 465 ASN 466 ARG 467 VAL 468 SER 469 PHE 470 GLU 471 HIS 472 MET 473 LYS 474 GLU 475 TYR 476 ARG 477 GLY 478 ILE 479 ASP 480 GLN 481 LYS 482 GLU 483 LEU 484 TYR 485 SER 486 MET 487 LEU 488 LYS 489 LYS 490 PHE 491 ARG 492 ARG 493 ASP 494 HIS 495 GLY 496 THR 497 ILE 498 PHE 499 ALA 500 VAL 501 SER 502 GLY 503 GLY 504 ARG 505 LEU 506 SER 507 GLU 508 GLY 509 ILE 510 ASN 511 PHE 512 PRO 513 GLY 514 ASN 515 GLU 516 LEU 517 GLU 518 MET 519 ILE 520 ILE 521 LEU 522 ALA 523 GLY 524 LEU 525 PRO 526 PHE 527 PRO 528 ARG 529 PRO 530 ASP 531 ALA 532 ILE 533 ASN 534 ARG 535 SER 536 LEU 537 PHE 538 ASP 539 TYR 540 TYR 541 CYS 542 ARG 543 LYS 544 TYR 545 GLY 546 LYS 547 GLY 548 TRP 549 GLU 550 TYR 551 SER 552 VAL 553 VAL 554 TYR 555 PRO 556 THR 557 ALA 558 ILE 559 LYS 560 ILE 561 ARG 562 GLN 563 GLU 564 ILE 565 GLY 566 ARG 567 LEU 568 ILE 569 ARG 570 SER 571 ALA 572 GLU 573 ASP 574 THR 575 GLY 576 ALA 577 ALA 578 VAL 579 ILE 580 LEU 581 ASP 582 LYS 583 ARG 584 ALA 585 GLY 586 GLN 587 PHE 588 ARG 589 LYS 590 PHE 591 ILE 592 PRO 593 ASP 594 MET 595 LYS 596 LYS 597 THR 598 SER 599 ASP 600 PRO 601 ALA 602 SER 603 ASP 604 ILE 605 TYR 606 ASN 607 PHE 608 PHE 609 ILE 610 SER 611 ALA 612 GLN 613 ALA 614 ARG 615

Other macromolecules

Unit 2

DT 1 DA 2 DC 3 DG 4 DA 5

Ligands

Unit 3

SF4 801 NA 802 NA 803