4DNZ - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: THE CRYSTAL STRUCTURES OF CYP199A4
• Keywords: CYTOCHROME P450, SECONDARY METABOLITES, BIOSYNTHESIS, TRANSP CATABOLISM, OXIDOREDUCTASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	4DNZ	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	CYTOCHROME P450	A	393	3021	0
2	Protein	CYTOCHROME P450	B	393	3021	0
3	Protein	CYTOCHROME P450	C	393	3021	0
4	Protein	CYTOCHROME P450	D	393	3021	0
5	Ligand	CYTOCHROME P450	A	4	0	55
6	Ligand	CYTOCHROME P450	B	4	0	55
7	Ligand	CYTOCHROME P450	C	4	0	55
8	Ligand	CYTOCHROME P450	D	4	0	55
9	Water			363	0	363
total				1951	12084	583

Proteins

Unit 1	THR 17 ILE 18 PRO 19 HIS 20 LEU 21 ALA 22 ILE 23 ASP 24 PRO 25 PHE 26 SER 27 LEU 28 ASP 29 PHE 30 PHE 31 ASP 32 ASP 33 PRO 34 TYR 35 PRO 36 ASP 37 GLN 38 GLN 39 THR 40 LEU 41 ARG 42 ASP 43 ALA 44 GLY 45 PRO 46 VAL 47 VAL 48 TYR 49 LEU 50 ASP 51 LYS 52 TRP 53 ASN 54 VAL 55 TYR 56 GLY 57 VAL 58 ALA 59 ARG 60 TYR 61 ALA 62 GLU 63 VAL 64 HIS 65 ALA 66 VAL 67 LEU 68 ASN 69 ASP 70 PRO 71 THR 72 THR 73 PHE 74 CYS 75 SER 76 SER 77 ARG 78 GLY 79 VAL 80 GLY 81 LEU 82 SER 83 ASP 84 PHE 85 LYS 86 LYS 87 GLU 88 LYS 89 PRO 90 TRP 91 ARG 92 PRO 93 PRO 94 SER 95 LEU 96 ILE 97 LEU 98 GLU 99 ALA 100 ASP 101 PRO 102 PRO 103 ALA 104 HIS 105 THR 106 ARG 107 PRO 108 ARG 109 ALA 110 VAL 111 LEU 112 SER 113 LYS 114 VAL 115 LEU 116 SER 117 PRO 118 ALA 119 THR 120 MET 121 LYS 122 THR 123 ILE 124 ARG 125 ASP 126 GLY 127 PHE 128 ALA 129 ALA 130 ALA 131 ALA 132 ASP 133 ALA 134 LYS 135 VAL 136 ASP 137 GLU 138 LEU 139 LEU 140 GLN 141 ARG 142 GLY 143 CYS 144 ILE 145 ASP 146 ALA 147 ILE 148 ALA 149 ASP 150 LEU 151 ALA 152 GLU 153 ALA 154 TYR 155 PRO 156 LEU 157 SER 158 VAL 159 PHE 160 PRO 161 ASP 162 ALA 163 MET 164 GLY 165 LEU 166 LYS 167 GLN 168 GLU 169 GLY 170 ARG 171 GLU 172 HIS 173 LEU 174 LEU 175 PRO 176 TYR 177 ALA 178 GLY 179 LEU 180 VAL 181 PHE 182 ASN 183 ALA 184 PHE 185 GLY 186 PRO 187 PRO 188 ASN 189 GLU 190 LEU 191 ARG 192 GLN 193 THR 194 ALA 195 ILE 196 GLU 197 ARG 198 SER 199 ALA 200 PRO 201 HIS 202 GLN 203 ALA 204 TYR 205 VAL 206 ASN 207 GLU 208 GLN 209 CYS 210 GLN 211 ARG 212 PRO 213 ASN 214 LEU 215 ALA 216 PRO 217 GLY 218 GLY 219 PHE 220 GLY 221 ALA 222 CYS 223 ILE 224 HIS 225 ALA 226 PHE 227 THR 228 ASP 229 THR 230 GLY 231 GLU 232 ILE 233 THR 234 PRO 235 ASP 236 GLU 237 ALA 238 PRO 239 LEU 240 LEU 241 VAL 242 ARG 243 SER 244 LEU 245 LEU 246 SER 247 ALA 248 GLY 249 LEU 250 ASP 251 THR 252 THR 253 VAL 254 ASN 255 GLY 256 ILE 257 GLY 258 ALA 259 ALA 260 VAL 261 TYR 262 CYS 263 LEU 264 ALA 265 ARG 266 PHE 267 PRO 268 GLY 269 GLU 270 LEU 271 GLN 272 ARG 273 LEU 274 ARG 275 SER 276 ASP 277 PRO 278 THR 279 LEU 280 ALA 281 ARG 282 ASN 283 ALA 284 PHE 285 GLU 286 GLU 287 ALA 288 VAL 289 ARG 290 PHE 291 GLU 292 SER 293 PRO 294 VAL 295 GLN 296 THR 297 PHE 298 PHE 299 ARG 300 THR 301 THR 302 THR 303 ARG 304 GLU 305 VAL 306 GLU 307 LEU 308 GLY 309 GLY 310 ALA 311 VAL 312 ILE 313 GLY 314 GLU 315 GLY 316 GLU 317 LYS 318 VAL 319 LEU 320 MET 321 PHE 322 LEU 323 GLY 324 SER 325 ALA 326 ASN 327 ARG 328 ASP 329 PRO 330 ARG 331 ARG 332 TRP 333 SER 334 ASP 335 PRO 336 ASP 337 LEU 338 TYR 339 ASP 340 ILE 341 THR 342 ARG 343 LYS 344 THR 345 SER 346 GLY 347 HIS 348 VAL 349 GLY 350 PHE 351 GLY 352 SER 353 GLY 354 VAL 355 HIS 356 MET 357 CYS 358 VAL 359 GLY 360 GLN 361 LEU 362 VAL 363 ALA 364 ARG 365 LEU 366 GLU 367 GLY 368 GLU 369 VAL 370 MET 371 LEU 372 SER 373 ALA 374 LEU 375 ALA 376 ARG 377 LYS 378 VAL 379 ALA 380 ALA 381 ILE 382 ASP 383 ILE 384 ASP 385 GLY 386 PRO 387 VAL 388 LYS 389 ARG 390 ARG 391 PHE 392 ASN 393 ASN 394 THR 395 LEU 396 ARG 397 GLY 398 LEU 399 GLU 400 SER 401 LEU 402 PRO 403 VAL 404 LYS 405 LEU 406 THR 407 PRO 408 ALA 409
Unit 2	THR 17 ILE 18 PRO 19 HIS 20 LEU 21 ALA 22 ILE 23 ASP 24 PRO 25 PHE 26 SER 27 LEU 28 ASP 29 PHE 30 PHE 31 ASP 32 ASP 33 PRO 34 TYR 35 PRO 36 ASP 37 GLN 38 GLN 39 THR 40 LEU 41 ARG 42 ASP 43 ALA 44 GLY 45 PRO 46 VAL 47 VAL 48 TYR 49 LEU 50 ASP 51 LYS 52 TRP 53 ASN 54 VAL 55 TYR 56 GLY 57 VAL 58 ALA 59 ARG 60 TYR 61 ALA 62 GLU 63 VAL 64 HIS 65 ALA 66 VAL 67 LEU 68 ASN 69 ASP 70 PRO 71 THR 72 THR 73 PHE 74 CYS 75 SER 76 SER 77 ARG 78 GLY 79 VAL 80 GLY 81 LEU 82 SER 83 ASP 84 PHE 85 LYS 86 LYS 87 GLU 88 LYS 89 PRO 90 TRP 91 ARG 92 PRO 93 PRO 94 SER 95 LEU 96 ILE 97 LEU 98 GLU 99 ALA 100 ASP 101 PRO 102 PRO 103 ALA 104 HIS 105 THR 106 ARG 107 PRO 108 ARG 109 ALA 110 VAL 111 LEU 112 SER 113 LYS 114 VAL 115 LEU 116 SER 117 PRO 118 ALA 119 THR 120 MET 121 LYS 122 THR 123 ILE 124 ARG 125 ASP 126 GLY 127 PHE 128 ALA 129 ALA 130 ALA 131 ALA 132 ASP 133 ALA 134 LYS 135 VAL 136 ASP 137 GLU 138 LEU 139 LEU 140 GLN 141 ARG 142 GLY 143 CYS 144 ILE 145 ASP 146 ALA 147 ILE 148 ALA 149 ASP 150 LEU 151 ALA 152 GLU 153 ALA 154 TYR 155 PRO 156 LEU 157 SER 158 VAL 159 PHE 160 PRO 161 ASP 162 ALA 163 MET 164 GLY 165 LEU 166 LYS 167 GLN 168 GLU 169 GLY 170 ARG 171 GLU 172 HIS 173 LEU 174 LEU 175 PRO 176 TYR 177 ALA 178 GLY 179 LEU 180 VAL 181 PHE 182 ASN 183 ALA 184 PHE 185 GLY 186 PRO 187 PRO 188 ASN 189 GLU 190 LEU 191 ARG 192 GLN 193 THR 194 ALA 195 ILE 196 GLU 197 ARG 198 SER 199 ALA 200 PRO 201 HIS 202 GLN 203 ALA 204 TYR 205 VAL 206 ASN 207 GLU 208 GLN 209 CYS 210 GLN 211 ARG 212 PRO 213 ASN 214 LEU 215 ALA 216 PRO 217 GLY 218 GLY 219 PHE 220 GLY 221 ALA 222 CYS 223 ILE 224 HIS 225 ALA 226 PHE 227 THR 228 ASP 229 THR 230 GLY 231 GLU 232 ILE 233 THR 234 PRO 235 ASP 236 GLU 237 ALA 238 PRO 239 LEU 240 LEU 241 VAL 242 ARG 243 SER 244 LEU 245 LEU 246 SER 247 ALA 248 GLY 249 LEU 250 ASP 251 THR 252 THR 253 VAL 254 ASN 255 GLY 256 ILE 257 GLY 258 ALA 259 ALA 260 VAL 261 TYR 262 CYS 263 LEU 264 ALA 265 ARG 266 PHE 267 PRO 268 GLY 269 GLU 270 LEU 271 GLN 272 ARG 273 LEU 274 ARG 275 SER 276 ASP 277 PRO 278 THR 279 LEU 280 ALA 281 ARG 282 ASN 283 ALA 284 PHE 285 GLU 286 GLU 287 ALA 288 VAL 289 ARG 290 PHE 291 GLU 292 SER 293 PRO 294 VAL 295 GLN 296 THR 297 PHE 298 PHE 299 ARG 300 THR 301 THR 302 THR 303 ARG 304 GLU 305 VAL 306 GLU 307 LEU 308 GLY 309 GLY 310 ALA 311 VAL 312 ILE 313 GLY 314 GLU 315 GLY 316 GLU 317 LYS 318 VAL 319 LEU 320 MET 321 PHE 322 LEU 323 GLY 324 SER 325 ALA 326 ASN 327 ARG 328 ASP 329 PRO 330 ARG 331 ARG 332 TRP 333 SER 334 ASP 335 PRO 336 ASP 337 LEU 338 TYR 339 ASP 340 ILE 341 THR 342 ARG 343 LYS 344 THR 345 SER 346 GLY 347 HIS 348 VAL 349 GLY 350 PHE 351 GLY 352 SER 353 GLY 354 VAL 355 HIS 356 MET 357 CYS 358 VAL 359 GLY 360 GLN 361 LEU 362 VAL 363 ALA 364 ARG 365 LEU 366 GLU 367 GLY 368 GLU 369 VAL 370 MET 371 LEU 372 SER 373 ALA 374 LEU 375 ALA 376 ARG 377 LYS 378 VAL 379 ALA 380 ALA 381 ILE 382 ASP 383 ILE 384 ASP 385 GLY 386 PRO 387 VAL 388 LYS 389 ARG 390 ARG 391 PHE 392 ASN 393 ASN 394 THR 395 LEU 396 ARG 397 GLY 398 LEU 399 GLU 400 SER 401 LEU 402 PRO 403 VAL 404 LYS 405 LEU 406 THR 407 PRO 408 ALA 409
Unit 3	THR 17 ILE 18 PRO 19 HIS 20 LEU 21 ALA 22 ILE 23 ASP 24 PRO 25 PHE 26 SER 27 LEU 28 ASP 29 PHE 30 PHE 31 ASP 32 ASP 33 PRO 34 TYR 35 PRO 36 ASP 37 GLN 38 GLN 39 THR 40 LEU 41 ARG 42 ASP 43 ALA 44 GLY 45 PRO 46 VAL 47 VAL 48 TYR 49 LEU 50 ASP 51 LYS 52 TRP 53 ASN 54 VAL 55 TYR 56 GLY 57 VAL 58 ALA 59 ARG 60 TYR 61 ALA 62 GLU 63 VAL 64 HIS 65 ALA 66 VAL 67 LEU 68 ASN 69 ASP 70 PRO 71 THR 72 THR 73 PHE 74 CYS 75 SER 76 SER 77 ARG 78 GLY 79 VAL 80 GLY 81 LEU 82 SER 83 ASP 84 PHE 85 LYS 86 LYS 87 GLU 88 LYS 89 PRO 90 TRP 91 ARG 92 PRO 93 PRO 94 SER 95 LEU 96 ILE 97 LEU 98 GLU 99 ALA 100 ASP 101 PRO 102 PRO 103 ALA 104 HIS 105 THR 106 ARG 107 PRO 108 ARG 109 ALA 110 VAL 111 LEU 112 SER 113 LYS 114 VAL 115 LEU 116 SER 117 PRO 118 ALA 119 THR 120 MET 121 LYS 122 THR 123 ILE 124 ARG 125 ASP 126 GLY 127 PHE 128 ALA 129 ALA 130 ALA 131 ALA 132 ASP 133 ALA 134 LYS 135 VAL 136 ASP 137 GLU 138 LEU 139 LEU 140 GLN 141 ARG 142 GLY 143 CYS 144 ILE 145 ASP 146 ALA 147 ILE 148 ALA 149 ASP 150 LEU 151 ALA 152 GLU 153 ALA 154 TYR 155 PRO 156 LEU 157 SER 158 VAL 159 PHE 160 PRO 161 ASP 162 ALA 163 MET 164 GLY 165 LEU 166 LYS 167 GLN 168 GLU 169 GLY 170 ARG 171 GLU 172 HIS 173 LEU 174 LEU 175 PRO 176 TYR 177 ALA 178 GLY 179 LEU 180 VAL 181 PHE 182 ASN 183 ALA 184 PHE 185 GLY 186 PRO 187 PRO 188 ASN 189 GLU 190 LEU 191 ARG 192 GLN 193 THR 194 ALA 195 ILE 196 GLU 197 ARG 198 SER 199 ALA 200 PRO 201 HIS 202 GLN 203 ALA 204 TYR 205 VAL 206 ASN 207 GLU 208 GLN 209 CYS 210 GLN 211 ARG 212 PRO 213 ASN 214 LEU 215 ALA 216 PRO 217 GLY 218 GLY 219 PHE 220 GLY 221 ALA 222 CYS 223 ILE 224 HIS 225 ALA 226 PHE 227 THR 228 ASP 229 THR 230 GLY 231 GLU 232 ILE 233 THR 234 PRO 235 ASP 236 GLU 237 ALA 238 PRO 239 LEU 240 LEU 241 VAL 242 ARG 243 SER 244 LEU 245 LEU 246 SER 247 ALA 248 GLY 249 LEU 250 ASP 251 THR 252 THR 253 VAL 254 ASN 255 GLY 256 ILE 257 GLY 258 ALA 259 ALA 260 VAL 261 TYR 262 CYS 263 LEU 264 ALA 265 ARG 266 PHE 267 PRO 268 GLY 269 GLU 270 LEU 271 GLN 272 ARG 273 LEU 274 ARG 275 SER 276 ASP 277 PRO 278 THR 279 LEU 280 ALA 281 ARG 282 ASN 283 ALA 284 PHE 285 GLU 286 GLU 287 ALA 288 VAL 289 ARG 290 PHE 291 GLU 292 SER 293 PRO 294 VAL 295 GLN 296 THR 297 PHE 298 PHE 299 ARG 300 THR 301 THR 302 THR 303 ARG 304 GLU 305 VAL 306 GLU 307 LEU 308 GLY 309 GLY 310 ALA 311 VAL 312 ILE 313 GLY 314 GLU 315 GLY 316 GLU 317 LYS 318 VAL 319 LEU 320 MET 321 PHE 322 LEU 323 GLY 324 SER 325 ALA 326 ASN 327 ARG 328 ASP 329 PRO 330 ARG 331 ARG 332 TRP 333 SER 334 ASP 335 PRO 336 ASP 337 LEU 338 TYR 339 ASP 340 ILE 341 THR 342 ARG 343 LYS 344 THR 345 SER 346 GLY 347 HIS 348 VAL 349 GLY 350 PHE 351 GLY 352 SER 353 GLY 354 VAL 355 HIS 356 MET 357 CYS 358 VAL 359 GLY 360 GLN 361 LEU 362 VAL 363 ALA 364 ARG 365 LEU 366 GLU 367 GLY 368 GLU 369 VAL 370 MET 371 LEU 372 SER 373 ALA 374 LEU 375 ALA 376 ARG 377 LYS 378 VAL 379 ALA 380 ALA 381 ILE 382 ASP 383 ILE 384 ASP 385 GLY 386 PRO 387 VAL 388 LYS 389 ARG 390 ARG 391 PHE 392 ASN 393 ASN 394 THR 395 LEU 396 ARG 397 GLY 398 LEU 399 GLU 400 SER 401 LEU 402 PRO 403 VAL 404 LYS 405 LEU 406 THR 407 PRO 408 ALA 409
Unit 4	THR 17 ILE 18 PRO 19 HIS 20 LEU 21 ALA 22 ILE 23 ASP 24 PRO 25 PHE 26 SER 27 LEU 28 ASP 29 PHE 30 PHE 31 ASP 32 ASP 33 PRO 34 TYR 35 PRO 36 ASP 37 GLN 38 GLN 39 THR 40 LEU 41 ARG 42 ASP 43 ALA 44 GLY 45 PRO 46 VAL 47 VAL 48 TYR 49 LEU 50 ASP 51 LYS 52 TRP 53 ASN 54 VAL 55 TYR 56 GLY 57 VAL 58 ALA 59 ARG 60 TYR 61 ALA 62 GLU 63 VAL 64 HIS 65 ALA 66 VAL 67 LEU 68 ASN 69 ASP 70 PRO 71 THR 72 THR 73 PHE 74 CYS 75 SER 76 SER 77 ARG 78 GLY 79 VAL 80 GLY 81 LEU 82 SER 83 ASP 84 PHE 85 LYS 86 LYS 87 GLU 88 LYS 89 PRO 90 TRP 91 ARG 92 PRO 93 PRO 94 SER 95 LEU 96 ILE 97 LEU 98 GLU 99 ALA 100 ASP 101 PRO 102 PRO 103 ALA 104 HIS 105 THR 106 ARG 107 PRO 108 ARG 109 ALA 110 VAL 111 LEU 112 SER 113 LYS 114 VAL 115 LEU 116 SER 117 PRO 118 ALA 119 THR 120 MET 121 LYS 122 THR 123 ILE 124 ARG 125 ASP 126 GLY 127 PHE 128 ALA 129 ALA 130 ALA 131 ALA 132 ASP 133 ALA 134 LYS 135 VAL 136 ASP 137 GLU 138 LEU 139 LEU 140 GLN 141 ARG 142 GLY 143 CYS 144 ILE 145 ASP 146 ALA 147 ILE 148 ALA 149 ASP 150 LEU 151 ALA 152 GLU 153 ALA 154 TYR 155 PRO 156 LEU 157 SER 158 VAL 159 PHE 160 PRO 161 ASP 162 ALA 163 MET 164 GLY 165 LEU 166 LYS 167 GLN 168 GLU 169 GLY 170 ARG 171 GLU 172 HIS 173 LEU 174 LEU 175 PRO 176 TYR 177 ALA 178 GLY 179 LEU 180 VAL 181 PHE 182 ASN 183 ALA 184 PHE 185 GLY 186 PRO 187 PRO 188 ASN 189 GLU 190 LEU 191 ARG 192 GLN 193 THR 194 ALA 195 ILE 196 GLU 197 ARG 198 SER 199 ALA 200 PRO 201 HIS 202 GLN 203 ALA 204 TYR 205 VAL 206 ASN 207 GLU 208 GLN 209 CYS 210 GLN 211 ARG 212 PRO 213 ASN 214 LEU 215 ALA 216 PRO 217 GLY 218 GLY 219 PHE 220 GLY 221 ALA 222 CYS 223 ILE 224 HIS 225 ALA 226 PHE 227 THR 228 ASP 229 THR 230 GLY 231 GLU 232 ILE 233 THR 234 PRO 235 ASP 236 GLU 237 ALA 238 PRO 239 LEU 240 LEU 241 VAL 242 ARG 243 SER 244 LEU 245 LEU 246 SER 247 ALA 248 GLY 249 LEU 250 ASP 251 THR 252 THR 253 VAL 254 ASN 255 GLY 256 ILE 257 GLY 258 ALA 259 ALA 260 VAL 261 TYR 262 CYS 263 LEU 264 ALA 265 ARG 266 PHE 267 PRO 268 GLY 269 GLU 270 LEU 271 GLN 272 ARG 273 LEU 274 ARG 275 SER 276 ASP 277 PRO 278 THR 279 LEU 280 ALA 281 ARG 282 ASN 283 ALA 284 PHE 285 GLU 286 GLU 287 ALA 288 VAL 289 ARG 290 PHE 291 GLU 292 SER 293 PRO 294 VAL 295 GLN 296 THR 297 PHE 298 PHE 299 ARG 300 THR 301 THR 302 THR 303 ARG 304 GLU 305 VAL 306 GLU 307 LEU 308 GLY 309 GLY 310 ALA 311 VAL 312 ILE 313 GLY 314 GLU 315 GLY 316 GLU 317 LYS 318 VAL 319 LEU 320 MET 321 PHE 322 LEU 323 GLY 324 SER 325 ALA 326 ASN 327 ARG 328 ASP 329 PRO 330 ARG 331 ARG 332 TRP 333 SER 334 ASP 335 PRO 336 ASP 337 LEU 338 TYR 339 ASP 340 ILE 341 THR 342 ARG 343 LYS 344 THR 345 SER 346 GLY 347 HIS 348 VAL 349 GLY 350 PHE 351 GLY 352 SER 353 GLY 354 VAL 355 HIS 356 MET 357 CYS 358 VAL 359 GLY 360 GLN 361 LEU 362 VAL 363 ALA 364 ARG 365 LEU 366 GLU 367 GLY 368 GLU 369 VAL 370 MET 371 LEU 372 SER 373 ALA 374 LEU 375 ALA 376 ARG 377 LYS 378 VAL 379 ALA 380 ALA 381 ILE 382 ASP 383 ILE 384 ASP 385 GLY 386 PRO 387 VAL 388 LYS 389 ARG 390 ARG 391 PHE 392 ASN 393 ASN 394 THR 395 LEU 396 ARG 397 GLY 398 LEU 399 GLU 400 SER 401 LEU 402 PRO 403 VAL 404 LYS 405 LEU 406 THR 407 PRO 408 ALA 409

Ligands

Unit 5	HEM 501 SO4 502 GOL 503 CL 504
Unit 6	HEM 501 SO4 502 GOL 503 CL 504
Unit 7	HEM 501 SO4 502 GOL 503 CL 504
Unit 8	HEM 501 SO4 502 GOL 503 CL 504