3OXD - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF GLYCINE RIBOSWITCH WITH TWO MUTATIONS
• Keywords: GENE EXPRESSION REGULATOR, GLYCINE RIBOSWITCH, RNA
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	3OXD	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	RNA		A	88	1855	51
2	RNA		B	87	1856	23
3	Ligand	DOMAIN II OF GLYCINE RIBOSWITCH	A	4	0	4
4	Ligand	DOMAIN II OF GLYCINE RIBOSWITCH	B	1	0	1
5	Ligand	DOMAIN II OF GLYCINE RIBOSWITCH	A	4	0	4
6	Ligand	DOMAIN II OF GLYCINE RIBOSWITCH	B	4	0	4
7	Ligand	DOMAIN II OF GLYCINE RIBOSWITCH	A	2	0	2
8	Ligand	DOMAIN II OF GLYCINE RIBOSWITCH	B	1	0	1
9	Ligand	DOMAIN II OF GLYCINE RIBOSWITCH	A	1	0	1
10	Ligand	DOMAIN II OF GLYCINE RIBOSWITCH	B	1	0	1
11	Ligand	DOMAIN II OF GLYCINE RIBOSWITCH	A	6	0	6
12	Ligand	DOMAIN II OF GLYCINE RIBOSWITCH	B	2	0	2
13	Ligand	DOMAIN II OF GLYCINE RIBOSWITCH	A	1	0	1
14	Ligand	DOMAIN II OF GLYCINE RIBOSWITCH	B	6	0	6
15	Ligand	DOMAIN II OF GLYCINE RIBOSWITCH	A	1	0	1
16	Water			70	0	70
total				279	3711	178

Nucleic acids

Unit 1

GDP 1 G 2 C 3 U 4 C 5 U 6 G 7 G 8 A 9 G 10 A 11 G 12 A 13 A 14 C 15 C 16 G 17 U 18 U 19 U 20 A 21 A 22 U 23 C 24 G 25 G 26 U 27 C 28 G 29 C 30 C 31 G 32 A 33 A 34 C 35 G 36 A 37 G 38 C 39 A 40 A 41 G 42 C 43 U 44 C 45 U 46 G 47 C 48 G 49 G 50 A 51 A 52 A 53 C 54 G 55 C 56 A 57 G 58 A 59 G 60 U 61 G 62 A 63 A 64 A 65 C 66 U 67 C 68 U 69 G 70 A 71 G 72 G 73 C 74 A 75 A 76 A 77 A 78 G 79 G 80 A 81 C 82 A 83 G 84 A 85 G 86 U 87 CCC 88

Unit 2

G 1 G 2 C 3 U 4 C 5 U 6 G 7 G 8 A 9 G 10 A 11 G 12 A 13 A 14 C 15 C 16 G 17 U 18 U 19 U 20 A 21 U 23 C 24 G 25 G 26 U 27 C 28 G 29 C 30 C 31 G 32 A 33 A 34 C 35 G 36 A 37 G 38 C 39 A 40 A 41 G 42 C 43 U 44 C 45 U 46 G 47 C 48 G 49 G 50 A 51 A 52 A 53 C 54 G 55 C 56 A 57 G 58 A 59 G 60 U 61 G 62 A 63 A 64 A 65 C 66 U 67 C 68 U 69 G 70 A 71 G 72 G 73 C 74 A 75 A 76 A 77 A 78 G 79 G 80 A 81 C 82 A 83 G 84 A 85 G 86 U 87 CCC 88

Ligands

Unit 3	MG 101 MG 103 MG 104 MG 105
Unit 4	MG 106
Unit 5	MG 109 MG 110 MG 111 MG 112
Unit 6	MG 113 MG 114 MG 115 MG 116
Unit 7	MG 117 MG 118
Unit 8	MG 119
Unit 9	MG 120
Unit 10	MG 121
Unit 11	MG 122 MG 123 MG 124 MG 125 MG 126 MG 127
Unit 12	MG 128 MG 129
Unit 13	MG 130
Unit 14	MG 131 MG 132 MG 133 MG 134 MG 135 MG 136
Unit 15	MG 137