5FDF - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF THE MONOCLINIC FORM OF THERMOTOGA MARIT ESTERASE TM0077 (APO STRUCTURE) AT 1.76 ANGSTROM RESOLUTION
• Keywords: HYDROLASE, CARBOHYDRATE METABOLISM, CEPHALOSPORIN DEACETYLAS ROSSMANN FOLD
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	5FDF	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	CEPHALOSPORIN-C DEACETYLASE	A	319	2516	0
2	Protein	CEPHALOSPORIN-C DEACETYLASE	B	320	2556	0
3	Protein	CEPHALOSPORIN-C DEACETYLASE	C	320	2528	0
4	Protein	CEPHALOSPORIN-C DEACETYLASE	D	319	2525	0
5	Protein	CEPHALOSPORIN-C DEACETYLASE	E	320	2560	0
6	Protein	CEPHALOSPORIN-C DEACETYLASE	F	320	2526	0
7	Ligand	CEPHALOSPORIN-C DEACETYLASE	B	1	0	1
8	Ligand	CEPHALOSPORIN-C DEACETYLASE	C	1	0	4
9	Water			1487	0	1487
total				3407	15211	1492

Proteins

Unit 1	PHE 4 ASP 5 LEU 6 PRO 7 LEU 8 GLU 9 GLU 10 LEU 11 LYS 12 LYS 13 TYR 14 ARG 15 PRO 16 GLU 17 ARG 18 TYR 19 GLU 20 GLU 21 LYS 22 ASP 23 PHE 24 ASP 25 GLU 26 PHE 27 TRP 28 GLU 29 GLU 30 THR 31 LEU 32 ALA 33 GLU 34 SER 35 GLU 36 LYS 37 PHE 38 PRO 39 LEU 40 ASP 41 PRO 42 VAL 43 PHE 44 GLU 45 ARG 46 MET 47 GLU 48 SER 49 HIS 50 LEU 51 LYS 52 THR 53 VAL 54 GLU 55 ALA 56 TYR 57 ASP 58 VAL 59 THR 60 PHE 61 SER 62 GLY 63 TYR 64 ARG 65 GLY 66 GLN 67 ARG 68 ILE 69 LYS 70 GLY 71 TRP 72 LEU 73 LEU 74 VAL 75 PRO 76 LYS 77 LEU 78 GLU 79 GLU 80 GLU 81 LYS 82 LEU 83 PRO 84 CYS 85 VAL 86 VAL 87 GLN 88 TYR 89 ILE 90 GLY 91 TYR 92 ASN 93 GLY 94 GLY 95 ARG 96 GLY 97 PHE 98 PRO 99 HIS 100 ASP 101 TRP 102 LEU 103 PHE 104 TRP 105 PRO 106 SER 107 MET 108 GLY 109 TYR 110 ILE 111 CYS 112 PHE 113 VAL 114 MET 115 ASP 116 THR 117 ARG 118 GLY 119 GLN 120 GLY 121 SER 122 GLY 123 TRP 124 LEU 125 LYS 126 GLY 127 ASP 128 THR 129 PRO 130 ASP 131 TYR 132 PRO 133 GLY 135 PRO 136 VAL 137 ASP 138 PRO 139 GLN 140 TYR 141 PRO 142 GLY 143 PHE 144 MET 145 THR 146 ARG 147 GLY 148 ILE 149 LEU 150 ASP 151 PRO 152 ARG 153 THR 154 TYR 155 TYR 156 TYR 157 ARG 158 ARG 159 VAL 160 PHE 161 THR 162 ASP 163 ALA 164 VAL 165 ARG 166 ALA 167 VAL 168 GLU 169 ALA 170 ALA 171 ALA 172 SER 173 PHE 174 PRO 175 GLN 176 VAL 177 ASP 178 GLN 179 GLU 180 ARG 181 ILE 182 VAL 183 ILE 184 ALA 185 GLY 186 GLY 187 SER 188 GLN 189 GLY 190 GLY 191 GLY 192 ILE 193 ALA 194 LEU 195 ALA 196 VAL 197 SER 198 ALA 199 LEU 200 SER 201 LYS 202 LYS 203 ALA 204 LYS 205 ALA 206 LEU 207 LEU 208 CYS 209 ASP 210 VAL 211 PRO 212 PHE 213 LEU 214 CYS 215 HIS 216 PHE 217 ARG 218 ARG 219 ALA 220 VAL 221 GLN 222 LEU 223 VAL 224 ASP 225 THR 226 HIS 227 PRO 228 TYR 229 ALA 230 GLU 231 ILE 232 THR 233 ASN 234 PHE 235 LEU 236 LYS 237 THR 238 HIS 239 ARG 240 ASP 241 LYS 242 GLU 243 GLU 244 ILE 245 VAL 246 PHE 247 ARG 248 THR 249 LEU 250 SER 251 TYR 252 PHE 253 ASP 254 GLY 255 VAL 256 ASN 257 PHE 258 ALA 259 ALA 260 ARG 261 ALA 262 LYS 263 ILE 264 PRO 265 ALA 266 LEU 267 PHE 268 SER 269 VAL 270 GLY 271 LEU 272 MET 273 ASP 274 ASN 275 ILE 276 CYS 277 PRO 278 PRO 279 SER 280 THR 281 VAL 282 PHE 283 ALA 284 ALA 285 TYR 286 ASN 287 TYR 288 TYR 289 ALA 290 GLY 291 PRO 292 LYS 293 GLU 294 ILE 295 ARG 296 ILE 297 TYR 298 PRO 299 TYR 300 ASN 301 ASN 302 HIS 303 GLU 304 GLY 305 GLY 306 GLY 307 SER 308 PHE 309 GLN 310 ALA 311 VAL 312 GLU 313 GLN 314 VAL 315 LYS 316 PHE 317 LEU 318 LYS 319 LYS 320 LEU 321 PHE 322 GLU 323
Unit 2	PHE 4 ASP 5 LEU 6 PRO 7 LEU 8 GLU 9 GLU 10 LEU 11 LYS 12 LYS 13 TYR 14 ARG 15 PRO 16 GLU 17 ARG 18 TYR 19 GLU 20 GLU 21 LYS 22 ASP 23 PHE 24 ASP 25 GLU 26 PHE 27 TRP 28 GLU 29 GLU 30 THR 31 LEU 32 ALA 33 GLU 34 SER 35 GLU 36 LYS 37 PHE 38 PRO 39 LEU 40 ASP 41 PRO 42 VAL 43 PHE 44 GLU 45 ARG 46 MET 47 GLU 48 SER 49 HIS 50 LEU 51 LYS 52 THR 53 VAL 54 GLU 55 ALA 56 TYR 57 ASP 58 VAL 59 THR 60 PHE 61 SER 62 GLY 63 TYR 64 ARG 65 GLY 66 GLN 67 ARG 68 ILE 69 LYS 70 GLY 71 TRP 72 LEU 73 LEU 74 VAL 75 PRO 76 LYS 77 LEU 78 GLU 79 GLU 80 GLU 81 LYS 82 LEU 83 PRO 84 CYS 85 VAL 86 VAL 87 GLN 88 TYR 89 ILE 90 GLY 91 TYR 92 ASN 93 GLY 94 GLY 95 ARG 96 GLY 97 PHE 98 PRO 99 HIS 100 ASP 101 TRP 102 LEU 103 PHE 104 TRP 105 PRO 106 SER 107 MET 108 GLY 109 TYR 110 ILE 111 CYS 112 PHE 113 VAL 114 MET 115 ASP 116 THR 117 ARG 118 GLY 119 GLN 120 GLY 121 SER 122 GLY 123 TRP 124 LEU 125 LYS 126 GLY 127 ASP 128 THR 129 PRO 130 ASP 131 TYR 132 PRO 133 GLU 134 GLY 135 PRO 136 VAL 137 ASP 138 PRO 139 GLN 140 TYR 141 PRO 142 GLY 143 PHE 144 MET 145 THR 146 ARG 147 GLY 148 ILE 149 LEU 150 ASP 151 PRO 152 ARG 153 THR 154 TYR 155 TYR 156 TYR 157 ARG 158 ARG 159 VAL 160 PHE 161 THR 162 ASP 163 ALA 164 VAL 165 ARG 166 ALA 167 VAL 168 GLU 169 ALA 170 ALA 171 ALA 172 SER 173 PHE 174 PRO 175 GLN 176 VAL 177 ASP 178 GLN 179 GLU 180 ARG 181 ILE 182 VAL 183 ILE 184 ALA 185 GLY 186 GLY 187 SER 188 GLN 189 GLY 190 GLY 191 GLY 192 ILE 193 ALA 194 LEU 195 ALA 196 VAL 197 SER 198 ALA 199 LEU 200 SER 201 LYS 202 LYS 203 ALA 204 LYS 205 ALA 206 LEU 207 LEU 208 CYS 209 ASP 210 VAL 211 PRO 212 PHE 213 LEU 214 CYS 215 HIS 216 PHE 217 ARG 218 ARG 219 ALA 220 VAL 221 GLN 222 LEU 223 VAL 224 ASP 225 THR 226 HIS 227 PRO 228 TYR 229 ALA 230 GLU 231 ILE 232 THR 233 ASN 234 PHE 235 LEU 236 LYS 237 THR 238 HIS 239 ARG 240 ASP 241 LYS 242 GLU 243 GLU 244 ILE 245 VAL 246 PHE 247 ARG 248 THR 249 LEU 250 SER 251 TYR 252 PHE 253 ASP 254 GLY 255 VAL 256 ASN 257 PHE 258 ALA 259 ALA 260 ARG 261 ALA 262 LYS 263 ILE 264 PRO 265 ALA 266 LEU 267 PHE 268 SER 269 VAL 270 GLY 271 LEU 272 MET 273 ASP 274 ASN 275 ILE 276 CYS 277 PRO 278 PRO 279 SER 280 THR 281 VAL 282 PHE 283 ALA 284 ALA 285 TYR 286 ASN 287 TYR 288 TYR 289 ALA 290 GLY 291 PRO 292 LYS 293 GLU 294 ILE 295 ARG 296 ILE 297 TYR 298 PRO 299 TYR 300 ASN 301 ASN 302 HIS 303 GLU 304 GLY 305 GLY 306 GLY 307 SER 308 PHE 309 GLN 310 ALA 311 VAL 312 GLU 313 GLN 314 VAL 315 LYS 316 PHE 317 LEU 318 LYS 319 LYS 320 LEU 321 PHE 322 GLU 323
Unit 3	PHE 4 ASP 5 LEU 6 PRO 7 LEU 8 GLU 9 GLU 10 LEU 11 LYS 12 LYS 13 TYR 14 ARG 15 PRO 16 GLU 17 ARG 18 TYR 19 GLU 20 GLU 21 LYS 22 ASP 23 PHE 24 ASP 25 GLU 26 PHE 27 TRP 28 GLU 29 GLU 30 THR 31 LEU 32 ALA 33 GLU 34 SER 35 GLU 36 LYS 37 PHE 38 PRO 39 LEU 40 ASP 41 PRO 42 VAL 43 PHE 44 GLU 45 ARG 46 MET 47 GLU 48 SER 49 HIS 50 LEU 51 LYS 52 THR 53 VAL 54 GLU 55 ALA 56 TYR 57 ASP 58 VAL 59 THR 60 PHE 61 SER 62 GLY 63 TYR 64 ARG 65 GLY 66 GLN 67 ARG 68 ILE 69 LYS 70 GLY 71 TRP 72 LEU 73 LEU 74 VAL 75 PRO 76 LYS 77 LEU 78 GLU 79 GLU 80 GLU 81 LYS 82 LEU 83 PRO 84 CYS 85 VAL 86 VAL 87 GLN 88 TYR 89 ILE 90 GLY 91 TYR 92 ASN 93 GLY 94 GLY 95 ARG 96 GLY 97 PHE 98 PRO 99 HIS 100 ASP 101 TRP 102 LEU 103 PHE 104 TRP 105 PRO 106 SER 107 MET 108 GLY 109 TYR 110 ILE 111 CYS 112 PHE 113 VAL 114 MET 115 ASP 116 THR 117 ARG 118 GLY 119 GLN 120 GLY 121 SER 122 GLY 123 TRP 124 LEU 125 LYS 126 GLY 127 ASP 128 THR 129 PRO 130 ASP 131 TYR 132 PRO 133 GLU 134 GLY 135 PRO 136 VAL 137 ASP 138 PRO 139 GLN 140 TYR 141 PRO 142 GLY 143 PHE 144 MET 145 THR 146 ARG 147 GLY 148 ILE 149 LEU 150 ASP 151 PRO 152 ARG 153 THR 154 TYR 155 TYR 156 TYR 157 ARG 158 ARG 159 VAL 160 PHE 161 THR 162 ASP 163 ALA 164 VAL 165 ARG 166 ALA 167 VAL 168 GLU 169 ALA 170 ALA 171 ALA 172 SER 173 PHE 174 PRO 175 GLN 176 VAL 177 ASP 178 GLN 179 GLU 180 ARG 181 ILE 182 VAL 183 ILE 184 ALA 185 GLY 186 GLY 187 SER 188 GLN 189 GLY 190 GLY 191 GLY 192 ILE 193 ALA 194 LEU 195 ALA 196 VAL 197 SER 198 ALA 199 LEU 200 SER 201 LYS 202 LYS 203 ALA 204 LYS 205 ALA 206 LEU 207 LEU 208 CYS 209 ASP 210 VAL 211 PRO 212 PHE 213 LEU 214 CYS 215 HIS 216 PHE 217 ARG 218 ARG 219 ALA 220 VAL 221 GLN 222 LEU 223 VAL 224 ASP 225 THR 226 HIS 227 PRO 228 TYR 229 ALA 230 GLU 231 ILE 232 THR 233 ASN 234 PHE 235 LEU 236 LYS 237 THR 238 HIS 239 ARG 240 ASP 241 LYS 242 GLU 243 GLU 244 ILE 245 VAL 246 PHE 247 ARG 248 THR 249 LEU 250 SER 251 TYR 252 PHE 253 ASP 254 GLY 255 VAL 256 ASN 257 PHE 258 ALA 259 ALA 260 ARG 261 ALA 262 LYS 263 ILE 264 PRO 265 ALA 266 LEU 267 PHE 268 SER 269 VAL 270 GLY 271 LEU 272 MET 273 ASP 274 ASN 275 ILE 276 CYS 277 PRO 278 PRO 279 SER 280 THR 281 VAL 282 PHE 283 ALA 284 ALA 285 TYR 286 ASN 287 TYR 288 TYR 289 ALA 290 GLY 291 PRO 292 LYS 293 GLU 294 ILE 295 ARG 296 ILE 297 TYR 298 PRO 299 TYR 300 ASN 301 ASN 302 HIS 303 GLU 304 GLY 305 GLY 306 GLY 307 SER 308 PHE 309 GLN 310 ALA 311 VAL 312 GLU 313 GLN 314 VAL 315 LYS 316 PHE 317 LEU 318 LYS 319 LYS 320 LEU 321 PHE 322 GLU 323
Unit 4	PHE 4 ASP 5 LEU 6 PRO 7 LEU 8 GLU 9 GLU 10 LEU 11 LYS 12 LYS 13 TYR 14 ARG 15 PRO 16 GLU 17 ARG 18 TYR 19 GLU 20 GLU 21 LYS 22 ASP 23 PHE 24 ASP 25 GLU 26 PHE 27 TRP 28 GLU 29 GLU 30 THR 31 LEU 32 ALA 33 GLU 34 SER 35 GLU 36 LYS 37 PHE 38 PRO 39 LEU 40 ASP 41 PRO 42 VAL 43 PHE 44 GLU 45 ARG 46 MET 47 GLU 48 SER 49 HIS 50 LEU 51 LYS 52 THR 53 VAL 54 GLU 55 ALA 56 TYR 57 ASP 58 VAL 59 THR 60 PHE 61 SER 62 GLY 63 TYR 64 ARG 65 GLY 66 GLN 67 ARG 68 ILE 69 LYS 70 GLY 71 TRP 72 LEU 73 LEU 74 VAL 75 PRO 76 LYS 77 LEU 78 GLU 79 GLU 80 GLU 81 LYS 82 LEU 83 PRO 84 CYS 85 VAL 86 VAL 87 GLN 88 TYR 89 ILE 90 GLY 91 TYR 92 ASN 93 GLY 94 GLY 95 ARG 96 GLY 97 PHE 98 PRO 99 HIS 100 ASP 101 TRP 102 LEU 103 PHE 104 TRP 105 PRO 106 SER 107 MET 108 GLY 109 TYR 110 ILE 111 CYS 112 PHE 113 VAL 114 MET 115 ASP 116 THR 117 ARG 118 GLY 119 GLN 120 GLY 121 SER 122 GLY 123 TRP 124 LEU 125 LYS 126 GLY 127 ASP 128 THR 129 PRO 130 ASP 131 TYR 132 PRO 133 GLY 135 PRO 136 VAL 137 ASP 138 PRO 139 GLN 140 TYR 141 PRO 142 GLY 143 PHE 144 MET 145 THR 146 ARG 147 GLY 148 ILE 149 LEU 150 ASP 151 PRO 152 ARG 153 THR 154 TYR 155 TYR 156 TYR 157 ARG 158 ARG 159 VAL 160 PHE 161 THR 162 ASP 163 ALA 164 VAL 165 ARG 166 ALA 167 VAL 168 GLU 169 ALA 170 ALA 171 ALA 172 SER 173 PHE 174 PRO 175 GLN 176 VAL 177 ASP 178 GLN 179 GLU 180 ARG 181 ILE 182 VAL 183 ILE 184 ALA 185 GLY 186 GLY 187 SER 188 GLN 189 GLY 190 GLY 191 GLY 192 ILE 193 ALA 194 LEU 195 ALA 196 VAL 197 SER 198 ALA 199 LEU 200 SER 201 LYS 202 LYS 203 ALA 204 LYS 205 ALA 206 LEU 207 LEU 208 CYS 209 ASP 210 VAL 211 PRO 212 PHE 213 LEU 214 CYS 215 HIS 216 PHE 217 ARG 218 ARG 219 ALA 220 VAL 221 GLN 222 LEU 223 VAL 224 ASP 225 THR 226 HIS 227 PRO 228 TYR 229 ALA 230 GLU 231 ILE 232 THR 233 ASN 234 PHE 235 LEU 236 LYS 237 THR 238 HIS 239 ARG 240 ASP 241 LYS 242 GLU 243 GLU 244 ILE 245 VAL 246 PHE 247 ARG 248 THR 249 LEU 250 SER 251 TYR 252 PHE 253 ASP 254 GLY 255 VAL 256 ASN 257 PHE 258 ALA 259 ALA 260 ARG 261 ALA 262 LYS 263 ILE 264 PRO 265 ALA 266 LEU 267 PHE 268 SER 269 VAL 270 GLY 271 LEU 272 MET 273 ASP 274 ASN 275 ILE 276 CYS 277 PRO 278 PRO 279 SER 280 THR 281 VAL 282 PHE 283 ALA 284 ALA 285 TYR 286 ASN 287 TYR 288 TYR 289 ALA 290 GLY 291 PRO 292 LYS 293 GLU 294 ILE 295 ARG 296 ILE 297 TYR 298 PRO 299 TYR 300 ASN 301 ASN 302 HIS 303 GLU 304 GLY 305 GLY 306 GLY 307 SER 308 PHE 309 GLN 310 ALA 311 VAL 312 GLU 313 GLN 314 VAL 315 LYS 316 PHE 317 LEU 318 LYS 319 LYS 320 LEU 321 PHE 322 GLU 323
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Ligands

Unit 7	CL 401
Unit 8	ACT 401