3NBF - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: Q28E MUTANT OF HERA HELICASE N-TERMINAL DOMAIN BOUND TO 8-OX
• Keywords: RNA HELICASE, RIBOSOME BIOGENESIS, ATP HYDROLYSIS, BASE SPEC THERMOSTABILITY, HYDROLASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	3NBF	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	HEAT RESISTANT RNA DEPENDENT ATPASE	A	207	1566	0
2	Protein	HEAT RESISTANT RNA DEPENDENT ATPASE	B	206	1563	0
3	Protein	HEAT RESISTANT RNA DEPENDENT ATPASE	C	207	1571	0
4	Protein	HEAT RESISTANT RNA DEPENDENT ATPASE	D	202	1532	0
5	Ligand	HEAT RESISTANT RNA DEPENDENT ATPASE	A	2	0	56
6	Ligand	HEAT RESISTANT RNA DEPENDENT ATPASE	B	2	0	56
7	Ligand	HEAT RESISTANT RNA DEPENDENT ATPASE	C	3	0	76
8	Ligand	HEAT RESISTANT RNA DEPENDENT ATPASE	D	2	0	52
9	Water			265	0	265
total				1096	6232	505

Proteins

Unit 1	MET 1 GLU 2 PHE 3 LYS 4 ASP 5 PHE 6 PRO 7 LEU 8 LYS 9 PRO 10 GLU 11 ILE 12 LEU 13 GLU 14 ALA 15 LEU 16 HIS 17 GLY 18 ARG 19 GLY 20 LEU 21 THR 22 THR 23 PRO 24 THR 25 PRO 26 ILE 27 GLU 28 ALA 29 ALA 30 ALA 31 LEU 32 PRO 33 LEU 34 ALA 35 LEU 36 GLU 37 GLY 38 LYS 39 ASP 40 LEU 41 ILE 42 GLY 43 GLN 44 ALA 45 ARG 46 THR 47 GLY 48 THR 49 GLY 50 LYS 51 THR 52 LEU 53 ALA 54 PHE 55 ALA 56 LEU 57 PRO 58 ILE 59 ALA 60 GLU 61 ARG 62 LEU 63 ALA 64 PRO 65 SER 66 GLN 67 GLU 68 ARG 69 GLY 70 ARG 71 LYS 72 PRO 73 ARG 74 ALA 75 LEU 76 VAL 77 LEU 78 THR 79 PRO 80 THR 81 ARG 82 GLU 83 LEU 84 ALA 85 LEU 86 GLN 87 VAL 88 ALA 89 SER 90 GLU 91 LEU 92 THR 93 ALA 94 VAL 95 ALA 96 PRO 97 HIS 98 LEU 99 LYS 100 VAL 101 VAL 102 ALA 103 VAL 104 TYR 105 GLY 106 GLY 107 THR 108 GLY 109 TYR 110 GLY 111 LYS 112 GLN 113 LYS 114 GLU 115 ALA 116 LEU 117 LEU 118 ARG 119 GLY 120 ALA 121 ASP 122 ALA 123 VAL 124 VAL 125 ALA 126 THR 127 PRO 128 GLY 129 ARG 130 ALA 131 LEU 132 ASP 133 TYR 134 LEU 135 ARG 136 GLN 137 GLY 138 VAL 139 LEU 140 ASP 141 LEU 142 SER 143 ARG 144 VAL 145 GLU 146 VAL 147 ALA 148 VAL 149 LEU 150 ASP 151 GLU 152 ALA 153 ASP 154 GLU 155 MET 156 LEU 157 SER 158 MET 159 GLY 160 PHE 161 GLU 162 GLU 163 GLU 164 VAL 165 GLU 166 ALA 167 LEU 168 LEU 169 SER 170 ALA 171 THR 172 PRO 173 PRO 174 SER 175 ARG 176 GLN 177 THR 178 LEU 179 LEU 180 PHE 181 SER 182 ALA 183 THR 184 LEU 185 PRO 186 SER 187 TRP 188 ALA 189 LYS 190 ARG 191 LEU 192 ALA 193 GLU 194 ARG 195 TYR 196 MET 197 LYS 198 ASN 199 PRO 200 VAL 201 LEU 202 ILE 203 ASN 204 VAL 205 ILE 206 LYS 207
Unit 2	GLU 2 PHE 3 LYS 4 ASP 5 PHE 6 PRO 7 LEU 8 LYS 9 PRO 10 GLU 11 ILE 12 LEU 13 GLU 14 ALA 15 LEU 16 HIS 17 GLY 18 ARG 19 GLY 20 LEU 21 THR 22 THR 23 PRO 24 THR 25 PRO 26 ILE 27 GLU 28 ALA 29 ALA 30 ALA 31 LEU 32 PRO 33 LEU 34 ALA 35 LEU 36 GLU 37 GLY 38 LYS 39 ASP 40 LEU 41 ILE 42 GLY 43 GLN 44 ALA 45 ARG 46 THR 47 GLY 48 THR 49 GLY 50 LYS 51 THR 52 LEU 53 ALA 54 PHE 55 ALA 56 LEU 57 PRO 58 ILE 59 ALA 60 GLU 61 ARG 62 LEU 63 ALA 64 PRO 65 SER 66 GLN 67 GLU 68 ARG 69 GLY 70 ARG 71 LYS 72 PRO 73 ARG 74 ALA 75 LEU 76 VAL 77 LEU 78 THR 79 PRO 80 THR 81 ARG 82 GLU 83 LEU 84 ALA 85 LEU 86 GLN 87 VAL 88 ALA 89 SER 90 GLU 91 LEU 92 THR 93 ALA 94 VAL 95 ALA 96 PRO 97 HIS 98 LEU 99 LYS 100 VAL 101 VAL 102 ALA 103 VAL 104 TYR 105 GLY 106 GLY 107 THR 108 GLY 109 TYR 110 GLY 111 LYS 112 GLN 113 LYS 114 GLU 115 ALA 116 LEU 117 LEU 118 ARG 119 GLY 120 ALA 121 ASP 122 ALA 123 VAL 124 VAL 125 ALA 126 THR 127 PRO 128 GLY 129 ARG 130 ALA 131 LEU 132 ASP 133 TYR 134 LEU 135 ARG 136 GLN 137 GLY 138 VAL 139 LEU 140 ASP 141 LEU 142 SER 143 ARG 144 VAL 145 GLU 146 VAL 147 ALA 148 VAL 149 LEU 150 ASP 151 GLU 152 ALA 153 ASP 154 GLU 155 MET 156 LEU 157 SER 158 MET 159 GLY 160 PHE 161 GLU 162 GLU 163 GLU 164 VAL 165 GLU 166 ALA 167 LEU 168 LEU 169 SER 170 ALA 171 THR 172 PRO 173 PRO 174 SER 175 ARG 176 GLN 177 THR 178 LEU 179 LEU 180 PHE 181 SER 182 ALA 183 THR 184 LEU 185 PRO 186 SER 187 TRP 188 ALA 189 LYS 190 ARG 191 LEU 192 ALA 193 GLU 194 ARG 195 TYR 196 MET 197 LYS 198 ASN 199 PRO 200 VAL 201 LEU 202 ILE 203 ASN 204 VAL 205 ILE 206 LYS 207
Unit 3	MET 1 GLU 2 PHE 3 LYS 4 ASP 5 PHE 6 PRO 7 LEU 8 LYS 9 PRO 10 GLU 11 ILE 12 LEU 13 GLU 14 ALA 15 LEU 16 HIS 17 GLY 18 ARG 19 GLY 20 LEU 21 THR 22 THR 23 PRO 24 THR 25 PRO 26 ILE 27 GLU 28 ALA 29 ALA 30 ALA 31 LEU 32 PRO 33 LEU 34 ALA 35 LEU 36 GLU 37 GLY 38 LYS 39 ASP 40 LEU 41 ILE 42 GLY 43 GLN 44 ALA 45 ARG 46 THR 47 GLY 48 THR 49 GLY 50 LYS 51 THR 52 LEU 53 ALA 54 PHE 55 ALA 56 LEU 57 PRO 58 ILE 59 ALA 60 GLU 61 ARG 62 LEU 63 ALA 64 PRO 65 SER 66 GLN 67 GLU 68 ARG 69 GLY 70 ARG 71 LYS 72 PRO 73 ARG 74 ALA 75 LEU 76 VAL 77 LEU 78 THR 79 PRO 80 THR 81 ARG 82 GLU 83 LEU 84 ALA 85 LEU 86 GLN 87 VAL 88 ALA 89 SER 90 GLU 91 LEU 92 THR 93 ALA 94 VAL 95 ALA 96 PRO 97 HIS 98 LEU 99 LYS 100 VAL 101 VAL 102 ALA 103 VAL 104 TYR 105 GLY 106 GLY 107 THR 108 GLY 109 TYR 110 GLY 111 LYS 112 GLN 113 LYS 114 GLU 115 ALA 116 LEU 117 LEU 118 ARG 119 GLY 120 ALA 121 ASP 122 ALA 123 VAL 124 VAL 125 ALA 126 THR 127 PRO 128 GLY 129 ARG 130 ALA 131 LEU 132 ASP 133 TYR 134 LEU 135 ARG 136 GLN 137 GLY 138 VAL 139 LEU 140 ASP 141 LEU 142 SER 143 ARG 144 VAL 145 GLU 146 VAL 147 ALA 148 VAL 149 LEU 150 ASP 151 GLU 152 ALA 153 ASP 154 GLU 155 MET 156 LEU 157 SER 158 MET 159 GLY 160 PHE 161 GLU 162 GLU 163 GLU 164 VAL 165 GLU 166 ALA 167 LEU 168 LEU 169 SER 170 ALA 171 THR 172 PRO 173 PRO 174 SER 175 ARG 176 GLN 177 THR 178 LEU 179 LEU 180 PHE 181 SER 182 ALA 183 THR 184 LEU 185 PRO 186 SER 187 TRP 188 ALA 189 LYS 190 ARG 191 LEU 192 ALA 193 GLU 194 ARG 195 TYR 196 MET 197 LYS 198 ASN 199 PRO 200 VAL 201 LEU 202 ILE 203 ASN 204 VAL 205 ILE 206 LYS 207
Unit 4	MET 1 GLU 2 PHE 3 LYS 4 ASP 5 PHE 6 PRO 7 LEU 8 LYS 9 PRO 10 GLU 11 ILE 12 LEU 13 GLU 14 ALA 15 LEU 16 HIS 17 GLY 18 ARG 19 GLY 20 LEU 21 THR 22 THR 23 PRO 24 THR 25 PRO 26 ILE 27 GLU 28 ALA 29 ALA 30 ALA 31 LEU 32 PRO 33 LEU 34 ALA 35 LEU 36 GLU 37 GLY 38 LYS 39 ASP 40 LEU 41 ILE 42 GLY 43 GLN 44 ALA 45 GLY 50 LYS 51 THR 52 LEU 53 ALA 54 PHE 55 ALA 56 LEU 57 PRO 58 ILE 59 ALA 60 GLU 61 ARG 62 LEU 63 ALA 64 PRO 65 SER 66 GLN 67 GLU 68 ARG 69 GLY 70 ARG 71 LYS 72 PRO 73 ARG 74 ALA 75 LEU 76 VAL 77 LEU 78 THR 79 PRO 80 THR 81 ARG 82 GLU 83 LEU 84 ALA 85 LEU 86 GLN 87 VAL 88 ALA 89 SER 90 GLU 91 LEU 92 THR 93 ALA 94 VAL 95 ALA 96 PRO 97 HIS 98 LEU 99 LYS 100 VAL 101 VAL 102 ALA 103 VAL 104 TYR 105 GLY 106 GLY 107 THR 108 GLY 109 TYR 110 GLY 111 LYS 112 GLN 113 LYS 114 GLU 115 ALA 116 LEU 117 LEU 118 ARG 119 GLY 120 ALA 121 ASP 122 ALA 123 VAL 124 VAL 125 ALA 126 THR 127 PRO 128 GLY 129 ARG 130 ALA 131 LEU 132 ASP 133 TYR 134 LEU 135 ARG 136 GLN 137 GLY 138 VAL 139 LEU 140 ASP 141 LEU 142 SER 143 ARG 144 VAL 145 GLU 146 VAL 147 ALA 148 VAL 149 LEU 150 ASP 151 GLU 152 ALA 153 ASP 154 GLU 155 MET 156 LEU 157 SER 158 MET 159 GLY 160 PHE 161 GLU 162 GLU 163 GLU 164 VAL 165 GLU 166 ALA 167 LEU 168 LEU 169 SER 170 ALA 171 THR 172 PRO 173 PRO 174 SER 175 ARG 176 GLN 177 THR 178 LEU 179 LEU 180 PHE 181 SER 182 ALA 183 THR 184 LEU 185 PRO 186 SER 187 TRP 188 ALA 189 LYS 190 ARG 191 LEU 192 ALA 193 GLU 194 ARG 195 TYR 196 MET 197 LYS 198 ASN 199 PRO 200 VAL 201 LEU 202 ILE 203 ASN 204 VAL 205 ILE 206

Ligands

Unit 5	8OD 500 8OD 600
Unit 6	8OD 500 8OD 600
Unit 7	8OP 500 8OP 501 8OD 600
Unit 8	8OP 500 8OD 600