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Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

Title STRUCTURE A OF GROUP II INTRON COMPLEXED WITH ITS REVERSE TRANSCRIPTASE
Keywords TRANSFERASE, GROUP II INTRONS, RIBONUCLEOPROTEIN, INTRON-ENC PROTEIN, RETROTRANSPOSONS AND SPLICEOSOM
Experiment ELECTRON MICROSCOPY
Number of Models  1


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        Header     Asymmetric unit     Biological unit  

PDB   5G2Y     released     available     available     Quaternary Structure Server  


Asymmetric unit from PDB
 Unit     Type     Name   Chain ID   Residues   Atoms   Hetatoms 
1  RNA    A 630 13494 0
total       630 13494 0

Nucleic acids
Unit 1 A1 U2 G3 C4 G5 C6 C7 C8 A9 G10 A11 U12 A13 G14 G15 G16 U17 G18 U19 U20 A21 A22 G23 U24 C25 A26 A27 G28 U29 A30 G31 U32 U33 U34 A35 A36 G37 G38 U39 A40 C41 U42 A43 C44 U45 C46 U47 G48 U49 A50 A51 G52 A53 U54 A55 A56 C57 A58 C59 A60 G61 A62 A63 A64 A65 C66 A67 G68 C69 C70 A71 A72 C73 C74 U75 A76 A77 C78 C79 G80 A81 A82 A83 A84 G85 C86 G87 A88 A89 A90 G91 C92 U93 G94 A95 U96 A97 C98 G99 G100 G101 A102 A103 C104 A105 G106 A107 G108 C109 A110 C111 G112 G113 U114 U115 G116 G117 A118 A119 A120 G121 C122 G123 A124 U125 G126 A127 G128 U129 U130 A131 C132 C133 U134 A135 A136 A137 G138 A139 C140 A141 A142 U143 C144 G145 G146 G147 U148 A149 C150 G151 A152 C153 U154 G155 A156 G157 U158 C159 G160 C161 A162 A163 U164 G165 U166 U167 A168 A169 U170 C171 A172 G173 A174 U175 A176 U177 A178 A179 G180 G181 U182 A183 U184 A185 A186 G187 U188 U189 G190 U191 G192 U193 U194 U195 A196 C197 U198 G199 A200 A201 C202 G203 C204 A205 A206 G207 U208 U209 U210 C211 U212 A213 A214 U215 U216 U217 C218 G219 G220 U221 U222 A223 U224 G225 U226 G227 U228 C229 G230 A231 U232 A233 G234 A235 G236 G237 A238 A239 A240 G241 U242 G243 U244 C245 U246 G247 A248 A249 A250 C251 C252 U253 C254 U255 A256 G257 U258 A259 C260 A261 A262 A263 G264 A265 A266 A267 G268 G269 U270 A271 A272 G273 U274 U275 A276 U281 G282 U283 G284 G285 A286 C287 U288 U289 A290 U291 C292 U293 G294 U295 U296 A297 U298 C299 A300 C301 C302 A303 C304 A305 U306 U307 U308 G309 U310 A311 C312 A313 A314 U315 C316 U317 G318 U319 A320 G321 G322 A323 G324 A325 A326 C327 C328 U329 A330 U331 G332 G333 G334 A335 A336 C337 G338 A339 A340 A341 C342 G343 A344 A345 A346 G347 C348 G349 A350 U351 G352 C353 C354 G355 A356 G357 A358 A359 U360 C361 U362 G363 A364 A365 U366 U367 U368 A369 C370 C371 A372 A373 G374 A375 C376 U377 U378 A379 A380 C381 A382 C383 U384 A385 A386 C387 U388 G389 G390 G391 G392 A393 U394 A395 C396 C397 C398 U399 A400 A401 A402 C403 A404 A405 G406 A407 A408 U409 G410 C411 C412 U413 A414 A420 A421 G422 G423 A424 G425 G426 A427 A428 A429 A430 A431 G432 G433 C434 U435 A436 U437 A438 G439 C440 A441 C442 U443 A444 G445 A446 G447 C448 U449 U450 G451 A452 A453 A454 A455 U456 C457 U458 U459 G460 C461 A462 A463 G464 G465 G466 U467 A468 C469 G470 G471 A472 G473 U474 A475 C476 U477 C478 G479 U480 A481 G482 U483 A484 G485 U486 C487 U488 G489 A490 G491 A492 A493 G494 G495 G496 U497 A498 A499 C500 G501 C502 C503 C504 U505 U506 U507 A508 C509 A510 U511 G512 G513 C514 A515 A516 A517 G518 G519 G520 G521 U522 A523 C524 A525 G526 U527 U528 A529 U530 U531 G532 U533 G534 A2388 C2389 A2390 A2391 U2392 A2393 A2394 C2395 A2396 G2397 A2398 G2399 C2400 C2401 G2402 U2403 A2404 U2405 A2406 C2407 U2408 C2409 C2410 G2411 A2412 G2413 A2414 G2415 G2416 G2417 G2418 U2419 A2420 C2421 G2422 U2423 A2424 C2425 G2426 G2427 U2428 U2429 C2430 C2431 C2432 G2433 A2434 A2435 G2436 A2437 G2438 G2439 G2440 U2441 G2442 G2443 U2444 G2445 C2446 A2447 A2448 A2449 C2450 C2451 A2452 G2453 U2454 C2455 A2456 C2457 A2458 G2459 U2460 A2461 A2462 U2463 G2464 U2465 G2466 A2467 A2468 C2469 A2470 A2471 G2472 G2473 C2474 G2475 G2476 U2477 A2478 C2479 C2480 U2481 C2482 C2483 C2484 U2485 A2486 C2487 U2488 U2489 C2490 A2491 C2492

Chirality of ribose and phosphate atoms

Check the naming of phosphate and ribose substituents. Recommended for phosphate oxygens and for ribose hydrogens in NMR structures.


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Perl script:    PDBscan.pl  (15 Sep 2016)
Author:    Peter Slickers  (slickers@leibniz-fli.de),  IMB Jena,  Germany