4KLY - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF A BLUE-LIGHT ABSORBING PROTEORHODOPSIN D97N FROM HOT75
• Keywords: ION TRANSPORT, PROTON PUMP, RETINYLIDENE SCHIFF BASE, MEMBRA PROTON TRANSPORT
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	4KLY	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	BLUE-LIGHT ABSORBING PROTEORHODOPSIN	A	228	1665	80
2	Protein	BLUE-LIGHT ABSORBING PROTEORHODOPSIN	B	232	1700	80
3	Protein	BLUE-LIGHT ABSORBING PROTEORHODOPSIN	C	230	1680	80
4	Protein	BLUE-LIGHT ABSORBING PROTEORHODOPSIN	D	221	1622	80
5	Protein	BLUE-LIGHT ABSORBING PROTEORHODOPSIN	E	226	1657	80
6	Ligand	BLUE-LIGHT ABSORBING PROTEORHODOPSIN	A	1	0	20
7	Ligand	BLUE-LIGHT ABSORBING PROTEORHODOPSIN	B	1	0	20
8	Ligand	BLUE-LIGHT ABSORBING PROTEORHODOPSIN	C	1	0	20
9	Ligand	BLUE-LIGHT ABSORBING PROTEORHODOPSIN	D	1	0	20
10	Ligand	BLUE-LIGHT ABSORBING PROTEORHODOPSIN	E	1	0	20
11	Water			13	0	13
total				1155	8324	513

Proteins

Unit 1	GLY 21 ASP 22 LEU 23 ASP 24 ILE 25 SER 26 ASP 27 THR 28 VAL 29 GLY 30 VAL 31 SER 32 PHE 33 TRP 34 LEU 35 VAL 36 THR 37 ALA 38 GLY 39 MSE 40 LEU 41 ALA 42 ALA 43 THR 44 VAL 45 PHE 46 PHE 47 PHE 48 VAL 49 GLU 50 ARG 51 ASP 52 GLN 53 VAL 54 SER 55 ALA 56 LYS 57 TRP 58 LYS 59 THR 60 SER 61 LEU 62 THR 63 VAL 64 SER 65 GLY 66 LEU 67 ILE 68 THR 69 GLY 70 ILE 71 ALA 72 PHE 73 TRP 74 HIS 75 TYR 76 LEU 77 TYR 78 MSE 79 ARG 80 GLY 81 VAL 82 TRP 83 ILE 84 ASP 85 THR 86 GLY 87 ASP 88 THR 89 PRO 90 THR 91 VAL 92 PHE 93 ARG 94 TYR 95 ILE 96 ASN 97 TRP 98 LEU 99 LEU 100 THR 101 VAL 102 PRO 103 LEU 104 GLN 105 VAL 106 VAL 107 GLU 108 PHE 109 TYR 110 LEU 111 ILE 112 LEU 113 ALA 114 ALA 115 CYS 116 THR 117 SER 118 VAL 119 ALA 120 ALA 121 SER 122 LEU 123 PHE 124 LYS 125 LYS 126 LEU 127 LEU 128 ALA 129 GLY 130 SER 131 LEU 132 VAL 133 MSE 134 LEU 135 GLY 136 ALA 137 GLY 138 PHE 139 ALA 140 GLY 141 GLU 142 ALA 143 GLY 144 LEU 145 ALA 146 PRO 147 VAL 148 LEU 149 PRO 150 ALA 151 PHE 152 ILE 153 ILE 154 GLY 155 MSE 156 ALA 157 GLY 158 TRP 159 LEU 160 TYR 161 MSE 162 ILE 163 TYR 164 GLU 165 LEU 166 TYR 167 MSE 168 GLY 169 GLU 170 GLY 171 LYS 172 THR 177 ALA 178 SER 179 PRO 180 ALA 181 VAL 182 ASN 183 SER 184 ALA 185 TYR 186 ASN 187 ALA 188 MSE 189 MSE 190 MSE 191 ILE 192 ILE 193 VAL 194 VAL 195 GLY 196 TRP 197 ALA 198 ILE 199 TYR 200 PRO 201 ALA 202 GLY 203 TYR 204 ALA 205 ALA 206 GLY 207 TYR 208 LEU 209 MSE 210 GLY 211 GLY 212 GLY 214 VAL 215 TYR 216 ALA 217 SER 218 ASN 219 LEU 220 ASN 221 LEU 222 ILE 223 TYR 224 ASN 225 LEU 226 ALA 227 ASP 228 PHE 229 VAL 230 ASN 231 LYS 232 ILE 233 LEU 234 PHE 235 GLY 236 LEU 237 ILE 238 ILE 239 TRP 240 ASN 241 VAL 242 ALA 243 VAL 244 LYS 245 GLU 246 SER 247 SER 248 ASN 249 ALA 250 LEU 251 GLU 252 HIS 253
Unit 2	GLY 21 ASP 22 LEU 23 ASP 24 ILE 25 SER 26 ASP 27 THR 28 VAL 29 GLY 30 VAL 31 SER 32 PHE 33 TRP 34 LEU 35 VAL 36 THR 37 ALA 38 GLY 39 MSE 40 LEU 41 ALA 42 ALA 43 THR 44 VAL 45 PHE 46 PHE 47 PHE 48 VAL 49 GLU 50 ARG 51 ASP 52 GLN 53 VAL 54 SER 55 ALA 56 LYS 57 TRP 58 LYS 59 THR 60 SER 61 LEU 62 THR 63 VAL 64 SER 65 GLY 66 LEU 67 ILE 68 THR 69 GLY 70 ILE 71 ALA 72 PHE 73 TRP 74 HIS 75 TYR 76 LEU 77 TYR 78 MSE 79 ARG 80 GLY 81 VAL 82 TRP 83 ILE 84 ASP 85 THR 86 GLY 87 ASP 88 THR 89 PRO 90 THR 91 VAL 92 PHE 93 ARG 94 TYR 95 ILE 96 ASN 97 TRP 98 LEU 99 LEU 100 THR 101 VAL 102 PRO 103 LEU 104 GLN 105 VAL 106 VAL 107 GLU 108 PHE 109 TYR 110 LEU 111 ILE 112 LEU 113 ALA 114 ALA 115 CYS 116 THR 117 SER 118 VAL 119 ALA 120 ALA 121 SER 122 LEU 123 PHE 124 LYS 125 LYS 126 LEU 127 LEU 128 ALA 129 GLY 130 SER 131 LEU 132 VAL 133 MSE 134 LEU 135 GLY 136 ALA 137 GLY 138 PHE 139 ALA 140 GLY 141 GLU 142 ALA 143 GLY 144 LEU 145 ALA 146 PRO 147 VAL 148 LEU 149 PRO 150 ALA 151 PHE 152 ILE 153 ILE 154 GLY 155 MSE 156 ALA 157 GLY 158 TRP 159 LEU 160 TYR 161 MSE 162 ILE 163 TYR 164 GLU 165 LEU 166 TYR 167 MSE 168 GLY 169 GLU 170 GLY 171 LYS 172 ALA 173 ALA 174 VAL 175 SER 176 THR 177 ALA 178 SER 179 PRO 180 ALA 181 VAL 182 ASN 183 SER 184 ALA 185 TYR 186 ASN 187 ALA 188 MSE 189 MSE 190 MSE 191 ILE 192 ILE 193 VAL 194 VAL 195 GLY 196 TRP 197 ALA 198 ILE 199 TYR 200 PRO 201 ALA 202 GLY 203 TYR 204 ALA 205 ALA 206 GLY 207 TYR 208 LEU 209 MSE 210 GLY 211 VAL 215 TYR 216 ALA 217 SER 218 ASN 219 LEU 220 ASN 221 LEU 222 ILE 223 TYR 224 ASN 225 LEU 226 ALA 227 ASP 228 PHE 229 VAL 230 ASN 231 LYS 232 ILE 233 LEU 234 PHE 235 GLY 236 LEU 237 ILE 238 ILE 239 TRP 240 ASN 241 VAL 242 ALA 243 VAL 244 LYS 245 GLU 246 SER 247 SER 248 ASN 249 ALA 250 LEU 251 GLU 252 HIS 253 HIS 254 HIS 255
Unit 3	GLY 21 ASP 22 LEU 23 ASP 24 ILE 25 SER 26 ASP 27 THR 28 VAL 29 GLY 30 VAL 31 SER 32 PHE 33 TRP 34 LEU 35 VAL 36 THR 37 ALA 38 GLY 39 MSE 40 LEU 41 ALA 42 ALA 43 THR 44 VAL 45 PHE 46 PHE 47 PHE 48 VAL 49 GLU 50 ARG 51 ASP 52 GLN 53 VAL 54 SER 55 ALA 56 LYS 57 TRP 58 LYS 59 THR 60 SER 61 LEU 62 THR 63 VAL 64 SER 65 GLY 66 LEU 67 ILE 68 THR 69 GLY 70 ILE 71 ALA 72 PHE 73 TRP 74 HIS 75 TYR 76 LEU 77 TYR 78 MSE 79 ARG 80 GLY 81 VAL 82 TRP 83 ILE 84 ASP 85 THR 86 GLY 87 ASP 88 THR 89 PRO 90 THR 91 VAL 92 PHE 93 ARG 94 TYR 95 ILE 96 ASN 97 TRP 98 LEU 99 LEU 100 THR 101 VAL 102 PRO 103 LEU 104 GLN 105 VAL 106 VAL 107 GLU 108 PHE 109 TYR 110 LEU 111 ILE 112 LEU 113 ALA 114 ALA 115 CYS 116 THR 117 SER 118 VAL 119 ALA 120 ALA 121 SER 122 LEU 123 PHE 124 LYS 125 LYS 126 LEU 127 LEU 128 ALA 129 GLY 130 SER 131 LEU 132 VAL 133 MSE 134 LEU 135 GLY 136 ALA 137 GLY 138 PHE 139 ALA 140 GLY 141 GLU 142 ALA 143 GLY 144 LEU 145 ALA 146 PRO 147 VAL 148 LEU 149 PRO 150 ALA 151 PHE 152 ILE 153 ILE 154 GLY 155 MSE 156 ALA 157 GLY 158 TRP 159 LEU 160 TYR 161 MSE 162 ILE 163 TYR 164 GLU 165 LEU 166 TYR 167 MSE 168 GLY 169 GLU 170 GLY 171 LYS 172 ALA 173 ALA 174 VAL 175 SER 176 THR 177 ALA 178 SER 179 PRO 180 ALA 181 VAL 182 ASN 183 SER 184 ALA 185 TYR 186 ASN 187 ALA 188 MSE 189 MSE 190 MSE 191 ILE 192 ILE 193 VAL 194 VAL 195 GLY 196 TRP 197 ALA 198 ILE 199 TYR 200 PRO 201 ALA 202 GLY 203 TYR 204 ALA 205 ALA 206 GLY 207 TYR 208 LEU 209 MSE 210 GLY 211 VAL 215 TYR 216 ALA 217 SER 218 ASN 219 LEU 220 ASN 221 LEU 222 ILE 223 TYR 224 ASN 225 LEU 226 ALA 227 ASP 228 PHE 229 VAL 230 ASN 231 LYS 232 ILE 233 LEU 234 PHE 235 GLY 236 LEU 237 ILE 238 ILE 239 TRP 240 ASN 241 VAL 242 ALA 243 VAL 244 LYS 245 GLU 246 SER 247 SER 248 ASN 249 ALA 250 LEU 251 GLU 252 HIS 253
Unit 4	GLY 20 GLY 21 ASP 22 LEU 23 ASP 24 ILE 25 SER 26 ASP 27 THR 28 VAL 29 GLY 30 VAL 31 SER 32 PHE 33 TRP 34 LEU 35 VAL 36 THR 37 ALA 38 GLY 39 MSE 40 LEU 41 ALA 42 ALA 43 THR 44 VAL 45 PHE 46 PHE 47 PHE 48 VAL 49 GLU 50 ARG 51 ASP 52 GLN 53 VAL 54 SER 55 ALA 56 LYS 57 TRP 58 LYS 59 THR 60 SER 61 LEU 62 THR 63 VAL 64 SER 65 GLY 66 LEU 67 ILE 68 THR 69 GLY 70 ILE 71 ALA 72 PHE 73 TRP 74 HIS 75 TYR 76 LEU 77 TYR 78 MSE 79 ARG 80 GLY 81 VAL 82 TRP 83 ILE 84 ASP 85 THR 86 GLY 87 ASP 88 THR 89 PRO 90 THR 91 VAL 92 PHE 93 ARG 94 TYR 95 ILE 96 ASN 97 TRP 98 LEU 99 LEU 100 THR 101 VAL 102 PRO 103 LEU 104 GLN 105 VAL 106 VAL 107 GLU 108 PHE 109 TYR 110 LEU 111 ILE 112 LEU 113 ALA 114 SER 118 VAL 119 ALA 120 ALA 121 SER 122 LEU 123 PHE 124 LYS 125 LYS 126 LEU 127 LEU 128 ALA 129 GLY 130 SER 131 LEU 132 VAL 133 MSE 134 LEU 135 GLY 136 ALA 137 GLY 138 PHE 139 ALA 140 GLY 141 GLU 142 ALA 143 GLY 144 LEU 145 ALA 146 PRO 147 VAL 148 LEU 149 PRO 150 ALA 151 PHE 152 ILE 153 ILE 154 GLY 155 MSE 156 ALA 157 GLY 158 TRP 159 LEU 160 TYR 161 MSE 162 ILE 163 TYR 164 GLU 165 LEU 166 TYR 167 MSE 168 GLY 169 GLU 170 GLY 171 SER 179 PRO 180 ALA 181 VAL 182 ASN 183 SER 184 ALA 185 TYR 186 ASN 187 ALA 188 MSE 189 MSE 190 MSE 191 ILE 192 ILE 193 VAL 194 VAL 195 GLY 196 TRP 197 ALA 198 ILE 199 TYR 200 PRO 201 ALA 202 GLY 203 TYR 204 ALA 205 ALA 206 GLY 207 TYR 208 LEU 209 MSE 210 GLY 211 VAL 215 TYR 216 ALA 217 SER 218 ASN 219 LEU 220 ASN 221 LEU 222 ILE 223 TYR 224 ASN 225 LEU 226 ALA 227 ASP 228 PHE 229 VAL 230 ASN 231 LYS 232 ILE 233 LEU 234 PHE 235 GLY 236 LEU 237 ILE 238 ILE 239 TRP 240 ASN 241 VAL 242 ALA 243 VAL 244 LYS 245 GLU 246 SER 247 SER 248 ASN 249 ALA 250 LEU 251 GLU 252 HIS 253
Unit 5	GLY 21 ASP 22 LEU 23 ASP 24 ILE 25 SER 26 ASP 27 THR 28 VAL 29 GLY 30 VAL 31 SER 32 PHE 33 TRP 34 LEU 35 VAL 36 THR 37 ALA 38 GLY 39 MSE 40 LEU 41 ALA 42 ALA 43 THR 44 VAL 45 PHE 46 PHE 47 PHE 48 VAL 49 GLU 50 ARG 51 ASP 52 GLN 53 VAL 54 SER 55 ALA 56 LYS 57 TRP 58 LYS 59 THR 60 SER 61 LEU 62 THR 63 VAL 64 SER 65 GLY 66 LEU 67 ILE 68 THR 69 GLY 70 ILE 71 ALA 72 PHE 73 TRP 74 HIS 75 TYR 76 LEU 77 TYR 78 MSE 79 ARG 80 GLY 81 VAL 82 TRP 83 ILE 84 ASP 85 THR 86 GLY 87 ASP 88 THR 89 PRO 90 THR 91 VAL 92 PHE 93 ARG 94 TYR 95 ILE 96 ASN 97 TRP 98 LEU 99 LEU 100 THR 101 VAL 102 PRO 103 LEU 104 GLN 105 VAL 106 VAL 107 GLU 108 PHE 109 TYR 110 LEU 111 ILE 112 LEU 113 ALA 114 ALA 115 CYS 116 THR 117 SER 118 VAL 119 ALA 120 ALA 121 SER 122 LEU 123 PHE 124 LYS 125 LYS 126 LEU 127 LEU 128 ALA 129 GLY 130 SER 131 LEU 132 VAL 133 MSE 134 LEU 135 GLY 136 ALA 137 GLY 138 PHE 139 ALA 140 GLY 141 GLU 142 ALA 143 GLY 144 LEU 145 ALA 146 PRO 147 VAL 148 LEU 149 PRO 150 ALA 151 PHE 152 ILE 153 ILE 154 GLY 155 MSE 156 ALA 157 GLY 158 TRP 159 LEU 160 TYR 161 MSE 162 ILE 163 TYR 164 GLU 165 LEU 166 TYR 167 MSE 168 GLY 169 GLU 170 GLY 171 LYS 172 THR 177 ALA 178 SER 179 PRO 180 ALA 181 VAL 182 ASN 183 SER 184 ALA 185 TYR 186 ASN 187 ALA 188 MSE 189 MSE 190 MSE 191 ILE 192 ILE 193 VAL 194 VAL 195 GLY 196 TRP 197 ALA 198 ILE 199 TYR 200 PRO 201 ALA 202 GLY 203 TYR 204 ALA 205 ALA 206 GLY 207 TYR 208 LEU 209 MSE 210 GLY 211 VAL 215 TYR 216 ALA 217 SER 218 ASN 219 LEU 220 ASN 221 LEU 222 ILE 223 TYR 224 ASN 225 LEU 226 ALA 227 ASP 228 PHE 229 VAL 230 ASN 231 LYS 232 ILE 233 LEU 234 PHE 235 GLY 236 LEU 237 ILE 238 ILE 239 TRP 240 ASN 241 VAL 242 ALA 243 VAL 244 LYS 245 GLU 246 SER 247 SER 248 ASN 249 ALA 250 LEU 251 GLU 252 HIS 253

Ligands

Unit 6	RET 301
Unit 7	RET 301
Unit 8	RET 301
Unit 9	RET 301
Unit 10	RET 301