5CCU - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF ENDOGLYCOCERAMIDASE I FROM RHODOCOC-CUS
• Keywords: APO, HYDROLASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	5CCU	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	PUTATIVE SECRETED ENDOGLYCOSYLCERAMIDASE	A	449	3448	0
2	Protein	PUTATIVE SECRETED ENDOGLYCOSYLCERAMIDASE	B	436	3355	0
3	Ligand	PUTATIVE SECRETED ENDOGLYCOSYLCERAMIDASE	A	12	0	45
4	Ligand	PUTATIVE SECRETED ENDOGLYCOSYLCERAMIDASE	B	8	0	32
5	Water			467	0	467
total				1372	6803	544

Proteins

Unit 1

PRO 37 ALA 38 THR 39 PRO 40 ILE 41 THR 42 THR 43 LEU 44 GLN 45 ALA 46 ASP 47 GLY 48 THR 49 HIS 50 LEU 51 VAL 52 ASP 53 GLY 54 TYR 55 GLY 56 ARG 57 THR 58 VAL 59 LEU 60 LEU 61 HIS 62 GLY 63 VAL 64 ASN 65 ASN 66 VAL 67 ASP 68 LYS 69 ASP 70 ALA 71 PRO 72 TYR 73 LEU 74 PRO 75 ALA 76 GLY 77 GLU 78 THR 79 LEU 80 THR 81 PRO 82 GLN 83 ASP 84 ILE 85 ASP 86 ILE 87 LEU 88 VAL 89 ARG 90 HIS 91 GLY 92 PHE 93 ASN 94 THR 95 VAL 96 ARG 97 LEU 98 GLY 99 THR 100 SER 101 PHE 102 ASP 103 ALA 104 LEU 105 MET 106 PRO 107 GLN 108 ARG 109 GLY 110 GLN 111 ILE 112 ASP 113 GLU 114 ALA 115 TYR 116 LEU 117 ASP 118 ARG 119 LEU 120 THR 121 GLY 122 VAL 123 VAL 124 ASP 125 ALA 126 LEU 127 THR 128 ALA 129 ARG 130 GLY 131 MET 132 HIS 133 VAL 134 LEU 135 LEU 136 ASP 137 ASN 138 HIS 139 GLN 140 ASP 141 GLY 142 LEU 143 SER 144 LYS 145 ALA 146 TRP 147 GLY 148 GLY 149 ASN 150 GLY 151 PHE 152 PRO 153 GLU 154 TRP 155 ALA 156 ILE 157 GLU 158 SER 159 ARG 160 PRO 161 ARG 162 GLU 163 TRP 164 GLU 165 PRO 166 ASN 167 PRO 168 GLY 169 PHE 170 PRO 171 LEU 172 TYR 173 TYR 174 LEU 175 MET 176 PRO 177 SER 178 LEU 179 ASN 180 ALA 181 GLY 182 TRP 183 ASP 184 GLU 185 VAL 186 TRP 187 GLY 188 ASN 189 THR 190 HIS 191 GLY 192 ALA 193 LEU 194 ASP 195 HIS 196 LEU 197 GLY 198 THR 199 ALA 200 LEU 201 GLY 202 ALA 203 LEU 204 ALA 205 GLU 206 ARG 207 VAL 208 GLU 209 GLY 210 LYS 211 PRO 212 GLY 213 VAL 214 MET 215 GLY 216 ILE 217 GLU 218 LEU 219 LEU 220 ASN 221 GLU 222 PRO 223 TRP 224 PRO 225 GLY 226 SER 227 ARG 228 PHE 229 LEU 230 SER 231 CYS 232 PHE 233 PRO 234 ASN 235 GLY 236 CYS 237 PRO 238 ASP 239 PHE 240 ASP 241 ARG 242 THR 243 TYR 244 GLN 245 ALA 246 ALA 247 MET 248 GLN 249 LYS 250 LEU 251 THR 252 ASP 253 ALA 254 VAL 255 ARG 256 ALA 257 GLN 258 ASN 259 PRO 260 THR 261 ILE 262 PRO 263 VAL 264 TYR 265 TRP 266 GLU 267 PRO 268 ASN 269 VAL 270 THR 271 TRP 272 ASN 273 GLN 274 MET 275 MET 276 PRO 277 SER 278 ASN 279 LEU 280 PHE 281 ALA 282 PRO 283 PRO 284 VAL 285 THR 286 PRO 287 ALA 288 LEU 289 THR 290 THR 291 ALA 292 ASP 293 VAL 294 VAL 295 PHE 296 ALA 297 PRO 298 HIS 299 ASP 300 TYR 301 CYS 302 ILE 303 PRO 304 SER 305 GLN 306 LEU 307 ALA 308 ILE 309 TYR 310 LEU 311 GLY 312 LEU 313 PRO 314 GLN 315 ALA 316 LEU 317 ARG 318 GLY 319 LEU 320 CYS 321 VAL 322 PRO 323 GLN 324 GLN 325 ASP 326 LEU 327 THR 328 TRP 329 SER 330 ASN 331 ILE 332 ASP 333 ALA 334 ILE 335 THR 336 GLU 337 ARG 338 ALA 339 ASN 340 VAL 341 PRO 342 THR 343 VAL 344 ILE 345 THR 346 GLU 347 PHE 348 GLY 349 ASP 350 GLY 351 ASP 352 PRO 353 THR 354 VAL 355 LEU 356 LYS 357 ASN 358 THR 359 LEU 360 ALA 361 ARG 362 ALA 363 ASP 364 GLU 365 ARG 366 PHE 367 ILE 368 GLY 369 TRP 370 GLN 371 TYR 372 TRP 373 HIS 374 PHE 375 GLY 376 ALA 377 GLY 378 ASN 379 ALA 380 THR 381 ASP 382 PRO 383 PHE 384 LEU 385 GLY 386 GLU 387 VAL 388 GLY 389 ARG 390 GLN 391 LEU 392 VAL 393 ARG 394 THR 395 TYR 396 PRO 397 GLN 398 ALA 399 THR 400 ALA 401 GLY 402 GLU 403 PRO 404 GLY 405 ARG 406 MET 407 ILE 408 PHE 409 ASP 410 ALA 411 ASP 412 ASN 413 GLY 414 ASP 415 PHE 416 ALA 417 TYR 418 ARG 419 PHE 420 THR 421 PRO 422 ARG 423 ALA 424 ALA 425 THR 426 ARG 427 PRO 428 THR 429 GLU 430 ILE 431 PHE 432 VAL 433 SER 434 ASP 435 LEU 436 HIS 437 TYR 438 PRO 439 ASP 440 GLY 441 TYR 442 ALA 443 VAL 444 GLN 445 VAL 446 ASP 447 GLY 448 GLY 449 GLN 450 VAL 451 THR 452 SER 453 ALA 454 PRO 455 GLY 456 ALA 457 ARG 458 ILE 459 VAL 460 THR 461 VAL 462 VAL 463 ALA 464 ASP 465 GLY 466 SER 467 GLY 468 PRO 469 VAL 470 THR 471 VAL 472 LYS 473 ILE 474 ASN 475 ARG 476 PRO 477 GLY 478 SER 479 ALA 480 GLY 481 ALA 482 GLU 483 VAL 484 PRO 485

Unit 2

ALA 38 THR 39 PRO 40 ILE 41 THR 42 THR 43 LEU 44 GLN 45 ALA 46 ASP 47 GLY 48 THR 49 HIS 50 LEU 51 VAL 52 ASP 53 GLY 54 TYR 55 GLY 56 ARG 57 THR 58 VAL 59 LEU 60 LEU 61 HIS 62 GLY 63 VAL 64 ASN 65 ASN 66 VAL 67 ASP 68 LYS 69 ASP 70 ALA 71 PRO 72 TYR 73 LEU 74 PRO 75 GLY 77 GLU 78 THR 79 LEU 80 THR 81 PRO 82 GLN 83 ASP 84 ILE 85 ASP 86 ILE 87 LEU 88 VAL 89 ARG 90 HIS 91 GLY 92 PHE 93 ASN 94 THR 95 VAL 96 ARG 97 LEU 98 GLY 99 THR 100 SER 101 PHE 102 ASP 103 ALA 104 LEU 105 MET 106 PRO 107 GLN 108 ARG 109 GLY 110 GLN 111 ILE 112 ASP 113 GLU 114 ALA 115 TYR 116 LEU 117 ASP 118 ARG 119 LEU 120 THR 121 GLY 122 VAL 123 VAL 124 ASP 125 ALA 126 LEU 127 THR 128 ALA 129 ARG 130 GLY 131 MET 132 HIS 133 VAL 134 LEU 135 LEU 136 ASP 137 ASN 138 HIS 139 GLN 140 ASP 141 GLY 142 LEU 143 SER 144 LYS 145 ALA 146 TRP 147 GLY 148 GLY 149 ASN 150 GLY 151 PHE 152 PRO 153 GLU 154 TRP 155 ALA 156 ILE 157 GLU 158 SER 159 ARG 160 PRO 161 ARG 162 GLU 163 TRP 164 GLU 165 PRO 166 ASN 167 PRO 168 GLY 169 PHE 170 PRO 171 LEU 172 TYR 173 TYR 174 LEU 175 MET 176 PRO 177 SER 178 LEU 179 ASN 180 ALA 181 GLY 182 TRP 183 ASP 184 GLU 185 VAL 186 TRP 187 GLY 188 ASN 189 THR 190 HIS 191 GLY 192 ALA 193 LEU 194 ASP 195 HIS 196 LEU 197 GLY 198 THR 199 ALA 200 LEU 201 GLY 202 ALA 203 LEU 204 ALA 205 GLU 206 ARG 207 VAL 208 GLU 209 GLY 210 LYS 211 PRO 212 GLY 213 VAL 214 MET 215 GLY 216 ILE 217 GLU 218 LEU 219 LEU 220 ASN 221 GLU 222 PRO 223 TRP 224 PRO 225 GLY 226 SER 227 ARG 228 PHE 229 LEU 230 SER 231 CYS 232 PHE 233 PRO 234 ASN 235 GLY 236 CYS 237 PRO 238 ASP 239 PHE 240 ASP 241 ARG 242 THR 243 TYR 244 GLN 245 ALA 246 ALA 247 MET 248 GLN 249 LYS 250 LEU 251 THR 252 ASP 253 ALA 254 VAL 255 ARG 256 ALA 257 GLN 258 ASN 259 PRO 260 THR 261 ILE 262 PRO 263 VAL 264 TYR 265 TRP 266 GLU 267 PRO 268 ASN 269 VAL 270 THR 271 TRP 272 ASN 273 GLN 274 MET 275 MET 276 PRO 277 SER 278 ASN 279 LEU 280 PHE 281 ALA 282 PRO 283 PRO 284 VAL 285 THR 286 PRO 287 ALA 288 LEU 289 THR 290 THR 291 ALA 292 ASP 293 VAL 294 VAL 295 PHE 296 ALA 297 PRO 298 HIS 299 ASP 300 TYR 301 CYS 302 ILE 303 PRO 304 SER 305 GLN 306 LEU 307 ALA 316 ARG 318 GLY 319 LEU 320 CYS 321 VAL 322 PRO 323 GLN 324 GLN 325 ASP 326 LEU 327 THR 328 TRP 329 SER 330 ASN 331 ILE 332 ASP 333 ALA 334 ILE 335 THR 336 GLU 337 ARG 338 ALA 339 ASN 340 VAL 341 PRO 342 THR 343 VAL 344 ILE 345 THR 346 GLU 347 PHE 348 GLY 349 ASP 352 PRO 353 THR 354 VAL 355 LEU 356 LYS 357 ASN 358 THR 359 LEU 360 ALA 361 ARG 362 ALA 363 ASP 364 GLU 365 ARG 366 PHE 367 ILE 368 GLY 369 TRP 370 GLN 371 TYR 372 TRP 373 HIS 374 PHE 375 GLY 376 ALA 377 GLY 378 ASN 379 ALA 380 THR 381 ASP 382 PRO 383 PHE 384 LEU 385 GLY 386 GLU 387 VAL 388 GLY 389 ARG 390 GLN 391 LEU 392 VAL 393 ARG 394 THR 395 TYR 396 PRO 397 GLN 398 ALA 399 THR 400 ALA 401 GLY 402 GLU 403 PRO 404 GLY 405 ARG 406 MET 407 ILE 408 PHE 409 ASP 410 ALA 411 ASP 412 ASN 413 GLY 414 ASP 415 PHE 416 ALA 417 TYR 418 ARG 419 PHE 420 THR 421 PRO 422 ARG 423 ALA 424 ALA 425 THR 426 ARG 427 PRO 428 THR 429 GLU 430 ILE 431 PHE 432 VAL 433 SER 434 ASP 435 LEU 436 HIS 437 TYR 438 PRO 439 ASP 440 GLY 441 TYR 442 ALA 443 VAL 444 GLN 445 VAL 446 ASP 447 GLY 448 GLY 449 GLN 450 VAL 451 THR 452 SER 453 ALA 454 PRO 455 GLY 456 ALA 457 ARG 458 ILE 459 VAL 460 THR 461 VAL 462 VAL 463 ALA 464 ASP 465 GLY 466 SER 467 GLY 468 PRO 469 VAL 470 THR 471 VAL 472 LYS 473 ILE 474 ASN 475 ARG 476 PRO 477 GLY 478 SER 479 ALA 480 GLY 481 ALA 482 GLU 483 VAL 484 PRO 485

Ligands

Unit 3	EDO 601 EDO 602 EDO 603 EDO 604 EDO 605 EDO 606 EDO 607 EDO 608 EDO 609 EDO 610 EDO 611 NA 612
Unit 4	EDO 601 EDO 602 EDO 603 EDO 604 EDO 605 EDO 606 EDO 607 EDO 608