5C8A - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF A TRUNCATED FORM OF THERMUS THERMOPHILU BOUND TO ADENOSYLCOBALAMIN (DARK STATE)
• Keywords: TRANSCRIPTION FACTOR, LIGHT SENSOR, ADENOSYLCOBALAMIN-BINDIN BINDING, TRANSCRIPTION, TRANSCRIPTIONAL REGULATOR
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	5C8A	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	LIGHT-DEPENDENT TRANSCRIPTIONAL REGULATOR CARH	A	194	1433	0
2	Protein	LIGHT-DEPENDENT TRANSCRIPTIONAL REGULATOR CARH	B	194	1440	0
3	Protein	LIGHT-DEPENDENT TRANSCRIPTIONAL REGULATOR CARH	C	195	1440	0
4	Protein	LIGHT-DEPENDENT TRANSCRIPTIONAL REGULATOR CARH	D	194	1442	0
5	Ligand	LIGHT-DEPENDENT TRANSCRIPTIONAL REGULATOR CARH	A	2	0	109
6	Ligand	LIGHT-DEPENDENT TRANSCRIPTIONAL REGULATOR CARH	B	3	0	115
7	Ligand	LIGHT-DEPENDENT TRANSCRIPTIONAL REGULATOR CARH	C	2	0	109
8	Ligand	LIGHT-DEPENDENT TRANSCRIPTIONAL REGULATOR CARH	D	2	0	109
9	Water			259	0	259
total				1045	5755	701

Proteins

Unit 1	GLU 81 ASP 82 LEU 83 GLY 84 THR 85 GLY 86 LEU 87 LEU 88 GLU 89 ALA 90 LEU 91 LEU 92 ARG 93 GLY 94 ASP 95 LEU 96 ALA 97 GLY 98 ALA 99 GLU 100 ALA 101 LEU 102 PHE 103 ARG 104 ARG 105 GLY 106 LEU 107 ARG 108 PHE 109 TRP 110 GLY 111 PRO 112 GLU 113 GLY 114 VAL 115 LEU 116 GLU 117 HIS 118 LEU 119 LEU 120 LEU 121 PRO 122 VAL 123 LEU 124 ARG 125 GLU 126 VAL 127 GLY 128 GLU 129 ALA 130 TRP 131 HIS 132 ARG 133 GLY 134 GLU 135 ILE 136 GLY 137 VAL 138 ALA 139 GLU 140 GLU 141 HIS 142 LEU 143 ALA 144 SER 145 THR 146 PHE 147 LEU 148 ARG 149 ALA 150 ARG 151 LEU 152 GLN 153 GLU 154 LEU 155 LEU 156 ASP 157 LEU 158 ALA 159 GLY 160 PHE 161 PRO 162 PRO 163 GLY 164 PRO 165 PRO 166 VAL 167 LEU 168 VAL 169 THR 170 THR 171 PRO 172 PRO 173 GLY 174 GLU 175 ARG 176 HIS 177 GLU 178 ILE 179 GLY 180 ALA 181 MET 182 LEU 183 ALA 184 ALA 185 TYR 186 HIS 187 LEU 188 ARG 189 ARG 190 LYS 191 GLY 192 VAL 193 PRO 194 ALA 195 LEU 196 TYR 197 LEU 198 GLY 199 PRO 200 ASP 201 THR 202 PRO 203 LEU 204 PRO 205 ASP 206 LEU 207 ARG 208 ALA 209 LEU 210 ALA 211 ARG 212 ARG 213 LEU 214 GLY 215 ALA 216 GLY 217 ALA 218 VAL 219 VAL 220 LEU 221 SER 222 ALA 223 VAL 224 LEU 225 SER 226 GLU 227 PRO 228 LEU 229 ARG 230 ALA 231 LEU 232 PRO 233 ASP 234 GLY 235 ALA 236 LEU 237 LYS 238 ASP 239 LEU 240 ALA 241 PRO 242 ARG 243 VAL 244 PHE 245 LEU 246 GLY 247 GLY 248 GLN 249 GLY 250 ALA 251 GLY 252 PRO 253 GLU 254 GLU 255 ALA 256 ARG 257 ARG 258 LEU 259 GLY 260 ALA 261 GLU 262 TYR 263 MET 264 GLU 265 ASP 266 LEU 267 LYS 268 GLY 269 LEU 270 ALA 271 GLU 272 ALA 273 LEU 274
Unit 2	LEU 83 GLY 84 THR 85 GLY 86 LEU 87 LEU 88 GLU 89 ALA 90 LEU 91 LEU 92 ARG 93 GLY 94 ASP 95 LEU 96 ALA 97 GLY 98 ALA 99 GLU 100 ALA 101 LEU 102 PHE 103 ARG 104 ARG 105 GLY 106 LEU 107 ARG 108 PHE 109 TRP 110 GLY 111 PRO 112 GLU 113 GLY 114 VAL 115 LEU 116 GLU 117 HIS 118 LEU 119 LEU 120 LEU 121 PRO 122 VAL 123 LEU 124 ARG 125 GLU 126 VAL 127 GLY 128 GLU 129 ALA 130 TRP 131 HIS 132 ARG 133 GLY 134 GLU 135 ILE 136 GLY 137 VAL 138 ALA 139 GLU 140 GLU 141 HIS 142 LEU 143 ALA 144 SER 145 THR 146 PHE 147 LEU 148 ARG 149 ALA 150 ARG 151 LEU 152 GLN 153 GLU 154 LEU 155 LEU 156 ASP 157 LEU 158 ALA 159 GLY 160 PHE 161 PRO 162 PRO 163 GLY 164 PRO 165 PRO 166 VAL 167 LEU 168 VAL 169 THR 170 THR 171 PRO 172 PRO 173 GLY 174 GLU 175 ARG 176 HIS 177 GLU 178 ILE 179 GLY 180 ALA 181 MET 182 LEU 183 ALA 184 ALA 185 TYR 186 HIS 187 LEU 188 ARG 189 ARG 190 LYS 191 GLY 192 VAL 193 PRO 194 ALA 195 LEU 196 TYR 197 LEU 198 GLY 199 PRO 200 ASP 201 THR 202 PRO 203 LEU 204 PRO 205 ASP 206 LEU 207 ARG 208 ALA 209 LEU 210 ALA 211 ARG 212 ARG 213 LEU 214 GLY 215 ALA 216 GLY 217 ALA 218 VAL 219 VAL 220 LEU 221 SER 222 ALA 223 VAL 224 LEU 225 SER 226 GLU 227 PRO 228 LEU 229 ARG 230 ALA 231 LEU 232 PRO 233 ASP 234 GLY 235 ALA 236 LEU 237 LYS 238 ASP 239 LEU 240 ALA 241 PRO 242 ARG 243 VAL 244 PHE 245 LEU 246 GLY 247 GLY 248 GLN 249 GLY 250 ALA 251 GLY 252 PRO 253 GLU 254 GLU 255 ALA 256 ARG 257 ARG 258 LEU 259 GLY 260 ALA 261 GLU 262 TYR 263 MET 264 GLU 265 ASP 266 LEU 267 LYS 268 GLY 269 LEU 270 ALA 271 GLU 272 ALA 273 LEU 274 TRP 275 LEU 276
Unit 3	PRO 80 GLU 81 ASP 82 LEU 83 GLY 84 THR 85 GLY 86 LEU 87 LEU 88 GLU 89 ALA 90 LEU 91 LEU 92 ARG 93 GLY 94 ASP 95 LEU 96 ALA 97 GLY 98 ALA 99 GLU 100 ALA 101 LEU 102 PHE 103 ARG 104 ARG 105 GLY 106 LEU 107 ARG 108 PHE 109 TRP 110 GLY 111 PRO 112 GLU 113 GLY 114 VAL 115 LEU 116 GLU 117 HIS 118 LEU 119 LEU 120 LEU 121 PRO 122 VAL 123 LEU 124 ARG 125 GLU 126 VAL 127 GLY 128 GLU 129 ALA 130 TRP 131 HIS 132 ARG 133 GLY 134 GLU 135 ILE 136 GLY 137 VAL 138 ALA 139 GLU 140 GLU 141 HIS 142 LEU 143 ALA 144 SER 145 THR 146 PHE 147 LEU 148 ARG 149 ALA 150 ARG 151 LEU 152 GLN 153 GLU 154 LEU 155 LEU 156 ASP 157 LEU 158 ALA 159 GLY 160 PHE 161 PRO 162 PRO 163 GLY 164 PRO 165 PRO 166 VAL 167 LEU 168 VAL 169 THR 170 THR 171 PRO 172 PRO 173 GLY 174 GLU 175 ARG 176 HIS 177 GLU 178 ILE 179 GLY 180 ALA 181 MET 182 LEU 183 ALA 184 ALA 185 TYR 186 HIS 187 LEU 188 ARG 189 ARG 190 LYS 191 GLY 192 VAL 193 PRO 194 ALA 195 LEU 196 TYR 197 LEU 198 GLY 199 PRO 200 ASP 201 THR 202 PRO 203 LEU 204 PRO 205 ASP 206 LEU 207 ARG 208 ALA 209 LEU 210 ALA 211 ARG 212 ARG 213 LEU 214 GLY 215 ALA 216 GLY 217 ALA 218 VAL 219 VAL 220 LEU 221 SER 222 ALA 223 VAL 224 LEU 225 SER 226 GLU 227 PRO 228 LEU 229 ARG 230 ALA 231 LEU 232 PRO 233 ASP 234 GLY 235 ALA 236 LEU 237 LYS 238 ASP 239 LEU 240 ALA 241 PRO 242 ARG 243 VAL 244 PHE 245 LEU 246 GLY 247 GLY 248 GLN 249 GLY 250 ALA 251 GLY 252 PRO 253 GLU 254 GLU 255 ALA 256 ARG 257 ARG 258 LEU 259 GLY 260 ALA 261 GLU 262 TYR 263 MET 264 GLU 265 ASP 266 LEU 267 LYS 268 GLY 269 LEU 270 ALA 271 GLU 272 ALA 273 LEU 274
Unit 4	GLU 81 ASP 82 LEU 83 GLY 84 THR 85 GLY 86 LEU 87 LEU 88 GLU 89 ALA 90 LEU 91 LEU 92 ARG 93 GLY 94 ASP 95 LEU 96 ALA 97 GLY 98 ALA 99 GLU 100 ALA 101 LEU 102 PHE 103 ARG 104 ARG 105 GLY 106 LEU 107 ARG 108 PHE 109 TRP 110 GLY 111 PRO 112 GLU 113 GLY 114 VAL 115 LEU 116 GLU 117 HIS 118 LEU 119 LEU 120 LEU 121 PRO 122 VAL 123 LEU 124 ARG 125 GLU 126 VAL 127 GLY 128 GLU 129 ALA 130 TRP 131 HIS 132 ARG 133 GLY 134 GLU 135 ILE 136 GLY 137 VAL 138 ALA 139 GLU 140 GLU 141 HIS 142 LEU 143 ALA 144 SER 145 THR 146 PHE 147 LEU 148 ARG 149 ALA 150 ARG 151 LEU 152 GLN 153 GLU 154 LEU 155 LEU 156 ASP 157 LEU 158 ALA 159 GLY 160 PHE 161 PRO 162 PRO 163 GLY 164 PRO 165 PRO 166 VAL 167 LEU 168 VAL 169 THR 170 THR 171 PRO 172 PRO 173 GLY 174 GLU 175 ARG 176 HIS 177 GLU 178 ILE 179 GLY 180 ALA 181 MET 182 LEU 183 ALA 184 ALA 185 TYR 186 HIS 187 LEU 188 ARG 189 ARG 190 LYS 191 GLY 192 VAL 193 PRO 194 ALA 195 LEU 196 TYR 197 LEU 198 GLY 199 PRO 200 ASP 201 THR 202 PRO 203 LEU 204 PRO 205 ASP 206 LEU 207 ARG 208 ALA 209 LEU 210 ALA 211 ARG 212 ARG 213 LEU 214 GLY 215 ALA 216 GLY 217 ALA 218 VAL 219 VAL 220 LEU 221 SER 222 ALA 223 VAL 224 LEU 225 SER 226 GLU 227 PRO 228 LEU 229 ARG 230 ALA 231 LEU 232 PRO 233 ASP 234 GLY 235 ALA 236 LEU 237 LYS 238 ASP 239 LEU 240 ALA 241 PRO 242 ARG 243 VAL 244 PHE 245 LEU 246 GLY 247 GLY 248 GLN 249 GLY 250 ALA 251 GLY 252 PRO 253 GLU 254 GLU 255 ALA 256 ARG 257 ARG 258 LEU 259 GLY 260 ALA 261 GLU 262 TYR 263 MET 264 GLU 265 ASP 266 LEU 267 LYS 268 GLY 269 LEU 270 ALA 271 GLU 272 ALA 273 LEU 274

Ligands

Unit 5	B12 300 5AD 301
Unit 6	B12 301 5AD 302 GOL 303
Unit 7	B12 300 5AD 301
Unit 8	B12 300 5AD 301