4J1U - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF ANTIBODY 93F3 UNSTABLE VARIANT
• Keywords: ANTIBODY MATURATION, ANTIBODY STABILITY, CLONAL SELECTION, I SYSTEM
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	4J1U	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	ANTIBODY 93F3 LIGHT CHAIN	A	210	1610	0
2	Protein	ANTIBODY 93F3 HEAVY CHAIN	B	208	1530	0
3	Protein	ANTIBODY 93F3 LIGHT CHAIN	C	213	1630	0
4	Protein	ANTIBODY 93F3 HEAVY CHAIN	D	210	1547	0
5	Protein	ANTIBODY 93F3 LIGHT CHAIN	E	214	1644	0
6	Protein	ANTIBODY 93F3 HEAVY CHAIN	F	207	1531	0
7	Water			78	0	78
total				1340	9492	78

Proteins

Unit 1	ASP 1 ILE 2 VAL 3 MET 4 SER 5 GLN 6 SER 7 PRO 8 SER 9 SER 10 LEU 11 ALA 12 VAL 13 SER 14 ALA 15 GLY 16 GLU 17 LYS 18 VAL 19 THR 20 MET 21 SER 22 CYS 23 LYS 24 SER 25 SER 26 GLN 27 SER 28 LEU 29 LEU 30 ASN 31 LYS 36 ASN 37 TYR 38 LEU 39 ALA 40 TRP 41 TYR 42 GLN 43 GLN 44 LYS 45 PRO 46 GLY 47 GLN 48 SER 49 PRO 50 THR 51 LYS 52 LEU 53 ILE 54 TYR 55 TRP 56 ALA 57 SER 58 THR 59 ARG 60 GLU 61 SER 62 GLY 63 VAL 64 PRO 65 ASP 66 ARG 67 PHE 68 THR 69 GLY 70 SER 71 GLY 72 SER 73 GLY 74 THR 75 ASP 76 PHE 77 THR 78 LEU 79 THR 80 ILE 81 SER 82 SER 83 VAL 84 GLN 85 ALA 86 GLU 87 ASP 88 LEU 89 ALA 90 VAL 91 TYR 92 TYR 93 CYS 94 LYS 95 GLN 96 SER 97 TYR 98 ASP 99 LEU 100 PRO 101 THR 102 PHE 103 GLY 104 ALA 105 GLY 106 THR 107 LYS 108 LEU 109 GLU 110 LEU 111 LYS 112 ARG 113 SER 114 VAL 115 ALA 116 ALA 117 PRO 118 SER 119 VAL 120 PHE 121 ILE 122 PHE 123 PRO 124 PRO 125 SER 126 ASP 127 GLU 128 GLN 129 LEU 130 LYS 131 SER 132 GLY 133 THR 134 ALA 135 SER 136 VAL 137 VAL 138 CYS 139 LEU 140 LEU 141 ASN 142 ASN 143 PHE 144 TYR 145 PRO 146 ARG 147 GLU 148 ALA 149 LYS 150 VAL 151 GLN 152 TRP 153 LYS 154 VAL 155 ASP 156 ASN 157 ALA 158 LEU 159 GLN 160 SER 161 GLY 162 ASN 163 SER 164 GLN 165 GLU 166 SER 167 VAL 168 THR 169 GLU 170 GLN 171 ASP 172 SER 173 LYS 174 ASP 175 SER 176 THR 177 TYR 178 SER 179 LEU 180 SER 181 SER 182 THR 183 LEU 184 THR 185 LEU 186 SER 187 LYS 188 ALA 189 ASP 190 TYR 191 GLU 192 LYS 193 HIS 194 LYS 195 VAL 196 TYR 197 ALA 198 CYS 199 GLU 200 VAL 201 THR 202 HIS 203 GLN 204 GLY 205 LEU 206 SER 207 SER 208 PRO 209 VAL 210 THR 211 LYS 212 SER 213 PHE 214
Unit 2	GLN 1 VAL 2 GLN 3 LEU 4 LYS 5 GLU 6 SER 7 GLY 8 PRO 9 GLY 10 LEU 11 VAL 12 ALA 13 PRO 14 SER 15 GLN 16 SER 17 LEU 18 SER 19 ILE 20 THR 21 CYS 22 THR 23 VAL 24 SER 25 GLY 26 PHE 27 SER 28 LEU 29 THR 30 ASP 31 TYR 32 GLY 33 VAL 34 SER 35 TRP 36 ILE 37 ARG 38 GLN 39 PRO 40 PRO 41 GLY 42 LYS 43 GLY 44 LEU 45 GLU 46 TRP 47 LEU 48 GLY 49 VAL 50 ILE 51 TRP 52 GLY 53 GLY 54 GLY 55 SER 56 THR 57 TYR 58 TYR 59 ASN 60 SER 61 ALA 62 LEU 63 LYS 64 SER 65 ARG 66 LEU 67 SER 68 ILE 69 SER 70 LYS 71 ASP 72 ASN 73 SER 74 LYS 75 SER 76 GLN 77 VAL 78 PHE 79 LEU 80 LYS 81 MET 82 ASN 83 SER 84 LEU 85 GLN 86 THR 87 ASP 88 ASP 89 THR 90 ALA 91 MET 92 TYR 93 TYR 94 CYS 95 ALA 96 LYS 97 PRO 103 GLY 104 ASP 105 SER 106 TRP 107 GLY 108 GLN 109 GLY 110 THR 111 SER 112 VAL 113 THR 114 VAL 115 SER 116 SER 117 ALA 118 SER 119 THR 120 LYS 121 GLY 122 PRO 123 SER 124 VAL 125 PHE 126 PRO 127 LEU 128 ALA 129 PRO 130 SER 131 SER 132 GLY 137 GLY 138 THR 139 ALA 140 ALA 141 LEU 142 GLY 143 CYS 144 LEU 145 VAL 146 LYS 147 ASP 148 TYR 149 PHE 150 PRO 151 GLU 152 PRO 153 VAL 154 THR 155 VAL 156 SER 157 TRP 158 ASN 159 SER 160 GLY 161 ALA 162 LEU 163 THR 164 SER 165 GLY 166 VAL 167 HIS 168 THR 169 PHE 170 PRO 171 ALA 172 VAL 173 LEU 174 GLN 175 SER 176 SER 177 GLY 178 LEU 179 TYR 180 SER 181 LEU 182 SER 183 SER 184 VAL 185 VAL 186 THR 187 VAL 188 PRO 189 SER 190 SER 191 SER 192 LEU 193 GLY 194 THR 195 GLN 196 THR 197 TYR 198 ILE 199 CYS 200 ASN 201 VAL 202 ASN 203 HIS 204 LYS 205 PRO 206 SER 207 ASN 208 THR 209 LYS 210 VAL 211 ASP 212 LYS 213 LYS 214 VAL 215 GLU 216 PRO 217
Unit 3	ASP 1 ILE 2 VAL 3 MET 4 SER 5 GLN 6 SER 7 PRO 8 SER 9 SER 10 LEU 11 ALA 12 VAL 13 SER 14 ALA 15 GLY 16 GLU 17 LYS 18 VAL 19 THR 20 MET 21 SER 22 CYS 23 LYS 24 SER 25 SER 26 GLN 27 SER 28 LEU 29 LEU 30 ASN 31 SER 32 ARG 33 THR 34 ARG 35 LYS 36 ASN 37 TYR 38 LEU 39 ALA 40 TRP 41 TYR 42 GLN 43 GLN 44 LYS 45 PRO 46 GLY 47 GLN 48 SER 49 PRO 50 THR 51 LYS 52 LEU 53 ILE 54 TYR 55 TRP 56 ALA 57 SER 58 THR 59 ARG 60 GLU 61 SER 62 GLY 63 VAL 64 PRO 65 ASP 66 ARG 67 PHE 68 THR 69 GLY 70 SER 71 GLY 72 SER 73 GLY 74 THR 75 ASP 76 PHE 77 THR 78 LEU 79 THR 80 ILE 81 SER 82 SER 83 VAL 84 GLN 85 ALA 86 GLU 87 ASP 88 LEU 89 ALA 90 VAL 91 TYR 92 TYR 93 CYS 94 LYS 95 GLN 96 SER 97 TYR 98 ASP 99 LEU 100 PRO 101 THR 102 PHE 103 GLY 104 ALA 105 GLY 106 THR 107 LYS 108 LEU 109 GLU 110 LEU 111 LYS 112 ARG 113 SER 114 VAL 115 ALA 116 ALA 117 PRO 118 SER 119 VAL 120 PHE 121 ILE 122 PHE 123 PRO 124 PRO 125 SER 126 ASP 127 GLU 128 GLN 129 LEU 130 LYS 131 SER 132 GLY 133 THR 134 ALA 135 SER 136 VAL 137 VAL 138 CYS 139 LEU 140 LEU 141 ASN 142 ASN 143 PHE 144 TYR 145 PRO 146 ARG 147 GLU 148 ALA 149 LYS 150 VAL 151 GLN 152 TRP 153 LYS 154 VAL 155 ASP 156 ASN 157 ALA 158 LEU 159 GLN 160 SER 161 GLY 162 ASN 163 SER 164 GLN 165 GLU 166 SER 167 VAL 168 THR 169 GLU 170 GLN 171 ASP 172 SER 173 LYS 174 ASP 175 SER 176 THR 177 TYR 178 SER 179 LEU 180 SER 181 SER 182 THR 183 LEU 184 THR 185 LEU 186 SER 187 LYS 188 ALA 189 ASP 190 TYR 191 GLU 192 LYS 193 HIS 194 ALA 198 CYS 199 GLU 200 VAL 201 THR 202 HIS 203 GLN 204 GLY 205 LEU 206 SER 207 SER 208 PRO 209 VAL 210 THR 211 LYS 212 SER 213 PHE 214 ASN 215 ARG 216
Unit 4	VAL 2 GLN 3 LEU 4 LYS 5 GLU 6 SER 7 GLY 8 PRO 9 GLY 10 LEU 11 VAL 12 ALA 13 PRO 14 SER 15 GLN 16 SER 17 LEU 18 SER 19 ILE 20 THR 21 CYS 22 THR 23 VAL 24 SER 25 GLY 26 PHE 27 SER 28 LEU 29 THR 30 ASP 31 TYR 32 GLY 33 VAL 34 SER 35 TRP 36 ILE 37 ARG 38 GLN 39 PRO 40 PRO 41 GLY 42 LYS 43 GLY 44 LEU 45 GLU 46 TRP 47 LEU 48 GLY 49 VAL 50 ILE 51 TRP 52 GLY 53 GLY 54 GLY 55 SER 56 THR 57 TYR 58 TYR 59 ASN 60 SER 61 ALA 62 LEU 63 LYS 64 SER 65 ARG 66 LEU 67 SER 68 ILE 69 SER 70 LYS 71 ASP 72 ASN 73 SER 74 LYS 75 SER 76 GLN 77 VAL 78 PHE 79 LEU 80 LYS 81 MET 82 ASN 83 SER 84 LEU 85 GLN 86 THR 87 ASP 88 ASP 89 THR 90 ALA 91 MET 92 TYR 93 TYR 94 CYS 95 ALA 96 LYS 97 HIS 98 THR 99 TYR 100 GLY 101 GLY 102 PRO 103 GLY 104 ASP 105 SER 106 TRP 107 GLY 108 GLN 109 GLY 110 THR 111 SER 112 VAL 113 THR 114 VAL 115 SER 116 SER 117 ALA 118 SER 119 THR 120 LYS 121 GLY 122 PRO 123 SER 124 VAL 125 PHE 126 PRO 127 LEU 128 ALA 129 PRO 130 GLY 137 GLY 138 THR 139 ALA 140 ALA 141 LEU 142 GLY 143 CYS 144 LEU 145 VAL 146 LYS 147 ASP 148 TYR 149 PHE 150 PRO 151 GLU 152 PRO 153 VAL 154 THR 155 VAL 156 SER 157 TRP 158 ASN 159 SER 160 GLY 161 ALA 162 LEU 163 THR 164 SER 165 GLY 166 VAL 167 HIS 168 THR 169 PHE 170 PRO 171 ALA 172 VAL 173 LEU 174 GLN 175 SER 176 SER 177 GLY 178 LEU 179 TYR 180 SER 181 LEU 182 SER 183 SER 184 VAL 185 VAL 186 THR 187 VAL 188 PRO 189 SER 190 SER 191 SER 192 LEU 193 GLY 194 THR 195 GLN 196 THR 197 TYR 198 ILE 199 CYS 200 ASN 201 VAL 202 ASN 203 HIS 204 LYS 205 PRO 206 SER 207 ASN 208 THR 209 LYS 210 VAL 211 ASP 212 LYS 213 LYS 214 VAL 215 GLU 216 PRO 217
Unit 5	VAL 3 MET 4 SER 5 GLN 6 SER 7 PRO 8 SER 9 SER 10 LEU 11 ALA 12 VAL 13 SER 14 ALA 15 GLY 16 GLU 17 LYS 18 VAL 19 THR 20 MET 21 SER 22 CYS 23 LYS 24 SER 25 SER 26 GLN 27 SER 28 LEU 29 LEU 30 ASN 31 SER 32 ARG 33 THR 34 ARG 35 LYS 36 ASN 37 TYR 38 LEU 39 ALA 40 TRP 41 TYR 42 GLN 43 GLN 44 LYS 45 PRO 46 GLY 47 GLN 48 SER 49 PRO 50 THR 51 LYS 52 LEU 53 ILE 54 TYR 55 TRP 56 ALA 57 SER 58 THR 59 ARG 60 GLU 61 SER 62 GLY 63 VAL 64 PRO 65 ASP 66 ARG 67 PHE 68 THR 69 GLY 70 SER 71 GLY 72 SER 73 GLY 74 THR 75 ASP 76 PHE 77 THR 78 LEU 79 THR 80 ILE 81 SER 82 SER 83 VAL 84 GLN 85 ALA 86 GLU 87 ASP 88 LEU 89 ALA 90 VAL 91 TYR 92 TYR 93 CYS 94 LYS 95 GLN 96 SER 97 TYR 98 ASP 99 LEU 100 PRO 101 THR 102 PHE 103 GLY 104 ALA 105 GLY 106 THR 107 LYS 108 LEU 109 GLU 110 LEU 111 LYS 112 ARG 113 SER 114 VAL 115 ALA 116 ALA 117 PRO 118 SER 119 VAL 120 PHE 121 ILE 122 PHE 123 PRO 124 PRO 125 SER 126 ASP 127 GLU 128 GLN 129 LEU 130 LYS 131 SER 132 GLY 133 THR 134 ALA 135 SER 136 VAL 137 VAL 138 CYS 139 LEU 140 LEU 141 ASN 142 ASN 143 PHE 144 TYR 145 PRO 146 ARG 147 GLU 148 ALA 149 LYS 150 VAL 151 GLN 152 TRP 153 LYS 154 VAL 155 ASP 156 ASN 157 ALA 158 LEU 159 GLN 160 SER 161 GLY 162 ASN 163 SER 164 GLN 165 GLU 166 SER 167 VAL 168 THR 169 GLU 170 GLN 171 ASP 172 SER 173 LYS 174 ASP 175 SER 176 THR 177 TYR 178 SER 179 LEU 180 SER 181 SER 182 THR 183 LEU 184 THR 185 LEU 186 SER 187 LYS 188 ALA 189 ASP 190 TYR 191 GLU 192 LYS 193 HIS 194 LYS 195 VAL 196 TYR 197 ALA 198 CYS 199 GLU 200 VAL 201 THR 202 HIS 203 GLN 204 GLY 205 LEU 206 SER 207 SER 208 PRO 209 VAL 210 THR 211 LYS 212 SER 213 PHE 214 ASN 215 ARG 216
Unit 6	VAL 2 GLN 3 LEU 4 LYS 5 GLU 6 SER 7 GLY 8 PRO 9 GLY 10 LEU 11 VAL 12 ALA 13 PRO 14 SER 15 GLN 16 SER 17 LEU 18 SER 19 ILE 20 THR 21 CYS 22 THR 23 VAL 24 SER 25 GLY 26 PHE 27 SER 28 LEU 29 THR 30 ASP 31 TYR 32 GLY 33 VAL 34 SER 35 TRP 36 ILE 37 ARG 38 GLN 39 PRO 40 PRO 41 GLY 42 LYS 43 GLY 44 LEU 45 GLU 46 TRP 47 LEU 48 GLY 49 VAL 50 ILE 51 TRP 52 GLY 53 GLY 54 GLY 55 SER 56 THR 57 TYR 58 TYR 59 ASN 60 SER 61 ALA 62 LEU 63 LYS 64 SER 65 ARG 66 LEU 67 SER 68 ILE 69 SER 70 LYS 71 ASP 72 ASN 73 SER 74 LYS 75 SER 76 GLN 77 VAL 78 PHE 79 LEU 80 LYS 81 MET 82 ASN 83 SER 84 LEU 85 GLN 86 THR 87 ASP 88 ASP 89 THR 90 ALA 91 MET 92 TYR 93 TYR 94 CYS 95 ALA 96 LYS 97 HIS 98 THR 99 ASP 105 SER 106 TRP 107 GLY 108 GLN 109 GLY 110 THR 111 SER 112 VAL 113 THR 114 VAL 115 SER 116 SER 117 ALA 118 SER 119 THR 120 LYS 121 GLY 122 PRO 123 SER 124 VAL 125 PHE 126 PRO 127 LEU 128 ALA 129 PRO 130 SER 136 GLY 137 GLY 138 THR 139 ALA 140 ALA 141 LEU 142 GLY 143 CYS 144 LEU 145 VAL 146 LYS 147 ASP 148 TYR 149 PHE 150 PRO 151 GLU 152 PRO 153 VAL 154 THR 155 VAL 156 SER 157 TRP 158 ASN 159 SER 160 GLY 161 ALA 162 LEU 163 THR 164 SER 165 GLY 166 VAL 167 HIS 168 THR 169 PHE 170 PRO 171 ALA 172 VAL 173 LEU 174 GLN 175 SER 176 SER 177 GLY 178 LEU 179 TYR 180 SER 181 LEU 182 SER 183 SER 184 VAL 185 VAL 186 THR 187 VAL 188 PRO 189 SER 190 SER 191 SER 192 LEU 193 GLY 194 THR 195 GLN 196 THR 197 TYR 198 ILE 199 CYS 200 ASN 201 VAL 202 ASN 203 HIS 204 LYS 205 PRO 206 SER 207 ASN 208 THR 209 LYS 210 VAL 211 ASP 212 LYS 213 LYS 214 VAL 215 GLU 216 PRO 217 LYS 218