Jena Library of Biological Macromolecules - Home Page [Image Library Home] [Image Library Entry]

Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

Title AIIFL SEGMENT DERIVED FROM ALZHEIMER'S AMYLOID-BETA DISPLAYE MEMBERED MACROCYCLE SCAFFOLD
Keywords BETA SHEET TETRAMER, MACROCYCLIC PEPTIDE, BETA-SHEET MIMIC, LIKE OLIGOMER, PROTEIN FIBRIL
Experiment X-ray diffraction
Number of Models  1

   Database       ID code    StatusCoordinate files
        Header     Asymmetric unit     Biological unit  
PDB   3Q9J     released     available     available     Quaternary Structure Server  
Asymmetric unit from PDB
 Unit     Type     Name   Chain ID   Residues   Atoms   Hetatoms 
1  Protein   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE AIIFL(ORN)(HAO)YK(ORN)  A 10 61 33
2  Protein   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE AIIFL(ORN)(HAO)YK(ORN)  B 10 61 33
3  Protein   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE AIIFL(ORN)(HAO)YK(ORN)  C 10 61 33
4  Protein   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE AIIFL(ORN)(HAO)YK(ORN)  D 10 61 33
5  Protein   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE AIIFL(ORN)(HAO)YK(ORN)  E 10 61 33
6  Protein   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE AIIFL(ORN)(HAO)YK(ORN)  F 10 61 33
7  Protein   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE AIIFL(ORN)(HAO)YK(ORN)  G 10 61 33
8  Protein   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE AIIFL(ORN)(HAO)YK(ORN)  H 10 61 33
9  Ligand   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE AIIFL(ORN)(HAO)YK(ORN)  A 2 0 2
10  Ligand   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE AIIFL(ORN)(HAO)YK(ORN)  B 3 0 8
11  Ligand   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE AIIFL(ORN)(HAO)YK(ORN)  C 1 0 1
12  Ligand   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE AIIFL(ORN)(HAO)YK(ORN)  D 1 0 1
13  Ligand   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE AIIFL(ORN)(HAO)YK(ORN)  E 3 0 3
14  Ligand   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE AIIFL(ORN)(HAO)YK(ORN)  F 3 0 3
15  Ligand   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE AIIFL(ORN)(HAO)YK(ORN)  G 1 0 6
16  Ligand   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE AIIFL(ORN)(HAO)YK(ORN)  H 1 0 6
17 Water     18 0 18
total       113 488 312
Proteins
Unit 1 ALA1 ILE2 ILE3 PHE4 LEU5 ORN6 HAO7 TYR8 LYS9 ORN10
Unit 2 ALA1 ILE2 ILE3 PHE4 LEU5 ORN6 HAO7 TYR8 LYS9 ORN10
Unit 3 ALA1 ILE2 ILE3 PHE4 LEU5 ORN6 HAO7 TYR8 LYS9 ORN10
Unit 4 ALA1 ILE2 ILE3 PHE4 LEU5 ORN6 HAO7 TYR8 LYS9 ORN10
Unit 5 ALA1 ILE2 ILE3 PHE4 LEU5 ORN6 HAO7 TYR8 LYS9 ORN10
Unit 6 ALA1 ILE2 ILE3 PHE4 LEU5 ORN6 HAO7 TYR8 LYS9 ORN10
Unit 7 ALA1 ILE2 ILE3 PHE4 LEU5 ORN6 HAO7 TYR8 LYS9 ORN10
Unit 8 ALA1 ILE2 ILE3 PHE4 LEU5 ORN6 HAO7 TYR8 LYS9 ORN10
Ligands
Unit 9 ZN12 ZN18
Unit 10 GOL11 ZN13 ZN14
Unit 11 CL11
Unit 12 CL11
Unit 13 CL11 ZN15 ZN19
Unit 14 CL11 ZN16 ZN17
Unit 15 GOL11
Unit 16 GOL11
Go to    [Image Library Home]    [Image Library Entry]
Perl script:    PDBscan.pl  (15 Sep 2016)
Author:    Peter Slickers  (slickers@leibniz-fli.de),  IMB Jena,  Germany