4DQM - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: REVEALING A MARINE NATURAL PRODUCT AS A NOVEL AGONIST FOR RE ACID RECEPTORS WITH A UNIQUE BINDING MODE AND ANTITUMOR ACT
• Keywords: NUCLEAR RECEPTOR TRANSCRIPTION FACTOR, LIGAND BINDING DOMAIN TRANSCRIPTION REGULATION, NUCLEUS, TRANSCRIPTION-TRANSFERAS
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	4DQM	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	RETINOIC ACID RECEPTOR ALPHA	A	234	1847	0
2	Protein	NUCLEAR RECEPTOR COACTIVATOR 1	B	10	81	0
3	Protein	RETINOIC ACID RECEPTOR ALPHA	C	234	1846	0
4	Protein	NUCLEAR RECEPTOR COACTIVATOR 1	D	10	81	0
5	Ligand	RETINOIC ACID RECEPTOR ALPHA	A	1	0	28
6	Ligand	RETINOIC ACID RECEPTOR ALPHA	C	1	0	26
7	Water			31	0	31
total				521	3855	85

Proteins

Unit 1	PRO 182 GLU 183 VAL 184 GLY 185 GLU 186 LEU 187 ILE 188 GLU 189 LYS 190 VAL 191 ARG 192 LYS 193 ALA 194 HIS 195 GLN 196 GLU 197 THR 198 PHE 199 PRO 200 ALA 201 LEU 202 CYS 203 GLN 204 LEU 205 GLY 206 LYS 207 TYR 208 THR 209 THR 210 ASN 211 ASN 212 SER 213 SER 214 GLU 215 GLN 216 ARG 217 VAL 218 SER 219 LEU 220 ASP 221 ILE 222 ASP 223 LEU 224 TRP 225 ASP 226 LYS 227 PHE 228 SER 229 GLU 230 LEU 231 SER 232 THR 233 LYS 234 CYS 235 ILE 236 ILE 237 LYS 238 THR 239 VAL 240 GLU 241 PHE 242 ALA 243 LYS 244 GLN 245 LEU 246 PRO 247 GLY 248 PHE 249 THR 250 THR 251 LEU 252 THR 253 ILE 254 ALA 255 ASP 256 GLN 257 ILE 258 THR 259 LEU 260 LEU 261 LYS 262 ALA 263 ALA 264 CYS 265 LEU 266 ASP 267 ILE 268 LEU 269 ILE 270 LEU 271 ARG 272 ILE 273 CYS 274 THR 275 ARG 276 TYR 277 THR 278 PRO 279 GLU 280 GLN 281 ASP 282 THR 283 MET 284 THR 285 PHE 286 SER 287 ASP 288 GLY 289 LEU 290 THR 291 LEU 292 ASN 293 ARG 294 THR 295 GLN 296 MET 297 HIS 298 ASN 299 ALA 300 GLY 301 PHE 302 GLY 303 PRO 304 LEU 305 THR 306 ASP 307 LEU 308 VAL 309 PHE 310 ALA 311 PHE 312 ALA 313 ASN 314 GLN 315 LEU 316 LEU 317 PRO 318 LEU 319 GLU 320 MET 321 ASP 322 ASP 323 ALA 324 GLU 325 THR 326 GLY 327 LEU 328 LEU 329 SER 330 ALA 331 ILE 332 CYS 333 LEU 334 ILE 335 CYS 336 GLY 337 ASP 338 ARG 339 GLN 340 ASP 341 LEU 342 GLU 343 GLN 344 PRO 345 ASP 346 ARG 347 VAL 348 ASP 349 MET 350 LEU 351 GLN 352 GLU 353 PRO 354 LEU 355 LEU 356 GLU 357 ALA 358 LEU 359 LYS 360 VAL 361 TYR 362 VAL 363 ARG 364 LYS 365 ARG 366 ARG 367 PRO 368 SER 369 ARG 370 PRO 371 HIS 372 MET 373 PHE 374 PRO 375 LYS 376 MET 377 LEU 378 MET 379 LYS 380 ILE 381 THR 382 ASP 383 LEU 384 ARG 385 SER 386 ILE 387 SER 388 ALA 389 LYS 390 GLY 391 ALA 392 GLU 393 ARG 394 VAL 395 ILE 396 THR 397 LEU 398 LYS 399 MET 400 GLU 401 ILE 402 PRO 403 GLY 404 SER 405 MET 406 PRO 407 PRO 408 LEU 409 ILE 410 GLN 411 GLU 412 MET 413 LEU 414 GLU 415
Unit 2	LYS 1432 SER 1433 LEU 1434 LEU 1435 GLN 1436 GLN 1437 LEU 1438 LEU 1439 THR 1440 GLU 1441
Unit 3	PRO 182 GLU 183 VAL 184 GLY 185 GLU 186 LEU 187 ILE 188 GLU 189 LYS 190 VAL 191 ARG 192 LYS 193 ALA 194 HIS 195 GLN 196 GLU 197 THR 198 PHE 199 PRO 200 ALA 201 LEU 202 CYS 203 GLN 204 LEU 205 GLY 206 LYS 207 TYR 208 THR 209 THR 210 ASN 211 ASN 212 SER 213 SER 214 GLU 215 GLN 216 ARG 217 VAL 218 SER 219 LEU 220 ASP 221 ILE 222 ASP 223 LEU 224 TRP 225 ASP 226 LYS 227 PHE 228 SER 229 GLU 230 LEU 231 SER 232 THR 233 LYS 234 CYS 235 ILE 236 ILE 237 LYS 238 THR 239 VAL 240 GLU 241 PHE 242 ALA 243 LYS 244 GLN 245 LEU 246 PRO 247 GLY 248 PHE 249 THR 250 THR 251 LEU 252 THR 253 ILE 254 ALA 255 ASP 256 GLN 257 ILE 258 THR 259 LEU 260 LEU 261 LYS 262 ALA 263 ALA 264 CYS 265 LEU 266 ASP 267 ILE 268 LEU 269 ILE 270 LEU 271 ARG 272 ILE 273 CYS 274 THR 275 ARG 276 TYR 277 THR 278 PRO 279 GLU 280 GLN 281 ASP 282 THR 283 MET 284 THR 285 PHE 286 SER 287 ASP 288 GLY 289 LEU 290 THR 291 LEU 292 ASN 293 ARG 294 THR 295 GLN 296 MET 297 HIS 298 ASN 299 ALA 300 GLY 301 PHE 302 GLY 303 PRO 304 LEU 305 THR 306 ASP 307 LEU 308 VAL 309 PHE 310 ALA 311 PHE 312 ALA 313 ASN 314 GLN 315 LEU 316 LEU 317 PRO 318 LEU 319 GLU 320 MET 321 ASP 322 ASP 323 ALA 324 GLU 325 THR 326 GLY 327 LEU 328 LEU 329 SER 330 ALA 331 ILE 332 CYS 333 LEU 334 ILE 335 CYS 336 GLY 337 ASP 338 ARG 339 GLN 340 ASP 341 LEU 342 GLU 343 GLN 344 PRO 345 ASP 346 ARG 347 VAL 348 ASP 349 MET 350 LEU 351 GLN 352 GLU 353 PRO 354 LEU 355 LEU 356 GLU 357 ALA 358 LEU 359 LYS 360 VAL 361 TYR 362 VAL 363 ARG 364 LYS 365 ARG 366 ARG 367 PRO 368 SER 369 ARG 370 PRO 371 HIS 372 MET 373 PHE 374 PRO 375 LYS 376 MET 377 LEU 378 MET 379 LYS 380 ILE 381 THR 382 ASP 383 LEU 384 ARG 385 SER 386 ILE 387 SER 388 ALA 389 LYS 390 GLY 391 ALA 392 GLU 393 ARG 394 VAL 395 ILE 396 THR 397 LEU 398 LYS 399 MET 400 GLU 401 ILE 402 PRO 403 GLY 404 SER 405 MET 406 PRO 407 PRO 408 LEU 409 ILE 410 GLN 411 GLU 412 MET 413 LEU 414 GLU 415
Unit 4	LYS 1432 SER 1433 LEU 1434 LEU 1435 GLN 1436 GLN 1437 LEU 1438 LEU 1439 THR 1440 GLU 1441

Ligands

Unit 5	LUF 501
Unit 6	LUF 501