5DS4 - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE THE ESCHERICHIA COLI CAS1-CAS2 COMPLEX BOU PROTOSPACER DNA
• Keywords: CRISPR-CAS SYSTEMS, CLUSTERED REGULARLY INTERSPACED SHORT PA REPEATS, INTEGRASES, ENDODEOXYRIBONUCLEASES, ENDONUCLEASES, BINDING PROTEIN, HYDROLASE-DNA COMPLEX
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	5DS4	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	CRISPR-ASSOCIATED ENDONUCLEASE CAS1	A	256	1953	0
2	Protein	CRISPR-ASSOCIATED ENDONUCLEASE CAS1	B	268	2061	0
3	Protein	CRISPR-ASSOCIATED ENDONUCLEASE CAS1	C	254	1941	0
4	Protein	CRISPR-ASSOCIATED ENDONUCLEASE CAS1	D	253	1949	0
5	Protein	CRISPR-ASSOCIATED ENDORIBONUCLEASE CAS2	E	93	732	0
6	Protein	CRISPR-ASSOCIATED ENDORIBONUCLEASE CAS2	F	94	739	0
7	Other macromolecule	DNA (28-MER)	G	28	578	0
8	Other macromolecule	DNA (28-MER)	H	28	564	0
total				1274	10517	0

Proteins

Unit 1	VAL 15 SER 16 MET 17 ILE 18 PHE 19 LEU 20 GLN 21 TYR 22 GLY 23 GLN 24 ILE 25 ASP 26 VAL 27 ILE 28 ASP 29 GLY 30 ALA 31 PHE 32 VAL 33 LEU 34 ILE 35 ASP 36 LYS 37 THR 38 GLY 39 ILE 40 ARG 41 THR 42 HIS 43 ILE 44 PRO 45 VAL 46 GLY 47 SER 48 VAL 49 ALA 50 CYS 51 ILE 52 MET 53 LEU 54 GLU 55 PRO 56 GLY 57 THR 58 ARG 59 VAL 60 SER 61 HIS 62 ALA 63 ALA 64 VAL 65 ARG 66 LEU 67 ALA 68 ALA 69 GLN 70 VAL 71 GLY 72 THR 73 LEU 74 LEU 75 VAL 76 TRP 77 VAL 78 GLY 79 GLU 80 ALA 81 GLY 82 VAL 83 ARG 84 VAL 85 TYR 86 ALA 87 SER 88 GLY 89 GLN 90 PRO 91 GLY 92 GLY 93 ALA 94 ARG 95 SER 96 ASP 97 LYS 98 LEU 99 LEU 100 TYR 101 GLN 102 ALA 103 LYS 104 LEU 105 ALA 106 LEU 107 ASP 108 GLU 109 ASP 110 LEU 111 ARG 112 LEU 113 LYS 114 VAL 115 VAL 116 ARG 117 LYS 118 MET 119 PHE 120 GLU 121 LEU 122 ARG 123 PHE 124 GLY 125 GLU 126 PRO 127 ALA 128 PRO 129 ALA 130 ARG 131 ARG 132 SER 133 VAL 134 GLU 135 GLN 136 LEU 137 ARG 138 GLY 139 ILE 140 GLU 141 GLY 142 SER 143 ARG 144 VAL 145 ARG 146 ALA 147 THR 148 TYR 149 ALA 150 LEU 151 LEU 152 ALA 153 LYS 154 GLN 155 TYR 156 GLY 157 VAL 158 THR 159 TRP 160 ASN 161 GLY 162 ARG 163 THR 175 ILE 176 ASN 177 GLN 178 CYS 179 ILE 180 SER 181 ALA 182 ALA 183 THR 184 SER 185 CYS 186 LEU 187 TYR 188 GLY 189 VAL 190 THR 191 GLU 192 ALA 193 ALA 194 ILE 195 LEU 196 ALA 197 ALA 198 GLY 199 TYR 200 ALA 201 PRO 202 ALA 203 ILE 204 GLY 205 PHE 206 VAL 207 HIS 208 THR 209 GLY 210 LYS 211 PRO 212 LEU 213 SER 214 PHE 215 VAL 216 TYR 217 ASP 218 ILE 219 ALA 220 ASP 221 ILE 222 ILE 223 LYS 224 PHE 225 ASP 226 THR 227 VAL 228 VAL 229 PRO 230 LYS 231 ALA 232 PHE 233 GLU 234 ILE 235 ALA 236 ARG 237 ARG 238 ASN 239 PRO 240 GLY 241 GLU 242 PRO 243 ASP 244 ARG 245 GLU 246 VAL 247 ARG 248 LEU 249 ALA 250 CYS 251 ARG 252 ASP 253 ILE 254 PHE 255 ARG 256 SER 257 SER 258 LYS 259 THR 260 LEU 261 ALA 262 LYS 263 LEU 264 ILE 265 PRO 266 LEU 267 ILE 268 GLU 269 ASP 270 VAL 271 LEU 272 ALA 273 ALA 274 GLY 275 GLU 276 ILE 277 GLN 278 PRO 279 PRO 280 ALA 281
Unit 2	LEU 4 PRO 5 LEU 6 ASN 7 PRO 8 ILE 9 PRO 10 LEU 11 LYS 12 ASP 13 ARG 14 VAL 15 SER 16 MET 17 ILE 18 PHE 19 LEU 20 GLN 21 TYR 22 GLY 23 GLN 24 ILE 25 ASP 26 VAL 27 ILE 28 ASP 29 GLY 30 ALA 31 PHE 32 VAL 33 LEU 34 ILE 35 ASP 36 LYS 37 THR 38 GLY 39 ILE 40 ARG 41 THR 42 HIS 43 ILE 44 PRO 45 VAL 46 GLY 47 SER 48 VAL 49 ALA 50 CYS 51 ILE 52 MET 53 LEU 54 GLU 55 PRO 56 GLY 57 THR 58 ARG 59 VAL 60 SER 61 HIS 62 ALA 63 ALA 64 VAL 65 ARG 66 LEU 67 ALA 68 ALA 69 GLN 70 VAL 71 GLY 72 THR 73 LEU 74 LEU 75 VAL 76 TRP 77 VAL 78 GLY 79 GLU 80 ALA 81 GLY 82 VAL 83 ARG 84 VAL 85 TYR 86 ALA 87 SER 88 GLY 89 GLN 90 PRO 91 GLY 92 GLY 93 ALA 94 ARG 95 SER 96 ASP 97 LYS 98 LEU 99 LEU 100 TYR 101 GLN 102 ALA 103 LYS 104 LEU 105 ALA 106 LEU 107 ASP 108 GLU 109 ASP 110 LEU 111 ARG 112 LEU 113 LYS 114 VAL 115 VAL 116 ARG 117 LYS 118 MET 119 PHE 120 GLU 121 LEU 122 ARG 123 PHE 124 GLY 125 GLU 126 PRO 127 ALA 128 PRO 129 ALA 130 ARG 131 ARG 132 SER 133 VAL 134 GLU 135 GLN 136 LEU 137 ARG 138 GLY 139 ILE 140 GLU 141 GLY 142 SER 143 ARG 144 VAL 145 ARG 146 ALA 147 THR 148 TYR 149 ALA 150 LEU 151 LEU 152 ALA 153 LYS 154 GLN 155 TYR 156 GLY 157 VAL 158 THR 159 TRP 160 ASN 161 GLY 162 ARG 163 ARG 164 TYR 165 ASP 166 THR 175 ILE 176 ASN 177 GLN 178 CYS 179 ILE 180 SER 181 ALA 182 ALA 183 THR 184 SER 185 CYS 186 LEU 187 TYR 188 GLY 189 VAL 190 THR 191 GLU 192 ALA 193 ALA 194 ILE 195 LEU 196 ALA 197 ALA 198 GLY 199 TYR 200 ALA 201 PRO 202 ALA 203 ILE 204 GLY 205 PHE 206 VAL 207 HIS 208 THR 209 GLY 210 LYS 211 PRO 212 LEU 213 SER 214 PHE 215 VAL 216 TYR 217 ASP 218 ILE 219 ALA 220 ASP 221 ILE 222 ILE 223 LYS 224 PHE 225 ASP 226 THR 227 VAL 228 VAL 229 PRO 230 LYS 231 ALA 232 PHE 233 GLU 234 ILE 235 ALA 236 ARG 237 ARG 238 ASN 239 PRO 240 GLY 241 GLU 242 PRO 243 ASP 244 ARG 245 GLU 246 VAL 247 ARG 248 LEU 249 ALA 250 CYS 251 ARG 252 ASP 253 ILE 254 PHE 255 ARG 256 SER 257 SER 258 LYS 259 THR 260 LEU 261 ALA 262 LYS 263 LEU 264 ILE 265 PRO 266 LEU 267 ILE 268 GLU 269 ASP 270 VAL 271 LEU 272 ALA 273 ALA 274 GLY 275 GLU 276 ILE 277 GLN 278 PRO 279
Unit 3	SER 16 MET 17 ILE 18 PHE 19 LEU 20 GLN 21 TYR 22 GLY 23 GLN 24 ILE 25 ASP 26 VAL 27 ILE 28 ASP 29 GLY 30 ALA 31 PHE 32 VAL 33 LEU 34 ILE 35 ASP 36 LYS 37 THR 38 GLY 39 ILE 40 ARG 41 THR 42 HIS 43 ILE 44 PRO 45 VAL 46 GLY 47 SER 48 VAL 49 ALA 50 CYS 51 ILE 52 MET 53 LEU 54 GLU 55 PRO 56 GLY 57 THR 58 ARG 59 VAL 60 SER 61 HIS 62 ALA 63 ALA 64 VAL 65 ARG 66 LEU 67 ALA 68 ALA 69 GLN 70 VAL 71 GLY 72 THR 73 LEU 74 LEU 75 VAL 76 TRP 77 VAL 78 GLY 79 GLU 80 ALA 81 GLY 82 VAL 83 ARG 84 VAL 85 TYR 86 ALA 87 SER 88 GLY 89 GLN 90 PRO 91 GLY 92 GLY 93 ALA 94 ARG 95 SER 96 ASP 97 LYS 98 LEU 99 LEU 100 TYR 101 GLN 102 ALA 103 LYS 104 LEU 105 ALA 106 LEU 107 ASP 108 GLU 109 ASP 110 LEU 111 ARG 112 LEU 113 LYS 114 VAL 115 VAL 116 ARG 117 LYS 118 MET 119 PHE 120 GLU 121 LEU 122 ARG 123 PHE 124 GLY 125 GLU 126 PRO 127 ALA 128 PRO 129 ALA 130 ARG 131 ARG 132 SER 133 VAL 134 GLU 135 GLN 136 LEU 137 ARG 138 GLY 139 ILE 140 GLU 141 GLY 142 SER 143 ARG 144 VAL 145 ARG 146 ALA 147 THR 148 TYR 149 ALA 150 LEU 151 LEU 152 ALA 153 LYS 154 GLN 155 TYR 156 GLY 157 VAL 158 THR 159 TRP 160 ASN 161 GLY 162 ARG 163 THR 175 ILE 176 ASN 177 GLN 178 CYS 179 ILE 180 SER 181 ALA 182 ALA 183 THR 184 SER 185 CYS 186 LEU 187 TYR 188 GLY 189 VAL 190 THR 191 GLU 192 ALA 193 ALA 194 ILE 195 LEU 196 ALA 197 ALA 198 GLY 199 TYR 200 ALA 201 PRO 202 ALA 203 ILE 204 GLY 205 PHE 206 VAL 207 HIS 208 THR 209 GLY 210 LYS 211 PRO 212 LEU 213 SER 214 PHE 215 VAL 216 TYR 217 ASP 218 ILE 219 ALA 220 ASP 221 ILE 222 ILE 223 LYS 224 PHE 225 ASP 226 THR 227 VAL 228 VAL 229 PRO 230 LYS 231 ALA 232 PHE 233 GLU 234 ILE 235 ALA 236 ARG 237 ARG 238 ASN 239 PRO 240 GLY 241 GLU 242 PRO 243 ASP 244 ARG 245 GLU 246 VAL 247 ARG 248 LEU 249 ALA 250 CYS 251 ARG 252 ASP 253 ILE 254 PHE 255 ARG 256 SER 257 SER 258 LYS 259 THR 260 LEU 261 ALA 262 LYS 263 LEU 264 ILE 265 PRO 266 LEU 267 ILE 268 GLU 269 ASP 270 VAL 271 LEU 272 ALA 273 ALA 274 GLY 275 GLU 276 ILE 277 GLN 278 PRO 279 PRO 280
Unit 4	LEU 4 PRO 5 LEU 6 ASN 7 PRO 8 ILE 9 PRO 10 LEU 11 LYS 12 ASP 13 ARG 14 VAL 15 SER 16 MET 17 ILE 18 PHE 19 LEU 20 GLN 21 TYR 22 GLY 23 GLN 24 ILE 25 ASP 26 VAL 27 ILE 28 ASP 29 GLY 30 ALA 31 PHE 32 VAL 33 LEU 34 ILE 35 ASP 36 LYS 37 THR 38 GLY 39 ILE 40 ARG 41 THR 42 HIS 43 ILE 44 PRO 45 VAL 46 GLY 47 SER 48 VAL 49 ALA 50 CYS 51 ILE 52 MET 53 LEU 54 GLU 55 PRO 56 GLY 57 THR 58 ARG 59 VAL 60 SER 61 HIS 62 ALA 63 ALA 64 VAL 65 ARG 66 LEU 67 ALA 68 ALA 69 GLN 70 VAL 71 GLY 72 THR 73 LEU 74 LEU 75 VAL 76 TRP 77 VAL 78 GLY 79 GLU 80 ALA 81 GLY 82 VAL 83 ARG 84 VAL 85 TYR 86 ALA 87 SER 88 GLY 89 GLN 90 PRO 91 GLY 92 ALA 94 ARG 95 SER 96 ASP 97 LYS 98 LEU 99 LEU 100 TYR 101 GLN 102 ALA 103 LYS 104 LEU 105 ALA 106 LEU 107 ASP 108 GLU 109 ASP 110 LEU 111 ARG 112 LEU 113 LYS 114 VAL 115 VAL 116 ARG 117 LYS 118 MET 119 PHE 120 GLU 121 LEU 122 ARG 123 PHE 124 GLY 125 GLU 126 PRO 127 ALA 128 PRO 129 ALA 130 ARG 131 ARG 132 SER 133 VAL 134 GLU 135 GLN 136 LEU 137 ARG 138 GLY 139 ILE 140 GLU 141 GLY 142 SER 143 ARG 144 VAL 145 ARG 146 ALA 147 THR 148 TYR 149 ALA 150 LEU 151 LEU 152 ALA 153 LYS 154 GLN 155 TYR 156 GLY 157 VAL 158 THR 159 TRP 160 ILE 176 ASN 177 GLN 178 CYS 179 ILE 180 SER 181 ALA 182 ALA 183 THR 184 SER 185 CYS 186 LEU 187 TYR 188 GLY 189 VAL 190 THR 191 GLU 192 ALA 193 ALA 194 ILE 195 LEU 196 ALA 197 ALA 198 GLY 199 TYR 200 ALA 201 PRO 202 ALA 203 ILE 204 GLY 205 PHE 206 VAL 207 HIS 208 THR 209 GLY 210 LYS 211 PRO 212 LEU 213 SER 214 PHE 215 VAL 216 TYR 217 ASP 218 ILE 219 ALA 220 ASP 221 ILE 222 ILE 223 LYS 224 PHE 225 ASP 226 THR 227 VAL 228 VAL 229 PRO 230 LYS 231 ALA 232 PHE 233 GLU 234 ILE 235 ALA 236 ARG 237 ARG 238 ASN 239 PRO 240 GLY 241 GLU 242 PRO 243 ASP 244 ARG 245 GLU 246 VAL 247 ARG 248 LEU 249 ALA 250 CYS 251 ARG 252 ASP 253 ILE 254 PHE 255 ARG 256 SER 257 SER 258 LYS 259 THR 260 LEU 261 ALA 262 LYS 263 LEU 264 ILE 265 PRO 266 LEU 267 ILE 268 GLU 269 ASP 270 VAL 271 LEU 272
Unit 5	MET 1 SER 2 MET 3 LEU 4 VAL 5 VAL 6 VAL 7 THR 8 GLU 9 ASN 10 VAL 11 PRO 12 PRO 13 ARG 14 LEU 15 ARG 16 GLY 17 ARG 18 LEU 19 ALA 20 ILE 21 TRP 22 LEU 23 LEU 24 GLU 25 VAL 26 ARG 27 ALA 28 GLY 29 VAL 30 TYR 31 VAL 32 GLY 33 ASP 34 VAL 35 SER 36 ALA 37 LYS 38 ILE 39 ARG 40 GLU 41 MET 42 ILE 43 TRP 44 GLU 45 GLN 46 ILE 47 ALA 48 GLY 49 LEU 50 ALA 51 GLU 52 GLU 53 GLY 54 ASN 55 VAL 56 VAL 57 MET 58 ALA 59 TRP 60 ALA 61 THR 62 ASN 63 THR 64 GLU 65 THR 66 GLY 67 PHE 68 GLU 69 PHE 70 GLN 71 THR 72 PHE 73 GLY 74 LEU 75 ASN 76 ARG 77 ARG 78 THR 79 PRO 80 VAL 81 ASP 82 LEU 83 ASP 84 GLY 85 LEU 86 ARG 87 LEU 88 VAL 89 SER 90 PHE 91 LEU 92 PRO 93
Unit 6	MET 1 SER 2 MET 3 LEU 4 VAL 5 VAL 6 VAL 7 THR 8 GLU 9 ASN 10 VAL 11 PRO 12 PRO 13 ARG 14 LEU 15 ARG 16 GLY 17 ARG 18 LEU 19 ALA 20 ILE 21 TRP 22 LEU 23 LEU 24 GLU 25 VAL 26 ARG 27 ALA 28 GLY 29 VAL 30 TYR 31 VAL 32 GLY 33 ASP 34 VAL 35 SER 36 ALA 37 LYS 38 ILE 39 ARG 40 GLU 41 MET 42 ILE 43 TRP 44 GLU 45 GLN 46 ILE 47 ALA 48 GLY 49 LEU 50 ALA 51 GLU 52 GLU 53 GLY 54 ASN 55 VAL 56 VAL 57 MET 58 ALA 59 TRP 60 ALA 61 THR 62 ASN 63 THR 64 GLU 65 THR 66 GLY 67 PHE 68 GLU 69 PHE 70 GLN 71 THR 72 PHE 73 GLY 74 LEU 75 ASN 76 ARG 77 ARG 78 THR 79 PRO 80 VAL 81 ASP 82 LEU 83 ASP 84 GLY 85 LEU 86 ARG 87 LEU 88 VAL 89 SER 90 PHE 91 LEU 92 PRO 93 VAL 94

Other macromolecules

Unit 7	DA 1 DA 2 DA 3 DC 4 DA 5 DC 6 DC 7 DA 8 DG 9 DA 10 DA 11 DC 12 DG 13 DA 14 DG 15 DT 16 DA 17 DG 18 DT 19 DA 20 DA 21 DA 22 DT 23 DT 24 DG 25 DG 26 DG 27 DC 28
Unit 8	DA 1 DT 2 DT 3 DT 4 DA 5 DC 6 DT 7 DA 8 DC 9 DT 10 DC 11 DG 12 DT 13 DT 14 DC 15 DT 16 DG 17 DG 18 DT 19 DG 20 DT 21 DT 22 DT 23 DC 24 DT 25 DC 26 DG 27 DT 28