4WKS - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: N-ALKYLBORONIC ACID INHIBITORS REVEAL DETERMINANTS OF LIGAND SPECIFICITY IN THE QUORUM-QUENCHING AND SIDEROPHORE BIOSYNT ENZYME PVDQ
• Keywords: PVDQ, N-ALKYLBORONIC ACID,HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR COMP
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	4WKS	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	ACYL-HOMOSERINE LACTONE ACYLASE PVDQ	C	548	4263	0
2	Protein	ACYL-HOMOSERINE LACTONE ACYLASE PVDQ	A	163	1253	0
3	Ligand	ACYL-HOMOSERINE LACTONE ACYLASE PVDQ	C	1	0	4
4	Water			781	0	781
total				1493	5516	785

Proteins

Unit 1

SER 217 ASN 218 ALA 219 ILE 220 ALA 221 VAL 222 GLY 223 SER 224 GLU 225 ARG 226 SER 227 ALA 228 ASP 229 GLY 230 LYS 231 GLY 232 MET 233 LEU 234 LEU 235 ALA 236 ASN 237 PRO 238 HIS 239 PHE 240 PRO 241 TRP 242 ASN 243 GLY 244 ALA 245 MET 246 ARG 247 PHE 248 TYR 249 GLN 250 MET 251 HIS 252 LEU 253 THR 254 ILE 255 PRO 256 GLY 257 ARG 258 LEU 259 ASP 260 VAL 261 MET 262 GLY 263 ALA 264 SER 265 LEU 266 PRO 267 GLY 268 LEU 269 PRO 270 VAL 271 VAL 272 ASN 273 ILE 274 GLY 275 PHE 276 SER 277 ARG 278 HIS 279 LEU 280 ALA 281 TRP 282 THR 283 HIS 284 THR 285 VAL 286 ASP 287 THR 288 SER 289 SER 290 HIS 291 PHE 292 THR 293 LEU 294 TYR 295 ARG 296 LEU 297 ALA 298 LEU 299 ASP 300 PRO 301 LYS 302 ASP 303 PRO 304 ARG 305 ARG 306 TYR 307 LEU 308 VAL 309 ASP 310 GLY 311 ARG 312 SER 313 LEU 314 PRO 315 LEU 316 GLU 317 GLU 318 LYS 319 SER 320 VAL 321 ALA 322 ILE 323 GLU 324 VAL 325 ARG 326 GLY 327 ALA 328 ASP 329 GLY 330 LYS 331 LEU 332 SER 333 ARG 334 VAL 335 GLU 336 HIS 337 LYS 338 VAL 339 TYR 340 GLN 341 SER 342 ILE 343 TYR 344 GLY 345 PRO 346 LEU 347 VAL 348 VAL 349 TRP 350 PRO 351 GLY 352 LYS 353 LEU 354 ASP 355 TRP 356 ASN 357 ARG 358 SER 359 GLU 360 ALA 361 TYR 362 ALA 363 LEU 364 ARG 365 ASP 366 ALA 367 ASN 368 LEU 369 GLU 370 ASN 371 THR 372 ARG 373 VAL 374 LEU 375 GLN 376 GLN 377 TRP 378 TYR 379 SER 380 ILE 381 ASN 382 GLN 383 ALA 384 SER 385 ASP 386 VAL 387 ALA 388 ASP 389 LEU 390 ARG 391 ARG 392 ARG 393 VAL 394 GLU 395 ALA 396 LEU 397 GLN 398 GLY 399 ILE 400 PRO 401 TRP 402 VAL 403 ASN 404 THR 405 LEU 406 ALA 407 ALA 408 ASP 409 GLU 410 GLN 411 GLY 412 ASN 413 ALA 414 LEU 415 TYR 416 MET 417 ASN 418 GLN 419 SER 420 VAL 421 VAL 422 PRO 423 TYR 424 LEU 425 LYS 426 PRO 427 GLU 428 LEU 429 ILE 430 PRO 431 ALA 432 CYS 433 ALA 434 ILE 435 PRO 436 GLN 437 LEU 438 VAL 439 ALA 440 GLU 441 GLY 442 LEU 443 PRO 444 ALA 445 LEU 446 GLN 447 GLY 448 GLN 449 ASP 450 SER 451 ARG 452 CYS 453 ALA 454 TRP 455 SER 456 ARG 457 ASP 458 PRO 459 ALA 460 ALA 461 ALA 462 GLN 463 ALA 464 GLY 465 ILE 466 THR 467 PRO 468 ALA 469 ALA 470 GLN 471 LEU 472 PRO 473 VAL 474 LEU 475 LEU 476 ARG 477 ARG 478 ASP 479 PHE 480 VAL 481 GLN 482 ASN 483 SER 484 ASN 485 ASP 486 SER 487 ALA 488 TRP 489 LEU 490 THR 491 ASN 492 PRO 493 ALA 494 SER 495 PRO 496 LEU 497 GLN 498 GLY 499 PHE 500 SER 501 PRO 502 LEU 503 VAL 504 SER 505 GLN 506 GLU 507 LYS 508 PRO 509 ILE 510 GLY 511 PRO 512 ARG 513 ALA 514 ARG 515 TYR 516 ALA 517 LEU 518 SER 519 ARG 520 LEU 521 GLN 522 GLY 523 LYS 524 GLN 525 PRO 526 LEU 527 GLU 528 ALA 529 LYS 530 THR 531 LEU 532 GLU 533 GLU 534 MET 535 VAL 536 THR 537 ALA 538 ASN 539 HIS 540 VAL 541 PHE 542 SER 543 ALA 544 ASP 545 GLN 546 VAL 547 LEU 548 PRO 549 ASP 550 LEU 551 LEU 552 ARG 553 LEU 554 CYS 555 ARG 556 ASP 557 ASN 558 GLN 559 GLY 560 GLU 561 LYS 562 SER 563 LEU 564 ALA 565 ARG 566 ALA 567 CYS 568 ALA 569 ALA 570 LEU 571 ALA 572 GLN 573 TRP 574 ASP 575 ARG 576 GLY 577 ALA 578 ASN 579 LEU 580 ASP 581 SER 582 GLY 583 SER 584 GLY 585 PHE 586 VAL 587 TYR 588 PHE 589 GLN 590 ARG 591 PHE 592 MET 593 GLN 594 ARG 595 PHE 596 ALA 597 GLU 598 LEU 599 ASP 600 GLY 601 ALA 602 TRP 603 LYS 604 GLU 605 PRO 606 PHE 607 ASP 608 ALA 609 GLN 610 ARG 611 PRO 612 LEU 613 ASP 614 THR 615 PRO 616 GLN 617 GLY 618 ILE 619 ALA 620 LEU 621 ASP 622 ARG 623 PRO 624 GLN 625 VAL 626 ALA 627 THR 628 GLN 629 VAL 630 ARG 631 GLN 632 ALA 633 LEU 634 ALA 635 ASP 636 ALA 637 ALA 638 ALA 639 GLU 640 VAL 641 GLU 642 LYS 643 SER 644 GLY 645 ILE 646 PRO 647 ASP 648 GLY 649 ALA 650 ARG 651 TRP 652 GLY 653 ASP 654 LEU 655 GLN 656 VAL 657 SER 658 THR 659 ARG 660 GLY 661 GLN 662 GLU 663 ARG 664 ILE 665 ALA 666 ILE 667 PRO 668 GLY 669 GLY 670 ASP 671 GLY 672 HIS 673 PHE 674 GLY 675 VAL 676 TYR 677 ASN 678 ALA 679 ILE 680 GLN 681 SER 682 VAL 683 ARG 684 LYS 685 GLY 686 ASP 687 HIS 688 LEU 689 GLU 690 VAL 691 VAL 692 GLY 693 GLY 694 THR 695 SER 696 TYR 697 ILE 698 GLN 699 LEU 700 VAL 701 THR 702 PHE 703 PRO 704 GLU 705 GLU 706 GLY 707 PRO 708 LYS 709 ALA 710 ARG 711 GLY 712 LEU 713 LEU 714 ALA 715 PHE 716 SER 717 GLN 718 SER 719 SER 720 ASP 721 PRO 722 ARG 723 SER 724 PRO 725 HIS 726 TYR 727 ARG 728 ASP 729 GLN 730 THR 731 GLU 732 LEU 733 PHE 734 SER 735 ARG 736 GLN 737 GLN 738 TRP 739 GLN 740 THR 741 LEU 742 PRO 743 PHE 744 SER 745 ASP 746 ARG 747 GLN 748 ILE 749 ASP 750 ALA 751 ASP 752 PRO 753 GLN 754 LEU 755 GLN 756 ARG 757 LEU 758 SER 759 ILE 760 ARG 761 GLU 762 ALA 763 ALA 764

Unit 2

GLY 30 LEU 31 ALA 32 ALA 33 ASP 34 ILE 35 ARG 36 TRP 37 THR 38 ALA 39 TYR 40 GLY 41 VAL 42 PRO 43 HIS 44 ILE 45 ARG 46 ALA 47 LYS 48 ASP 49 GLU 50 ARG 51 GLY 52 LEU 53 GLY 54 TYR 55 GLY 56 ILE 57 GLY 58 TYR 59 ALA 60 TYR 61 ALA 62 ARG 63 ASP 64 ASN 65 ALA 66 CYS 67 LEU 68 LEU 69 ALA 70 GLU 71 GLU 72 ILE 73 VAL 74 THR 75 ALA 76 ARG 77 GLY 78 GLU 79 ARG 80 ALA 81 ARG 82 TYR 83 PHE 84 GLY 85 SER 86 GLU 87 GLY 88 LYS 89 SER 90 SER 91 ALA 92 GLU 93 LEU 94 ASP 95 ASN 96 LEU 97 PRO 98 SER 99 ASP 100 ILE 101 PHE 102 TYR 103 ALA 104 TRP 105 LEU 106 ASN 107 GLN 108 PRO 109 GLU 110 ALA 111 LEU 112 GLN 113 ALA 114 PHE 115 TRP 116 GLN 117 ALA 118 GLN 119 THR 120 PRO 121 ALA 122 VAL 123 ARG 124 GLN 125 LEU 126 LEU 127 GLU 128 GLY 129 TYR 130 ALA 131 ALA 132 GLY 133 PHE 134 ASN 135 ARG 136 PHE 137 LEU 138 ARG 139 GLU 140 ALA 141 ASP 142 GLY 143 LYS 144 THR 145 THR 146 SER 147 CYS 148 LEU 149 GLY 150 GLN 151 PRO 152 TRP 153 LEU 154 ARG 155 ALA 156 ILE 157 ALA 158 THR 159 ASP 160 ASP 161 LEU 162 LEU 163 ARG 164 LEU 165 THR 166 ARG 167 ARG 168 LEU 169 LEU 170 VAL 171 GLU 172 GLY 173 GLY 174 VAL 175 GLY 176 GLN 177 PHE 178 ALA 179 ASP 180 ALA 181 LEU 182 VAL 183 ALA 184 ALA 185 ALA 186 PRO 187 PRO 188 GLY 189 ALA 190 GLU 191 LYS 192

Ligands

Unit 3

3QD 801