4R0D - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF A EUKARYOTIC GROUP II INTRON LARIAT
• Keywords: LARIAT, RIBOZYME, 2'-5' PHOSPHODIESTER, RNA
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	4R0D	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	DNA/RNA		A	617	13177	0
2	RNA		B	14	295	0
3	Ligand	GROUP IIB INTRON LARIAT	A	137	0	391
4	Ligand	LIGATED EXONS	B	2	0	2
5	Water			115	0	115
total				885	13472	508

Nucleic acids

Unit 1

G 1 U 2 G 3 C 4 G 5 A 6 C 7 A 8 A 9 G 10 A 11 A 12 G 13 U 14 U 15 C 16 A 17 G 18 G 19 A 20 A 21 G 22 G 23 G 24 A 25 U 26 U 27 G 28 A 29 G 30 G 31 U 32 G 33 A 34 A 35 A 36 G 37 U 38 C 39 C 40 U 41 C 42 C 43 U 44 C 45 C 46 C 47 G 48 A 49 A 50 U 51 C 52 G 53 U 54 U 55 C 56 A 57 U 58 G 59 G 60 G 61 A 62 G 63 A 64 G 65 U 66 C 67 U 68 A 69 U 70 C 71 C 72 A 73 G 74 A 75 C 76 U 77 U 78 G 79 C 80 G 81 U 82 A 83 G 84 C 85 G 86 A 87 G 88 U 89 A 90 A 91 U 92 C 93 G 94 C 95 U 96 A 97 G 98 G 99 U 100 G 101 A 102 G 103 A 104 A 105 G 106 C 107 U 108 C 109 U 110 G 111 G 112 A 113 G 114 A 115 C 116 A 117 A 118 U 119 G 120 U 121 A 122 C 123 C 124 U 125 G 126 C 127 C 128 C 129 U 130 U 131 C 132 A 133 A 134 U 135 U 136 G 137 G 138 A 139 G 140 G 141 U 142 G 143 C 144 C 145 A 146 G 147 G 148 G 149 C 150 U 151 A 152 G 153 G 154 C 155 U 156 U 157 U 158 G 159 U 160 U 161 C 162 C 163 U 164 A 165 U 166 G 167 G 168 C 169 U 170 A 171 G 172 C 173 G 174 A 175 A 176 A 177 G 178 C 179 G 180 A 181 A 182 U 183 A 184 C 185 A 186 G 187 G 188 U 189 U 190 A 191 U 192 A 194 G 195 G 196 C 197 G 198 U 199 C 200 G 201 U 202 G 203 A 204 A 205 A 206 A 207 C 208 A 209 A 210 A 211 A 212 C 213 U 214 C 215 U 216 U 217 U 218 C 219 G 220 A 221 C 222 A 223 U 224 A 225 A 226 G 227 G 228 G 229 A 230 G 231 A 232 G 233 G 238 U 239 A 240 G 241 A 242 U 243 G 244 A 245 G 246 U 247 U 248 A 249 C 250 C 251 C 252 U 253 C 254 C 255 U 256 U 257 U 258 U 259 U 260 A 261 U 262 G 263 G 264 G 265 G 266 U 267 A 268 A 269 C 270 U 271 G 272 A 273 A 274 C 275 G 276 A 277 U 278 C 279 A 280 A 281 U 282 A 283 U 284 C 285 U 286 A 287 C 288 C 289 G 290 G 291 C 292 G 293 U 294 A 295 G 296 A 297 C 298 U 299 G 300 U 301 G 302 A 303 G 304 C 305 C 306 U 307 A 308 A 309 A 310 G 311 G 312 A 313 A 314 A 315 C 316 G 317 A 318 A 319 U 320 G 321 A 322 A 323 A 324 G 325 U 326 G 327 U 328 C 329 C 330 C 331 U 332 U 333 C 334 C 335 U 336 G 337 G 338 G 339 A 340 A 341 C 342 U 343 U 344 G 345 G 346 U 347 A 348 A 349 G 350 C 351 C 352 C 353 A 354 A 355 U 356 A 357 G 358 A 359 C 360 U 361 C 362 C 363 C 364 U 365 C 366 U 367 G 368 G 369 G 370 A 371 A 372 A 373 C 374 C 375 A 376 G 377 A 378 G 379 G 380 A 381 G 382 G 383 A 384 G 385 U 386 A 387 A 388 G 389 A 390 G 391 C 392 A 393 A 394 U 395 C 396 U 397 U 398 A 399 C 400 U 401 U 402 A 403 U 404 C 405 G 406 U 407 C 408 U 409 A 410 G 411 U 412 G 413 G 414 G 415 U 416 A 417 A 418 A 419 A 420 G 421 A 422 C 423 A 424 U 425 A 426 A 427 U 428 A 429 G 430 G 431 A 432 A 433 G 434 C 435 A 436 A 437 A 438 U 439 G 440 C 441 U 442 U 443 G 444 G 445 U 446 U 447 G 448 U 449 A 450 A 451 C 452 G 453 A 454 U 455 C 456 G 457 A 458 G 459 A 460 U 461 A 462 G 463 A 464 A 465 U 466 C 467 U 468 G 469 U 470 U 471 G 472 A 473 U 474 U 475 U 476 A 477 A 478 G 479 C 480 U 481 G 482 A 483 A 484 A 485 G 486 G 487 C 488 U 489 G 490 C 491 A 492 G 493 A 494 C 495 U 496 U 497 A 498 U 499 U 500 A 501 A 502 A 503 U 504 G 505 G 506 G 507 U 508 G 509 U 510 U 511 C 512 U 513 G 514 C 515 U 516 G 517 U 518 A 519 U 520 G 521 G 522 C 523 G 524 U 525 U 526 C 527 G 528 C 529 G 530 C 531 C 532 U 533 A 534 A 535 G 536 C 537 A 538 G 539 C 540 A 541 G 542 A 543 A 544 U 545 G 546 C 547 G 548 U 549 G 550 A 551 G 552 C 553 C 554 G 555 U 556 G 557 U 558 G 559 C 560 G 561 A 562 U 563 G 564 A 565 A 566 A 567 G 568 U 569 C 570 G 571 C 572 A 573 A 574 G 575 C 576 A 577 C 578 G 579 G 580 U 581 U 582 C 583 U 584 G 585 A 586 U 587 G 588 G 589 G 590 G 591 G 592 G 593 A 594 A 595 A 596 A 597 C 598 G 599 A 600 G 601 A 602 G 603 A 604 U 605 C 606 G 607 U 608 C 609 U 610 A 611 C 612 C 613 U 614 A 615 U 616 C 617 C 618 A 619 A 620 C 621 U 622

Unit 2

U 1 G 2 U 3 U 4 U 5 A 6 U 7 U 8 A 9 A 10 A 11 A 12 A 13 C 14

Ligands

Unit 3

SPM 701 SPM 702 IRI 703 IRI 704 IRI 705 IRI 706 IRI 707 IRI 708 IRI 709 IRI 710 IRI 711 IRI 712 IRI 713 IRI 714 IRI 715 IRI 716 IRI 717 IRI 718 IRI 719 IRI 720 IRI 721 IRI 722 IRI 723 IRI 724 IRI 725 IRI 726 IRI 727 IRI 728 IRI 729 IRI 730 IRI 731 IRI 732 IRI 733 IRI 734 IRI 735 IRI 736 IRI 737 IRI 738 IRI 739 IRI 740 MG 741 MG 742 MG 743 MG 744 MG 745 MG 746 MG 747 MG 748 MG 749 MG 750 MG 751 MG 752 MG 753 MG 754 MG 755 MG 756 MG 757 MG 758 MG 759 MG 760 MG 761 MG 762 MG 763 MG 764 MG 765 MG 766 MG 767 MG 768 MG 769 MG 770 MG 771 MG 772 MG 773 MG 774 MG 775 MG 776 MG 777 MG 778 MG 779 MG 780 MG 781 MG 782 MG 783 MG 784 MG 785 MG 786 MG 787 MG 788 MG 789 MG 790 MG 791 MG 792 MG 793 MG 794 MG 795 MG 796 MG 797 MG 798 MG 799 MG 800 MG 801 MG 802 MG 803 MG 804 MG 805 MG 806 MG 807 MG 808 MG 809 MG 810 MG 811 MG 812 MG 813 MG 814 MG 815 MG 816 MG 817 MG 818 MG 819 MG 820 MG 821 NA 822 NA 823 NA 824 NA 825 NA 826 NA 827 NA 828 NA 829 NA 830 NA 831 NA 832 NA 833 NA 834 NA 835 NA 836 NA 837

Unit 4

MG 101 MG 102