4NAP - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF A TRAP PERIPLASMIC SOLUTE BINDING PROTE DESULFOVIBRIO ALASKENSIS G20 (DDE_0634), TARGET EFI-510102, BOUND D-TRYPTOPHAN
• Keywords: TRAP PERIPLASMIC SOLUTE BINDING FAMILY, ENZYME FUNCTION INIT EFI, STRUCTURAL GENOMICS, TRANSPORT PROTEIN
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	4NAP	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	EXTRACELLULAR SOLUTE-BINDING PROTEIN, FAMILY 7	A	308	4429	272
2	Protein	EXTRACELLULAR SOLUTE-BINDING PROTEIN, FAMILY 7	B	309	4439	272
3	Protein	EXTRACELLULAR SOLUTE-BINDING PROTEIN, FAMILY 7	C	309	4450	272
4	Protein	EXTRACELLULAR SOLUTE-BINDING PROTEIN, FAMILY 7	D	310	4470	272
5	Ligand	EXTRACELLULAR SOLUTE-BINDING PROTEIN, FAMILY 7	A	1	0	15
6	Ligand	EXTRACELLULAR SOLUTE-BINDING PROTEIN, FAMILY 7	B	1	0	15
7	Ligand	EXTRACELLULAR SOLUTE-BINDING PROTEIN, FAMILY 7	C	1	0	15
8	Ligand	EXTRACELLULAR SOLUTE-BINDING PROTEIN, FAMILY 7	D	1	0	15
9	Water			350	0	350
total				1590	17788	1498

Proteins

Unit 1	PRO 32 VAL 33 THR 34 LEU 35 ASN 36 TYR 37 ALA 38 ASN 39 PHE 40 PRO 41 PRO 42 ALA 43 SER 44 THR 45 PHE 46 PRO 47 CYS 48 ILE 49 GLN 50 MSE 51 GLU 52 GLN 53 TRP 54 ALA 55 HIS 56 GLU 57 VAL 58 ARG 59 THR 60 ARG 61 THR 62 ARG 63 GLY 64 LYS 65 VAL 66 ASP 67 VAL 68 LEU 69 THR 70 TYR 71 PRO 72 GLY 73 GLY 74 THR 75 LEU 76 LEU 77 GLY 78 ALA 79 ARG 80 ASN 81 MSE 82 LEU 83 ARG 84 GLY 85 VAL 86 MSE 87 SER 88 GLY 89 GLN 90 ALA 91 ASP 92 ILE 93 GLY 94 CYS 95 ILE 96 SER 97 LEU 98 ALA 99 TYR 100 HIS 101 PRO 102 GLY 103 VAL 104 PHE 105 PRO 106 VAL 107 MSE 108 SER 109 VAL 110 PHE 111 GLU 112 LEU 113 PRO 114 LEU 115 GLY 116 PHE 117 THR 118 SER 119 ALA 120 GLU 121 ALA 122 ALA 123 SER 124 SER 125 VAL 126 LEU 127 TRP 128 GLU 129 LEU 130 TYR 131 SER 132 GLY 133 LEU 134 ARG 135 PRO 136 ALA 137 GLU 138 LEU 139 GLU 140 ARG 141 VAL 142 LYS 143 VAL 144 LEU 145 THR 146 MSE 147 PHE 148 THR 149 SER 150 ALA 151 PRO 152 SER 153 HIS 154 PHE 155 MSE 156 THR 157 VAL 158 THR 159 PRO 160 VAL 161 ARG 162 SER 163 LEU 164 ARG 165 ASP 166 LEU 167 GLN 168 GLY 169 MSE 170 GLU 171 ILE 172 ARG 173 GLY 174 ALA 175 GLY 176 THR 177 LEU 178 SER 179 ALA 180 ILE 181 LEU 182 GLU 183 LYS 184 LEU 185 GLY 186 ALA 187 THR 188 PRO 189 VAL 190 SER 191 MSE 192 PRO 193 MSE 194 PRO 195 GLU 196 VAL 197 PRO 198 GLU 199 ALA 200 VAL 201 GLN 202 LYS 203 GLY 204 ILE 205 ILE 206 LYS 207 GLY 208 LEU 209 PHE 210 THR 211 SER 212 LEU 213 ASP 214 VAL 215 MSE 216 LYS 217 ASP 218 MSE 219 ASN 220 PHE 221 ALA 222 GLU 223 MSE 224 THR 225 GLY 226 HIS 227 VAL 228 THR 229 ARG 230 ALA 231 ASP 232 GLN 233 ALA 234 VAL 235 TYR 236 PRO 237 PHE 238 ALA 239 VAL 240 ILE 241 MSE 242 ASN 243 ARG 244 GLU 245 ALA 246 TRP 247 GLU 248 ARG 249 LEU 250 SER 251 PRO 252 ASP 253 VAL 254 GLN 255 GLN 256 VAL 257 LEU 258 ASP 259 GLY 260 LEU 261 ALA 262 ALA 263 GLU 264 HIS 265 ALA 266 ALA 267 TRP 268 THR 269 GLY 270 ARG 271 TYR 272 LEU 273 ASP 274 ALA 275 HIS 276 VAL 277 GLN 278 ASP 279 SER 280 MSE 281 ARG 282 TRP 283 ALA 284 GLU 285 GLU 286 LYS 287 HIS 288 GLY 289 VAL 290 GLN 291 VAL 292 HIS 293 THR 294 LEU 295 PRO 296 GLU 297 GLU 298 ASP 299 ILE 300 ALA 301 ALA 302 MSE 303 ARG 304 ARG 305 SER 306 VAL 307 GLN 308 PRO 309 LEU 310 PHE 311 ASP 312 ALA 313 TRP 314 ALA 315 GLN 316 ARG 317 ALA 318 ALA 319 ASP 320 LYS 321 GLY 322 ALA 323 ASP 324 PRO 325 ASP 326 ALA 327 VAL 328 MSE 329 ARG 330 THR 331 VAL 332 ASP 333 ALA 334 LEU 335 LYS 336 ALA 337 GLN 338 TYR 339
Unit 2	GLN 31 PRO 32 VAL 33 THR 34 LEU 35 ASN 36 TYR 37 ALA 38 ASN 39 PHE 40 PRO 41 PRO 42 ALA 43 SER 44 THR 45 PHE 46 PRO 47 CYS 48 ILE 49 GLN 50 MSE 51 GLU 52 GLN 53 TRP 54 ALA 55 HIS 56 GLU 57 VAL 58 ARG 59 THR 60 ARG 61 THR 62 ARG 63 GLY 64 LYS 65 VAL 66 ASP 67 VAL 68 LEU 69 THR 70 TYR 71 PRO 72 GLY 73 GLY 74 THR 75 LEU 76 LEU 77 GLY 78 ALA 79 ARG 80 ASN 81 MSE 82 LEU 83 ARG 84 GLY 85 VAL 86 MSE 87 SER 88 GLY 89 GLN 90 ALA 91 ASP 92 ILE 93 GLY 94 CYS 95 ILE 96 SER 97 LEU 98 ALA 99 TYR 100 HIS 101 PRO 102 GLY 103 VAL 104 PHE 105 PRO 106 VAL 107 MSE 108 SER 109 VAL 110 PHE 111 GLU 112 LEU 113 PRO 114 LEU 115 GLY 116 PHE 117 THR 118 SER 119 ALA 120 GLU 121 ALA 122 ALA 123 SER 124 SER 125 VAL 126 LEU 127 TRP 128 GLU 129 LEU 130 TYR 131 SER 132 GLY 133 LEU 134 ARG 135 PRO 136 ALA 137 GLU 138 LEU 139 GLU 140 ARG 141 VAL 142 LYS 143 VAL 144 LEU 145 THR 146 MSE 147 PHE 148 THR 149 SER 150 ALA 151 PRO 152 SER 153 HIS 154 PHE 155 MSE 156 THR 157 VAL 158 THR 159 PRO 160 VAL 161 ARG 162 SER 163 LEU 164 ARG 165 ASP 166 LEU 167 GLN 168 GLY 169 MSE 170 GLU 171 ILE 172 ARG 173 GLY 174 ALA 175 GLY 176 THR 177 LEU 178 SER 179 ALA 180 ILE 181 LEU 182 GLU 183 LYS 184 LEU 185 GLY 186 ALA 187 THR 188 PRO 189 VAL 190 SER 191 MSE 192 PRO 193 MSE 194 PRO 195 GLU 196 VAL 197 PRO 198 GLU 199 ALA 200 VAL 201 GLN 202 LYS 203 GLY 204 ILE 205 ILE 206 LYS 207 GLY 208 LEU 209 PHE 210 THR 211 SER 212 LEU 213 ASP 214 VAL 215 MSE 216 LYS 217 ASP 218 MSE 219 ASN 220 PHE 221 ALA 222 GLU 223 MSE 224 THR 225 GLY 226 HIS 227 VAL 228 THR 229 ARG 230 ALA 231 ASP 232 GLN 233 ALA 234 VAL 235 TYR 236 PRO 237 PHE 238 ALA 239 VAL 240 ILE 241 MSE 242 ASN 243 ARG 244 GLU 245 ALA 246 TRP 247 GLU 248 ARG 249 LEU 250 SER 251 PRO 252 ASP 253 VAL 254 GLN 255 GLN 256 VAL 257 LEU 258 ASP 259 GLY 260 LEU 261 ALA 262 ALA 263 GLU 264 HIS 265 ALA 266 ALA 267 TRP 268 THR 269 GLY 270 ARG 271 TYR 272 LEU 273 ASP 274 ALA 275 HIS 276 VAL 277 GLN 278 ASP 279 SER 280 MSE 281 ARG 282 TRP 283 ALA 284 GLU 285 GLU 286 LYS 287 HIS 288 GLY 289 VAL 290 GLN 291 VAL 292 HIS 293 THR 294 LEU 295 PRO 296 GLU 297 GLU 298 ASP 299 ILE 300 ALA 301 ALA 302 MSE 303 ARG 304 ARG 305 SER 306 VAL 307 GLN 308 PRO 309 LEU 310 PHE 311 ASP 312 ALA 313 TRP 314 ALA 315 GLN 316 ARG 317 ALA 318 ALA 319 ASP 320 LYS 321 GLY 322 ALA 323 ASP 324 PRO 325 ASP 326 ALA 327 VAL 328 MSE 329 ARG 330 THR 331 VAL 332 ASP 333 ALA 334 LEU 335 LYS 336 ALA 337 GLN 338 TYR 339
Unit 3	PRO 32 VAL 33 THR 34 LEU 35 ASN 36 TYR 37 ALA 38 ASN 39 PHE 40 PRO 41 PRO 42 ALA 43 SER 44 THR 45 PHE 46 PRO 47 CYS 48 ILE 49 GLN 50 MSE 51 GLU 52 GLN 53 TRP 54 ALA 55 HIS 56 GLU 57 VAL 58 ARG 59 THR 60 ARG 61 THR 62 ARG 63 GLY 64 LYS 65 VAL 66 ASP 67 VAL 68 LEU 69 THR 70 TYR 71 PRO 72 GLY 73 GLY 74 THR 75 LEU 76 LEU 77 GLY 78 ALA 79 ARG 80 ASN 81 MSE 82 LEU 83 ARG 84 GLY 85 VAL 86 MSE 87 SER 88 GLY 89 GLN 90 ALA 91 ASP 92 ILE 93 GLY 94 CYS 95 ILE 96 SER 97 LEU 98 ALA 99 TYR 100 HIS 101 PRO 102 GLY 103 VAL 104 PHE 105 PRO 106 VAL 107 MSE 108 SER 109 VAL 110 PHE 111 GLU 112 LEU 113 PRO 114 LEU 115 GLY 116 PHE 117 THR 118 SER 119 ALA 120 GLU 121 ALA 122 ALA 123 SER 124 SER 125 VAL 126 LEU 127 TRP 128 GLU 129 LEU 130 TYR 131 SER 132 GLY 133 LEU 134 ARG 135 PRO 136 ALA 137 GLU 138 LEU 139 GLU 140 ARG 141 VAL 142 LYS 143 VAL 144 LEU 145 THR 146 MSE 147 PHE 148 THR 149 SER 150 ALA 151 PRO 152 SER 153 HIS 154 PHE 155 MSE 156 THR 157 VAL 158 THR 159 PRO 160 VAL 161 ARG 162 SER 163 LEU 164 ARG 165 ASP 166 LEU 167 GLN 168 GLY 169 MSE 170 GLU 171 ILE 172 ARG 173 GLY 174 ALA 175 GLY 176 THR 177 LEU 178 SER 179 ALA 180 ILE 181 LEU 182 GLU 183 LYS 184 LEU 185 GLY 186 ALA 187 THR 188 PRO 189 VAL 190 SER 191 MSE 192 PRO 193 MSE 194 PRO 195 GLU 196 VAL 197 PRO 198 GLU 199 ALA 200 VAL 201 GLN 202 LYS 203 GLY 204 ILE 205 ILE 206 LYS 207 GLY 208 LEU 209 PHE 210 THR 211 SER 212 LEU 213 ASP 214 VAL 215 MSE 216 LYS 217 ASP 218 MSE 219 ASN 220 PHE 221 ALA 222 GLU 223 MSE 224 THR 225 GLY 226 HIS 227 VAL 228 THR 229 ARG 230 ALA 231 ASP 232 GLN 233 ALA 234 VAL 235 TYR 236 PRO 237 PHE 238 ALA 239 VAL 240 ILE 241 MSE 242 ASN 243 ARG 244 GLU 245 ALA 246 TRP 247 GLU 248 ARG 249 LEU 250 SER 251 PRO 252 ASP 253 VAL 254 GLN 255 GLN 256 VAL 257 LEU 258 ASP 259 GLY 260 LEU 261 ALA 262 ALA 263 GLU 264 HIS 265 ALA 266 ALA 267 TRP 268 THR 269 GLY 270 ARG 271 TYR 272 LEU 273 ASP 274 ALA 275 HIS 276 VAL 277 GLN 278 ASP 279 SER 280 MSE 281 ARG 282 TRP 283 ALA 284 GLU 285 GLU 286 LYS 287 HIS 288 GLY 289 VAL 290 GLN 291 VAL 292 HIS 293 THR 294 LEU 295 PRO 296 GLU 297 GLU 298 ASP 299 ILE 300 ALA 301 ALA 302 MSE 303 ARG 304 ARG 305 SER 306 VAL 307 GLN 308 PRO 309 LEU 310 PHE 311 ASP 312 ALA 313 TRP 314 ALA 315 GLN 316 ARG 317 ALA 318 ALA 319 ASP 320 LYS 321 GLY 322 ALA 323 ASP 324 PRO 325 ASP 326 ALA 327 VAL 328 MSE 329 ARG 330 THR 331 VAL 332 ASP 333 ALA 334 LEU 335 LYS 336 ALA 337 GLN 338 TYR 339 GLY 340
Unit 4	PRO 32 VAL 33 THR 34 LEU 35 ASN 36 TYR 37 ALA 38 ASN 39 PHE 40 PRO 41 PRO 42 ALA 43 SER 44 THR 45 PHE 46 PRO 47 CYS 48 ILE 49 GLN 50 MSE 51 GLU 52 GLN 53 TRP 54 ALA 55 HIS 56 GLU 57 VAL 58 ARG 59 THR 60 ARG 61 THR 62 ARG 63 GLY 64 LYS 65 VAL 66 ASP 67 VAL 68 LEU 69 THR 70 TYR 71 PRO 72 GLY 73 GLY 74 THR 75 LEU 76 LEU 77 GLY 78 ALA 79 ARG 80 ASN 81 MSE 82 LEU 83 ARG 84 GLY 85 VAL 86 MSE 87 SER 88 GLY 89 GLN 90 ALA 91 ASP 92 ILE 93 GLY 94 CYS 95 ILE 96 SER 97 LEU 98 ALA 99 TYR 100 HIS 101 PRO 102 GLY 103 VAL 104 PHE 105 PRO 106 VAL 107 MSE 108 SER 109 VAL 110 PHE 111 GLU 112 LEU 113 PRO 114 LEU 115 GLY 116 PHE 117 THR 118 SER 119 ALA 120 GLU 121 ALA 122 ALA 123 SER 124 SER 125 VAL 126 LEU 127 TRP 128 GLU 129 LEU 130 TYR 131 SER 132 GLY 133 LEU 134 ARG 135 PRO 136 ALA 137 GLU 138 LEU 139 GLU 140 ARG 141 VAL 142 LYS 143 VAL 144 LEU 145 THR 146 MSE 147 PHE 148 THR 149 SER 150 ALA 151 PRO 152 SER 153 HIS 154 PHE 155 MSE 156 THR 157 VAL 158 THR 159 PRO 160 VAL 161 ARG 162 SER 163 LEU 164 ARG 165 ASP 166 LEU 167 GLN 168 GLY 169 MSE 170 GLU 171 ILE 172 ARG 173 GLY 174 ALA 175 GLY 176 THR 177 LEU 178 SER 179 ALA 180 ILE 181 LEU 182 GLU 183 LYS 184 LEU 185 GLY 186 ALA 187 THR 188 PRO 189 VAL 190 SER 191 MSE 192 PRO 193 MSE 194 PRO 195 GLU 196 VAL 197 PRO 198 GLU 199 ALA 200 VAL 201 GLN 202 LYS 203 GLY 204 ILE 205 ILE 206 LYS 207 GLY 208 LEU 209 PHE 210 THR 211 SER 212 LEU 213 ASP 214 VAL 215 MSE 216 LYS 217 ASP 218 MSE 219 ASN 220 PHE 221 ALA 222 GLU 223 MSE 224 THR 225 GLY 226 HIS 227 VAL 228 THR 229 ARG 230 ALA 231 ASP 232 GLN 233 ALA 234 VAL 235 TYR 236 PRO 237 PHE 238 ALA 239 VAL 240 ILE 241 MSE 242 ASN 243 ARG 244 GLU 245 ALA 246 TRP 247 GLU 248 ARG 249 LEU 250 SER 251 PRO 252 ASP 253 VAL 254 GLN 255 GLN 256 VAL 257 LEU 258 ASP 259 GLY 260 LEU 261 ALA 262 ALA 263 GLU 264 HIS 265 ALA 266 ALA 267 TRP 268 THR 269 GLY 270 ARG 271 TYR 272 LEU 273 ASP 274 ALA 275 HIS 276 VAL 277 GLN 278 ASP 279 SER 280 MSE 281 ARG 282 TRP 283 ALA 284 GLU 285 GLU 286 LYS 287 HIS 288 GLY 289 VAL 290 GLN 291 VAL 292 HIS 293 THR 294 LEU 295 PRO 296 GLU 297 GLU 298 ASP 299 ILE 300 ALA 301 ALA 302 MSE 303 ARG 304 ARG 305 SER 306 VAL 307 GLN 308 PRO 309 LEU 310 PHE 311 ASP 312 ALA 313 TRP 314 ALA 315 GLN 316 ARG 317 ALA 318 ALA 319 ASP 320 LYS 321 GLY 322 ALA 323 ASP 324 PRO 325 ASP 326 ALA 327 VAL 328 MSE 329 ARG 330 THR 331 VAL 332 ASP 333 ALA 334 LEU 335 LYS 336 ALA 337 GLN 338 TYR 339 GLY 340 GLY 341

Ligands

Unit 5	DTR 401
Unit 6	DTR 401
Unit 7	DTR 401
Unit 8	DTR 401