4O2D - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF ASPARTYL-TRNA SYNTHETASE FROM MYCOBACTE SMEGMATIS WITH BOUND ASPARTIC ACID
• Keywords: MYCOBATERIUM, STRUCTURAL GENOMICS, TRNA SYNTHETASE, ASPS, AS NIAID, NATIONAL INSTITUTE OF ALLERGY AND INFECTIOUS DISEASE SEATTLE STRUCTURAL GENOMICS CENTER FOR INFECTIOUS DISEASE, LIGASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	4O2D	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	ASPARTATE--TRNA LIGASE	A	580	4357	0
2	Protein	ASPARTATE--TRNA LIGASE	B	515	3806	0
3	Protein	ASPARTATE--TRNA LIGASE	A	3	0	25
4	Protein	ASPARTATE--TRNA LIGASE	B	3	0	25
5	Water			234	0	234
total				1335	8163	284

Proteins

Unit 1	VAL 2 LEU 3 ARG 4 THR 5 HIS 6 ALA 7 ALA 8 GLY 9 SER 10 LEU 11 ARG 12 PRO 13 ALA 14 ASP 15 ALA 16 GLY 17 GLN 18 THR 19 VAL 20 THR 21 LEU 22 ALA 23 GLY 24 TRP 25 VAL 26 ALA 27 ARG 28 ARG 29 ARG 30 ASP 31 HIS 32 GLY 33 GLY 34 VAL 35 ILE 36 PHE 37 ILE 38 ASP 39 LEU 40 ARG 41 ASP 42 ALA 43 SER 44 GLY 45 VAL 46 SER 47 GLN 48 VAL 49 VAL 50 PHE 51 ARG 52 GLU 53 GLY 54 ASP 55 VAL 56 LEU 57 ALA 58 ALA 59 ALA 60 HIS 61 ARG 62 LEU 63 ARG 64 ALA 65 GLU 66 PHE 67 CYS 68 VAL 69 ALA 70 VAL 71 THR 72 GLY 73 VAL 74 VAL 75 GLU 76 VAL 77 ARG 78 PRO 79 GLU 80 GLY 81 ASN 82 GLU 83 ASN 84 PRO 85 GLU 86 ILE 87 PRO 88 THR 89 GLY 90 GLN 91 ILE 92 GLU 93 VAL 94 ASN 95 ALA 96 THR 97 GLU 98 LEU 99 THR 100 VAL 101 LEU 102 GLY 103 GLU 104 SER 105 ALA 106 PRO 107 LEU 108 PRO 109 PHE 110 GLN 111 LEU 112 ASP 113 GLU 114 GLN 115 ALA 116 GLY 117 GLU 118 GLU 119 ALA 120 ARG 121 LEU 122 LYS 123 TYR 124 ARG 125 TYR 126 LEU 127 ASP 128 LEU 129 ARG 130 ARG 131 GLU 132 GLY 133 PRO 134 GLY 135 ASN 136 ALA 137 LEU 138 ARG 139 LEU 140 ARG 141 SER 142 LYS 143 VAL 144 ASN 145 ALA 146 ALA 147 ALA 148 ARG 149 SER 150 VAL 151 LEU 152 ALA 153 GLU 154 HIS 155 ASP 156 PHE 157 VAL 158 GLU 159 ILE 160 GLU 161 THR 162 PRO 163 THR 164 LEU 165 THR 166 ARG 167 SER 168 THR 169 PRO 170 GLU 171 GLY 172 ALA 173 ARG 174 ASP 175 PHE 176 LEU 177 VAL 178 PRO 179 ALA 180 ARG 181 LEU 182 GLN 183 PRO 184 GLY 185 SER 186 PHE 187 TYR 188 ALA 189 LEU 190 PRO 191 GLN 192 SER 193 PRO 194 GLN 195 LEU 196 PHE 197 LYS 198 GLN 199 LEU 200 LEU 201 MET 202 VAL 203 ALA 204 GLY 205 MET 206 GLU 207 ARG 208 TYR 209 TYR 210 GLN 211 ILE 212 ALA 213 ARG 214 CYS 215 TYR 216 ARG 217 ASP 218 GLU 219 ASP 220 PHE 221 ASP 224 ARG 225 GLN 226 PRO 227 GLU 228 PHE 229 THR 230 GLN 231 LEU 232 ASP 233 MET 234 GLU 235 MET 236 SER 237 PHE 238 VAL 239 GLU 240 ALA 241 ASP 242 ASP 243 VAL 244 ILE 245 ALA 246 ILE 247 SER 248 GLU 249 GLN 250 VAL 251 LEU 252 LYS 253 ALA 254 VAL 255 TRP 256 ALA 257 THR 258 ILE 259 GLY 260 TYR 261 ASP 262 LEU 263 PRO 264 LEU 265 PRO 266 LEU 267 PRO 268 ARG 269 ILE 270 SER 271 TYR 272 GLU 273 GLU 274 ALA 275 MET 276 ARG 277 ARG 278 PHE 279 GLY 280 SER 281 ASP 282 LYS 283 PRO 284 ASP 285 LEU 286 ARG 287 PHE 288 GLY 289 ILE 290 GLU 291 LEU 292 VAL 293 GLU 294 CYS 295 THR 296 GLU 297 TYR 298 PHE 299 LYS 300 ASP 301 THR 302 THR 303 PHE 304 ARG 305 VAL 306 PHE 307 GLN 308 ALA 309 PRO 310 TYR 311 VAL 312 GLY 313 ALA 314 VAL 315 VAL 316 MET 317 PRO 318 GLY 319 GLY 320 ALA 321 SER 322 GLN 323 PRO 324 ARG 325 ARG 326 THR 327 LEU 328 ASP 329 GLY 330 TRP 331 GLN 332 GLU 333 PHE 334 ALA 335 LYS 336 GLN 337 ARG 338 GLY 339 HIS 340 LYS 341 GLY 342 LEU 343 ALA 344 TYR 345 VAL 346 LEU 347 VAL 348 GLY 349 GLU 350 ASP 351 GLY 352 THR 353 LEU 354 GLY 355 GLY 356 PRO 357 VAL 358 ALA 359 LYS 360 ASN 361 LEU 362 SER 363 ASP 364 ALA 365 GLU 366 ARG 367 ASP 368 GLY 369 LEU 370 VAL 371 ALA 372 HIS 373 VAL 374 GLY 375 ALA 376 ASN 377 PRO 378 GLY 379 ASP 380 CYS 381 ILE 382 PHE 383 PHE 384 ALA 385 ALA 386 GLY 387 PRO 388 ALA 389 LYS 390 GLY 391 ALA 392 ARG 393 ALA 394 LEU 395 LEU 396 GLY 397 ALA 398 THR 399 ARG 400 ILE 401 GLU 402 ILE 403 ALA 404 LYS 405 ARG 406 LEU 407 ASP 408 LEU 409 ILE 410 ASP 411 PRO 412 ASN 413 ALA 414 TRP 415 ALA 416 PHE 417 THR 418 TRP 419 VAL 420 VAL 421 ASP 422 PHE 423 PRO 424 MET 425 PHE 426 GLU 427 ALA 428 ALA 429 ASP 430 GLU 431 ALA 432 THR 433 ALA 434 ALA 435 GLY 436 ASP 437 VAL 438 ALA 439 VAL 440 GLY 441 SER 442 GLY 443 ALA 444 TRP 445 THR 446 ALA 447 MET 448 HIS 449 HIS 450 ALA 451 PHE 452 THR 453 ALA 454 PRO 455 LYS 456 PRO 457 ASP 458 SER 459 VAL 460 ASP 461 THR 462 PHE 463 ASP 464 SER 465 ASP 466 PRO 467 GLY 468 ASN 469 ALA 470 LEU 471 SER 472 ASP 473 ALA 474 TYR 475 ASP 476 ILE 477 VAL 478 CYS 479 ASN 480 GLY 481 ASN 482 GLU 483 ILE 484 GLY 485 GLY 486 GLY 487 SER 488 ILE 489 ARG 490 ILE 491 HIS 492 ARG 493 ARG 494 ASP 495 ILE 496 GLN 497 GLU 498 ARG 499 VAL 500 PHE 501 ALA 502 MET 503 MET 504 GLY 505 ILE 506 ASP 507 HIS 508 ASP 509 GLU 510 ALA 511 GLN 512 GLU 513 LYS 514 PHE 515 GLY 516 PHE 517 LEU 518 LEU 519 ASP 520 ALA 521 PHE 522 SER 523 TYR 524 GLY 525 ALA 526 PRO 527 PRO 528 HIS 529 GLY 530 GLY 531 ILE 532 ALA 533 PHE 534 GLY 535 TRP 536 ASP 537 ARG 538 ILE 539 THR 540 ALA 541 LEU 542 LEU 543 ALA 544 GLY 545 VAL 546 ASP 547 SER 548 ILE 549 ARG 550 GLU 551 VAL 552 ILE 553 ALA 554 PHE 555 PRO 556 LYS 557 SER 558 GLY 559 GLY 560 GLY 561 VAL 562 ASP 563 PRO 564 LEU 565 THR 566 ASP 567 ALA 568 PRO 569 ALA 570 PRO 571 ILE 572 THR 573 PRO 574 GLN 575 GLN 576 ARG 577 LYS 578 GLU 579 SER 580 GLY 581 ILE 582 ASP 583
Unit 2	VAL 2 LEU 3 ARG 4 THR 5 HIS 6 ALA 7 ALA 8 GLY 9 SER 10 LEU 11 ARG 12 PRO 13 ALA 14 ASP 15 ALA 16 GLY 17 GLN 18 THR 19 VAL 20 THR 21 LEU 22 ALA 23 GLY 24 TRP 25 VAL 26 ALA 27 ARG 28 ARG 29 ARG 30 ASP 31 HIS 32 GLY 33 GLY 34 VAL 35 ILE 36 PHE 37 ILE 38 ASP 39 LEU 40 ARG 41 ASP 42 ALA 43 SER 44 GLY 45 VAL 46 SER 47 GLN 48 VAL 49 VAL 50 PHE 51 ARG 52 GLU 53 GLY 54 ASP 55 VAL 56 LEU 57 ALA 58 ALA 59 ALA 60 HIS 61 ARG 62 LEU 63 ARG 64 ALA 65 GLU 66 PHE 67 CYS 68 VAL 69 ALA 70 VAL 71 THR 72 GLY 73 VAL 74 VAL 75 GLU 76 VAL 77 ARG 78 PRO 79 GLU 80 GLY 81 ASN 82 GLU 83 ASN 84 PRO 85 GLU 86 ILE 87 PRO 88 THR 89 GLY 90 GLN 91 ILE 92 GLU 93 VAL 94 ASN 95 ALA 96 THR 97 GLU 98 LEU 99 THR 100 VAL 101 LEU 102 GLY 103 GLU 104 SER 105 ALA 106 PRO 107 LEU 108 PRO 109 PHE 110 GLN 111 LEU 112 ASP 113 GLU 114 GLN 115 ALA 116 GLY 117 GLU 118 GLU 119 ALA 120 ARG 121 LEU 122 LYS 123 TYR 124 ARG 125 TYR 126 LEU 127 ASP 128 LEU 129 ARG 130 ARG 131 GLU 132 GLY 133 PRO 134 GLY 135 ASN 136 ALA 137 LEU 138 ARG 139 LEU 140 ARG 141 SER 142 LYS 143 VAL 144 ASN 145 ALA 146 ALA 147 ALA 148 ARG 149 SER 150 VAL 151 LEU 152 ALA 153 GLU 154 HIS 155 ASP 156 PHE 157 VAL 158 GLU 159 ILE 160 GLU 161 THR 162 PRO 163 THR 164 LEU 165 THR 166 ARG 167 SER 168 THR 169 PRO 170 GLU 171 GLY 172 ALA 173 ARG 174 ASP 175 PHE 176 LEU 177 VAL 178 PRO 179 ALA 180 ARG 181 LEU 182 GLN 183 PRO 184 GLY 185 SER 186 PHE 187 TYR 188 ALA 189 LEU 190 PRO 191 GLN 192 SER 193 PRO 194 GLN 195 LEU 196 PHE 197 LYS 198 GLN 199 LEU 200 LEU 201 MET 202 VAL 203 ALA 204 GLY 205 MET 206 GLU 207 ARG 208 TYR 209 TYR 210 GLN 211 ILE 212 ALA 213 ARG 214 CYS 215 TYR 216 ARG 217 ASP 218 GLU 219 ASP 220 PHE 221 ASP 224 ARG 225 GLN 226 PRO 227 GLU 228 PHE 229 THR 230 GLN 231 LEU 232 ASP 233 MET 234 GLU 235 MET 236 SER 237 PHE 238 VAL 239 GLU 240 ALA 241 ASP 242 ASP 243 VAL 244 ILE 245 ALA 246 ILE 247 SER 248 GLU 249 GLN 250 VAL 251 LEU 252 LYS 253 ALA 254 VAL 255 TRP 256 ALA 257 THR 258 ILE 259 GLY 260 TYR 261 ASP 262 LEU 263 PRO 264 LEU 265 PRO 266 LEU 267 PRO 268 ARG 269 ILE 270 SER 271 TYR 272 GLU 273 GLU 274 ALA 275 MET 276 ARG 277 ARG 278 PHE 279 GLY 280 SER 281 ASP 282 LYS 283 PRO 284 ASP 285 LEU 286 ARG 287 PHE 288 GLY 289 ILE 290 GLU 291 LEU 292 VAL 293 GLU 294 CYS 295 THR 296 GLU 297 TYR 298 PHE 299 PRO 310 TYR 311 VAL 312 GLY 313 ALA 314 VAL 315 VAL 316 MET 317 PRO 318 TRP 331 GLN 332 GLU 333 PHE 334 ALA 335 LYS 336 GLN 337 ARG 338 GLY 339 PHE 383 PHE 384 ALA 385 ALA 386 GLY 387 PRO 388 ALA 389 LYS 390 GLY 391 ALA 392 ARG 393 ALA 394 LEU 395 LEU 396 GLY 397 ALA 398 THR 399 ARG 400 ILE 401 GLU 402 ILE 403 ALA 404 LYS 405 ARG 406 LEU 407 ASP 408 LEU 409 ILE 410 ASP 411 PRO 412 ASN 413 ALA 414 TRP 415 ALA 416 PHE 417 THR 418 TRP 419 VAL 420 VAL 421 ASP 422 PHE 423 PRO 424 MET 425 PHE 426 GLU 427 ALA 428 ALA 429 ASP 430 GLU 431 ALA 432 THR 433 ALA 434 ALA 435 GLY 436 ASP 437 VAL 438 ALA 439 VAL 440 GLY 441 SER 442 GLY 443 ALA 444 TRP 445 THR 446 ALA 447 MET 448 HIS 449 HIS 450 ALA 451 PHE 452 THR 453 ALA 454 PRO 455 LYS 456 PRO 457 ASP 458 SER 459 VAL 460 ASP 461 THR 462 PHE 463 ASP 464 SER 465 ASP 466 PRO 467 GLY 468 ASN 469 ALA 470 LEU 471 SER 472 ASP 473 ALA 474 TYR 475 ASP 476 ILE 477 VAL 478 CYS 479 ASN 480 GLY 481 ASN 482 GLU 483 ILE 484 GLY 485 GLY 486 GLY 487 SER 488 ILE 489 ARG 490 ILE 491 HIS 492 ARG 493 ARG 494 ASP 495 ILE 496 GLN 497 GLU 498 ARG 499 VAL 500 PHE 501 ALA 502 MET 503 MET 504 GLY 505 ILE 506 ASP 507 HIS 508 ASP 509 GLU 510 ALA 511 GLN 512 GLU 513 LYS 514 PHE 515 GLY 516 PHE 517 LEU 518 LEU 519 ASP 520 ALA 521 PHE 522 SER 523 TYR 524 GLY 525 ALA 526 PRO 527 PRO 528 HIS 529 GLY 530 GLY 531 ILE 532 ALA 533 PHE 534 GLY 535 TRP 536 ASP 537 ARG 538 ILE 539 THR 540 ALA 541 LEU 542 LEU 543 ALA 544 GLY 545 VAL 546 ASP 547 SER 548 ILE 549 ARG 550 GLU 551 VAL 552 ILE 553 ALA 554 PHE 555 PRO 556 LYS 557 SER 558 GLY 559 GLY 560 GLY 561 VAL 562 ASP 563 PRO 564 LEU 565 THR 566 ASP 567 ALA 568 PRO 569 ALA 570 PRO 571 ILE 572 THR 573 PRO 574 GLN 575 GLN 576 ARG 577 LYS 578 GLU 579 SER 580 GLY 581 ILE 582 ASP 583
Unit 3	ASP 801 TRS 802 TRS 803
Unit 4	ASP 801 TRS 802 TRS 803