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Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

Title CRYSTAL STRUCTURE OF SPLSM4
Keywords SM FOLD, MRNA DECAY, PRE-MRNA SPLICING, LSM PROTEINS, RNA BI PROTEIN
Experiment X-ray diffraction
Number of Models  1


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        Header     Asymmetric unit     Biological unit  

PDB   4EMH     released     available     available     Quaternary Structure Server  


Asymmetric unit from PDB
 Unit     Type     Name   Chain ID   Residues   Atoms   Hetatoms 
1  Protein    A 60 481 16
2  Protein    B 60 481 16
3  Protein    C 60 481 16
4  Protein    D 60 481 16
5  Protein    E 60 481 16
6  Protein    F 60 481 16
7  Protein    G 60 481 16
8  Protein    H 60 481 16
9  Protein    I 60 481 16
10  Protein    J 60 481 16
11  Protein    K 60 481 16
12  Protein    L 60 481 16
13  Protein    M 60 481 16
14  Protein    N 60 481 16
15  Protein    O 60 481 16
16  Protein    P 60 481 16
17  Protein    Q 60 481 16
18  Protein    R 60 481 16
19  Protein    T 60 481 16
20  Protein    U 60 481 16
21  Protein    V 60 481 16
22  Protein    W 60 481 16
23  Protein    X 60 481 16
24  Protein    Y 60 481 16
25 Water     1063 0 1063
total       2503 11544 1447

Proteins
Unit 1 GLY12 ARG13 PRO14 ILE15 LEU16 VAL17 GLU18 LEU19 LYS20 ASN21 GLY22 GLU23 THR24 PHE25 ASN26 GLY27 HIS28 LEU29 GLU30 ASN31 CYS32 ASP33 ASN34 TYR35 MSE36 ASN37 LEU38 THR39 LEU40 ARG41 GLU42 VAL43 ILE44 ARG45 THR46 MSE47 PRO48 ASP49 GLY50 ASP51 LYS52 PHE53 PHE54 ARG55 LEU56 PRO57 GLU58 CYS59 TYR60 ILE61 ARG62 GLY63 ASN64 ASN65 ILE66 LYS67 TYR68 LEU69 ARG70 ILE71
Unit 2 GLY12 ARG13 PRO14 ILE15 LEU16 VAL17 GLU18 LEU19 LYS20 ASN21 GLY22 GLU23 THR24 PHE25 ASN26 GLY27 HIS28 LEU29 GLU30 ASN31 CYS32 ASP33 ASN34 TYR35 MSE36 ASN37 LEU38 THR39 LEU40 ARG41 GLU42 VAL43 ILE44 ARG45 THR46 MSE47 PRO48 ASP49 GLY50 ASP51 LYS52 PHE53 PHE54 ARG55 LEU56 PRO57 GLU58 CYS59 TYR60 ILE61 ARG62 GLY63 ASN64 ASN65 ILE66 LYS67 TYR68 LEU69 ARG70 ILE71
Unit 3 GLY12 ARG13 PRO14 ILE15 LEU16 VAL17 GLU18 LEU19 LYS20 ASN21 GLY22 GLU23 THR24 PHE25 ASN26 GLY27 HIS28 LEU29 GLU30 ASN31 CYS32 ASP33 ASN34 TYR35 MSE36 ASN37 LEU38 THR39 LEU40 ARG41 GLU42 VAL43 ILE44 ARG45 THR46 MSE47 PRO48 ASP49 GLY50 ASP51 LYS52 PHE53 PHE54 ARG55 LEU56 PRO57 GLU58 CYS59 TYR60 ILE61 ARG62 GLY63 ASN64 ASN65 ILE66 LYS67 TYR68 LEU69 ARG70 ILE71
Unit 4 GLY12 ARG13 PRO14 ILE15 LEU16 VAL17 GLU18 LEU19 LYS20 ASN21 GLY22 GLU23 THR24 PHE25 ASN26 GLY27 HIS28 LEU29 GLU30 ASN31 CYS32 ASP33 ASN34 TYR35 MSE36 ASN37 LEU38 THR39 LEU40 ARG41 GLU42 VAL43 ILE44 ARG45 THR46 MSE47 PRO48 ASP49 GLY50 ASP51 LYS52 PHE53 PHE54 ARG55 LEU56 PRO57 GLU58 CYS59 TYR60 ILE61 ARG62 GLY63 ASN64 ASN65 ILE66 LYS67 TYR68 LEU69 ARG70 ILE71
Unit 5 GLY12 ARG13 PRO14 ILE15 LEU16 VAL17 GLU18 LEU19 LYS20 ASN21 GLY22 GLU23 THR24 PHE25 ASN26 GLY27 HIS28 LEU29 GLU30 ASN31 CYS32 ASP33 ASN34 TYR35 MSE36 ASN37 LEU38 THR39 LEU40 ARG41 GLU42 VAL43 ILE44 ARG45 THR46 MSE47 PRO48 ASP49 GLY50 ASP51 LYS52 PHE53 PHE54 ARG55 LEU56 PRO57 GLU58 CYS59 TYR60 ILE61 ARG62 GLY63 ASN64 ASN65 ILE66 LYS67 TYR68 LEU69 ARG70 ILE71
Unit 6 GLY12 ARG13 PRO14 ILE15 LEU16 VAL17 GLU18 LEU19 LYS20 ASN21 GLY22 GLU23 THR24 PHE25 ASN26 GLY27 HIS28 LEU29 GLU30 ASN31 CYS32 ASP33 ASN34 TYR35 MSE36 ASN37 LEU38 THR39 LEU40 ARG41 GLU42 VAL43 ILE44 ARG45 THR46 MSE47 PRO48 ASP49 GLY50 ASP51 LYS52 PHE53 PHE54 ARG55 LEU56 PRO57 GLU58 CYS59 TYR60 ILE61 ARG62 GLY63 ASN64 ASN65 ILE66 LYS67 TYR68 LEU69 ARG70 ILE71
Unit 7 GLY12 ARG13 PRO14 ILE15 LEU16 VAL17 GLU18 LEU19 LYS20 ASN21 GLY22 GLU23 THR24 PHE25 ASN26 GLY27 HIS28 LEU29 GLU30 ASN31 CYS32 ASP33 ASN34 TYR35 MSE36 ASN37 LEU38 THR39 LEU40 ARG41 GLU42 VAL43 ILE44 ARG45 THR46 MSE47 PRO48 ASP49 GLY50 ASP51 LYS52 PHE53 PHE54 ARG55 LEU56 PRO57 GLU58 CYS59 TYR60 ILE61 ARG62 GLY63 ASN64 ASN65 ILE66 LYS67 TYR68 LEU69 ARG70 ILE71
Unit 8 GLY12 ARG13 PRO14 ILE15 LEU16 VAL17 GLU18 LEU19 LYS20 ASN21 GLY22 GLU23 THR24 PHE25 ASN26 GLY27 HIS28 LEU29 GLU30 ASN31 CYS32 ASP33 ASN34 TYR35 MSE36 ASN37 LEU38 THR39 LEU40 ARG41 GLU42 VAL43 ILE44 ARG45 THR46 MSE47 PRO48 ASP49 GLY50 ASP51 LYS52 PHE53 PHE54 ARG55 LEU56 PRO57 GLU58 CYS59 TYR60 ILE61 ARG62 GLY63 ASN64 ASN65 ILE66 LYS67 TYR68 LEU69 ARG70 ILE71
Unit 9 GLY12 ARG13 PRO14 ILE15 LEU16 VAL17 GLU18 LEU19 LYS20 ASN21 GLY22 GLU23 THR24 PHE25 ASN26 GLY27 HIS28 LEU29 GLU30 ASN31 CYS32 ASP33 ASN34 TYR35 MSE36 ASN37 LEU38 THR39 LEU40 ARG41 GLU42 VAL43 ILE44 ARG45 THR46 MSE47 PRO48 ASP49 GLY50 ASP51 LYS52 PHE53 PHE54 ARG55 LEU56 PRO57 GLU58 CYS59 TYR60 ILE61 ARG62 GLY63 ASN64 ASN65 ILE66 LYS67 TYR68 LEU69 ARG70 ILE71
Unit 10 GLY12 ARG13 PRO14 ILE15 LEU16 VAL17 GLU18 LEU19 LYS20 ASN21 GLY22 GLU23 THR24 PHE25 ASN26 GLY27 HIS28 LEU29 GLU30 ASN31 CYS32 ASP33 ASN34 TYR35 MSE36 ASN37 LEU38 THR39 LEU40 ARG41 GLU42 VAL43 ILE44 ARG45 THR46 MSE47 PRO48 ASP49 GLY50 ASP51 LYS52 PHE53 PHE54 ARG55 LEU56 PRO57 GLU58 CYS59 TYR60 ILE61 ARG62 GLY63 ASN64 ASN65 ILE66 LYS67 TYR68 LEU69 ARG70 ILE71
Unit 11 GLY12 ARG13 PRO14 ILE15 LEU16 VAL17 GLU18 LEU19 LYS20 ASN21 GLY22 GLU23 THR24 PHE25 ASN26 GLY27 HIS28 LEU29 GLU30 ASN31 CYS32 ASP33 ASN34 TYR35 MSE36 ASN37 LEU38 THR39 LEU40 ARG41 GLU42 VAL43 ILE44 ARG45 THR46 MSE47 PRO48 ASP49 GLY50 ASP51 LYS52 PHE53 PHE54 ARG55 LEU56 PRO57 GLU58 CYS59 TYR60 ILE61 ARG62 GLY63 ASN64 ASN65 ILE66 LYS67 TYR68 LEU69 ARG70 ILE71
Unit 12 GLY12 ARG13 PRO14 ILE15 LEU16 VAL17 GLU18 LEU19 LYS20 ASN21 GLY22 GLU23 THR24 PHE25 ASN26 GLY27 HIS28 LEU29 GLU30 ASN31 CYS32 ASP33 ASN34 TYR35 MSE36 ASN37 LEU38 THR39 LEU40 ARG41 GLU42 VAL43 ILE44 ARG45 THR46 MSE47 PRO48 ASP49 GLY50 ASP51 LYS52 PHE53 PHE54 ARG55 LEU56 PRO57 GLU58 CYS59 TYR60 ILE61 ARG62 GLY63 ASN64 ASN65 ILE66 LYS67 TYR68 LEU69 ARG70 ILE71
Unit 13 GLY12 ARG13 PRO14 ILE15 LEU16 VAL17 GLU18 LEU19 LYS20 ASN21 GLY22 GLU23 THR24 PHE25 ASN26 GLY27 HIS28 LEU29 GLU30 ASN31 CYS32 ASP33 ASN34 TYR35 MSE36 ASN37 LEU38 THR39 LEU40 ARG41 GLU42 VAL43 ILE44 ARG45 THR46 MSE47 PRO48 ASP49 GLY50 ASP51 LYS52 PHE53 PHE54 ARG55 LEU56 PRO57 GLU58 CYS59 TYR60 ILE61 ARG62 GLY63 ASN64 ASN65 ILE66 LYS67 TYR68 LEU69 ARG70 ILE71
Unit 14 GLY12 ARG13 PRO14 ILE15 LEU16 VAL17 GLU18 LEU19 LYS20 ASN21 GLY22 GLU23 THR24 PHE25 ASN26 GLY27 HIS28 LEU29 GLU30 ASN31 CYS32 ASP33 ASN34 TYR35 MSE36 ASN37 LEU38 THR39 LEU40 ARG41 GLU42 VAL43 ILE44 ARG45 THR46 MSE47 PRO48 ASP49 GLY50 ASP51 LYS52 PHE53 PHE54 ARG55 LEU56 PRO57 GLU58 CYS59 TYR60 ILE61 ARG62 GLY63 ASN64 ASN65 ILE66 LYS67 TYR68 LEU69 ARG70 ILE71
Unit 15 GLY12 ARG13 PRO14 ILE15 LEU16 VAL17 GLU18 LEU19 LYS20 ASN21 GLY22 GLU23 THR24 PHE25 ASN26 GLY27 HIS28 LEU29 GLU30 ASN31 CYS32 ASP33 ASN34 TYR35 MSE36 ASN37 LEU38 THR39 LEU40 ARG41 GLU42 VAL43 ILE44 ARG45 THR46 MSE47 PRO48 ASP49 GLY50 ASP51 LYS52 PHE53 PHE54 ARG55 LEU56 PRO57 GLU58 CYS59 TYR60 ILE61 ARG62 GLY63 ASN64 ASN65 ILE66 LYS67 TYR68 LEU69 ARG70 ILE71
Unit 16 GLY12 ARG13 PRO14 ILE15 LEU16 VAL17 GLU18 LEU19 LYS20 ASN21 GLY22 GLU23 THR24 PHE25 ASN26 GLY27 HIS28 LEU29 GLU30 ASN31 CYS32 ASP33 ASN34 TYR35 MSE36 ASN37 LEU38 THR39 LEU40 ARG41 GLU42 VAL43 ILE44 ARG45 THR46 MSE47 PRO48 ASP49 GLY50 ASP51 LYS52 PHE53 PHE54 ARG55 LEU56 PRO57 GLU58 CYS59 TYR60 ILE61 ARG62 GLY63 ASN64 ASN65 ILE66 LYS67 TYR68 LEU69 ARG70 ILE71
Unit 17 GLY12 ARG13 PRO14 ILE15 LEU16 VAL17 GLU18 LEU19 LYS20 ASN21 GLY22 GLU23 THR24 PHE25 ASN26 GLY27 HIS28 LEU29 GLU30 ASN31 CYS32 ASP33 ASN34 TYR35 MSE36 ASN37 LEU38 THR39 LEU40 ARG41 GLU42 VAL43 ILE44 ARG45 THR46 MSE47 PRO48 ASP49 GLY50 ASP51 LYS52 PHE53 PHE54 ARG55 LEU56 PRO57 GLU58 CYS59 TYR60 ILE61 ARG62 GLY63 ASN64 ASN65 ILE66 LYS67 TYR68 LEU69 ARG70 ILE71
Unit 18 GLY12 ARG13 PRO14 ILE15 LEU16 VAL17 GLU18 LEU19 LYS20 ASN21 GLY22 GLU23 THR24 PHE25 ASN26 GLY27 HIS28 LEU29 GLU30 ASN31 CYS32 ASP33 ASN34 TYR35 MSE36 ASN37 LEU38 THR39 LEU40 ARG41 GLU42 VAL43 ILE44 ARG45 THR46 MSE47 PRO48 ASP49 GLY50 ASP51 LYS52 PHE53 PHE54 ARG55 LEU56 PRO57 GLU58 CYS59 TYR60 ILE61 ARG62 GLY63 ASN64 ASN65 ILE66 LYS67 TYR68 LEU69 ARG70 ILE71
Unit 19 GLY12 ARG13 PRO14 ILE15 LEU16 VAL17 GLU18 LEU19 LYS20 ASN21 GLY22 GLU23 THR24 PHE25 ASN26 GLY27 HIS28 LEU29 GLU30 ASN31 CYS32 ASP33 ASN34 TYR35 MSE36 ASN37 LEU38 THR39 LEU40 ARG41 GLU42 VAL43 ILE44 ARG45 THR46 MSE47 PRO48 ASP49 GLY50 ASP51 LYS52 PHE53 PHE54 ARG55 LEU56 PRO57 GLU58 CYS59 TYR60 ILE61 ARG62 GLY63 ASN64 ASN65 ILE66 LYS67 TYR68 LEU69 ARG70 ILE71
Unit 20 GLY12 ARG13 PRO14 ILE15 LEU16 VAL17 GLU18 LEU19 LYS20 ASN21 GLY22 GLU23 THR24 PHE25 ASN26 GLY27 HIS28 LEU29 GLU30 ASN31 CYS32 ASP33 ASN34 TYR35 MSE36 ASN37 LEU38 THR39 LEU40 ARG41 GLU42 VAL43 ILE44 ARG45 THR46 MSE47 PRO48 ASP49 GLY50 ASP51 LYS52 PHE53 PHE54 ARG55 LEU56 PRO57 GLU58 CYS59 TYR60 ILE61 ARG62 GLY63 ASN64 ASN65 ILE66 LYS67 TYR68 LEU69 ARG70 ILE71
Unit 21 GLY12 ARG13 PRO14 ILE15 LEU16 VAL17 GLU18 LEU19 LYS20 ASN21 GLY22 GLU23 THR24 PHE25 ASN26 GLY27 HIS28 LEU29 GLU30 ASN31 CYS32 ASP33 ASN34 TYR35 MSE36 ASN37 LEU38 THR39 LEU40 ARG41 GLU42 VAL43 ILE44 ARG45 THR46 MSE47 PRO48 ASP49 GLY50 ASP51 LYS52 PHE53 PHE54 ARG55 LEU56 PRO57 GLU58 CYS59 TYR60 ILE61 ARG62 GLY63 ASN64 ASN65 ILE66 LYS67 TYR68 LEU69 ARG70 ILE71
Unit 22 GLY12 ARG13 PRO14 ILE15 LEU16 VAL17 GLU18 LEU19 LYS20 ASN21 GLY22 GLU23 THR24 PHE25 ASN26 GLY27 HIS28 LEU29 GLU30 ASN31 CYS32 ASP33 ASN34 TYR35 MSE36 ASN37 LEU38 THR39 LEU40 ARG41 GLU42 VAL43 ILE44 ARG45 THR46 MSE47 PRO48 ASP49 GLY50 ASP51 LYS52 PHE53 PHE54 ARG55 LEU56 PRO57 GLU58 CYS59 TYR60 ILE61 ARG62 GLY63 ASN64 ASN65 ILE66 LYS67 TYR68 LEU69 ARG70 ILE71
Unit 23 GLY12 ARG13 PRO14 ILE15 LEU16 VAL17 GLU18 LEU19 LYS20 ASN21 GLY22 GLU23 THR24 PHE25 ASN26 GLY27 HIS28 LEU29 GLU30 ASN31 CYS32 ASP33 ASN34 TYR35 MSE36 ASN37 LEU38 THR39 LEU40 ARG41 GLU42 VAL43 ILE44 ARG45 THR46 MSE47 PRO48 ASP49 GLY50 ASP51 LYS52 PHE53 PHE54 ARG55 LEU56 PRO57 GLU58 CYS59 TYR60 ILE61 ARG62 GLY63 ASN64 ASN65 ILE66 LYS67 TYR68 LEU69 ARG70 ILE71
Unit 24 GLY12 ARG13 PRO14 ILE15 LEU16 VAL17 GLU18 LEU19 LYS20 ASN21 GLY22 GLU23 THR24 PHE25 ASN26 GLY27 HIS28 LEU29 GLU30 ASN31 CYS32 ASP33 ASN34 TYR35 MSE36 ASN37 LEU38 THR39 LEU40 ARG41 GLU42 VAL43 ILE44 ARG45 THR46 MSE47 PRO48 ASP49 GLY50 ASP51 LYS52 PHE53 PHE54 ARG55 LEU56 PRO57 GLU58 CYS59 TYR60 ILE61 ARG62 GLY63 ASN64 ASN65 ILE66 LYS67 TYR68 LEU69 ARG70 ILE71

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Perl script:    PDBscan.pl  (15 Sep 2016)
Author:    Peter Slickers  (slickers@leibniz-fli.de),  IMB Jena,  Germany