3VFH - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: BLAC E166A CDC-1 ACYL-INTERMEDIATE
• Keywords: BETA-LACTAMASE, SERINE HYDROLASE, SERINE ESTERASE, ACYL-INTE HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR COMPLEX
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	3VFH	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	BETA-LACTAMASE	A	265	1984	0
2	Protein	BETA-LACTAMASE	B	265	1984	0
3	Protein	BETA-LACTAMASE	C	265	1980	0
4	Protein	BETA-LACTAMASE	D	265	1980	0
5	Ligand	BETA-LACTAMASE	A	3	0	15
6	Ligand	BETA-LACTAMASE	B	2	0	28
7	Ligand	BETA-LACTAMASE	C	2	0	28
8	Ligand	BETA-LACTAMASE	D	2	0	10
9	Water			114	0	114
total				1183	7928	195

Proteins

Unit 1	ASP 29 LEU 30 ALA 31 ASP 32 ARG 33 PHE 34 ALA 35 GLU 36 LEU 37 GLU 38 ARG 39 ARG 40 TYR 41 ASP 42 ALA 43 ARG 44 LEU 45 GLY 46 VAL 47 TYR 48 VAL 49 PRO 50 ALA 51 THR 52 GLY 53 THR 54 THR 55 ALA 56 ALA 57 ILE 58 GLU 59 TYR 60 ARG 61 ALA 62 ASP 63 GLU 64 ARG 65 PHE 66 ALA 67 PHE 68 CYS 69 SER 70 THR 71 PHE 72 LYS 73 ALA 74 PRO 75 LEU 76 VAL 77 ALA 78 ALA 79 VAL 80 LEU 81 HIS 82 GLN 83 ASN 86 PRO 87 LEU 88 THR 89 HIS 90 LEU 91 ASP 92 LYS 93 LEU 94 ILE 95 THR 96 TYR 97 THR 98 SER 99 ASP 100 ASP 101 ILE 102 ARG 103 SER 104 ILE 105 SER 106 PRO 107 VAL 108 ALA 109 GLN 110 GLN 111 HIS 112 VAL 113 GLN 114 THR 115 GLY 116 MET 117 THR 118 ILE 119 GLY 120 GLN 121 LEU 122 CYS 123 ASP 124 ALA 125 ALA 126 ILE 127 ARG 128 TYR 129 SER 130 ASP 131 GLY 132 THR 133 ALA 134 ALA 135 ASN 136 LEU 137 LEU 138 LEU 139 ALA 140 ASP 141 LEU 142 GLY 143 GLY 144 PRO 145 GLY 145A GLY 145B GLY 145C THR 145D ALA 146 ALA 147 PHE 148 THR 149 GLY 150 TYR 151 LEU 152 ARG 153 SER 154 LEU 155 GLY 156 ASP 157 THR 158 VAL 159 SER 160 ARG 161 LEU 162 ASP 163 ALA 164 GLU 165 ALA 166 PRO 167 GLU 168 LEU 169 ASN 170 ARG 171 ASP 172 PRO 173 PRO 174 GLY 175 ASP 176 GLU 177 ARG 178 ASP 179 THR 180 THR 181 THR 182 PRO 183 HIS 184 ALA 185 ILE 186 ALA 187 LEU 188 VAL 189 LEU 190 GLN 191 GLN 192 LEU 193 VAL 194 LEU 195 GLY 196 ASN 197 ALA 198 LEU 199 PRO 200 PRO 201 ASP 202 LYS 203 ARG 204 ALA 205 LEU 206 LEU 207 THR 208 ASP 209 TRP 210 MET 211 ALA 212 ARG 213 ASN 214 THR 215 THR 216 GLY 217 ALA 218 LYS 219 ARG 220 ILE 221 ARG 222 ALA 223 GLY 224 PHE 225 PRO 226 ALA 227 ASP 228 TRP 229 LYS 230 VAL 231 ILE 232 ASP 233 LYS 234 THR 235 GLY 236 THR 237 GLY 238 ASP 240 TYR 241 GLY 242 ARG 243 ALA 244 ASN 245 ASP 246 ILE 247 ALA 248 VAL 249 VAL 250 TRP 251 SER 252 PRO 254 THR 255 GLY 256 VAL 257 PRO 258 TYR 259 VAL 260 VAL 261 ALA 262 VAL 263 MET 264 SER 265 ASP 266 ARG 267 ALA 268 GLY 269 GLY 270 GLY 271 TYR 272 ASP 273 ALA 274 GLU 275 PRO 276 ARG 277 GLU 278 ALA 279 LEU 280 LEU 281 ALA 282 GLU 283 ALA 284 ALA 285 THR 286 CYS 287 VAL 288 ALA 289 GLY 290 VAL 291 LEU 292 ALA 293
Unit 2	ASP 29 LEU 30 ALA 31 ASP 32 ARG 33 PHE 34 ALA 35 GLU 36 LEU 37 GLU 38 ARG 39 ARG 40 TYR 41 ASP 42 ALA 43 ARG 44 LEU 45 GLY 46 VAL 47 TYR 48 VAL 49 PRO 50 ALA 51 THR 52 GLY 53 THR 54 THR 55 ALA 56 ALA 57 ILE 58 GLU 59 TYR 60 ARG 61 ALA 62 ASP 63 GLU 64 ARG 65 PHE 66 ALA 67 PHE 68 CYS 69 SER 70 THR 71 PHE 72 LYS 73 ALA 74 PRO 75 LEU 76 VAL 77 ALA 78 ALA 79 VAL 80 LEU 81 HIS 82 GLN 83 ASN 86 PRO 87 LEU 88 THR 89 HIS 90 LEU 91 ASP 92 LYS 93 LEU 94 ILE 95 THR 96 TYR 97 THR 98 SER 99 ASP 100 ASP 101 ILE 102 ARG 103 SER 104 ILE 105 SER 106 PRO 107 VAL 108 ALA 109 GLN 110 GLN 111 HIS 112 VAL 113 GLN 114 THR 115 GLY 116 MET 117 THR 118 ILE 119 GLY 120 GLN 121 LEU 122 CYS 123 ASP 124 ALA 125 ALA 126 ILE 127 ARG 128 TYR 129 SER 130 ASP 131 GLY 132 THR 133 ALA 134 ALA 135 ASN 136 LEU 137 LEU 138 LEU 139 ALA 140 ASP 141 LEU 142 GLY 143 GLY 144 PRO 145 GLY 145A GLY 145B GLY 145C THR 145D ALA 146 ALA 147 PHE 148 THR 149 GLY 150 TYR 151 LEU 152 ARG 153 SER 154 LEU 155 GLY 156 ASP 157 THR 158 VAL 159 SER 160 ARG 161 LEU 162 ASP 163 ALA 164 GLU 165 ALA 166 PRO 167 GLU 168 LEU 169 ASN 170 ARG 171 ASP 172 PRO 173 PRO 174 GLY 175 ASP 176 GLU 177 ARG 178 ASP 179 THR 180 THR 181 THR 182 PRO 183 HIS 184 ALA 185 ILE 186 ALA 187 LEU 188 VAL 189 LEU 190 GLN 191 GLN 192 LEU 193 VAL 194 LEU 195 GLY 196 ASN 197 ALA 198 LEU 199 PRO 200 PRO 201 ASP 202 LYS 203 ARG 204 ALA 205 LEU 206 LEU 207 THR 208 ASP 209 TRP 210 MET 211 ALA 212 ARG 213 ASN 214 THR 215 THR 216 GLY 217 ALA 218 LYS 219 ARG 220 ILE 221 ARG 222 ALA 223 GLY 224 PHE 225 PRO 226 ALA 227 ASP 228 TRP 229 LYS 230 VAL 231 ILE 232 ASP 233 LYS 234 THR 235 GLY 236 THR 237 GLY 238 ASP 240 TYR 241 GLY 242 ARG 243 ALA 244 ASN 245 ASP 246 ILE 247 ALA 248 VAL 249 VAL 250 TRP 251 SER 252 PRO 254 THR 255 GLY 256 VAL 257 PRO 258 TYR 259 VAL 260 VAL 261 ALA 262 VAL 263 MET 264 SER 265 ASP 266 ARG 267 ALA 268 GLY 269 GLY 270 GLY 271 TYR 272 ASP 273 ALA 274 GLU 275 PRO 276 ARG 277 GLU 278 ALA 279 LEU 280 LEU 281 ALA 282 GLU 283 ALA 284 ALA 285 THR 286 CYS 287 VAL 288 ALA 289 GLY 290 VAL 291 LEU 292 ALA 293
Unit 3	ASP 29 LEU 30 ALA 31 ASP 32 ARG 33 PHE 34 ALA 35 GLU 36 LEU 37 GLU 38 ARG 39 ARG 40 TYR 41 ASP 42 ALA 43 ARG 44 LEU 45 GLY 46 VAL 47 TYR 48 VAL 49 PRO 50 ALA 51 THR 52 GLY 53 THR 54 THR 55 ALA 56 ALA 57 ILE 58 GLU 59 TYR 60 ARG 61 ALA 62 ASP 63 GLU 64 ARG 65 PHE 66 ALA 67 PHE 68 CYS 69 SER 70 THR 71 PHE 72 LYS 73 ALA 74 PRO 75 LEU 76 VAL 77 ALA 78 ALA 79 VAL 80 LEU 81 HIS 82 GLN 83 ASN 86 PRO 87 LEU 88 THR 89 HIS 90 LEU 91 ASP 92 LYS 93 LEU 94 ILE 95 THR 96 TYR 97 THR 98 SER 99 ASP 100 ASP 101 ILE 102 ARG 103 SER 104 ILE 105 SER 106 PRO 107 VAL 108 ALA 109 GLN 110 GLN 111 HIS 112 VAL 113 GLN 114 THR 115 GLY 116 MET 117 THR 118 ILE 119 GLY 120 GLN 121 LEU 122 CYS 123 ASP 124 ALA 125 ALA 126 ILE 127 ARG 128 TYR 129 SER 130 ASP 131 GLY 132 THR 133 ALA 134 ALA 135 ASN 136 LEU 137 LEU 138 LEU 139 ALA 140 ASP 141 LEU 142 GLY 143 GLY 144 PRO 145 GLY 145A GLY 145B GLY 145C THR 145D ALA 146 ALA 147 PHE 148 THR 149 GLY 150 TYR 151 LEU 152 ARG 153 SER 154 LEU 155 GLY 156 ASP 157 THR 158 VAL 159 SER 160 ARG 161 LEU 162 ASP 163 ALA 164 GLU 165 ALA 166 PRO 167 GLU 168 LEU 169 ASN 170 ARG 171 ASP 172 PRO 173 PRO 174 GLY 175 ASP 176 GLU 177 ARG 178 ASP 179 THR 180 THR 181 THR 182 PRO 183 HIS 184 ALA 185 ILE 186 ALA 187 LEU 188 VAL 189 LEU 190 GLN 191 GLN 192 LEU 193 VAL 194 LEU 195 GLY 196 ASN 197 ALA 198 LEU 199 PRO 200 PRO 201 ASP 202 LYS 203 ARG 204 ALA 205 LEU 206 LEU 207 THR 208 ASP 209 TRP 210 MET 211 ALA 212 ARG 213 ASN 214 THR 215 THR 216 GLY 217 ALA 218 LYS 219 ARG 220 ILE 221 ARG 222 ALA 223 GLY 224 PHE 225 PRO 226 ALA 227 ASP 228 TRP 229 LYS 230 VAL 231 ILE 232 ASP 233 LYS 234 THR 235 GLY 236 THR 237 GLY 238 ASP 240 TYR 241 GLY 242 ARG 243 ALA 244 ASN 245 ASP 246 ILE 247 ALA 248 VAL 249 VAL 250 TRP 251 SER 252 PRO 254 THR 255 GLY 256 VAL 257 PRO 258 TYR 259 VAL 260 VAL 261 ALA 262 VAL 263 MET 264 SER 265 ASP 266 ARG 267 ALA 268 GLY 269 GLY 270 GLY 271 TYR 272 ASP 273 ALA 274 GLU 275 PRO 276 ARG 277 GLU 278 ALA 279 LEU 280 LEU 281 ALA 282 GLU 283 ALA 284 ALA 285 THR 286 CYS 287 VAL 288 ALA 289 GLY 290 VAL 291 LEU 292 ALA 293
Unit 4	ASP 29 LEU 30 ALA 31 ASP 32 ARG 33 PHE 34 ALA 35 GLU 36 LEU 37 GLU 38 ARG 39 ARG 40 TYR 41 ASP 42 ALA 43 ARG 44 LEU 45 GLY 46 VAL 47 TYR 48 VAL 49 PRO 50 ALA 51 THR 52 GLY 53 THR 54 THR 55 ALA 56 ALA 57 ILE 58 GLU 59 TYR 60 ARG 61 ALA 62 ASP 63 GLU 64 ARG 65 PHE 66 ALA 67 PHE 68 CYS 69 SER 70 THR 71 PHE 72 LYS 73 ALA 74 PRO 75 LEU 76 VAL 77 ALA 78 ALA 79 VAL 80 LEU 81 HIS 82 GLN 83 ASN 86 PRO 87 LEU 88 THR 89 HIS 90 LEU 91 ASP 92 LYS 93 LEU 94 ILE 95 THR 96 TYR 97 THR 98 SER 99 ASP 100 ASP 101 ILE 102 ARG 103 SER 104 ILE 105 SER 106 PRO 107 VAL 108 ALA 109 GLN 110 GLN 111 HIS 112 VAL 113 GLN 114 THR 115 GLY 116 MET 117 THR 118 ILE 119 GLY 120 GLN 121 LEU 122 CYS 123 ASP 124 ALA 125 ALA 126 ILE 127 ARG 128 TYR 129 SER 130 ASP 131 GLY 132 THR 133 ALA 134 ALA 135 ASN 136 LEU 137 LEU 138 LEU 139 ALA 140 ASP 141 LEU 142 GLY 143 GLY 144 PRO 145 GLY 145A GLY 145B GLY 145C THR 145D ALA 146 ALA 147 PHE 148 THR 149 GLY 150 TYR 151 LEU 152 ARG 153 SER 154 LEU 155 GLY 156 ASP 157 THR 158 VAL 159 SER 160 ARG 161 LEU 162 ASP 163 ALA 164 GLU 165 ALA 166 PRO 167 GLU 168 LEU 169 ASN 170 ARG 171 ASP 172 PRO 173 PRO 174 GLY 175 ASP 176 GLU 177 ARG 178 ASP 179 THR 180 THR 181 THR 182 PRO 183 HIS 184 ALA 185 ILE 186 ALA 187 LEU 188 VAL 189 LEU 190 GLN 191 GLN 192 LEU 193 VAL 194 LEU 195 GLY 196 ASN 197 ALA 198 LEU 199 PRO 200 PRO 201 ASP 202 LYS 203 ARG 204 ALA 205 LEU 206 LEU 207 THR 208 ASP 209 TRP 210 MET 211 ALA 212 ARG 213 ASN 214 THR 215 THR 216 GLY 217 ALA 218 LYS 219 ARG 220 ILE 221 ARG 222 ALA 223 GLY 224 PHE 225 PRO 226 ALA 227 ASP 228 TRP 229 LYS 230 VAL 231 ILE 232 ASP 233 LYS 234 THR 235 GLY 236 THR 237 GLY 238 ASP 240 TYR 241 GLY 242 ARG 243 ALA 244 ASN 245 ASP 246 ILE 247 ALA 248 VAL 249 VAL 250 TRP 251 SER 252 PRO 254 THR 255 GLY 256 VAL 257 PRO 258 TYR 259 VAL 260 VAL 261 ALA 262 VAL 263 MET 264 SER 265 ASP 266 ARG 267 ALA 268 GLY 269 GLY 270 GLY 271 TYR 272 ASP 273 ALA 274 GLU 275 PRO 276 ARG 277 GLU 278 ALA 279 LEU 280 LEU 281 ALA 282 GLU 283 ALA 284 ALA 285 THR 286 CYS 287 VAL 288 ALA 289 GLY 290 VAL 291 LEU 292 ALA 293

Ligands

Unit 5	PO4 301 PO4 302 PO4 303
Unit 6	CD6 301 PO4 302
Unit 7	CD6 301 PO4 302
Unit 8	PO4 301 PO4 302