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Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

Title X-RAY STRUCTURE OF MACROPHAGE INFLAMMATORY PROTEIN-1 ALPHA ( HEPARIN COMPLEX
Keywords CC CHEMOKINE, CCL3, OLIGOMER, SIGNALING PROTEIN, HEPARIN, GA COMPLEX, CYTOKINE
Experiment X-ray diffraction
Number of Models  1


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        Header     Asymmetric unit     Biological unit  

PDB   5D65     released     available     available     Quaternary Structure Server  


Asymmetric unit from PDB
 Unit     Type     Name   Chain ID   Residues   Atoms   Hetatoms 
1  Protein   C-C MOTIF CHEMOKINE 3  A 68 535 0
2  Protein   C-C MOTIF CHEMOKINE 3  B 67 529 0
3  Protein   C-C MOTIF CHEMOKINE 3  C 67 529 0
4  Protein   C-C MOTIF CHEMOKINE 3  D 67 529 0
5  Protein   C-C MOTIF CHEMOKINE 3  E 69 540 0
6  Ligand    F 2 0 35
7  Ligand    G 2 0 36
8  Ligand   C-C MOTIF CHEMOKINE 3  A 4 0 48
9  Ligand   C-C MOTIF CHEMOKINE 3  B 2 0 13
10  Ligand   C-C MOTIF CHEMOKINE 3  C 1 0 12
11  Ligand   C-C MOTIF CHEMOKINE 3  D 2 0 24
12  Ligand   C-C MOTIF CHEMOKINE 3  E 3 0 25
total       354 2662 193

Proteins
Unit 1 SER2 LEU3 ALA4 ALA5 ASP6 THR7 PRO8 THR9 ALA10 CYS11 CYS12 PHE13 SER14 TYR15 THR16 SER17 ARG18 GLN19 ILE20 PRO21 GLN22 ASN23 PHE24 ILE25 ALA26 ASP27 TYR28 PHE29 GLU30 THR31 SER32 SER33 GLN34 CYS35 SER36 LYS37 PRO38 GLY39 VAL40 ILE41 PHE42 LEU43 THR44 LYS45 ARG46 SER47 ARG48 GLN49 VAL50 CYS51 ALA52 ASP53 PRO54 SER55 GLU56 GLU57 TRP58 VAL59 GLN60 LYS61 TYR62 VAL63 SER64 ASP65 LEU66 GLU67 LEU68 SER69
Unit 2 LEU3 ALA4 ALA5 ASP6 THR7 PRO8 THR9 ALA10 CYS11 CYS12 PHE13 SER14 TYR15 THR16 SER17 ARG18 GLN19 ILE20 PRO21 GLN22 ASN23 PHE24 ILE25 ALA26 ASP27 TYR28 PHE29 GLU30 THR31 SER32 SER33 GLN34 CYS35 SER36 LYS37 PRO38 GLY39 VAL40 ILE41 PHE42 LEU43 THR44 LYS45 ARG46 SER47 ARG48 GLN49 VAL50 CYS51 ALA52 ASP53 PRO54 SER55 GLU56 GLU57 TRP58 VAL59 GLN60 LYS61 TYR62 VAL63 SER64 ASP65 LEU66 GLU67 LEU68 SER69
Unit 3 LEU3 ALA4 ALA5 ASP6 THR7 PRO8 THR9 ALA10 CYS11 CYS12 PHE13 SER14 TYR15 THR16 SER17 ARG18 GLN19 ILE20 PRO21 GLN22 ASN23 PHE24 ILE25 ALA26 ASP27 TYR28 PHE29 GLU30 THR31 SER32 SER33 GLN34 CYS35 SER36 LYS37 PRO38 GLY39 VAL40 ILE41 PHE42 LEU43 THR44 LYS45 ARG46 SER47 ARG48 GLN49 VAL50 CYS51 ALA52 ASP53 PRO54 SER55 GLU56 GLU57 TRP58 VAL59 GLN60 LYS61 TYR62 VAL63 SER64 ASP65 LEU66 GLU67 LEU68 SER69
Unit 4 LEU3 ALA4 ALA5 ASP6 THR7 PRO8 THR9 ALA10 CYS11 CYS12 PHE13 SER14 TYR15 THR16 SER17 ARG18 GLN19 ILE20 PRO21 GLN22 ASN23 PHE24 ILE25 ALA26 ASP27 TYR28 PHE29 GLU30 THR31 SER32 SER33 GLN34 CYS35 SER36 LYS37 PRO38 GLY39 VAL40 ILE41 PHE42 LEU43 THR44 LYS45 ARG46 SER47 ARG48 GLN49 VAL50 CYS51 ALA52 ASP53 PRO54 SER55 GLU56 GLU57 TRP58 VAL59 GLN60 LYS61 TYR62 VAL63 SER64 ASP65 LEU66 GLU67 LEU68 SER69
Unit 5 ALA1 SER2 LEU3 ALA4 ALA5 ASP6 THR7 PRO8 THR9 ALA10 CYS11 CYS12 PHE13 SER14 TYR15 THR16 SER17 ARG18 GLN19 ILE20 PRO21 GLN22 ASN23 PHE24 ILE25 ALA26 ASP27 TYR28 PHE29 GLU30 THR31 SER32 SER33 GLN34 CYS35 SER36 LYS37 PRO38 GLY39 VAL40 ILE41 PHE42 LEU43 THR44 LYS45 ARG46 SER47 ARG48 GLN49 VAL50 CYS51 ALA52 ASP53 PRO54 SER55 GLU56 GLU57 TRP58 VAL59 GLN60 LYS61 TYR62 VAL63 SER64 ASP65 LEU66 GLU67 LEU68 SER69

Ligands
Unit 6 IDS1 SGN2
Unit 7 IDS1 SGN2
Unit 8 BGC101 BGC102 BGC103 BGC104
Unit 9 BGC101 CL102
Unit 10 BGC101
Unit 11 BGC101 BGC102
Unit 12 GLC101 BGC102 CL103

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Perl script:    PDBscan.pl  (15 Sep 2016)
Author:    Peter Slickers  (slickers@leibniz-fli.de),  IMB Jena,  Germany