4W4Z - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: STRUCTURE OF THE EPHA4 LBD IN COMPLEX WITH PEPTIDE
• Keywords: PROTEIN-INHIBITOR COMPLEX, LIGAND BINDING DOMAIN, SIGNAL TRANSDUCTION, RECEPTOR-TYROSINE KINASE, CYCLIC PEPTIDE, EPH DISPLAY, TRANSFERASE-TRANSFERASE INHIBITOR COMPLEX
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	4W4Z	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	EPHRIN TYPE-A RECEPTOR 4	A	177	1423	0
2	Protein	EPHRIN TYPE-A RECEPTOR 4	B	177	1423	0
3	Protein	EPHRIN TYPE-A RECEPTOR 4	C	175	1405	0
4	Protein	EPHRIN TYPE-A RECEPTOR 4	D	174	1397	0
5	Protein	APY-BALA8.AM PEPTIDE	E	13	92	6
6	Protein	APY-BALA8.AM PEPTIDE	F	13	92	6
7	Protein	APY-BALA8.AM PEPTIDE	G	13	92	6
8	Protein	APY-BALA8.AM PEPTIDE	H	13	92	6
9	Ligand	EPHRIN TYPE-A RECEPTOR 4	A	5	0	34
10	Ligand	EPHRIN TYPE-A RECEPTOR 4	B	6	0	40
11	Ligand	EPHRIN TYPE-A RECEPTOR 4	C	4	0	24
12	Ligand	EPHRIN TYPE-A RECEPTOR 4	D	5	0	36
13	Ligand	APY-BALA8.AM PEPTIDE	H	1	0	6
14	Water			150	0	150
total				926	6016	314

Proteins

Unit 1	GLY 28 ASN 29 GLU 30 VAL 31 THR 32 LEU 33 LEU 34 ASP 35 SER 36 ARG 37 SER 38 VAL 39 GLN 40 GLY 41 GLU 42 LEU 43 GLY 44 TRP 45 ILE 46 ALA 47 SER 48 PRO 49 LEU 50 GLU 51 GLY 52 GLY 53 TRP 54 GLU 55 GLU 56 VAL 57 SER 58 ILE 59 MET 60 ASP 61 GLU 62 LYS 63 ASN 64 THR 65 PRO 66 ILE 67 ARG 68 THR 69 TYR 70 GLN 71 VAL 72 CYS 73 ASN 74 VAL 75 MET 76 GLU 77 PRO 78 SER 79 GLN 80 ASN 81 ASN 82 TRP 83 LEU 84 ARG 85 THR 86 ASP 87 TRP 88 ILE 89 THR 90 ARG 91 GLU 92 GLY 93 ALA 94 GLN 95 ARG 96 VAL 97 TYR 98 ILE 99 GLU 100 ILE 101 LYS 102 PHE 103 THR 104 LEU 105 ARG 106 ASP 107 CYS 108 ASN 109 SER 110 LEU 111 PRO 112 GLY 113 VAL 114 MET 115 GLY 116 THR 117 CYS 118 LYS 119 GLU 120 THR 121 PHE 122 ASN 123 LEU 124 TYR 125 TYR 126 TYR 127 GLU 128 SER 129 ASP 130 ASN 131 ASP 132 LYS 133 GLU 134 ARG 135 PHE 136 ILE 137 ARG 138 GLU 139 ASN 140 GLN 141 PHE 142 VAL 143 LYS 144 ILE 145 ASP 146 THR 147 ILE 148 ALA 149 ALA 150 ASP 151 GLU 152 SER 153 PHE 154 THR 155 GLN 156 VAL 157 ASP 158 ILE 159 GLY 160 ASP 161 ARG 162 ILE 163 MET 164 LYS 165 LEU 166 ASN 167 THR 168 GLU 169 ILE 170 ARG 171 ASP 172 VAL 173 GLY 174 PRO 175 LEU 176 SER 177 LYS 178 LYS 179 GLY 180 PHE 181 TYR 182 LEU 183 ALA 184 PHE 185 GLN 186 ASP 187 VAL 188 GLY 189 ALA 190 CYS 191 ILE 192 ALA 193 LEU 194 VAL 195 SER 196 VAL 197 ARG 198 VAL 199 PHE 200 TYR 201 LYS 202 LYS 203 ALA 204
Unit 2	GLY 28 ASN 29 GLU 30 VAL 31 THR 32 LEU 33 LEU 34 ASP 35 SER 36 ARG 37 SER 38 VAL 39 GLN 40 GLY 41 GLU 42 LEU 43 GLY 44 TRP 45 ILE 46 ALA 47 SER 48 PRO 49 LEU 50 GLU 51 GLY 52 GLY 53 TRP 54 GLU 55 GLU 56 VAL 57 SER 58 ILE 59 MET 60 ASP 61 GLU 62 LYS 63 ASN 64 THR 65 PRO 66 ILE 67 ARG 68 THR 69 TYR 70 GLN 71 VAL 72 CYS 73 ASN 74 VAL 75 MET 76 GLU 77 PRO 78 SER 79 GLN 80 ASN 81 ASN 82 TRP 83 LEU 84 ARG 85 THR 86 ASP 87 TRP 88 ILE 89 THR 90 ARG 91 GLU 92 GLY 93 ALA 94 GLN 95 ARG 96 VAL 97 TYR 98 ILE 99 GLU 100 ILE 101 LYS 102 PHE 103 THR 104 LEU 105 ARG 106 ASP 107 CYS 108 ASN 109 SER 110 LEU 111 PRO 112 GLY 113 VAL 114 MET 115 GLY 116 THR 117 CYS 118 LYS 119 GLU 120 THR 121 PHE 122 ASN 123 LEU 124 TYR 125 TYR 126 TYR 127 GLU 128 SER 129 ASP 130 ASN 131 ASP 132 LYS 133 GLU 134 ARG 135 PHE 136 ILE 137 ARG 138 GLU 139 ASN 140 GLN 141 PHE 142 VAL 143 LYS 144 ILE 145 ASP 146 THR 147 ILE 148 ALA 149 ALA 150 ASP 151 GLU 152 SER 153 PHE 154 THR 155 GLN 156 VAL 157 ASP 158 ILE 159 GLY 160 ASP 161 ARG 162 ILE 163 MET 164 LYS 165 LEU 166 ASN 167 THR 168 GLU 169 ILE 170 ARG 171 ASP 172 VAL 173 GLY 174 PRO 175 LEU 176 SER 177 LYS 178 LYS 179 GLY 180 PHE 181 TYR 182 LEU 183 ALA 184 PHE 185 GLN 186 ASP 187 VAL 188 GLY 189 ALA 190 CYS 191 ILE 192 ALA 193 LEU 194 VAL 195 SER 196 VAL 197 ARG 198 VAL 199 PHE 200 TYR 201 LYS 202 LYS 203 ALA 204
Unit 3	GLY 28 ASN 29 GLU 30 VAL 31 THR 32 LEU 33 LEU 34 ASP 35 SER 36 ARG 37 SER 38 VAL 39 GLN 40 GLY 41 GLU 42 LEU 43 GLY 44 TRP 45 ILE 46 ALA 47 SER 48 PRO 49 LEU 50 GLU 51 GLY 52 GLY 53 TRP 54 GLU 55 GLU 56 VAL 57 SER 58 ILE 59 MET 60 ASP 61 ASN 64 THR 65 PRO 66 ILE 67 ARG 68 THR 69 TYR 70 GLN 71 VAL 72 CYS 73 ASN 74 VAL 75 MET 76 GLU 77 PRO 78 SER 79 GLN 80 ASN 81 ASN 82 TRP 83 LEU 84 ARG 85 THR 86 ASP 87 TRP 88 ILE 89 THR 90 ARG 91 GLU 92 GLY 93 ALA 94 GLN 95 ARG 96 VAL 97 TYR 98 ILE 99 GLU 100 ILE 101 LYS 102 PHE 103 THR 104 LEU 105 ARG 106 ASP 107 CYS 108 ASN 109 SER 110 LEU 111 PRO 112 GLY 113 VAL 114 MET 115 GLY 116 THR 117 CYS 118 LYS 119 GLU 120 THR 121 PHE 122 ASN 123 LEU 124 TYR 125 TYR 126 TYR 127 GLU 128 SER 129 ASP 130 ASN 131 ASP 132 LYS 133 GLU 134 ARG 135 PHE 136 ILE 137 ARG 138 GLU 139 ASN 140 GLN 141 PHE 142 VAL 143 LYS 144 ILE 145 ASP 146 THR 147 ILE 148 ALA 149 ALA 150 ASP 151 GLU 152 SER 153 PHE 154 THR 155 GLN 156 VAL 157 ASP 158 ILE 159 GLY 160 ASP 161 ARG 162 ILE 163 MET 164 LYS 165 LEU 166 ASN 167 THR 168 GLU 169 ILE 170 ARG 171 ASP 172 VAL 173 GLY 174 PRO 175 LEU 176 SER 177 LYS 178 LYS 179 GLY 180 PHE 181 TYR 182 LEU 183 ALA 184 PHE 185 GLN 186 ASP 187 VAL 188 GLY 189 ALA 190 CYS 191 ILE 192 ALA 193 LEU 194 VAL 195 SER 196 VAL 197 ARG 198 VAL 199 PHE 200 TYR 201 LYS 202 LYS 203 ALA 204
Unit 4	GLY 28 ASN 29 GLU 30 VAL 31 THR 32 LEU 33 LEU 34 ASP 35 SER 36 ARG 37 SER 38 VAL 39 GLN 40 GLY 41 GLU 42 LEU 43 GLY 44 TRP 45 ILE 46 ALA 47 SER 48 PRO 49 LEU 50 GLU 51 GLY 52 GLY 53 TRP 54 GLU 55 GLU 56 VAL 57 SER 58 ILE 59 MET 60 ASP 61 THR 65 PRO 66 ILE 67 ARG 68 THR 69 TYR 70 GLN 71 VAL 72 CYS 73 ASN 74 VAL 75 MET 76 GLU 77 PRO 78 SER 79 GLN 80 ASN 81 ASN 82 TRP 83 LEU 84 ARG 85 THR 86 ASP 87 TRP 88 ILE 89 THR 90 ARG 91 GLU 92 GLY 93 ALA 94 GLN 95 ARG 96 VAL 97 TYR 98 ILE 99 GLU 100 ILE 101 LYS 102 PHE 103 THR 104 LEU 105 ARG 106 ASP 107 CYS 108 ASN 109 SER 110 LEU 111 PRO 112 GLY 113 VAL 114 MET 115 GLY 116 THR 117 CYS 118 LYS 119 GLU 120 THR 121 PHE 122 ASN 123 LEU 124 TYR 125 TYR 126 TYR 127 GLU 128 SER 129 ASP 130 ASN 131 ASP 132 LYS 133 GLU 134 ARG 135 PHE 136 ILE 137 ARG 138 GLU 139 ASN 140 GLN 141 PHE 142 VAL 143 LYS 144 ILE 145 ASP 146 THR 147 ILE 148 ALA 149 ALA 150 ASP 151 GLU 152 SER 153 PHE 154 THR 155 GLN 156 VAL 157 ASP 158 ILE 159 GLY 160 ASP 161 ARG 162 ILE 163 MET 164 LYS 165 LEU 166 ASN 167 THR 168 GLU 169 ILE 170 ARG 171 ASP 172 VAL 173 GLY 174 PRO 175 LEU 176 SER 177 LYS 178 LYS 179 GLY 180 PHE 181 TYR 182 LEU 183 ALA 184 PHE 185 GLN 186 ASP 187 VAL 188 GLY 189 ALA 190 CYS 191 ILE 192 ALA 193 LEU 194 VAL 195 SER 196 VAL 197 ARG 198 VAL 199 PHE 200 TYR 201 LYS 202 LYS 203 ALA 204
Unit 5	ALA 1 PRO 2 TYR 3 CYS 4 VAL 5 TYR 6 ARG 7 BAL 8 SER 9 TRP 10 SER 11 CYS 12 NH2 13
Unit 6	ALA 1 PRO 2 TYR 3 CYS 4 VAL 5 TYR 6 ARG 7 BAL 8 SER 9 TRP 10 SER 11 CYS 12 NH2 13
Unit 7	ALA 1 PRO 2 TYR 3 CYS 4 VAL 5 TYR 6 ARG 7 BAL 8 SER 9 TRP 10 SER 11 CYS 12 NH2 13
Unit 8	ALA 1 PRO 2 TYR 3 CYS 4 VAL 5 TYR 6 ARG 7 BAL 8 SER 9 TRP 10 SER 11 CYS 12 NH2 13

Ligands

Unit 9	HEZ 301 HEZ 302 GOL 303 GOL 304 GOL 305
Unit 10	HEZ 301 HEZ 302 GOL 303 GOL 304 GOL 305 GOL 306
Unit 11	GOL 301 GOL 302 GOL 303 GOL 304
Unit 12	HEZ 301 HEZ 302 HEZ 303 GOL 304 GOL 305
Unit 13	GOL 101