3TOY - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF ENOLASE BRADO_4202 (TARGET EFI-501651) BRADYRHIZOBIUM SP. ORS278 WITH CALCIUM AND ACETATE BOUND
• Keywords: ENOLASE, MAGNESIUM BINDING SITE, LYASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	3TOY	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	MANDELATE RACEMASE/MUCONATE LACTONIZING ENZYME FA PROTEIN	A	359	2682	0
2	Protein	MANDELATE RACEMASE/MUCONATE LACTONIZING ENZYME FA PROTEIN	B	359	2698	0
3	Protein	MANDELATE RACEMASE/MUCONATE LACTONIZING ENZYME FA PROTEIN	C	359	2694	0
4	Protein	MANDELATE RACEMASE/MUCONATE LACTONIZING ENZYME FA PROTEIN	D	359	2698	0
5	Ligand	MANDELATE RACEMASE/MUCONATE LACTONIZING ENZYME FA PROTEIN	A	5	0	23
6	Ligand	MANDELATE RACEMASE/MUCONATE LACTONIZING ENZYME FA PROTEIN	B	6	0	51
7	Ligand	MANDELATE RACEMASE/MUCONATE LACTONIZING ENZYME FA PROTEIN	C	5	0	50
8	Ligand	MANDELATE RACEMASE/MUCONATE LACTONIZING ENZYME FA PROTEIN	D	5	0	23
9	Water			1397	0	1397
total				2854	10772	1544

Proteins

Unit 1	THR 2 THR 3 ALA 4 ALA 5 ILE 6 THR 7 GLY 8 VAL 9 THR 10 ALA 11 ARG 12 ALA 13 VAL 14 ILE 15 THR 16 PRO 17 MET 18 LYS 19 ARG 20 PRO 21 LEU 22 ARG 23 ASN 24 ALA 25 PHE 26 GLY 27 VAL 28 ILE 29 ASP 30 SER 31 GLY 32 PRO 33 LEU 34 VAL 35 LEU 36 ILE 37 ASP 38 VAL 39 THR 40 THR 41 ASP 42 GLN 43 GLY 44 VAL 45 THR 46 GLY 47 HIS 48 SER 49 TYR 50 LEU 51 PHE 52 ALA 53 TYR 54 THR 55 ARG 56 LEU 57 ALA 58 LEU 59 LYS 60 PRO 61 LEU 62 VAL 63 HIS 64 LEU 65 VAL 66 GLU 67 ASP 68 ILE 69 GLY 70 ARG 71 GLU 72 LEU 73 ALA 74 GLY 75 LYS 76 ALA 77 LEU 78 VAL 79 PRO 80 VAL 81 ASP 82 LEU 83 MET 84 LYS 85 ALA 86 MET 87 ASP 88 ALA 89 LYS 90 PHE 91 ARG 92 LEU 93 LEU 94 GLY 95 TRP 96 GLN 97 GLY 98 LEU 99 VAL 100 GLY 101 MET 102 ALA 103 VAL 104 SER 105 GLY 106 LEU 107 ASP 108 MET 109 ALA 110 PHE 111 TRP 112 ASP 113 ALA 114 LEU 115 GLY 116 GLN 117 LEU 118 ALA 119 GLY 120 LYS 121 PRO 122 VAL 123 VAL 124 GLU 125 LEU 126 LEU 127 GLY 128 GLY 129 SER 130 ALA 131 ARG 132 PRO 133 ILE 134 PRO 135 ALA 136 TYR 137 ASP 138 SER 139 TYR 140 GLY 141 VAL 142 LEU 143 ASP 144 ALA 145 ARG 146 ASP 147 ASP 148 GLU 149 ARG 150 THR 151 LEU 152 ARG 153 THR 154 ALA 155 CYS 156 ASP 157 GLU 158 HIS 159 GLY 160 PHE 161 ARG 162 ALA 163 ILE 164 LYS 165 SER 166 LYS 167 GLY 168 GLY 169 HIS 170 GLY 171 ASP 172 LEU 173 ALA 174 THR 175 ASP 176 GLU 177 ALA 178 MET 179 ILE 180 LYS 181 GLY 182 LEU 183 ARG 184 ALA 185 LEU 186 LEU 187 GLY 188 PRO 189 ASP 190 ILE 191 ALA 192 LEU 193 MET 194 LEU 195 ASP 196 PHE 197 ASN 198 GLN 199 SER 200 LEU 201 ASP 202 PRO 203 ALA 204 GLU 205 ALA 206 THR 207 ARG 208 ARG 209 ILE 210 ALA 211 ARG 212 LEU 213 ALA 214 ASP 215 TYR 216 ASP 217 LEU 218 THR 219 TRP 220 ILE 221 GLU 222 GLU 223 PRO 224 VAL 225 PRO 226 GLN 227 GLU 228 ASN 229 LEU 230 SER 231 GLY 232 HIS 233 ALA 234 ALA 235 VAL 236 ARG 237 GLU 238 ARG 239 SER 240 GLU 241 ILE 242 PRO 243 ILE 244 GLN 245 ALA 246 GLY 247 GLU 248 ASN 249 TRP 250 TRP 251 PHE 252 PRO 253 ARG 254 GLY 255 PHE 256 ALA 257 GLU 258 ALA 259 ILE 260 ALA 261 ALA 262 GLY 263 ALA 264 SER 265 ASP 266 PHE 267 ILE 268 MET 269 PRO 270 ASP 271 LEU 272 MET 273 LYS 274 VAL 275 GLY 276 GLY 277 ILE 278 THR 279 GLY 280 TRP 281 LEU 282 ASN 283 VAL 284 ALA 285 GLY 286 GLN 287 ALA 288 ASP 289 ALA 290 ALA 291 SER 292 ILE 293 PRO 294 MET 295 SER 296 SER 297 HIS 298 ILE 299 LEU 300 PRO 301 GLU 302 ALA 303 SER 304 ALA 305 HIS 306 VAL 307 LEU 308 PRO 309 VAL 310 THR 311 PRO 312 THR 313 ALA 314 HIS 315 PHE 316 LEU 317 GLU 318 VAL 319 LEU 320 ASP 321 PHE 322 ALA 323 GLY 324 ALA 325 ILE 326 LEU 327 THR 328 GLU 329 PRO 330 LEU 331 ARG 332 VAL 333 ILE 334 ASP 335 GLY 336 LYS 337 VAL 338 THR 339 ALA 340 LYS 341 GLY 342 PRO 343 GLY 344 LEU 345 GLY 346 LEU 347 ALA 348 TRP 349 ASN 350 GLU 351 SER 352 ALA 353 VAL 354 ALA 355 LYS 356 TYR 357 GLN 358 VAL 359 THR 360
Unit 2	THR 2 THR 3 ALA 4 ALA 5 ILE 6 THR 7 GLY 8 VAL 9 THR 10 ALA 11 ARG 12 ALA 13 VAL 14 ILE 15 THR 16 PRO 17 MET 18 LYS 19 ARG 20 PRO 21 LEU 22 ARG 23 ASN 24 ALA 25 PHE 26 GLY 27 VAL 28 ILE 29 ASP 30 SER 31 GLY 32 PRO 33 LEU 34 VAL 35 LEU 36 ILE 37 ASP 38 VAL 39 THR 40 THR 41 ASP 42 GLN 43 GLY 44 VAL 45 THR 46 GLY 47 HIS 48 SER 49 TYR 50 LEU 51 PHE 52 ALA 53 TYR 54 THR 55 ARG 56 LEU 57 ALA 58 LEU 59 LYS 60 PRO 61 LEU 62 VAL 63 HIS 64 LEU 65 VAL 66 GLU 67 ASP 68 ILE 69 GLY 70 ARG 71 GLU 72 LEU 73 ALA 74 GLY 75 LYS 76 ALA 77 LEU 78 VAL 79 PRO 80 VAL 81 ASP 82 LEU 83 MET 84 LYS 85 ALA 86 MET 87 ASP 88 ALA 89 LYS 90 PHE 91 ARG 92 LEU 93 LEU 94 GLY 95 TRP 96 GLN 97 GLY 98 LEU 99 VAL 100 GLY 101 MET 102 ALA 103 VAL 104 SER 105 GLY 106 LEU 107 ASP 108 MET 109 ALA 110 PHE 111 TRP 112 ASP 113 ALA 114 LEU 115 GLY 116 GLN 117 LEU 118 ALA 119 GLY 120 LYS 121 PRO 122 VAL 123 VAL 124 GLU 125 LEU 126 LEU 127 GLY 128 GLY 129 SER 130 ALA 131 ARG 132 PRO 133 ILE 134 PRO 135 ALA 136 TYR 137 ASP 138 SER 139 TYR 140 GLY 141 VAL 142 LEU 143 ASP 144 ALA 145 ARG 146 ASP 147 ASP 148 GLU 149 ARG 150 THR 151 LEU 152 ARG 153 THR 154 ALA 155 CYS 156 ASP 157 GLU 158 HIS 159 GLY 160 PHE 161 ARG 162 ALA 163 ILE 164 LYS 165 SER 166 LYS 167 GLY 168 GLY 169 HIS 170 GLY 171 ASP 172 LEU 173 ALA 174 THR 175 ASP 176 GLU 177 ALA 178 MET 179 ILE 180 LYS 181 GLY 182 LEU 183 ARG 184 ALA 185 LEU 186 LEU 187 GLY 188 PRO 189 ASP 190 ILE 191 ALA 192 LEU 193 MET 194 LEU 195 ASP 196 PHE 197 ASN 198 GLN 199 SER 200 LEU 201 ASP 202 PRO 203 ALA 204 GLU 205 ALA 206 THR 207 ARG 208 ARG 209 ILE 210 ALA 211 ARG 212 LEU 213 ALA 214 ASP 215 TYR 216 ASP 217 LEU 218 THR 219 TRP 220 ILE 221 GLU 222 GLU 223 PRO 224 VAL 225 PRO 226 GLN 227 GLU 228 ASN 229 LEU 230 SER 231 GLY 232 HIS 233 ALA 234 ALA 235 VAL 236 ARG 237 GLU 238 ARG 239 SER 240 GLU 241 ILE 242 PRO 243 ILE 244 GLN 245 ALA 246 GLY 247 GLU 248 ASN 249 TRP 250 TRP 251 PHE 252 PRO 253 ARG 254 GLY 255 PHE 256 ALA 257 GLU 258 ALA 259 ILE 260 ALA 261 ALA 262 GLY 263 ALA 264 SER 265 ASP 266 PHE 267 ILE 268 MET 269 PRO 270 ASP 271 LEU 272 MET 273 LYS 274 VAL 275 GLY 276 GLY 277 ILE 278 THR 279 GLY 280 TRP 281 LEU 282 ASN 283 VAL 284 ALA 285 GLY 286 GLN 287 ALA 288 ASP 289 ALA 290 ALA 291 SER 292 ILE 293 PRO 294 MET 295 SER 296 SER 297 HIS 298 ILE 299 LEU 300 PRO 301 GLU 302 ALA 303 SER 304 ALA 305 HIS 306 VAL 307 LEU 308 PRO 309 VAL 310 THR 311 PRO 312 THR 313 ALA 314 HIS 315 PHE 316 LEU 317 GLU 318 VAL 319 LEU 320 ASP 321 PHE 322 ALA 323 GLY 324 ALA 325 ILE 326 LEU 327 THR 328 GLU 329 PRO 330 LEU 331 ARG 332 VAL 333 ILE 334 ASP 335 GLY 336 LYS 337 VAL 338 THR 339 ALA 340 LYS 341 GLY 342 PRO 343 GLY 344 LEU 345 GLY 346 LEU 347 ALA 348 TRP 349 ASN 350 GLU 351 SER 352 ALA 353 VAL 354 ALA 355 LYS 356 TYR 357 GLN 358 VAL 359 THR 360
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Unit 4	THR 2 THR 3 ALA 4 ALA 5 ILE 6 THR 7 GLY 8 VAL 9 THR 10 ALA 11 ARG 12 ALA 13 VAL 14 ILE 15 THR 16 PRO 17 MET 18 LYS 19 ARG 20 PRO 21 LEU 22 ARG 23 ASN 24 ALA 25 PHE 26 GLY 27 VAL 28 ILE 29 ASP 30 SER 31 GLY 32 PRO 33 LEU 34 VAL 35 LEU 36 ILE 37 ASP 38 VAL 39 THR 40 THR 41 ASP 42 GLN 43 GLY 44 VAL 45 THR 46 GLY 47 HIS 48 SER 49 TYR 50 LEU 51 PHE 52 ALA 53 TYR 54 THR 55 ARG 56 LEU 57 ALA 58 LEU 59 LYS 60 PRO 61 LEU 62 VAL 63 HIS 64 LEU 65 VAL 66 GLU 67 ASP 68 ILE 69 GLY 70 ARG 71 GLU 72 LEU 73 ALA 74 GLY 75 LYS 76 ALA 77 LEU 78 VAL 79 PRO 80 VAL 81 ASP 82 LEU 83 MET 84 LYS 85 ALA 86 MET 87 ASP 88 ALA 89 LYS 90 PHE 91 ARG 92 LEU 93 LEU 94 GLY 95 TRP 96 GLN 97 GLY 98 LEU 99 VAL 100 GLY 101 MET 102 ALA 103 VAL 104 SER 105 GLY 106 LEU 107 ASP 108 MET 109 ALA 110 PHE 111 TRP 112 ASP 113 ALA 114 LEU 115 GLY 116 GLN 117 LEU 118 ALA 119 GLY 120 LYS 121 PRO 122 VAL 123 VAL 124 GLU 125 LEU 126 LEU 127 GLY 128 GLY 129 SER 130 ALA 131 ARG 132 PRO 133 ILE 134 PRO 135 ALA 136 TYR 137 ASP 138 SER 139 TYR 140 GLY 141 VAL 142 LEU 143 ASP 144 ALA 145 ARG 146 ASP 147 ASP 148 GLU 149 ARG 150 THR 151 LEU 152 ARG 153 THR 154 ALA 155 CYS 156 ASP 157 GLU 158 HIS 159 GLY 160 PHE 161 ARG 162 ALA 163 ILE 164 LYS 165 SER 166 LYS 167 GLY 168 GLY 169 HIS 170 GLY 171 ASP 172 LEU 173 ALA 174 THR 175 ASP 176 GLU 177 ALA 178 MET 179 ILE 180 LYS 181 GLY 182 LEU 183 ARG 184 ALA 185 LEU 186 LEU 187 GLY 188 PRO 189 ASP 190 ILE 191 ALA 192 LEU 193 MET 194 LEU 195 ASP 196 PHE 197 ASN 198 GLN 199 SER 200 LEU 201 ASP 202 PRO 203 ALA 204 GLU 205 ALA 206 THR 207 ARG 208 ARG 209 ILE 210 ALA 211 ARG 212 LEU 213 ALA 214 ASP 215 TYR 216 ASP 217 LEU 218 THR 219 TRP 220 ILE 221 GLU 222 GLU 223 PRO 224 VAL 225 PRO 226 GLN 227 GLU 228 ASN 229 LEU 230 SER 231 GLY 232 HIS 233 ALA 234 ALA 235 VAL 236 ARG 237 GLU 238 ARG 239 SER 240 GLU 241 ILE 242 PRO 243 ILE 244 GLN 245 ALA 246 GLY 247 GLU 248 ASN 249 TRP 250 TRP 251 PHE 252 PRO 253 ARG 254 GLY 255 PHE 256 ALA 257 GLU 258 ALA 259 ILE 260 ALA 261 ALA 262 GLY 263 ALA 264 SER 265 ASP 266 PHE 267 ILE 268 MET 269 PRO 270 ASP 271 LEU 272 MET 273 LYS 274 VAL 275 GLY 276 GLY 277 ILE 278 THR 279 GLY 280 TRP 281 LEU 282 ASN 283 VAL 284 ALA 285 GLY 286 GLN 287 ALA 288 ASP 289 ALA 290 ALA 291 SER 292 ILE 293 PRO 294 MET 295 SER 296 SER 297 HIS 298 ILE 299 LEU 300 PRO 301 GLU 302 ALA 303 SER 304 ALA 305 HIS 306 VAL 307 LEU 308 PRO 309 VAL 310 THR 311 PRO 312 THR 313 ALA 314 HIS 315 PHE 316 LEU 317 GLU 318 VAL 319 LEU 320 ASP 321 PHE 322 ALA 323 GLY 324 ALA 325 ILE 326 LEU 327 THR 328 GLU 329 PRO 330 LEU 331 ARG 332 VAL 333 ILE 334 ASP 335 GLY 336 LYS 337 VAL 338 THR 339 ALA 340 LYS 341 GLY 342 PRO 343 GLY 344 LEU 345 GLY 346 LEU 347 ALA 348 TRP 349 ASN 350 GLU 351 SER 352 ALA 353 VAL 354 ALA 355 LYS 356 TYR 357 GLN 358 VAL 359 THR 360

Ligands

Unit 5	CA 361 ACT 362 NI 363 P4C 364 CA 365
Unit 6	CA 361 ACT 362 NI 363 P4C 364 P4C 365 CA 366
Unit 7	CA 361 ACT 362 P4C 363 P4C 364 CA 365
Unit 8	CA 361 ACT 362 NI 363 P4C 364 CA 365