3O4H - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: STRUCTURE AND CATALYSIS OF ACYLAMINOACYL PEPTIDASE
• Keywords: ALPHA/BETA HYDROLASE FOLD, BETA PROPELLER, HYDROLASE, OLIGOP SIZE SELECTIVITY
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	3O4H	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	ACYLAMINO-ACID-RELEASING ENZYME	A	576	4324	0
2	Protein	ACYLAMINO-ACID-RELEASING ENZYME	B	574	4242	0
3	Protein	ACYLAMINO-ACID-RELEASING ENZYME	C	577	4273	0
4	Protein	ACYLAMINO-ACID-RELEASING ENZYME	D	575	4279	0
5	Ligand	ACYLAMINO-ACID-RELEASING ENZYME	A	2	0	12
6	Ligand	ACYLAMINO-ACID-RELEASING ENZYME	B	2	0	7
7	Ligand	ACYLAMINO-ACID-RELEASING ENZYME	D	3	0	13
8	Water			928	0	928
total				3237	17118	960

Proteins

Unit 1	PRO 6 VAL 7 GLU 8 PHE 9 SER 10 ARG 11 ILE 12 VAL 13 ARG 14 ASP 15 VAL 16 GLU 17 ARG 18 LEU 19 ILE 20 ALA 21 VAL 22 GLU 23 LYS 24 TYR 25 SER 26 LEU 27 GLN 28 GLY 29 VAL 30 VAL 31 ASP 32 GLY 33 ASP 34 LYS 35 LEU 36 LEU 37 VAL 38 VAL 39 GLY 40 PHE 41 SER 42 GLU 43 GLY 44 SER 45 VAL 46 ASN 47 ALA 48 TYR 49 LEU 50 TYR 51 ASP 52 GLY 53 GLY 54 GLU 55 THR 56 VAL 57 LYS 58 LEU 59 ASN 60 ARG 61 GLU 62 PRO 63 ILE 64 ASN 65 SER 66 VAL 67 LEU 68 ASP 69 PRO 70 HIS 71 TYR 72 GLY 73 VAL 74 GLY 75 ARG 76 VAL 77 ILE 78 LEU 79 VAL 80 ARG 81 ASP 82 VAL 83 SER 84 LYS 85 GLY 86 ALA 87 GLU 88 GLN 89 HIS 90 ALA 91 LEU 92 PHE 93 LYS 94 VAL 95 ASN 96 THR 97 SER 98 ARG 99 PRO 100 GLY 101 GLU 102 GLU 103 GLN 104 ARG 105 LEU 106 GLU 107 ALA 108 VAL 109 LYS 110 PRO 111 MET 112 ARG 113 ILE 114 LEU 115 SER 116 GLY 117 VAL 118 ASP 119 THR 120 GLY 121 GLU 122 ALA 123 VAL 124 VAL 125 PHE 126 THR 127 GLY 128 ALA 129 THR 130 GLU 131 ASP 132 ARG 133 VAL 134 ALA 135 LEU 136 TYR 137 ALA 138 LEU 139 ASP 140 GLY 141 GLY 142 GLY 143 LEU 144 ARG 145 GLU 146 LEU 147 ALA 148 ARG 149 LEU 150 PRO 151 GLY 152 PHE 153 GLY 154 PHE 155 VAL 156 SER 157 ASP 158 ILE 159 ARG 160 GLY 161 ASP 162 LEU 163 ILE 164 ALA 165 GLY 166 LEU 167 GLY 168 PHE 169 PHE 170 GLY 171 GLY 172 GLY 173 ARG 174 VAL 175 SER 176 LEU 177 PHE 178 THR 179 SER 180 ASN 181 LEU 182 SER 183 SER 184 GLY 185 GLY 186 LEU 187 ARG 188 VAL 189 PHE 190 ASP 191 SER 192 GLY 193 GLU 194 GLY 195 SER 196 PHE 197 SER 198 SER 199 ALA 200 SER 201 ILE 202 SER 203 PRO 204 GLY 205 MET 206 LYS 207 VAL 208 THR 209 ALA 210 GLY 211 LEU 212 GLU 213 THR 214 ALA 215 ARG 216 GLU 217 ALA 218 ARG 219 LEU 220 VAL 221 THR 222 VAL 223 ASP 224 PRO 225 ARG 226 ASP 227 GLY 228 SER 229 VAL 230 GLU 231 ASP 232 LEU 233 GLU 234 LEU 235 PRO 236 SER 237 LYS 238 ASP 239 PHE 240 SER 241 SER 242 TYR 243 ARG 244 PRO 245 THR 246 ALA 247 ILE 248 THR 249 TRP 250 LEU 251 GLY 252 TYR 253 LEU 254 PRO 255 ASP 256 GLY 257 ARG 258 LEU 259 ALA 260 VAL 261 VAL 262 ALA 263 ARG 264 ARG 265 GLU 266 GLY 267 ARG 268 SER 269 ALA 270 VAL 271 PHE 272 ILE 273 ASP 274 GLY 275 GLU 276 ARG 277 VAL 278 GLU 279 ALA 280 PRO 281 GLN 282 GLY 283 ASN 284 HIS 285 GLY 286 ARG 287 VAL 288 VAL 289 LEU 290 TRP 291 ARG 292 GLY 293 LYS 294 LEU 295 VAL 296 THR 297 SER 298 HIS 299 THR 300 SER 301 LEU 302 SER 303 THR 304 PRO 305 PRO 306 ARG 307 ILE 308 VAL 309 SER 310 LEU 311 PRO 312 SER 313 GLY 314 GLU 315 PRO 316 LEU 317 LEU 318 GLU 319 GLY 320 GLY 321 LEU 322 PRO 323 GLU 324 ASP 325 LEU 326 ARG 327 ARG 328 SER 329 ILE 330 ALA 331 GLY 332 SER 333 ARG 334 LEU 335 VAL 336 TRP 337 VAL 338 GLU 339 SER 340 PHE 341 ASP 342 GLY 343 SER 344 ARG 345 VAL 346 PRO 347 THR 348 TYR 349 VAL 350 LEU 351 GLU 352 SER 353 GLY 354 ARG 355 ALA 356 PRO 357 THR 358 PRO 359 GLY 360 PRO 361 THR 362 VAL 363 VAL 364 LEU 365 VAL 366 HIS 367 GLY 368 GLY 369 PRO 370 PHE 371 ALA 372 GLU 373 ASP 374 SER 375 ASP 376 SER 377 TRP 378 ASP 379 THR 380 PHE 381 ALA 382 ALA 383 SER 384 LEU 385 ALA 386 ALA 387 ALA 388 GLY 389 PHE 390 HIS 391 VAL 392 VAL 393 MET 394 PRO 395 ASN 396 TYR 397 ARG 398 GLY 399 SER 400 THR 401 GLY 402 TYR 403 GLY 404 GLU 405 GLU 406 TRP 407 ARG 408 LEU 409 LYS 410 ILE 411 ILE 412 GLY 413 ASP 414 PRO 415 CYS 416 GLY 417 GLY 418 GLU 419 LEU 420 GLU 421 ASP 422 VAL 423 SER 424 ALA 425 ALA 426 ALA 427 ARG 428 TRP 429 ALA 430 ARG 431 GLU 432 SER 433 GLY 434 LEU 435 ALA 436 SER 437 GLU 438 LEU 439 TYR 440 ILE 441 MET 442 GLY 443 TYR 444 SER 445 TYR 446 GLY 447 GLY 448 TYR 449 MET 450 THR 451 LEU 452 CYS 453 ALA 454 LEU 455 THR 456 MET 457 LYS 458 PRO 459 GLY 460 LEU 461 PHE 462 LYS 463 ALA 464 GLY 465 VAL 466 ALA 467 GLY 468 ALA 469 SER 470 VAL 471 VAL 472 ASP 473 TRP 474 GLU 475 GLU 476 MET 477 TYR 478 GLU 479 LEU 480 SER 481 ASP 482 ALA 483 ALA 484 PHE 485 ARG 486 ASN 487 PHE 488 ILE 489 GLU 490 GLN 491 LEU 492 THR 493 GLY 494 GLY 495 SER 496 ARG 497 GLU 498 ILE 499 MET 500 ARG 501 SER 502 ARG 503 SER 504 PRO 505 ILE 506 ASN 507 HIS 508 VAL 509 ASP 510 ARG 511 ILE 512 LYS 513 GLU 514 PRO 515 LEU 516 ALA 517 LEU 518 ILE 519 HIS 520 PRO 521 GLN 522 ASN 523 ALA 524 SER 525 ARG 526 THR 527 PRO 528 LEU 529 LYS 530 PRO 531 LEU 532 LEU 533 ARG 534 LEU 535 MET 536 GLY 537 GLU 538 LEU 539 LEU 540 ALA 541 ARG 542 GLY 543 LYS 544 THR 545 PHE 546 GLU 547 ALA 548 HIS 549 ILE 550 ILE 551 PRO 552 ASP 553 ALA 554 GLY 555 HIS 556 ALA 557 ILE 558 ASN 559 THR 560 MET 561 GLU 562 ASP 563 ALA 564 VAL 565 LYS 566 ILE 567 LEU 568 LEU 569 PRO 570 ALA 571 VAL 572 PHE 573 PHE 574 LEU 575 ALA 576 THR 577 GLN 578 ARG 579 GLU 580 ARG 581
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Unit 4	VAL 7 GLU 8 PHE 9 SER 10 ARG 11 ILE 12 VAL 13 ARG 14 ASP 15 VAL 16 GLU 17 ARG 18 LEU 19 ILE 20 ALA 21 VAL 22 GLU 23 LYS 24 TYR 25 SER 26 LEU 27 GLN 28 GLY 29 VAL 30 VAL 31 ASP 32 GLY 33 ASP 34 LYS 35 LEU 36 LEU 37 VAL 38 VAL 39 GLY 40 PHE 41 SER 42 GLU 43 GLY 44 SER 45 VAL 46 ASN 47 ALA 48 TYR 49 LEU 50 TYR 51 ASP 52 GLY 53 GLY 54 GLU 55 THR 56 VAL 57 LYS 58 LEU 59 ASN 60 ARG 61 GLU 62 PRO 63 ILE 64 ASN 65 SER 66 VAL 67 LEU 68 ASP 69 PRO 70 HIS 71 TYR 72 GLY 73 VAL 74 GLY 75 ARG 76 VAL 77 ILE 78 LEU 79 VAL 80 ARG 81 ASP 82 VAL 83 SER 84 LYS 85 GLY 86 ALA 87 GLU 88 GLN 89 HIS 90 ALA 91 LEU 92 PHE 93 LYS 94 VAL 95 ASN 96 THR 97 SER 98 ARG 99 PRO 100 GLY 101 GLU 102 GLU 103 GLN 104 ARG 105 LEU 106 GLU 107 ALA 108 VAL 109 LYS 110 PRO 111 MET 112 ARG 113 ILE 114 LEU 115 SER 116 GLY 117 VAL 118 ASP 119 THR 120 GLY 121 GLU 122 ALA 123 VAL 124 VAL 125 PHE 126 THR 127 GLY 128 ALA 129 THR 130 GLU 131 ASP 132 ARG 133 VAL 134 ALA 135 LEU 136 TYR 137 ALA 138 LEU 139 ASP 140 GLY 141 GLY 142 GLY 143 LEU 144 ARG 145 GLU 146 LEU 147 ALA 148 ARG 149 LEU 150 PRO 151 GLY 152 PHE 153 GLY 154 PHE 155 VAL 156 SER 157 ASP 158 ILE 159 ARG 160 GLY 161 ASP 162 LEU 163 ILE 164 ALA 165 GLY 166 LEU 167 GLY 168 PHE 169 PHE 170 GLY 171 GLY 172 GLY 173 ARG 174 VAL 175 SER 176 LEU 177 PHE 178 THR 179 SER 180 ASN 181 LEU 182 SER 183 SER 184 GLY 185 GLY 186 LEU 187 ARG 188 VAL 189 PHE 190 ASP 191 SER 192 GLY 193 GLU 194 GLY 195 SER 196 PHE 197 SER 198 SER 199 ALA 200 SER 201 ILE 202 SER 203 PRO 204 GLY 205 MET 206 LYS 207 VAL 208 THR 209 ALA 210 GLY 211 LEU 212 GLU 213 THR 214 ALA 215 ARG 216 GLU 217 ALA 218 ARG 219 LEU 220 VAL 221 THR 222 VAL 223 ASP 224 PRO 225 ARG 226 ASP 227 GLY 228 SER 229 VAL 230 GLU 231 ASP 232 LEU 233 GLU 234 LEU 235 PRO 236 SER 237 LYS 238 ASP 239 PHE 240 SER 241 SER 242 TYR 243 ARG 244 PRO 245 THR 246 ALA 247 ILE 248 THR 249 TRP 250 LEU 251 GLY 252 TYR 253 LEU 254 PRO 255 ASP 256 GLY 257 ARG 258 LEU 259 ALA 260 VAL 261 VAL 262 ALA 263 ARG 264 ARG 265 GLU 266 GLY 267 ARG 268 SER 269 ALA 270 VAL 271 PHE 272 ILE 273 ASP 274 GLY 275 GLU 276 ARG 277 VAL 278 GLU 279 ALA 280 PRO 281 GLN 282 GLY 283 ASN 284 HIS 285 GLY 286 ARG 287 VAL 288 VAL 289 LEU 290 TRP 291 ARG 292 GLY 293 LYS 294 LEU 295 VAL 296 THR 297 SER 298 HIS 299 THR 300 SER 301 LEU 302 SER 303 THR 304 PRO 305 PRO 306 ARG 307 ILE 308 VAL 309 SER 310 LEU 311 PRO 312 SER 313 GLY 314 GLU 315 PRO 316 LEU 317 LEU 318 GLU 319 GLY 320 GLY 321 LEU 322 PRO 323 GLU 324 ASP 325 LEU 326 ARG 327 ARG 328 SER 329 ILE 330 ALA 331 GLY 332 SER 333 ARG 334 LEU 335 VAL 336 TRP 337 VAL 338 GLU 339 SER 340 PHE 341 ASP 342 GLY 343 SER 344 ARG 345 VAL 346 PRO 347 THR 348 TYR 349 VAL 350 LEU 351 GLU 352 SER 353 GLY 354 ARG 355 ALA 356 PRO 357 THR 358 PRO 359 GLY 360 PRO 361 THR 362 VAL 363 VAL 364 LEU 365 VAL 366 HIS 367 GLY 368 GLY 369 PRO 370 PHE 371 ALA 372 GLU 373 ASP 374 SER 375 ASP 376 SER 377 TRP 378 ASP 379 THR 380 PHE 381 ALA 382 ALA 383 SER 384 LEU 385 ALA 386 ALA 387 ALA 388 GLY 389 PHE 390 HIS 391 VAL 392 VAL 393 MET 394 PRO 395 ASN 396 TYR 397 ARG 398 GLY 399 SER 400 THR 401 GLY 402 TYR 403 GLY 404 GLU 405 GLU 406 TRP 407 ARG 408 LEU 409 LYS 410 ILE 411 ILE 412 GLY 413 ASP 414 PRO 415 CYS 416 GLY 417 GLY 418 GLU 419 LEU 420 GLU 421 ASP 422 VAL 423 SER 424 ALA 425 ALA 426 ALA 427 ARG 428 TRP 429 ALA 430 ARG 431 GLU 432 SER 433 GLY 434 LEU 435 ALA 436 SER 437 GLU 438 LEU 439 TYR 440 ILE 441 MET 442 GLY 443 TYR 444 SER 445 TYR 446 GLY 447 GLY 448 TYR 449 MET 450 THR 451 LEU 452 CYS 453 ALA 454 LEU 455 THR 456 MET 457 LYS 458 PRO 459 GLY 460 LEU 461 PHE 462 LYS 463 ALA 464 GLY 465 VAL 466 ALA 467 GLY 468 ALA 469 SER 470 VAL 471 VAL 472 ASP 473 TRP 474 GLU 475 GLU 476 MET 477 TYR 478 GLU 479 LEU 480 SER 481 ASP 482 ALA 483 ALA 484 PHE 485 ARG 486 ASN 487 PHE 488 ILE 489 GLU 490 GLN 491 LEU 492 THR 493 GLY 494 GLY 495 SER 496 ARG 497 GLU 498 ILE 499 MET 500 ARG 501 SER 502 ARG 503 SER 504 PRO 505 ILE 506 ASN 507 HIS 508 VAL 509 ASP 510 ARG 511 ILE 512 LYS 513 GLU 514 PRO 515 LEU 516 ALA 517 LEU 518 ILE 519 HIS 520 PRO 521 GLN 522 ASN 523 ALA 524 SER 525 ARG 526 THR 527 PRO 528 LEU 529 LYS 530 PRO 531 LEU 532 LEU 533 ARG 534 LEU 535 MET 536 GLY 537 GLU 538 LEU 539 LEU 540 ALA 541 ARG 542 GLY 543 LYS 544 THR 545 PHE 546 GLU 547 ALA 548 HIS 549 ILE 550 ILE 551 PRO 552 ASP 553 ALA 554 GLY 555 HIS 556 ALA 557 ILE 558 ASN 559 THR 560 MET 561 GLU 562 ASP 563 ALA 564 VAL 565 LYS 566 ILE 567 LEU 568 LEU 569 PRO 570 ALA 571 VAL 572 PHE 573 PHE 574 LEU 575 ALA 576 THR 577 GLN 578 ARG 579 GLU 580 ARG 581

Ligands

Unit 5	GOL 583 GOL 584
Unit 6	NA 583 GOL 584
Unit 7	NA 583 GOL 584 GOL 585