3VXF - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: X/N JOINT REFINEMENT OF HUMAN ALPHA-THROMBIN-BIVALIRUDIN COM
• Keywords: SERINE PROTEASE, HYDROLYSIS, HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR C
• Experiment: neutron diffraction, X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	3VXF	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	THROMBIN LIGHT CHAIN	L	28	436	0
2	Protein	THROMBIN HEAVY CHAIN	H	257	4247	0
3	Protein	BIVALIRUDIN	J	10	143	0
4	Protein	BIVALIRUDIN	I	3	40	22
5	Ligand	THROMBIN HEAVY CHAIN	H	1	0	26
6	Ligand	THROMBIN LIGHT CHAIN	L	10	0	18
7	Ligand	THROMBIN HEAVY CHAIN	H	144	0	278
8	Ligand	BIVALIRUDIN	J	2	0	4
9	Ligand	BIVALIRUDIN	I	2	0	4
total				457	4866	352

Proteins

Unit 1	CYS 1 ASP 1A ALA 1B GLU 1C GLY 2 LEU 3 ARG 4 PRO 5 LEU 6 PHE 7 GLU 8 LYS 9 LYS 10 SER 11 LEU 12 GLU 13 ASP 14 LYS 14A THR 14B GLU 14C ARG 14D GLU 14E LEU 14F LEU 14G GLU 14H SER 14I TYR 14J ILE 14K
Unit 2	ILE 16 VAL 17 GLU 18 GLY 19 SER 20 ASP 21 ALA 22 GLU 23 ILE 24 GLY 25 MET 26 SER 27 PRO 28 TRP 29 GLN 30 VAL 31 MET 32 LEU 33 PHE 34 ARG 35 LYS 36 SER 36A PRO 37 GLN 38 GLU 39 LEU 40 LEU 41 CYS 42 GLY 43 ALA 44 SER 45 LEU 46 ILE 47 SER 48 ASP 49 ARG 50 TRP 51 VAL 52 LEU 53 THR 54 ALA 55 ALA 56 HIS 57 CYS 58 LEU 59 LEU 60 TYR 60A PRO 60B PRO 60C TRP 60D ASP 60E LYS 60F ASN 60G PHE 60H THR 60I GLU 61 ASN 62 ASP 63 LEU 64 LEU 65 VAL 66 ARG 67 ILE 68 GLY 69 LYS 70 HIS 71 SER 72 ARG 73 THR 74 ARG 75 TYR 76 GLU 77 ARG 77A ASN 78 ILE 79 GLU 80 LYS 81 ILE 82 SER 83 MET 84 LEU 85 GLU 86 LYS 87 ILE 88 TYR 89 ILE 90 HIS 91 PRO 92 ARG 93 TYR 94 ASN 95 TRP 96 ARG 97 GLU 97A ASN 98 LEU 99 ASP 100 ARG 101 ASP 102 ILE 103 ALA 104 LEU 105 MET 106 LYS 107 LEU 108 LYS 109 LYS 110 PRO 111 VAL 112 ALA 113 PHE 114 SER 115 ASP 116 TYR 117 ILE 118 HIS 119 PRO 120 VAL 121 CYS 122 LEU 123 PRO 124 ASP 125 ARG 126 GLU 127 THR 128 ALA 129 ALA 129A SER 129B LEU 129C LEU 130 GLN 131 ALA 132 GLY 133 TYR 134 LYS 135 GLY 136 ARG 137 VAL 138 THR 139 GLY 140 TRP 141 GLY 142 ASN 143 LEU 144 LYS 145 GLU 146 THR 147 TRP 148 THR 149 ALA 149A ASN 149B VAL 149C GLY 149D LYS 149E GLY 150 GLN 151 PRO 152 SER 153 VAL 154 LEU 155 GLN 156 VAL 157 VAL 158 ASN 159 LEU 160 PRO 161 ILE 162 VAL 163 GLU 164 ARG 165 PRO 166 VAL 167 CYS 168 LYS 169 ASP 170 SER 171 THR 172 ARG 173 ILE 174 ARG 175 ILE 176 THR 177 ASP 178 ASN 179 MET 180 PHE 181 CYS 182 ALA 183 GLY 184 TYR 184A LYS 185 PRO 186 ASP 186A GLU 186B GLY 186C LYS 186D ARG 187 GLY 188 ASP 189 ALA 190 CYS 191 GLU 192 GLY 193 ASP 194 SER 195 GLY 196 GLY 197 PRO 198 PHE 199 VAL 200 MET 201 LYS 202 SER 203 PRO 204 PHE 204A ASN 204B ASN 205 ARG 206 TRP 207 TYR 208 GLN 209 MET 210 GLY 211 ILE 212 VAL 213 SER 214 TRP 215 GLY 216 GLU 217 GLY 219 CYS 220 ASP 221 ARG 221A ASP 222 GLY 223 LYS 224 TYR 225 GLY 226 PHE 227 TYR 228 THR 229 HIS 230 VAL 231 PHE 232 ARG 233 LEU 234 LYS 235 LYS 236 TRP 237 ILE 238 GLN 239 LYS 240 VAL 241 ILE 242 ASP 243 GLN 244 PHE 245
Unit 3	ASP 55 PHE 56 GLU 57 GLU 58 ILE 59 PRO 60 GLU 61 GLU 62 TYR 63 LEU 64
Unit 4	DPN 1 PRO 2 ARG 3

Ligands

Unit 5	NAG 300
Unit 6	DOD 101 DOD 102 DOD 103 DOD 104 DOD 105 DOD 106 DOD 107 DOD 108 DOD 109 DOD 110
Unit 7	DOD 1001 DOD 1002 DOD 1003 DOD 1004 DOD 1005 DOD 1006 DOD 1007 DOD 1008 DOD 1009 DOD 1010 DOD 1011 DOD 1012 DOD 1013 DOD 1014 DOD 1015 DOD 1016 DOD 1017 DOD 1018 DOD 1019 DOD 1020 DOD 1021 DOD 1022 DOD 1023 DOD 1024 DOD 1025 DOD 1026 DOD 1027 DOD 1028 DOD 1029 DOD 1030 DOD 1031 DOD 1032 DOD 1033 DOD 1034 DOD 1035 DOD 1036 DOD 1037 DOD 1038 DOD 1039 DOD 1040 DOD 1041 DOD 1042 DOD 1043 DOD 1044 DOD 1045 DOD 1046 DOD 1047 DOD 1048 DOD 1049 DOD 1050 DOD 1051 DOD 1052 DOD 1053 DOD 1054 DOD 1055 DOD 1056 DOD 1057 DOD 1058 DOD 1059 DOD 1060 DOD 1061 DOD 1062 DOD 1063 DOD 1064 DOD 1065 DOD 1066 DOD 1067 DOD 1068 DOD 1069 DOD 1070 DOD 1071 DOD 1072 DOD 1073 DOD 1074 DOD 1075 DOD 1076 DOD 1077 DOD 1078 DOD 1079 DOD 1080 DOD 1081 DOD 1082 DOD 1083 DOD 1084 DOD 1085 DOD 1086 DOD 1087 DOD 1088 DOD 1089 DOD 1090 DOD 1091 DOD 1092 DOD 1093 DOD 1094 DOD 1095 DOD 1096 DOD 1097 DOD 1098 DOD 1099 DOD 1100 DOD 1101 DOD 1102 DOD 1103 DOD 1104 DOD 1105 DOD 1106 DOD 1107 DOD 1108 DOD 1109 DOD 1110 DOD 1111 DOD 1112 DOD 1113 DOD 1114 DOD 1115 DOD 1116 DOD 1117 DOD 1118 DOD 1119 DOD 1120 DOD 1121 DOD 1122 DOD 1123 DOD 1124 DOD 1125 DOD 1126 DOD 1127 DOD 1128 DOD 1129 DOD 1130 DOD 1131 DOD 1132 DOD 1133 DOD 1134 DOD 1135 DOD 1136 DOD 1137 DOD 1138 DOD 1139 DOD 1140 DOD 1141 DOD 1142 DOD 1143 DOD 1144
Unit 8	DOD 101 DOD 102
Unit 9	DOD 101 DOD 102