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Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

Title LVFFA SEGMENT FROM ALZHEIMER'S AMYLOID-BETA DISPLAYED ON 42- MACROCYCLE SCAFFOLD
Keywords BETA SHEET TETRAMER, MACROCYCLIC PEPTIDE, BETA-SHEET MIMETIC FIBRIL
Experiment X-ray diffraction
Number of Models  1

   Database       ID code    StatusCoordinate files
        Header     Asymmetric unit     Biological unit  
PDB   3Q9H     released     available     available     Quaternary Structure Server  
Asymmetric unit from PDB
 Unit     Type     Name   Chain ID   Residues   Atoms   Hetatoms 
1  Protein   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE LVFFA(ORN)(HAO)LK(ORN)  A 10 59 33
2  Protein   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE LVFFA(ORN)(HAO)LK(ORN)  B 10 59 33
3  Protein   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE LVFFA(ORN)(HAO)LK(ORN)  C 10 59 33
4  Protein   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE LVFFA(ORN)(HAO)LK(ORN)  D 10 59 33
5  Protein   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE LVFFA(ORN)(HAO)LK(ORN)  E 10 59 33
6  Protein   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE LVFFA(ORN)(HAO)LK(ORN)  F 10 59 33
7  Protein   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE LVFFA(ORN)(HAO)LK(ORN)  G 10 59 33
8  Protein   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE LVFFA(ORN)(HAO)LK(ORN)  H 10 59 33
9  Ligand   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE LVFFA(ORN)(HAO)LK(ORN)  A 1 0 5
10  Ligand   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE LVFFA(ORN)(HAO)LK(ORN)  B 3 0 18
11  Ligand   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE LVFFA(ORN)(HAO)LK(ORN)  C 2 0 12
12  Ligand   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE LVFFA(ORN)(HAO)LK(ORN)  D 1 0 6
13  Ligand   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE LVFFA(ORN)(HAO)LK(ORN)  E 3 0 16
14  Ligand   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE LVFFA(ORN)(HAO)LK(ORN)  F 2 0 12
15  Ligand   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE LVFFA(ORN)(HAO)LK(ORN)  G 4 0 23
16  Ligand   CYCLIC PSEUDO-PEPTIDE LVFFA(ORN)(HAO)LK(ORN)  H 6 0 34
17 Water     30 0 30
total       132 472 420
Proteins
Unit 1 LEU1 VAL2 PHE3 PHE4 ALA5 ORN6 HAO7 LEU8 LYS9 ORN10
Unit 2 LEU1 VAL2 PHE3 PHE4 ALA5 ORN6 HAO7 LEU8 LYS9 ORN10
Unit 3 LEU1 VAL2 PHE3 PHE4 ALA5 ORN6 HAO7 LEU8 LYS9 ORN10
Unit 4 LEU1 VAL2 PHE3 PHE4 ALA5 ORN6 HAO7 LEU8 LYS9 ORN10
Unit 5 LEU1 VAL2 PHE3 PHE4 ALA5 ORN6 HAO7 LEU8 LYS9 ORN10
Unit 6 LEU1 VAL2 PHE3 PHE4 ALA5 ORN6 HAO7 LEU8 LYS9 ORN10
Unit 7 LEU1 VAL2 PHE3 PHE4 ALA5 ORN6 HAO7 LEU8 LYS9 ORN10
Unit 8 LEU1 VAL2 PHE3 PHE4 ALA5 ORN6 HAO7 LEU8 LYS9 ORN10
Ligands
Unit 9 SO411
Unit 10 GOL11 BU112 GOL23
Unit 11 BU118 GOL22
Unit 12 GOL11
Unit 13 SO411 SO412 BU116
Unit 14 BU113 BU117
Unit 15 SO411 BU112 BU114 BU119
Unit 16 SO411 SO412 BU113 BU115 BU120 GOL21
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Perl script:    PDBscan.pl  (15 Sep 2016)
Author:    Peter Slickers  (slickers@leibniz-fli.de),  IMB Jena,  Germany