3W3S - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF A. AEOLICUS TRNASEC IN COMPLEX WITH M. SERRS
• Keywords: CLASS 2 AMINOACYL-TRNA SYNTHETASE, TRANSFER RNA, AMINOACYLAT SELENOCYSTEINE INCORPORATION, SELENIUM METABOLISM, LIGASE-R COMPLEX
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	3W3S	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	TYPE-2 SERINE--TRNA LIGASE	A	527	4299	64
2	RNA		B	98	2090	0
3	Ligand	TYPE-2 SERINE--TRNA LIGASE	A	23	0	75
4	Ligand	SELENOCYSTEINE TRNA	B	2	0	10
total				650	6389	149

Proteins

Unit 1

MSE 1 GLU 2 LEU 3 LYS 4 PHE 5 SER 6 ALA 7 GLU 8 VAL 9 GLU 10 LEU 11 THR 12 LEU 13 SER 14 ARG 15 GLU 16 VAL 17 ASP 18 PRO 19 ALA 20 GLU 21 ILE 22 GLU 23 PRO 24 THR 25 VAL 26 GLU 27 GLU 28 PHE 29 VAL 30 LYS 31 GLU 32 ALA 33 ASN 34 GLU 35 ASP 36 LEU 37 LEU 38 GLN 39 ARG 40 GLY 41 VAL 42 PRO 43 THR 44 GLY 45 LYS 46 GLU 47 GLY 48 ALA 49 LYS 50 ILE 51 GLU 52 SER 53 TYR 54 TYR 55 VAL 56 LEU 57 TYR 58 ASP 59 THR 60 ILE 61 TYR 62 MSE 63 GLU 64 ILE 65 THR 66 GLY 67 THR 68 ARG 69 TYR 70 LEU 71 ARG 72 PRO 73 HIS 74 GLU 75 ALA 76 ALA 77 MSE 78 ARG 79 VAL 80 ARG 81 LYS 82 ARG 83 LEU 84 ALA 85 GLU 86 ARG 87 LEU 88 GLY 89 ARG 90 LYS 91 HIS 92 ARG 93 VAL 94 GLY 95 VAL 96 ARG 97 ASP 98 LEU 99 LYS 100 ILE 101 PRO 102 ARG 103 TYR 104 GLU 105 VAL 106 VAL 107 LEU 108 ARG 109 PHE 110 ASP 111 ARG 112 GLU 113 VAL 114 THR 115 TYR 116 ASP 117 TYR 118 VAL 119 GLY 120 TYR 121 VAL 122 PRO 123 VAL 124 ALA 125 ASP 126 ASP 127 VAL 128 VAL 129 VAL 130 GLU 131 ASP 132 GLY 133 THR 134 VAL 135 ARG 136 LEU 137 THR 138 PHE 139 GLN 140 ASP 141 VAL 142 ASP 143 GLU 144 GLU 145 MSE 146 LEU 147 ARG 148 ARG 149 HIS 150 VAL 151 ILE 152 ASP 153 ARG 154 VAL 155 ILE 156 ARG 157 LEU 158 VAL 159 ALA 160 TRP 161 ALA 162 VAL 163 GLU 164 GLU 165 ARG 166 SER 167 GLU 168 LEU 169 VAL 170 GLU 171 ARG 172 VAL 173 THR 174 LYS 175 VAL 176 GLU 177 PRO 178 GLY 179 THR 180 VAL 181 VAL 182 ASP 183 GLU 184 SER 185 GLY 186 PRO 187 ARG 188 ARG 189 ILE 190 ARG 191 PHE 192 ARG 193 GLY 194 ASP 195 VAL 196 THR 197 GLU 198 GLU 199 ALA 200 ARG 201 ARG 202 ARG 203 GLY 204 TRP 205 VAL 206 LYS 207 GLU 208 PHE 209 PRO 210 GLY 211 ARG 212 GLY 213 GLN 214 TRP 215 ILE 216 TYR 217 THR 218 PRO 219 PRO 220 MSE 221 ALA 222 ALA 223 LEU 224 PHE 225 GLU 226 VAL 227 LEU 228 ARG 229 ASP 230 PHE 231 LEU 232 LEU 233 GLU 234 ARG 235 VAL 236 THR 237 ARG 238 LYS 239 LEU 240 GLY 241 PHE 242 GLU 243 PRO 244 ALA 245 LEU 246 PHE 247 PRO 248 LYS 249 LEU 250 ILE 251 PRO 252 LEU 253 GLU 254 THR 255 MSE 256 PHE 257 ARG 258 MSE 259 ARG 260 TYR 261 LEU 262 HIS 263 GLY 264 LEU 265 PRO 266 ASP 267 GLY 268 MSE 269 TYR 270 TYR 271 VAL 272 CYS 273 PRO 274 PRO 275 LYS 276 ARG 277 ASP 278 PRO 279 GLU 280 LEU 281 PHE 282 ASP 283 ASP 284 PHE 285 LYS 286 ARG 287 GLU 288 LEU 289 TYR 290 VAL 291 TRP 292 GLY 293 GLU 294 LEU 295 ASN 296 GLU 297 ARG 298 THR 299 LEU 300 GLY 301 SER 302 LEU 303 LYS 304 GLU 305 LYS 306 LEU 307 ARG 308 ASP 309 PRO 310 GLY 311 TYR 312 VAL 313 LEU 314 ALA 315 PRO 316 ALA 317 GLN 318 CYS 319 GLU 320 PRO 321 PHE 322 TYR 323 GLU 324 LEU 325 LEU 326 ARG 327 ASP 328 GLU 329 VAL 330 VAL 331 ASP 332 PRO 333 GLU 334 ARG 335 LEU 336 PRO 337 ILE 338 LYS 339 LEU 340 TYR 341 ASP 342 CYS 343 SER 344 GLY 345 TRP 346 THR 347 TYR 348 ARG 349 TRP 350 GLU 351 GLY 352 GLY 353 ALA 354 ALA 355 LYS 356 GLY 357 LEU 358 GLU 359 ARG 360 VAL 361 ASN 362 GLU 363 PHE 364 GLN 365 ARG 366 ILE 367 GLU 368 HIS 369 VAL 370 TRP 371 ILE 372 ALA 373 GLU 374 PRO 375 GLU 376 GLU 377 ALA 378 TYR 379 ARG 380 ILE 381 ARG 382 ARG 383 GLU 384 LEU 385 LEU 386 GLU 387 ALA 388 THR 389 LYS 390 ARG 391 VAL 392 ALA 393 GLU 394 GLU 395 LEU 396 GLU 397 LEU 398 GLU 399 TRP 400 LYS 401 VAL 402 VAL 403 VAL 404 SER 405 ASP 406 ASP 407 PRO 408 PHE 409 TYR 410 LEU 411 GLU 412 GLY 413 ARG 414 LEU 415 LEU 416 GLU 417 ASP 418 ARG 419 ASP 420 ILE 421 GLU 422 LEU 423 PRO 424 ASP 425 VAL 426 PRO 427 SER 428 TYR 429 GLU 430 PHE 431 GLU 432 VAL 433 TYR 434 LEU 435 PRO 436 PHE 437 LYS 438 GLY 439 GLU 440 ARG 441 SER 442 SER 443 GLU 444 GLU 445 ALA 446 TRP 447 ILE 448 SER 449 VAL 450 GLY 451 SER 452 PHE 453 ASN 454 VAL 455 HIS 456 GLY 457 GLU 458 HIS 459 PHE 460 VAL 461 ASP 462 GLY 463 PHE 464 ASN 465 VAL 466 LYS 467 GLU 468 LYS 469 SER 470 GLY 471 ARG 472 THR 473 LEU 474 PHE 475 THR 476 GLY 477 CYS 478 ALA 479 GLY 480 LEU 481 GLY 482 VAL 483 THR 484 ARG 485 TRP 486 VAL 487 VAL 488 GLY 489 LEU 490 LEU 491 ALA 492 GLN 493 HIS 494 GLY 495 PHE 496 TYR 497 PRO 498 TYR 499 GLU 500 TRP 501 PRO 502 GLU 503 PRO 504 ILE 505 LEU 506 GLU 507 ARG 508 ILE 509 ASP 510 GLU 511 LYS 512 PHE 513 GLY 514 GLY 515 LEU 516 PRO 517 GLU 518 VAL 519 PRO 520 LYS 521 THR 522 LEU 523 THR 524 TRP 525 PRO 526 GLU 527

Nucleic acids

Unit 2

G 1 G 2 G 3 A 4 G 5 A 5A G 6 G 7 U 8 U 9 G 10 G 11 C 11A C 12 G 13 G 14 C 15 U 16 G 18 G 19 U 20 G 20A C 21 C 22 G 23 C 24 C 25 C 26 C 27 G 28 G 29 G 30 A 31 C 32 U 33 U 34 C 35 A 36 A 37 A 38 U 39 C 40 C 41 C 42 G 43 U 43A G 44 G 45 G 46 A 47 G 47A G 47B U 47C C 47D C 47E C 47F G 47G C 47H A 47I A 47J G 47K G 47L G 47M A 47N G 47O C 47P U 47Q C 47R C 47S G 48 G 49 A 50 G 51 G 52 G 53 U 54 U 55 C 56 G 57 A 58 U 59 U 60 C 61 C 62 C 63 U 64 C 65 C 66 C 67 U 67A C 68 U 69 C 70 C 71 C 72 G 73 C 74 C 75

Ligands

Unit 3	ZN 2001 SSA 2002 PT 2003 PT 2004 PT 2005 PT 2006 PT 2007 PT 2008 PT 2009 PT 2010 PT 2011 PT 2012 PT 2013 PT 2014 PT 2015 PT 2016 PT 2017 SO4 2018 SO4 2019 SO4 2020 SO4 2021 SO4 2022 SO4 2023
Unit 4	SO4 101 SO4 102