4KBF - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: TWO DIFFERENT OPEN CONFORMATIONS OF THE HELICASE CORE OF THE HELICASE HERA
• Keywords: DEAD BOX RNA HELICASE, DIMER, ATP-BINDING, HELICASE, HYDROLA NUCLEOTIDE-BINDING
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	4KBF	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	HEAT RESISTANT RNA DEPENDENT ATPASE	A	365	2815	0
2	Protein	HEAT RESISTANT RNA DEPENDENT ATPASE	B	365	2815	0
3	Ligand	HEAT RESISTANT RNA DEPENDENT ATPASE	A	3	0	25
4	Ligand	HEAT RESISTANT RNA DEPENDENT ATPASE	B	1	0	5
5	Water			159	0	159
total				893	5630	189

Proteins

Unit 1

MET 1 GLU 2 PHE 3 LYS 4 ASP 5 PHE 6 PRO 7 LEU 8 LYS 9 PRO 10 GLU 11 ILE 12 LEU 13 GLU 14 ALA 15 LEU 16 HIS 17 GLY 18 ARG 19 GLY 20 LEU 21 THR 22 THR 23 PRO 24 THR 25 PRO 26 ILE 27 GLN 28 ALA 29 ALA 30 ALA 31 LEU 32 PRO 33 LEU 34 ALA 35 LEU 36 GLU 37 GLY 38 LYS 39 ASP 40 LEU 41 ILE 42 GLY 43 GLN 44 ALA 45 ARG 46 THR 47 GLY 48 THR 49 GLY 50 LYS 51 THR 52 LEU 53 ALA 54 PHE 55 ALA 56 LEU 57 PRO 58 ILE 59 ALA 60 GLU 61 ARG 62 LEU 63 ALA 64 PRO 65 SER 66 GLN 67 GLU 68 ARG 69 GLY 70 ARG 71 LYS 72 PRO 73 ARG 74 ALA 75 LEU 76 VAL 77 LEU 78 THR 79 PRO 80 THR 81 ARG 82 GLU 83 LEU 84 ALA 85 LEU 86 GLN 87 VAL 88 ALA 89 SER 90 GLU 91 LEU 92 THR 93 ALA 94 VAL 95 ALA 96 PRO 97 HIS 98 LEU 99 LYS 100 VAL 101 VAL 102 ALA 103 VAL 104 TYR 105 GLY 106 GLY 107 THR 108 GLY 109 TYR 110 GLY 111 LYS 112 GLN 113 LYS 114 GLU 115 ALA 116 LEU 117 LEU 118 ARG 119 GLY 120 ALA 121 ASP 122 ALA 123 VAL 124 VAL 125 ALA 126 THR 127 PRO 128 GLY 129 ARG 130 ALA 131 LEU 132 ASP 133 TYR 134 LEU 135 ARG 136 GLN 137 GLY 138 VAL 139 LEU 140 ASP 141 LEU 142 SER 143 ARG 144 VAL 145 GLU 146 VAL 147 ALA 148 VAL 149 LEU 150 ASP 151 GLU 152 ALA 153 ASP 154 GLU 155 MET 156 LEU 157 SER 158 MET 159 GLY 160 PHE 161 GLU 162 GLU 163 GLU 164 VAL 165 GLU 166 ALA 167 LEU 168 LEU 169 SER 170 ALA 171 THR 172 PRO 173 PRO 174 SER 175 ARG 176 GLN 177 THR 178 LEU 179 LEU 180 PHE 181 SER 182 ALA 183 THR 184 LEU 185 PRO 186 SER 187 TRP 188 ALA 189 LYS 190 ARG 191 LEU 192 ALA 193 GLU 194 ARG 195 TYR 196 MET 197 LYS 198 ASN 199 PRO 200 VAL 201 LEU 202 ILE 203 ASN 204 VAL 205 ILE 206 LYS 207 ASP 208 GLU 209 PRO 210 VAL 211 THR 212 TYR 213 GLU 214 GLU 215 GLU 216 ALA 217 VAL 218 PRO 219 ALA 220 PRO 221 VAL 222 ARG 223 GLY 224 ARG 225 LEU 226 GLU 227 VAL 228 LEU 229 SER 230 ASP 231 LEU 232 LEU 233 TYR 234 VAL 235 ALA 236 SER 237 PRO 238 ASP 239 ARG 240 ALA 241 MET 242 VAL 243 PHE 244 THR 245 ARG 246 THR 247 LYS 248 ALA 249 GLU 250 THR 251 GLU 252 GLU 253 ILE 254 ALA 255 GLN 256 GLY 257 LEU 258 LEU 259 ARG 260 LEU 261 GLY 262 HIS 263 PRO 264 ALA 265 GLN 266 ALA 267 LEU 268 HIS 269 GLY 270 ASP 271 LEU 272 SER 273 GLN 274 GLY 275 GLU 276 ARG 277 GLU 278 ARG 279 VAL 280 LEU 281 GLY 282 ALA 283 PHE 284 ARG 285 GLN 286 GLY 287 GLU 288 VAL 289 ARG 290 VAL 291 LEU 292 VAL 293 ALA 294 THR 295 ASP 296 VAL 297 ALA 298 ALA 299 ARG 300 GLY 301 LEU 302 ASP 303 ILE 304 PRO 305 GLN 306 VAL 307 ASP 308 LEU 309 VAL 310 VAL 311 HIS 312 TYR 313 ARG 314 LEU 315 PRO 316 ASP 317 ARG 318 ALA 319 GLU 320 ALA 321 TYR 322 GLN 323 HIS 324 ARG 325 SER 326 GLY 327 ARG 328 THR 329 GLY 330 ARG 331 ALA 332 GLY 333 ARG 334 GLY 335 GLY 336 ARG 337 VAL 338 VAL 339 LEU 340 LEU 341 TYR 342 GLY 343 PRO 344 ARG 345 GLU 346 ARG 347 ARG 348 ASP 349 VAL 350 GLU 351 ALA 352 LEU 353 GLU 354 ARG 355 ALA 356 VAL 357 GLY 358 ARG 359 ARG 360 PHE 361 LYS 362 ARG 363 VAL 364 ASN 365

Unit 2

MET 1 GLU 2 PHE 3 LYS 4 ASP 5 PHE 6 PRO 7 LEU 8 LYS 9 PRO 10 GLU 11 ILE 12 LEU 13 GLU 14 ALA 15 LEU 16 HIS 17 GLY 18 ARG 19 GLY 20 LEU 21 THR 22 THR 23 PRO 24 THR 25 PRO 26 ILE 27 GLN 28 ALA 29 ALA 30 ALA 31 LEU 32 PRO 33 LEU 34 ALA 35 LEU 36 GLU 37 GLY 38 LYS 39 ASP 40 LEU 41 ILE 42 GLY 43 GLN 44 ALA 45 ARG 46 THR 47 GLY 48 THR 49 GLY 50 LYS 51 THR 52 LEU 53 ALA 54 PHE 55 ALA 56 LEU 57 PRO 58 ILE 59 ALA 60 GLU 61 ARG 62 LEU 63 ALA 64 PRO 65 SER 66 GLN 67 GLU 68 ARG 69 GLY 70 ARG 71 LYS 72 PRO 73 ARG 74 ALA 75 LEU 76 VAL 77 LEU 78 THR 79 PRO 80 THR 81 ARG 82 GLU 83 LEU 84 ALA 85 LEU 86 GLN 87 VAL 88 ALA 89 SER 90 GLU 91 LEU 92 THR 93 ALA 94 VAL 95 ALA 96 PRO 97 HIS 98 LEU 99 LYS 100 VAL 101 VAL 102 ALA 103 VAL 104 TYR 105 GLY 106 GLY 107 THR 108 GLY 109 TYR 110 GLY 111 LYS 112 GLN 113 LYS 114 GLU 115 ALA 116 LEU 117 LEU 118 ARG 119 GLY 120 ALA 121 ASP 122 ALA 123 VAL 124 VAL 125 ALA 126 THR 127 PRO 128 GLY 129 ARG 130 ALA 131 LEU 132 ASP 133 TYR 134 LEU 135 ARG 136 GLN 137 GLY 138 VAL 139 LEU 140 ASP 141 LEU 142 SER 143 ARG 144 VAL 145 GLU 146 VAL 147 ALA 148 VAL 149 LEU 150 ASP 151 GLU 152 ALA 153 ASP 154 GLU 155 MET 156 LEU 157 SER 158 MET 159 GLY 160 PHE 161 GLU 162 GLU 163 GLU 164 VAL 165 GLU 166 ALA 167 LEU 168 LEU 169 SER 170 ALA 171 THR 172 PRO 173 PRO 174 SER 175 ARG 176 GLN 177 THR 178 LEU 179 LEU 180 PHE 181 SER 182 ALA 183 THR 184 LEU 185 PRO 186 SER 187 TRP 188 ALA 189 LYS 190 ARG 191 LEU 192 ALA 193 GLU 194 ARG 195 TYR 196 MET 197 LYS 198 ASN 199 PRO 200 VAL 201 LEU 202 ILE 203 ASN 204 VAL 205 ILE 206 LYS 207 ASP 208 GLU 209 PRO 210 VAL 211 THR 212 TYR 213 GLU 214 GLU 215 GLU 216 ALA 217 VAL 218 PRO 219 ALA 220 PRO 221 VAL 222 ARG 223 GLY 224 ARG 225 LEU 226 GLU 227 VAL 228 LEU 229 SER 230 ASP 231 LEU 232 LEU 233 TYR 234 VAL 235 ALA 236 SER 237 PRO 238 ASP 239 ARG 240 ALA 241 MET 242 VAL 243 PHE 244 THR 245 ARG 246 THR 247 LYS 248 ALA 249 GLU 250 THR 251 GLU 252 GLU 253 ILE 254 ALA 255 GLN 256 GLY 257 LEU 258 LEU 259 ARG 260 LEU 261 GLY 262 HIS 263 PRO 264 ALA 265 GLN 266 ALA 267 LEU 268 HIS 269 GLY 270 ASP 271 LEU 272 SER 273 GLN 274 GLY 275 GLU 276 ARG 277 GLU 278 ARG 279 VAL 280 LEU 281 GLY 282 ALA 283 PHE 284 ARG 285 GLN 286 GLY 287 GLU 288 VAL 289 ARG 290 VAL 291 LEU 292 VAL 293 ALA 294 THR 295 ASP 296 VAL 297 ALA 298 ALA 299 ARG 300 GLY 301 LEU 302 ASP 303 ILE 304 PRO 305 GLN 306 VAL 307 ASP 308 LEU 309 VAL 310 VAL 311 HIS 312 TYR 313 ARG 314 LEU 315 PRO 316 ASP 317 ARG 318 ALA 319 GLU 320 ALA 321 TYR 322 GLN 323 HIS 324 ARG 325 SER 326 GLY 327 ARG 328 THR 329 GLY 330 ARG 331 ALA 332 GLY 333 ARG 334 GLY 335 GLY 336 ARG 337 VAL 338 VAL 339 LEU 340 LEU 341 TYR 342 GLY 343 PRO 344 ARG 345 GLU 346 ARG 347 ARG 348 ASP 349 VAL 350 GLU 351 ALA 352 LEU 353 GLU 354 ARG 355 ALA 356 VAL 357 GLY 358 ARG 359 ARG 360 PHE 361 LYS 362 ARG 363 VAL 364 ASN 365

Ligands

Unit 3	AMP 401 NA 402 NA 403
Unit 4	SO4 401