4YLF - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: INSIGHTS INTO FLAVIN-BASED ELECTRON BIFURCATION VIA THE NADH REDUCED FERREDOXIN-NADP OXIDOREDUCTASE STRUCTURE
• Keywords: OXIDOREDUCTASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	4YLF	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE B (NAD(+)), ELECTRON SUBUNIT HOMOLOG	A	276	2140	0
2	Protein	DIHYDROPYRIMIDINE DEHYDROGENASE SUBUNIT A	B	468	3625	0
3	Protein	DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE B (NAD(+)), ELECTRON SUBUNIT HOMOLOG	C	263	2031	0
4	Protein	DIHYDROPYRIMIDINE DEHYDROGENASE SUBUNIT A	D	468	3625	0
5	Ligand	DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE B (NAD(+)), ELECTRON SUBUNIT HOMOLOG	A	2	0	57
6	Ligand	DIHYDROPYRIMIDINE DEHYDROGENASE SUBUNIT A	B	4	0	74
7	Ligand	DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE B (NAD(+)), ELECTRON SUBUNIT HOMOLOG	C	2	0	57
8	Ligand	DIHYDROPYRIMIDINE DEHYDROGENASE SUBUNIT A	D	4	0	74
9	Water			160	0	160
total				1647	11421	422

Proteins

Unit 1	MET 1 GLY 2 GLY 3 THR 4 ALA 5 LEU 6 ASN 7 GLU 8 ILE 9 VAL 10 LYS 11 LYS 12 VAL 13 LYS 14 ILE 15 ALA 16 GLU 17 ASP 18 VAL 19 PHE 20 ASP 21 PHE 22 TRP 23 ILE 24 HIS 25 SER 26 PRO 27 SER 28 VAL 29 SER 30 LYS 31 GLU 32 ALA 33 ARG 34 PRO 35 GLY 36 GLN 37 PHE 38 VAL 39 VAL 40 ILE 41 ARG 42 LEU 43 HIS 44 GLU 45 LYS 46 GLY 47 GLU 48 ARG 49 ILE 50 PRO 51 LEU 52 THR 53 VAL 54 ALA 55 ASP 56 THR 57 LYS 58 PRO 59 GLU 60 GLU 61 GLY 62 LEU 63 PHE 64 ARG 65 MET 66 VAL 67 VAL 68 LYS 69 VAL 70 VAL 71 GLY 72 LYS 73 THR 74 THR 75 HIS 76 GLU 77 LEU 78 SER 79 LEU 80 LYS 81 LYS 82 GLU 83 GLY 84 ASP 85 THR 86 ILE 87 LEU 88 ASP 89 VAL 90 VAL 91 GLY 92 PRO 93 LEU 94 GLY 95 ASN 96 PRO 97 SER 98 GLU 99 ILE 100 GLU 101 ASN 102 TYR 103 GLY 104 ASN 105 VAL 106 LEU 107 LEU 108 VAL 109 GLY 110 GLY 111 GLY 112 VAL 113 GLY 114 ILE 115 ALA 116 THR 117 LEU 118 TYR 119 PRO 120 ILE 121 ALA 122 LYS 123 ALA 124 LEU 125 LYS 126 GLU 127 ALA 128 GLY 129 ASN 130 ASN 131 ILE 132 THR 133 THR 134 VAL 135 LEU 136 GLY 137 ALA 138 ARG 139 THR 140 LYS 141 ASP 142 TYR 143 LEU 144 ILE 145 MET 146 VAL 147 ASP 148 GLU 149 PHE 150 LYS 151 GLU 152 ILE 153 SER 154 ASP 155 VAL 156 LEU 157 LEU 158 VAL 159 THR 160 ASP 161 ASP 162 GLY 163 SER 164 ALA 165 GLY 166 MET 167 LYS 168 GLY 169 VAL 170 VAL 171 THR 172 ASP 173 ALA 174 MET 175 ASP 176 LYS 177 LEU 178 PHE 179 ARG 180 GLU 181 ARG 182 LYS 183 PHE 184 ASP 185 ILE 186 CYS 187 TRP 188 ALA 189 VAL 190 GLY 191 PRO 192 THR 193 ILE 194 MET 195 MET 196 LYS 197 PHE 198 CYS 199 THR 200 LEU 201 LYS 202 ALA 203 ARG 204 GLU 205 PHE 206 GLY 207 VAL 208 PRO 209 ILE 210 TRP 211 VAL 212 SER 213 LEU 214 ASN 215 PRO 216 ILE 217 MET 218 VAL 219 ASP 220 GLY 221 THR 222 GLY 223 MET 224 CYS 225 GLY 226 ALA 227 CYS 228 ARG 229 VAL 230 THR 231 VAL 232 SER 233 GLY 234 GLN 235 ILE 236 LYS 237 PHE 238 ALA 239 CYS 240 VAL 241 ASP 242 GLY 243 PRO 244 GLU 245 PHE 246 ARG 247 GLY 248 GLU 249 GLU 250 VAL 251 ASP 252 TRP 253 ASP 254 GLU 255 LEU 256 LEU 257 LYS 258 ARG 259 LEU 260 ALA 261 GLN 262 TYR 263 ARG 264 GLU 265 GLN 266 GLU 267 LYS 268 ILE 269 SER 270 TYR 271 GLU 272 ARG 273 PHE 274 LEU 275 LYS 276
Unit 2	MET 1 LYS 2 ASN 3 ARG 4 LYS 5 THR 6 PRO 7 MET 8 LYS 9 GLU 10 GLN 11 SER 12 PRO 13 GLU 14 SER 15 ARG 16 ARG 17 ARG 18 ASN 19 PHE 20 GLU 21 GLU 22 VAL 23 ALA 24 LEU 25 GLY 26 TYR 27 THR 28 LEU 29 GLU 30 GLU 31 ALA 32 LEU 33 GLU 34 GLU 35 ALA 36 GLN 37 ARG 38 CYS 39 LEU 40 GLN 41 CYS 42 PRO 43 THR 44 HIS 45 PRO 46 CYS 47 VAL 48 SER 49 GLY 50 CYS 51 PRO 52 VAL 53 GLU 54 ILE 55 ASP 56 ILE 57 PRO 58 GLY 59 PHE 60 ILE 61 ARG 62 LYS 63 LEU 64 ARG 65 ASP 66 GLY 67 LYS 68 LEU 69 GLU 70 GLU 71 SER 72 TYR 73 ARG 74 ILE 75 LEU 76 LYS 77 SER 78 TYR 79 ASN 80 ASN 81 LEU 82 PRO 83 ALA 84 VAL 85 CYS 86 GLY 87 ARG 88 VAL 89 CYS 90 PRO 91 GLN 92 GLU 93 VAL 94 GLN 95 CYS 96 GLU 97 SER 98 ARG 99 CYS 100 VAL 101 VAL 102 GLY 103 LYS 104 MET 105 LYS 106 ASP 107 SER 108 GLU 109 PRO 110 VAL 111 ALA 112 ILE 113 GLY 114 ARG 115 LEU 116 GLU 117 ARG 118 PHE 119 VAL 120 ALA 121 ASP 122 TRP 123 ALA 124 ALA 125 GLU 126 ASN 127 LEU 128 GLU 129 GLU 130 ASP 131 VAL 132 LYS 133 PRO 134 LEU 135 ALA 136 GLY 137 SER 138 LYS 139 LYS 140 GLU 141 LYS 142 VAL 143 ALA 144 VAL 145 VAL 146 GLY 147 SER 148 GLY 149 PRO 150 ALA 151 GLY 152 LEU 153 THR 154 ALA 155 ALA 156 ALA 157 ASP 158 LEU 159 ALA 160 LYS 161 MET 162 GLY 163 TYR 164 HIS 165 VAL 166 ASP 167 ILE 168 PHE 169 GLU 170 ALA 171 PHE 172 HIS 173 LYS 174 PRO 175 GLY 176 GLY 177 VAL 178 LEU 179 VAL 180 TYR 181 GLY 182 ILE 183 PRO 184 GLU 185 PHE 186 ARG 187 LEU 188 PRO 189 LYS 190 ARG 191 ILE 192 VAL 193 GLU 194 ARG 195 GLU 196 VAL 197 SER 198 TYR 199 ILE 200 ARG 201 LYS 202 LEU 203 GLY 204 VAL 205 ASN 206 PHE 207 HIS 208 LEU 209 ASN 210 THR 211 VAL 212 VAL 213 GLY 214 LYS 215 THR 216 VAL 217 LYS 218 VAL 219 LYS 220 GLU 221 LEU 222 LEU 223 SER 224 GLU 225 TYR 226 ASP 227 ALA 228 VAL 229 PHE 230 ILE 231 GLY 232 THR 233 GLY 234 ALA 235 GLY 236 THR 237 PRO 238 LYS 239 PHE 240 MET 241 GLY 242 ILE 243 PRO 244 GLY 245 THR 246 ASN 247 LEU 248 ASN 249 GLY 250 VAL 251 TYR 252 SER 253 ALA 254 ASN 255 GLU 256 PHE 257 LEU 258 THR 259 ARG 260 VAL 261 ASN 262 LEU 263 MET 264 LYS 265 ALA 266 TYR 267 LEU 268 PHE 269 PRO 270 GLU 271 TYR 272 ASP 273 THR 274 PRO 275 ILE 276 ARG 277 VAL 278 GLY 279 LYS 280 LYS 281 VAL 282 ALA 283 VAL 284 ILE 285 GLY 286 ALA 287 GLY 288 ASN 289 THR 290 ALA 291 MET 292 ASP 293 ALA 294 ALA 295 ARG 296 SER 297 ALA 298 LEU 299 ARG 300 LEU 301 GLY 302 ALA 303 GLU 304 LYS 305 VAL 306 TYR 307 ILE 308 VAL 309 TYR 310 ARG 311 ARG 312 THR 313 GLU 314 ARG 315 GLU 316 MET 317 PRO 318 ALA 319 ARG 320 ARG 321 GLU 322 GLU 323 TYR 324 HIS 325 HIS 326 ALA 327 LEU 328 GLU 329 GLU 330 GLY 331 ILE 332 GLU 333 PHE 334 LEU 335 TRP 336 LEU 337 THR 338 LEU 339 PRO 340 ILE 341 ARG 342 TYR 343 ILE 344 GLY 345 ASP 346 ALA 347 ASN 348 GLY 349 ASN 350 VAL 351 GLU 352 ALA 353 MET 354 GLU 355 CYS 356 VAL 357 ARG 358 MET 359 GLU 360 LEU 361 LYS 362 GLU 363 ALA 364 ASP 365 GLY 366 SER 367 GLY 368 ARG 369 PRO 370 ARG 371 PRO 372 VAL 373 PRO 374 ILE 375 GLU 376 GLY 377 SER 378 ASN 379 PHE 380 VAL 381 LEU 382 GLU 383 VAL 384 ASP 385 MET 386 VAL 387 ILE 388 GLU 389 ALA 390 ILE 391 GLY 392 GLN 393 GLY 394 PRO 395 ASN 396 ARG 397 VAL 398 LEU 399 LEU 400 SER 401 GLU 402 PHE 403 PRO 404 GLY 405 LEU 406 GLU 407 LEU 408 ASN 409 GLU 410 ARG 411 GLY 412 TYR 413 ILE 414 LYS 415 ALA 416 ASP 417 GLU 418 ASP 419 THR 420 GLY 421 ALA 422 THR 423 SER 424 VAL 425 LYS 426 GLY 427 VAL 428 PHE 429 ALA 430 GLY 431 GLY 432 ASP 433 ILE 434 VAL 435 THR 436 GLY 437 ALA 438 ALA 439 THR 440 VAL 441 ILE 442 LYS 443 ALA 444 MET 445 GLY 446 ALA 447 GLY 448 LYS 449 LYS 450 ALA 451 ALA 452 GLN 453 PHE 454 ILE 455 HIS 456 SER 457 TYR 458 LEU 459 THR 460 GLY 461 GLU 462 TRP 463 ASN 464 PRO 465 TRP 466 GLN 467 LYS 468
Unit 3	MET 1 GLY 2 GLY 3 THR 4 ALA 5 LEU 6 ASN 7 GLU 8 ILE 9 VAL 10 LYS 11 LYS 12 VAL 13 LYS 14 ILE 15 ALA 16 GLU 17 ASP 18 VAL 19 PHE 20 ASP 21 PHE 22 TRP 23 ILE 24 HIS 25 SER 26 PRO 27 SER 28 VAL 29 SER 30 LYS 31 GLU 32 ALA 33 ARG 34 PRO 35 GLY 36 GLN 37 PHE 38 VAL 39 VAL 40 ILE 41 ARG 42 LEU 43 HIS 44 GLU 45 LYS 46 GLY 47 GLU 48 ARG 49 ILE 50 PRO 51 LEU 52 THR 53 VAL 54 ALA 55 ASP 56 THR 57 LYS 58 PRO 59 GLU 60 GLU 61 GLY 62 LEU 63 PHE 64 ARG 65 MET 66 VAL 67 VAL 68 LYS 69 VAL 70 VAL 71 GLY 72 LYS 73 THR 74 THR 75 HIS 76 GLU 77 LEU 78 SER 79 LEU 80 LYS 81 LYS 82 GLU 83 GLY 84 ASP 85 THR 86 ILE 87 LEU 88 ASP 89 VAL 90 VAL 91 GLY 92 PRO 93 LEU 94 GLY 95 ASN 96 PRO 97 SER 98 GLU 99 ILE 100 GLU 101 ASN 102 TYR 103 GLY 104 ASN 105 VAL 106 LEU 107 LEU 108 VAL 109 GLY 110 GLY 111 GLY 112 VAL 113 GLY 114 ILE 115 ALA 116 THR 117 LEU 118 TYR 119 PRO 120 ILE 121 ALA 122 LYS 123 ALA 124 LEU 125 LYS 126 GLU 127 ALA 128 GLY 129 ASN 130 ASN 131 ILE 132 THR 133 THR 134 VAL 135 LEU 136 GLY 137 ALA 138 ARG 139 THR 140 LYS 141 ASP 142 TYR 143 LEU 144 ILE 145 MET 146 VAL 147 ASP 148 GLU 149 PHE 150 LYS 151 GLU 152 ILE 153 SER 154 ASP 155 VAL 156 LEU 157 LEU 158 VAL 159 THR 160 ASP 161 ASP 162 GLY 163 SER 164 ALA 165 GLY 166 MET 167 LYS 168 GLY 169 LYS 183 PHE 184 ASP 185 ILE 186 CYS 187 TRP 188 ALA 189 VAL 190 GLY 191 PRO 192 THR 193 ILE 194 MET 195 MET 196 LYS 197 PHE 198 CYS 199 THR 200 LEU 201 LYS 202 ALA 203 ARG 204 GLU 205 PHE 206 GLY 207 VAL 208 PRO 209 ILE 210 TRP 211 VAL 212 SER 213 LEU 214 ASN 215 PRO 216 ILE 217 MET 218 VAL 219 ASP 220 GLY 221 THR 222 GLY 223 MET 224 CYS 225 GLY 226 ALA 227 CYS 228 ARG 229 VAL 230 THR 231 VAL 232 SER 233 GLY 234 GLN 235 ILE 236 LYS 237 PHE 238 ALA 239 CYS 240 VAL 241 ASP 242 GLY 243 PRO 244 GLU 245 PHE 246 ARG 247 GLY 248 GLU 249 GLU 250 VAL 251 ASP 252 TRP 253 ASP 254 GLU 255 LEU 256 LEU 257 LYS 258 ARG 259 LEU 260 ALA 261 GLN 262 TYR 263 ARG 264 GLU 265 GLN 266 GLU 267 LYS 268 ILE 269 SER 270 TYR 271 GLU 272 ARG 273 PHE 274 LEU 275 LYS 276
Unit 4	MET 1 LYS 2 ASN 3 ARG 4 LYS 5 THR 6 PRO 7 MET 8 LYS 9 GLU 10 GLN 11 SER 12 PRO 13 GLU 14 SER 15 ARG 16 ARG 17 ARG 18 ASN 19 PHE 20 GLU 21 GLU 22 VAL 23 ALA 24 LEU 25 GLY 26 TYR 27 THR 28 LEU 29 GLU 30 GLU 31 ALA 32 LEU 33 GLU 34 GLU 35 ALA 36 GLN 37 ARG 38 CYS 39 LEU 40 GLN 41 CYS 42 PRO 43 THR 44 HIS 45 PRO 46 CYS 47 VAL 48 SER 49 GLY 50 CYS 51 PRO 52 VAL 53 GLU 54 ILE 55 ASP 56 ILE 57 PRO 58 GLY 59 PHE 60 ILE 61 ARG 62 LYS 63 LEU 64 ARG 65 ASP 66 GLY 67 LYS 68 LEU 69 GLU 70 GLU 71 SER 72 TYR 73 ARG 74 ILE 75 LEU 76 LYS 77 SER 78 TYR 79 ASN 80 ASN 81 LEU 82 PRO 83 ALA 84 VAL 85 CYS 86 GLY 87 ARG 88 VAL 89 CYS 90 PRO 91 GLN 92 GLU 93 VAL 94 GLN 95 CYS 96 GLU 97 SER 98 ARG 99 CYS 100 VAL 101 VAL 102 GLY 103 LYS 104 MET 105 LYS 106 ASP 107 SER 108 GLU 109 PRO 110 VAL 111 ALA 112 ILE 113 GLY 114 ARG 115 LEU 116 GLU 117 ARG 118 PHE 119 VAL 120 ALA 121 ASP 122 TRP 123 ALA 124 ALA 125 GLU 126 ASN 127 LEU 128 GLU 129 GLU 130 ASP 131 VAL 132 LYS 133 PRO 134 LEU 135 ALA 136 GLY 137 SER 138 LYS 139 LYS 140 GLU 141 LYS 142 VAL 143 ALA 144 VAL 145 VAL 146 GLY 147 SER 148 GLY 149 PRO 150 ALA 151 GLY 152 LEU 153 THR 154 ALA 155 ALA 156 ALA 157 ASP 158 LEU 159 ALA 160 LYS 161 MET 162 GLY 163 TYR 164 HIS 165 VAL 166 ASP 167 ILE 168 PHE 169 GLU 170 ALA 171 PHE 172 HIS 173 LYS 174 PRO 175 GLY 176 GLY 177 VAL 178 LEU 179 VAL 180 TYR 181 GLY 182 ILE 183 PRO 184 GLU 185 PHE 186 ARG 187 LEU 188 PRO 189 LYS 190 ARG 191 ILE 192 VAL 193 GLU 194 ARG 195 GLU 196 VAL 197 SER 198 TYR 199 ILE 200 ARG 201 LYS 202 LEU 203 GLY 204 VAL 205 ASN 206 PHE 207 HIS 208 LEU 209 ASN 210 THR 211 VAL 212 VAL 213 GLY 214 LYS 215 THR 216 VAL 217 LYS 218 VAL 219 LYS 220 GLU 221 LEU 222 LEU 223 SER 224 GLU 225 TYR 226 ASP 227 ALA 228 VAL 229 PHE 230 ILE 231 GLY 232 THR 233 GLY 234 ALA 235 GLY 236 THR 237 PRO 238 LYS 239 PHE 240 MET 241 GLY 242 ILE 243 PRO 244 GLY 245 THR 246 ASN 247 LEU 248 ASN 249 GLY 250 VAL 251 TYR 252 SER 253 ALA 254 ASN 255 GLU 256 PHE 257 LEU 258 THR 259 ARG 260 VAL 261 ASN 262 LEU 263 MET 264 LYS 265 ALA 266 TYR 267 LEU 268 PHE 269 PRO 270 GLU 271 TYR 272 ASP 273 THR 274 PRO 275 ILE 276 ARG 277 VAL 278 GLY 279 LYS 280 LYS 281 VAL 282 ALA 283 VAL 284 ILE 285 GLY 286 ALA 287 GLY 288 ASN 289 THR 290 ALA 291 MET 292 ASP 293 ALA 294 ALA 295 ARG 296 SER 297 ALA 298 LEU 299 ARG 300 LEU 301 GLY 302 ALA 303 GLU 304 LYS 305 VAL 306 TYR 307 ILE 308 VAL 309 TYR 310 ARG 311 ARG 312 THR 313 GLU 314 ARG 315 GLU 316 MET 317 PRO 318 ALA 319 ARG 320 ARG 321 GLU 322 GLU 323 TYR 324 HIS 325 HIS 326 ALA 327 LEU 328 GLU 329 GLU 330 GLY 331 ILE 332 GLU 333 PHE 334 LEU 335 TRP 336 LEU 337 THR 338 LEU 339 PRO 340 ILE 341 ARG 342 TYR 343 ILE 344 GLY 345 ASP 346 ALA 347 ASN 348 GLY 349 ASN 350 VAL 351 GLU 352 ALA 353 MET 354 GLU 355 CYS 356 VAL 357 ARG 358 MET 359 GLU 360 LEU 361 LYS 362 GLU 363 ALA 364 ASP 365 GLY 366 SER 367 GLY 368 ARG 369 PRO 370 ARG 371 PRO 372 VAL 373 PRO 374 ILE 375 GLU 376 GLY 377 SER 378 ASN 379 PHE 380 VAL 381 LEU 382 GLU 383 VAL 384 ASP 385 MET 386 VAL 387 ILE 388 GLU 389 ALA 390 ILE 391 GLY 392 GLN 393 GLY 394 PRO 395 ASN 396 ARG 397 VAL 398 LEU 399 LEU 400 SER 401 GLU 402 PHE 403 PRO 404 GLY 405 LEU 406 GLU 407 LEU 408 ASN 409 GLU 410 ARG 411 GLY 412 TYR 413 ILE 414 LYS 415 ALA 416 ASP 417 GLU 418 ASP 419 THR 420 GLY 421 ALA 422 THR 423 SER 424 VAL 425 LYS 426 GLY 427 VAL 428 PHE 429 ALA 430 GLY 431 GLY 432 ASP 433 ILE 434 VAL 435 THR 436 GLY 437 ALA 438 ALA 439 THR 440 VAL 441 ILE 442 LYS 443 ALA 444 MET 445 GLY 446 ALA 447 GLY 448 LYS 449 LYS 450 ALA 451 ALA 452 GLN 453 PHE 454 ILE 455 HIS 456 SER 457 TYR 458 LEU 459 THR 460 GLY 461 GLU 462 TRP 463 ASN 464 PRO 465 TRP 466 GLN 467 LYS 468

Ligands

Unit 5	FES 501 FAD 502
Unit 6	SF4 501 SF4 502 FAD 503 PO4 504
Unit 7	FAD 301 FES 302
Unit 8	SF4 501 SF4 502 FAD 503 PO4 504