4C5A - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: THE X-RAY CRYSTAL STRUCTURES OF D-ALANYL-D-ALANINE LIGASE IN ADP AND D-CYCLOSERINE PHOSPHATE
• Keywords: LIGASE, DDLB, ANTIBIOTIC
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	4C5A	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	D-ALANINE--D-ALANINE LIGASE	A	306	2305	0
2	Protein	D-ALANINE--D-ALANINE LIGASE	B	304	2290	0
3	Protein	PEPTIDE	C	8	66	0
4	Ligand	D-ALANINE--D-ALANINE LIGASE	A	6	0	52
5	Ligand	D-ALANINE--D-ALANINE LIGASE	B	4	0	40
6	Water			347	0	347
total				975	4661	439

Proteins

Unit 1	MET 1 THR 2 ASP 3 LYS 4 ILE 5 ALA 6 VAL 7 LEU 8 LEU 9 GLY 10 GLY 11 THR 12 SER 13 ALA 14 GLU 15 ARG 16 GLU 17 VAL 18 SER 19 LEU 20 ASN 21 SER 22 GLY 23 ALA 24 ALA 25 VAL 26 LEU 27 ALA 28 GLY 29 LEU 30 ARG 31 GLU 32 GLY 33 GLY 34 ILE 35 ASP 36 ALA 37 TYR 38 PRO 39 VAL 40 ASP 41 PRO 42 LYS 43 GLU 44 VAL 45 ASP 46 VAL 47 THR 48 GLN 49 LEU 50 LYS 51 SER 52 MET 53 GLY 54 PHE 55 GLN 56 LYS 57 VAL 58 PHE 59 ILE 60 ALA 61 LEU 62 HIS 63 GLY 64 ARG 65 GLY 66 GLY 67 GLU 68 ASP 69 GLY 70 THR 71 LEU 72 GLN 73 GLY 74 MET 75 LEU 76 GLU 77 LEU 78 MET 79 GLY 80 LEU 81 PRO 82 TYR 83 THR 84 GLY 85 SER 86 GLY 87 VAL 88 MET 89 ALA 90 SER 91 ALA 92 LEU 93 SER 94 MET 95 ASP 96 LYS 97 LEU 98 ARG 99 SER 100 LYS 101 LEU 102 LEU 103 TRP 104 GLN 105 GLY 106 ALA 107 GLY 108 LEU 109 PRO 110 VAL 111 ALA 112 PRO 113 TRP 114 VAL 115 ALA 116 LEU 117 THR 118 ARG 119 ALA 120 GLU 121 PHE 122 GLU 123 LYS 124 GLY 125 LEU 126 SER 127 ASP 128 LYS 129 GLN 130 LEU 131 ALA 132 GLU 133 ILE 134 SER 135 ALA 136 LEU 137 GLY 138 LEU 139 PRO 140 VAL 141 ILE 142 VAL 143 LYS 144 PRO 145 SER 146 ARG 147 GLU 148 GLY 149 SER 150 SER 151 VAL 152 GLY 153 MET 154 SER 155 LYS 156 VAL 157 VAL 158 ALA 159 GLU 160 ASN 161 ALA 162 LEU 163 GLN 164 ASP 165 ALA 166 LEU 167 ARG 168 LEU 169 ALA 170 PHE 171 GLN 172 HIS 173 ASP 174 GLU 175 GLU 176 VAL 177 LEU 178 ILE 179 GLU 180 LYS 181 TRP 182 LEU 183 SER 184 GLY 185 PRO 186 GLU 187 PHE 188 THR 189 VAL 190 ALA 191 ILE 192 LEU 193 GLY 194 GLU 195 GLU 196 ILE 197 LEU 198 PRO 199 SER 200 ILE 201 ARG 202 ILE 203 GLN 204 PRO 205 SER 206 GLY 207 THR 208 PHE 209 TYR 210 ASP 211 TYR 212 GLU 213 ALA 214 LYS 215 TYR 216 LEU 217 SER 218 ASP 219 GLU 220 THR 221 GLN 222 TYR 223 PHE 224 CYS 225 PRO 226 ALA 227 GLY 228 LEU 229 GLU 230 ALA 231 SER 232 GLN 233 GLU 234 ALA 235 ASN 236 LEU 237 GLN 238 ALA 239 LEU 240 VAL 241 LEU 242 LYS 243 ALA 244 TRP 245 THR 246 THR 247 LEU 248 GLY 249 CYS 250 LYS 251 GLY 252 TRP 253 GLY 254 ARG 255 ILE 256 ASP 257 VAL 258 MET 259 LEU 260 ASP 261 SER 262 ASP 263 GLY 264 GLN 265 PHE 266 TYR 267 LEU 268 LEU 269 GLU 270 ALA 271 ASN 272 THR 273 SER 274 PRO 275 GLY 276 MET 277 THR 278 SER 279 HIS 280 SER 281 LEU 282 VAL 283 PRO 284 MET 285 ALA 286 ALA 287 ARG 288 GLN 289 ALA 290 GLY 291 MET 292 SER 293 PHE 294 SER 295 GLN 296 LEU 297 VAL 298 VAL 299 ARG 300 ILE 301 LEU 302 GLU 303 LEU 304 ALA 305 ASP 306
Unit 2	ASP 3 LYS 4 ILE 5 ALA 6 VAL 7 LEU 8 LEU 9 GLY 10 GLY 11 THR 12 SER 13 ALA 14 GLU 15 ARG 16 GLU 17 VAL 18 SER 19 LEU 20 ASN 21 SER 22 GLY 23 ALA 24 ALA 25 VAL 26 LEU 27 ALA 28 GLY 29 LEU 30 ARG 31 GLU 32 GLY 33 GLY 34 ILE 35 ASP 36 ALA 37 TYR 38 PRO 39 VAL 40 ASP 41 PRO 42 LYS 43 GLU 44 VAL 45 ASP 46 VAL 47 THR 48 GLN 49 LEU 50 LYS 51 SER 52 MET 53 GLY 54 PHE 55 GLN 56 LYS 57 VAL 58 PHE 59 ILE 60 ALA 61 LEU 62 HIS 63 GLY 64 ARG 65 GLY 66 GLY 67 GLU 68 ASP 69 GLY 70 THR 71 LEU 72 GLN 73 GLY 74 MET 75 LEU 76 GLU 77 LEU 78 MET 79 GLY 80 LEU 81 PRO 82 TYR 83 THR 84 GLY 85 SER 86 GLY 87 VAL 88 MET 89 ALA 90 SER 91 ALA 92 LEU 93 SER 94 MET 95 ASP 96 LYS 97 LEU 98 ARG 99 SER 100 LYS 101 LEU 102 LEU 103 TRP 104 GLN 105 GLY 106 ALA 107 GLY 108 LEU 109 PRO 110 VAL 111 ALA 112 PRO 113 TRP 114 VAL 115 ALA 116 LEU 117 THR 118 ARG 119 ALA 120 GLU 121 PHE 122 GLU 123 LYS 124 GLY 125 LEU 126 SER 127 ASP 128 LYS 129 GLN 130 LEU 131 ALA 132 GLU 133 ILE 134 SER 135 ALA 136 LEU 137 GLY 138 LEU 139 PRO 140 VAL 141 ILE 142 VAL 143 LYS 144 PRO 145 SER 146 ARG 147 GLU 148 GLY 149 SER 150 SER 151 VAL 152 GLY 153 MET 154 SER 155 LYS 156 VAL 157 VAL 158 ALA 159 GLU 160 ASN 161 ALA 162 LEU 163 GLN 164 ASP 165 ALA 166 LEU 167 ARG 168 LEU 169 ALA 170 PHE 171 GLN 172 HIS 173 ASP 174 GLU 175 GLU 176 VAL 177 LEU 178 ILE 179 GLU 180 LYS 181 TRP 182 LEU 183 SER 184 GLY 185 PRO 186 GLU 187 PHE 188 THR 189 VAL 190 ALA 191 ILE 192 LEU 193 GLY 194 GLU 195 GLU 196 ILE 197 LEU 198 PRO 199 SER 200 ILE 201 ARG 202 ILE 203 GLN 204 PRO 205 SER 206 GLY 207 THR 208 PHE 209 TYR 210 ASP 211 TYR 212 GLU 213 ALA 214 LYS 215 TYR 216 LEU 217 SER 218 ASP 219 GLU 220 THR 221 GLN 222 TYR 223 PHE 224 CYS 225 PRO 226 ALA 227 GLY 228 LEU 229 GLU 230 ALA 231 SER 232 GLN 233 GLU 234 ALA 235 ASN 236 LEU 237 GLN 238 ALA 239 LEU 240 VAL 241 LEU 242 LYS 243 ALA 244 TRP 245 THR 246 THR 247 LEU 248 GLY 249 CYS 250 LYS 251 GLY 252 TRP 253 GLY 254 ARG 255 ILE 256 ASP 257 VAL 258 MET 259 LEU 260 ASP 261 SER 262 ASP 263 GLY 264 GLN 265 PHE 266 TYR 267 LEU 268 LEU 269 GLU 270 ALA 271 ASN 272 THR 273 SER 274 PRO 275 GLY 276 MET 277 THR 278 SER 279 HIS 280 SER 281 LEU 282 VAL 283 PRO 284 MET 285 ALA 286 ALA 287 ARG 288 GLN 289 ALA 290 GLY 291 MET 292 SER 293 PHE 294 SER 295 GLN 296 LEU 297 VAL 298 VAL 299 ARG 300 ILE 301 LEU 302 GLU 303 LEU 304 ALA 305 ASP 306
Unit 3	GLU 1 ASN 2 LEU 3 TYR 4 PHE 5 GLN 6 GLY 7 ALA 8

Ligands

Unit 4	ADP 310 DS0 311 MG 330 MG 331 GOL 1307 GOL 1308
Unit 5	ADP 310 DS0 311 MG 330 MG 331